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Heatmap: Cluster_91 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-1.07 -0.51 -0.6 -0.09 0.43 0.64 0.46 0.25 -0.01 0.13 -0.33 -0.21
-0.17 0.05 -0.11 -0.08 0.18 0.08 -0.0 0.27 0.13 0.09 -0.19 -0.38
- -0.83 -1.03 0.89 -0.1 0.44 0.5 0.66 0.26 -0.04 -1.1 0.21
-0.72 -0.1 -0.23 -0.01 0.25 0.39 0.29 0.3 0.04 -0.0 -0.29 -0.3
-0.57 -0.28 -0.26 0.05 0.1 0.48 0.41 0.29 0.08 0.06 -0.46 -0.35
-0.29 -0.15 -0.15 -0.04 0.21 0.3 0.25 0.32 0.13 -0.03 -0.3 -0.54
-0.22 -0.1 -0.22 0.03 0.1 0.1 0.18 0.18 0.18 0.12 -0.16 -0.32
-1.97 -0.31 -0.41 0.03 0.59 0.7 0.54 0.35 0.03 -0.05 -0.77 -0.45
-0.01 0.07 -0.29 -0.01 0.21 0.34 0.2 0.48 0.14 -0.19 -0.57 -0.92
-3.73 -1.77 -0.71 -0.17 0.4 0.54 0.82 0.8 0.33 0.27 -0.35 -0.71
-1.86 -0.35 -0.56 -0.08 0.4 0.46 0.76 0.7 0.13 -0.01 -0.49 -1.01
-2.24 -0.51 -0.97 0.43 0.63 0.46 0.68 0.39 0.18 0.18 -0.77 -0.87
-2.38 -0.76 -0.19 0.39 0.47 0.72 0.58 0.54 -0.25 -0.54 -0.37 -0.44
-2.28 -1.07 -0.39 0.11 0.27 0.34 0.74 0.51 0.3 0.23 -0.36 -0.45
-0.03 0.05 -0.22 0.02 0.24 0.22 0.15 0.37 0.02 -0.1 -0.34 -0.69
-3.17 -1.25 -1.05 0.34 0.79 0.82 0.95 0.33 0.18 -0.15 -1.39 -0.68
-0.84 -0.39 -0.61 0.22 0.11 -0.08 0.58 0.32 0.04 0.25 -0.26 0.05
-0.16 -0.08 -0.09 -0.12 0.27 0.29 0.13 0.31 0.03 -0.01 -0.27 -0.5
-0.19 -0.18 -0.32 -0.2 0.08 0.22 0.32 0.15 0.24 0.17 -0.18 -0.32
-0.78 -0.31 -0.37 0.15 0.41 0.27 0.4 0.22 0.22 0.22 -0.59 -0.49
-1.41 -0.49 -0.47 -0.27 0.22 0.22 0.68 0.99 0.24 0.05 -0.43 -1.04
-1.28 -0.52 -0.54 0.05 0.41 0.59 0.36 0.3 -0.03 0.22 -0.39 -0.15
-0.35 -0.04 -1.05 0.68 0.1 0.07 0.54 -0.0 0.23 0.01 -0.63 -0.39
-1.53 -0.22 -0.82 0.47 0.43 0.59 0.7 0.11 0.04 -0.12 -0.48 -0.72
-0.78 0.35 -0.51 0.43 0.53 0.36 0.26 -0.23 -0.14 -0.08 -0.7 -0.27
-3.08 -1.48 -0.84 0.05 0.47 0.96 0.96 0.65 0.23 -0.16 -0.97 -0.97
-0.71 0.16 -0.22 0.2 0.31 0.19 0.38 -0.13 -0.09 0.12 -0.49 -0.11
-0.01 -0.05 -0.38 0.04 0.17 0.16 0.35 0.18 0.27 0.07 -0.62 -0.55
-2.29 -0.45 -0.44 0.16 0.38 0.61 0.71 0.3 0.12 0.01 -0.73 -0.29
- -2.64 -1.72 -0.21 0.45 1.07 1.29 0.54 0.4 0.02 -1.0 -1.09
-0.2 -0.03 -0.05 -0.13 0.08 0.13 0.01 0.29 0.2 0.1 -0.19 -0.33
-1.84 -0.71 -0.88 0.17 0.25 0.33 0.68 0.52 0.42 0.3 -0.59 -0.45
