Heatmap: Cluster_30 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.03 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.02 0.08 0.21 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.13 0.0
0.03 0.27 0.23 0.15 0.27 0.23 0.22 0.34 0.25 0.68 0.51 0.64
0.71 0.29 0.04 0.09 0.11 0.07 0.03 0.15 0.08 0.21 0.32 0.62
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0
0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.06 0.06 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0
0.0 0.0 0.02 0.02 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02
0.07 0.13 0.15 0.13 0.14 0.09 0.0 0.03 0.1 0.11 0.3 0.29
0.2 0.58 0.46 0.2 0.46 0.32 0.55 1.32 0.44 1.88 4.69 3.5
0.0 0.22 0.11 0.02 0.42 0.05 0.02 0.27 0.06 0.54 0.93 0.51
0.0 0.25 0.07 0.09 0.25 0.06 0.0 0.06 0.08 0.28 0.8 0.4
0.0 0.44 0.2 0.48 0.46 0.35 0.25 0.62 0.24 1.14 3.09 1.62
0.0 0.62 0.42 0.44 0.4 1.49 1.03 1.04 0.39 1.19 2.85 1.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.07 0.19 0.03 0.02 0.09 0.06 0.03 0.05 0.06 0.06 0.17 0.11
0.47 10.31 7.06 2.37 4.48 6.09 6.97 8.44 8.86 9.89 17.68 14.25
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0
0.0 0.05 0.07 0.09 0.05 0.04 0.0 0.09 0.14 0.12 0.08 0.14
0.07 0.08 0.04 0.0 0.02 0.04 0.0 0.03 0.02 0.04 0.09 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.04 0.02
0.42 1.7 1.53 2.0 2.75 2.31 0.99 2.02 1.38 2.34 3.77 1.95
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.11 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.13 0.04
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
0.0 0.02 0.05 0.04 0.05 0.02 0.04 0.06 0.02 0.02 0.23 0.09
0.07 6.86 7.79 9.67 8.82 6.42 8.29 6.4 11.64 6.3 21.81 14.6
0.03 5.16 3.94 6.67 6.03 3.06 1.82 3.76 8.79 4.26 18.51 9.72
0.0 0.9 0.52 1.05 1.3 0.21 0.0 0.57 1.11 0.82 3.19 1.16
0.0 4.99 1.81 3.81 5.6 2.28 0.91 3.23 8.03 3.84 14.84 7.46
0.0 3.29 1.09 2.49 2.87 0.68 0.31 1.97 3.56 2.44 8.98 3.08
29.18 31.28 24.7 25.18 25.76 26.73 27.2 26.4 26.42 32.24 33.79 34.4
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.23 0.11 0.02 0.0 0.0 0.1 0.03 0.0 0.02 0.08 0.21 0.2
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.02 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.9 2.37 2.39 1.13 1.99 0.92 1.02 1.55 1.1 2.81 4.77 4.37
0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0
0.0 0.02 0.07 0.04 0.05 0.02 0.0 0.02 0.06 0.11 0.13 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0
0.0 0.0 0.0 0.09 0.09 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0
0.0 0.0 0.05 0.09 0.0 0.04 0.04 0.04 0.05 0.16 0.17 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.13 0.15 0.22 0.09 0.23 0.04 0.2 0.18 0.51 0.42 0.22
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.09 0.38 0.0
0.0 0.23 0.04 0.07 0.26 0.13 0.02 0.06 0.12 0.13 0.49 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.07 0.56 0.04 0.09 0.14 0.09 0.02 0.08 0.12 0.11 0.53 0.22
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.13 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.04 0.0 0.09 0.16 0.29 0.14 0.38 0.31 0.15 0.53 0.28 0.22
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0
0.0 0.0 0.0 0.02 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.06 0.0
0.07 0.31 0.08 0.38 0.64 0.13 0.28 0.21 0.05 0.38 0.69 0.28
4.45 2.06 1.61 1.6 0.83 1.78 1.45 2.53 1.71 2.8 2.8 3.87
0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0
0.0 0.0 0.05 0.0 0.02 0.05 0.0 0.02 0.02 0.02 0.13 0.0
2.61 1.44 1.18 1.22 1.18 0.73 0.8 1.29 0.94 1.8 1.25 2.43

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)