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Heatmap: Cluster_73 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.04 0.07 -0.35 0.12 0.21 -0.05 -0.07 0.02 0.09 0.09 -0.11 -0.05
-3.99 -0.49 -1.0 0.21 0.6 0.37 0.17 -0.08 0.26 0.48 0.09 0.04
-1.87 -0.35 -0.77 -0.37 0.74 0.65 -0.07 -0.18 -0.16 0.5 0.24 0.02
-0.08 -0.06 -0.27 -0.16 0.28 0.18 -0.15 0.04 -0.02 0.11 0.03 0.01
-0.34 0.07 -0.42 -0.01 0.41 0.2 -0.11 0.13 0.01 0.18 -0.12 -0.21
0.1 -0.09 -0.61 -0.08 0.26 0.02 -0.02 0.13 0.22 0.25 -0.13 -0.28
-0.59 -0.19 -0.98 -0.06 0.32 0.35 0.07 0.01 -0.34 0.12 0.3 0.38
-0.14 -0.06 -0.22 -0.17 0.23 0.19 -0.04 0.01 0.04 0.14 -0.08 0.02
-0.41 -0.09 -0.58 -0.08 0.34 0.15 0.1 0.18 0.03 0.32 -0.03 -0.2
-1.06 -0.44 -0.93 -0.06 0.57 0.41 0.17 0.1 0.28 0.53 -0.24 -0.37
-0.26 -0.09 -0.22 -0.09 0.24 0.06 -0.04 0.01 0.13 0.2 -0.06 0.04
-0.6 -0.02 -0.43 0.07 0.43 0.26 -0.03 -0.03 -0.12 0.21 -0.05 0.02
-0.34 -0.17 -0.59 -0.02 0.35 0.05 -0.05 0.23 0.1 0.29 -0.06 -0.05
-0.52 -0.27 -0.32 -0.41 -0.02 0.37 0.12 0.04 0.14 0.27 0.13 0.16
-0.38 -0.0 -0.09 -0.16 0.23 0.25 0.06 -0.07 0.06 0.16 -0.08 -0.09
-1.58 -0.38 -0.58 -0.03 0.62 0.33 -0.3 -0.44 -0.31 0.43 0.43 0.48
-0.42 -0.43 -0.67 -0.09 0.21 -0.08 -0.25 0.14 0.28 0.38 0.22 0.29
-0.37 -0.55 -0.83 -0.13 0.16 -0.08 0.18 0.03 0.42 0.47 -0.11 0.26
-0.87 -0.42 -1.35 -0.33 0.44 0.7 -0.44 -0.47 -0.39 0.68 0.44 0.44
-0.62 -0.17 -0.56 -0.07 0.27 0.17 -0.01 0.14 0.2 0.46 0.04 -0.23
-0.13 -0.17 -0.27 -0.27 0.03 0.15 0.13 0.06 0.09 0.21 0.11 -0.06
-0.27 -0.2 -0.5 -0.28 0.19 0.28 0.01 0.16 0.03 0.13 0.17 0.07
-0.25 -0.07 -0.12 0.1 0.17 0.05 -0.17 0.21 0.13 0.0 -0.01 -0.12
-0.75 -0.11 -0.86 0.42 0.54 0.26 -0.12 -0.07 0.09 0.41 -0.18 -0.35
-0.29 -0.11 -0.88 -0.42 0.37 0.34 -0.13 0.03 0.02 0.26 0.09 0.25
0.03 -0.16 -0.49 -0.3 0.13 0.12 0.12 -0.02 0.17 0.21 -0.12 0.14
-0.48 -0.01 -0.29 0.15 0.35 -0.02 -0.13 0.08 0.11 0.36 -0.11 -0.26
-0.16 -0.23 -0.2 -0.1 0.21 0.13 -0.05 0.13 -0.0 0.06 0.1 0.03
-0.95 -0.37 -0.46 0.13 0.26 -0.03 0.08 0.06 0.19 0.31 0.06 0.25
-0.02 -0.19 -0.4 -0.22 0.26 0.1 -0.17 0.06 -0.02 0.14 0.15 0.16
0.01 0.03 -0.44 -0.07 0.28 0.28 0.21 -0.19 -0.04 0.1 -0.23 -0.12
-0.7 -0.23 -0.43 0.13 0.08 -0.11 -0.11 0.08 0.1 0.45 0.12 0.27
-2.19 -0.43 -1.48 0.26 0.06 -0.09 0.47 -0.09 0.43 0.78 0.08 0.09
-2.73 -0.19 -1.8 0.07 1.04 0.3 -0.23 0.28 -0.27 0.65 -0.1 -0.07
-0.12 0.04 -0.02 0.14 0.43 -0.1 -0.25 -0.2 -0.24 0.16 0.02 -0.01
-0.74 -0.37 -0.32 0.0 0.05 -0.03 0.21 0.25 0.29 0.36 -0.1 0.05
-0.46 -0.21 -0.54 -0.14 0.38 0.42 0.05 -0.38 -0.05 0.29 -0.02 0.24
-0.73 -0.34 -0.55 0.04 0.52 0.28 0.11 0.01 -0.12 0.29 0.1 -0.09
-0.09 -0.12 -0.47 -0.29 0.32 0.34 0.07 -0.14 0.1 0.15 -0.16 0.09
-0.57 -0.37 -0.41 -0.46 0.0 0.25 0.29 0.13 0.25 0.3 0.06 0.14