-0.08 -0.19 -0.46 0.24 -0.1 0.42 0.37 0.16 0.09 -0.36 -0.28 -0.12
-2.43 -0.76 -0.52 -0.29 0.63 0.83 0.77 0.77 -0.01 -0.18 -0.57 -1.26
-3.46 -1.4 -1.12 -0.62 0.42 0.94 1.0 1.01 0.25 0.03 -0.74 -1.52
-2.57 -0.52 -0.55 0.16 0.45 0.43 0.54 0.37 0.39 0.21 -0.5 -0.51
-0.24 -0.02 -0.03 -0.1 0.21 0.27 0.11 0.17 0.08 0.01 -0.22 -0.38
-2.08 -0.36 -0.5 0.03 0.76 0.58 0.67 0.43 -0.34 -0.1 -0.36 -0.68
-0.15 -0.33 -0.92 -0.05 0.2 0.14 0.71 0.51 0.27 0.07 -0.66 -0.72
-0.76 -0.08 -0.56 -0.31 0.26 0.72 0.58 0.51 -0.08 -0.1 -0.51 -0.68
-1.36 0.07 -0.58 -0.29 0.82 0.68 0.61 0.52 -0.16 -0.4 -0.7 -1.06
-1.73 -0.33 -0.32 0.16 0.57 0.44 0.55 0.65 -0.09 -0.2 -0.52 -0.74
-0.22 -0.08 -0.19 -0.06 0.2 0.21 0.13 0.33 0.16 0.09 -0.22 -0.58
-0.43 -0.12 -0.32 -0.15 0.28 0.24 0.19 0.5 0.15 0.09 -0.3 -0.53
-1.5 -0.39 -0.47 -0.17 0.16 0.42 0.37 0.43 0.09 0.33 -0.08 -0.13
-2.19 -0.94 -0.74 -0.03 0.43 0.74 0.86 0.32 0.16 0.02 -0.52 -0.38
-0.31 0.14 -0.56 0.17 0.44 0.18 0.2 0.28 0.19 0.15 -0.62 -0.92
-2.6 -1.07 -0.68 0.08 0.18 0.35 0.92 0.45 0.5 0.27 -0.63 -0.44
-0.52 0.02 -0.56 0.1 0.29 0.25 0.6 0.67 -0.13 -0.4 -0.4 -0.76
-3.84 -1.9 -0.82 -0.23 0.47 0.95 1.08 0.69 0.3 0.01 -0.92 -1.22
-0.57 -0.32 -0.31 -0.07 0.18 0.35 0.53 0.34 0.3 -0.01 -0.48 -0.48
-1.33 -0.37 -0.37 0.33 0.4 0.37 0.45 0.01 0.2 0.07 -0.58 -0.07
-2.41 -0.78 -0.77 0.09 0.53 0.73 0.62 0.41 0.19 0.25 -0.54 -0.78
-3.22 -1.69 -1.31 0.28 0.98 0.33 1.29 0.22 0.18 0.24 -1.21 -1.34
-0.91 -0.32 -0.73 0.13 0.16 0.1 0.42 0.64 0.37 0.28 -0.45 -0.61
-1.48 -0.6 -0.27 0.08 0.22 0.38 0.49 0.52 0.27 0.09 -0.35 -0.42
-1.16 -0.28 -0.64 0.15 0.28 0.0 0.51 0.58 0.24 0.16 -0.31 -0.43
-1.86 -1.18 -0.68 -0.19 0.68 0.94 0.97 1.0 -0.03 -0.74 -1.12 -1.89
-0.63 -0.35 -0.32 -0.2 0.34 0.29 0.21 0.54 0.3 0.24 -0.34 -0.74
-1.03 -0.67 -0.9 0.01 -0.06 -0.01 0.53 0.79 0.54 0.38 -0.25 -0.69
-1.84 -0.63 -0.52 -0.24 0.5 0.65 0.51 0.55 0.06 0.2 -0.25 -0.68
-0.81 -0.25 -0.3 0.47 -0.03 0.7 0.51 0.56 0.09 -0.15 -0.45 -2.35
-1.05 -0.82 -0.75 -0.38 0.16 0.4 0.81 1.08 0.26 -0.0 -0.57 -1.27
-5.66 -0.94 -0.79 0.71 0.59 0.5 0.72 0.28 0.27 -0.01 -0.66 -0.64
-0.52 0.6 -1.48 0.63 0.28 -0.18 0.18 -0.74 0.79 0.06 -0.68 -0.62
-3.13 -1.28 -0.94 -0.02 0.59 0.77 0.92 0.71 0.17 -0.02 -0.75 -0.94
-2.7 -1.3 -0.75 0.68 0.57 0.11 0.72 0.64 0.33 0.21 -1.02 -0.81
-0.31 -0.01 -0.12 -0.19 0.16 0.26 0.22 0.29 0.04 -0.01 -0.15 -0.36
-1.45 -0.39 -0.48 0.41 0.32 0.47 0.7 0.35 0.07 -0.26 -0.43 -0.61
-2.17 -0.42 -0.88 0.31 0.73 0.64 0.6 0.34 0.0 0.17 -1.18 -0.58
-1.15 -0.94 -1.98 0.47 0.43 0.19 1.2 0.2 0.29 0.23 -1.71 -0.41
-2.07 -0.41 -0.41 0.2 0.4 0.41 0.46 0.37 0.05 0.07 -0.19 -0.26
-4.54 -1.7 -1.02 -0.1 0.6 1.08 0.79 0.84 0.04 0.08 -1.07 -0.97
-3.0 -0.94 -0.51 0.54 0.07 0.93 0.9 0.38 0.22 -0.05 -2.0 -0.54
-0.29 -0.06 -0.03 0.09 0.29 0.27 0.23 0.21 0.09 -0.04 -0.45 -0.62
-0.35 -0.27 -0.26 0.01 0.28 0.42 0.52 0.54 0.14 -0.17 -0.69 -1.0
-0.52 -0.06 -0.5 0.15 0.24 0.08 0.33 0.38 0.16 0.05 -0.35 -0.32
-1.38 -0.51 -0.29 0.11 0.42 0.44 0.5 0.39 0.14 0.01 -0.43 -0.4
-0.16 -0.19 -0.39 0.06 0.31 0.2 0.26 0.47 0.11 -0.02 -0.42 -0.62
-1.45 -0.71 -0.64 0.16 0.56 0.49 0.18 0.39 0.36 0.33 -0.33 -0.72
-0.45 -0.28 -0.45 -0.16 0.23 0.39 0.35 0.46 0.14 0.03 -0.26 -0.48
-0.38 -0.08 -0.22 -0.33 0.32 0.69 0.46 0.31 -0.41 -0.14 -0.45 -0.38
-1.4 -0.12 -0.15 0.08 0.39 0.73 0.7 0.36 -0.29 -0.44 -0.61 -0.59
-2.75 -0.9 -0.9 0.05 0.44 0.62 0.73 0.24 0.07 0.27 -0.14 -0.24
-2.28 -0.19 -0.15 0.18 0.6 0.66 0.59 0.3 -0.06 -0.07 -0.9 -0.72
-1.21 -0.83 -0.56 -0.08 -0.03 0.11 0.37 0.61 0.55 0.26 -0.11 -0.12
0.14 0.1 -0.76 0.06 0.19 -0.29 0.61 0.78 0.23 -0.12 -1.0 -1.35
-0.94 -0.47 -0.37 -0.09 0.33 0.36 0.47 0.37 0.12 0.04 -0.15 -0.31
-0.28 -0.05 -0.29 -0.22 0.39 0.45 0.4 0.42 0.05 -0.04 -0.58 -0.9
-2.78 -1.44 -1.1 -0.37 0.27 0.71 0.91 0.67 0.38 0.26 -0.39 -0.59
-0.93 -0.05 -0.42 -0.09 0.32 0.56 0.37 0.4 0.12 0.05 -0.53 -0.56
- - - 1.19 -0.27 0.42 1.69 1.3 -0.4 -1.5 -1.4 -1.45
-2.06 -1.45 -0.94 -0.09 0.69 1.07 0.8 0.84 -0.58 -0.09 -0.63 -1.2
-2.59 -1.63 -1.18 -0.16 0.38 0.71 0.88 0.7 0.31 0.11 -0.38 -0.57
-2.14 -0.81 -0.45 0.07 0.45 0.5 0.81 0.84 0.32 -0.31 -0.88 -1.01
-3.56 -1.62 -1.19 0.18 0.69 0.53 0.88 0.74 0.59 0.23 -1.46 -1.3
-2.12 -0.53 -1.02 -0.2 -0.31 -0.12 0.87 0.92 0.53 0.54 -0.64 -0.45
-0.64 0.02 -0.11 0.1 0.15 0.3 0.33 0.13 0.24 -0.14 -0.31 -0.39
-3.32 -1.73 -1.2 -0.46 0.26 0.55 0.9 0.95 0.24 0.26 -0.04 -0.7

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.