-0.47 -0.28 -0.39 0.16 0.42 0.25 -0.18 -0.09 -0.03 0.13 0.1 0.11
-0.31 -0.25 -0.25 -0.23 0.14 0.17 0.04 0.07 0.01 0.24 0.2 0.03
-0.28 -0.03 -0.38 -0.13 0.12 -0.02 0.13 0.2 0.1 0.27 -0.05 -0.07
-0.44 -0.14 -0.19 -0.04 0.38 0.13 -0.05 0.04 -0.04 0.23 0.05 -0.1
-1.14 -0.37 -0.2 0.17 0.31 0.25 -0.04 0.1 -0.05 0.21 0.18 0.07
-2.24 -0.49 -0.56 -0.3 0.69 0.52 0.07 -0.3 -0.02 0.46 0.18 0.22
-0.17 -0.27 -0.54 -0.19 0.34 0.22 -0.03 0.07 0.12 0.27 -0.13 0.05
-1.42 -0.15 -0.75 -0.06 0.56 0.27 -0.45 -0.22 -0.13 0.52 0.48 0.22
-0.26 -0.22 -0.51 -0.11 0.22 0.24 0.03 0.03 0.22 0.4 -0.22 -0.08
-0.56 -0.31 -0.9 -0.28 0.42 0.57 0.05 -0.14 -0.28 0.32 0.1 0.31
-0.18 -0.21 -0.53 -0.35 -0.05 -0.04 0.28 0.02 0.35 0.4 -0.0 0.01
-0.75 -0.3 -0.93 -0.11 0.65 0.38 0.2 0.01 -0.31 0.21 0.06 0.15
-0.27 -0.49 -0.56 -0.0 0.23 0.16 -0.04 0.19 0.11 0.18 0.02 0.21
-0.08 0.07 -0.13 -0.16 0.18 0.12 0.05 0.05 -0.01 0.04 -0.04 -0.11
-0.13 0.06 -0.29 -0.09 0.2 0.03 -0.16 0.05 0.03 0.18 0.05 0.0
-0.3 -0.11 -0.82 -0.11 0.18 -0.13 0.2 -0.07 0.3 0.43 0.0 0.08
-1.1 -0.1 -0.38 0.25 0.59 0.21 0.26 -0.2 -0.19 0.56 -0.23 -0.48
-0.82 -0.08 -0.21 0.21 0.32 0.17 -0.18 -0.12 -0.22 0.14 0.14 0.3
-0.22 -0.01 -0.12 -0.02 0.29 0.15 -0.08 -0.14 0.0 0.15 -0.04 -0.03
-0.28 0.04 -0.12 0.1 0.23 0.1 -0.15 0.08 0.13 0.1 -0.18 -0.13
0.21 -0.04 -0.83 -0.21 0.01 0.12 0.09 0.23 0.07 0.17 -0.08 -0.0
-0.64 -0.23 -0.4 -0.22 0.37 0.47 -0.15 -0.16 0.02 0.37 0.08 0.08
-0.39 -0.08 0.02 -0.05 0.11 0.09 -0.03 0.26 0.13 -0.06 0.01 -0.09
-0.08 0.09 -0.4 0.11 0.38 -0.18 -0.34 -0.1 -0.02 0.27 0.05 0.02
-0.43 -0.82 -0.94 -0.2 -0.03 0.29 0.23 0.09 0.45 0.51 0.17 -0.08
-0.18 -0.11 -0.15 -0.2 0.21 -0.02 -0.13 -0.08 0.15 0.25 0.08 0.09
-0.35 0.06 -0.39 -0.3 0.45 0.12 -0.24 -0.05 0.07 0.46 0.07 -0.22
-0.22 0.1 -0.65 -0.17 0.53 -0.05 -0.19 -0.21 0.2 0.36 -0.12 0.07
-0.18 0.08 -0.24 -0.12 0.24 0.18 0.04 -0.15 -0.06 0.08 -0.14 0.17
0.02 -0.36 -1.13 -0.62 0.11 0.45 0.2 0.25 0.19 0.37 -0.03 -0.15
0.17 0.01 -0.58 -0.11 0.17 0.09 0.1 0.2 0.04 0.06 -0.12 -0.2
-0.08 -0.06 -0.32 0.16 0.25 -0.04 -0.27 -0.11 0.11 0.17 0.02 0.06
-0.3 -0.1 -0.62 -0.3 0.09 -0.07 0.06 0.11 0.3 0.36 0.05 0.13
-0.28 -0.24 -0.55 -0.09 0.21 -0.01 0.05 0.08 0.2 0.37 0.08 -0.05
-0.66 -0.59 -0.68 -0.48 0.39 0.35 0.04 -0.16 0.22 0.16 0.54 0.16
-0.45 -0.38 -0.29 -0.17 0.24 -0.02 0.08 0.12 0.1 0.38 0.12 0.03
-0.68 -0.13 -0.18 -0.07 0.22 0.27 0.01 0.07 0.12 0.25 -0.03 -0.08
-0.96 -0.87 -0.42 0.2 0.44 0.21 0.15 0.19 0.18 0.25 -0.13 0.07
-0.14 -0.63 -1.05 -0.44 0.21 0.31 0.06 0.16 0.2 0.2 0.32 0.16
-0.4 -0.08 -0.63 0.02 0.16 -0.36 0.38 -0.22 0.32 0.37 -0.12 0.16
-0.49 -0.19 -0.83 -0.37 0.17 0.3 0.05 -0.01 0.32 0.36 0.05 0.18
-0.98 -0.63 -0.79 -0.67 0.15 0.59 0.26 0.13 0.34 0.43 0.05 0.12

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.