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Heatmap: Cluster_95 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.7 0.22 -0.31 -0.67 -0.94 -0.94 -0.19 0.04 0.17 0.2 0.06 0.6
0.58 0.03 -0.38 -1.26 -1.48 -0.56 0.01 0.22 0.24 0.25 0.35 0.53
0.24 -0.18 -1.06 -0.92 -1.53 -2.01 -1.76 -0.7 0.01 0.75 1.16 1.32
0.1 0.02 -0.66 -1.35 -2.38 -2.41 -0.57 -0.0 0.02 0.99 0.8 1.08
-0.85 -0.31 -0.78 -1.29 -0.47 -0.91 -0.28 0.57 0.41 0.74 0.87 0.32
-0.61 -0.22 -0.76 -1.21 -0.5 -0.59 -0.09 0.41 0.52 0.59 0.6 0.45
-0.56 -0.8 -1.84 -1.95 -2.11 -2.12 -0.66 -0.27 0.57 1.03 1.14 1.35
-0.35 0.05 -0.31 -0.44 -0.16 -0.42 -0.36 0.24 0.05 0.44 0.49 0.32
0.09 -0.05 -0.15 -0.39 -0.73 -0.37 -0.03 -0.12 0.15 0.29 0.39 0.48
-0.55 0.05 -0.26 -0.46 -1.11 -0.51 -0.2 -0.81 0.7 0.7 0.39 0.63
-0.11 0.06 -0.67 -1.11 -0.53 -0.56 -0.45 -0.4 0.42 0.68 0.5 0.78
1.39 0.14 -1.47 -2.62 -4.67 -5.68 -4.32 -1.57 -0.47 0.67 1.23 1.41
1.23 0.25 -1.47 -2.6 -4.11 -7.38 -4.29 -1.63 -0.59 0.68 1.4 1.38
1.12 0.52 -2.12 -3.42 -3.31 - -4.19 -1.11 -0.57 0.24 1.61 1.34
-0.51 -0.66 -1.03 -0.74 -0.14 -0.56 -0.66 -0.58 -0.04 0.87 0.76 1.14
0.17 -0.04 -0.15 -0.42 -0.5 -0.28 -0.09 0.11 0.23 0.19 0.16 0.33
-0.14 -0.32 -0.57 -0.49 -0.47 -0.65 -0.08 0.12 0.59 0.76 0.35 0.06
-0.87 -1.8 -1.01 -0.74 -0.27 0.32 -1.02 0.46 0.68 0.54 0.27 0.9
0.09 -0.12 -0.43 -0.36 -0.3 -0.41 -0.28 0.0 -0.01 0.35 0.51 0.49
0.75 -0.23 -0.67 -2.59 -2.68 -1.16 -0.29 0.02 0.16 0.53 0.65 1.07
0.87 0.32 -1.83 -3.02 -3.33 -3.15 -1.85 -0.65 -0.0 0.68 1.11 1.4
0.31 -0.14 -0.97 -0.84 -1.22 -1.59 -1.38 -0.42 -0.4 1.15 1.1 0.82
0.61 -0.04 -0.49 -2.55 -3.67 -2.05 -0.67 0.13 0.28 0.65 0.89 0.96
0.93 -0.53 -1.52 -2.71 -3.04 -2.78 -0.94 0.24 0.55 0.97 0.76 0.88
0.37 -0.45 -1.11 -1.63 -1.45 -0.98 -0.65 -0.24 0.01 0.78 1.02 1.06
0.4 -0.24 -1.28 -1.25 -1.73 -1.13 -0.77 -0.24 0.26 0.77 1.03 0.89
0.06 -0.07 -0.39 -0.28 -0.33 -0.5 -0.26 0.05 0.17 0.39 0.33 0.44
0.35 0.25 -0.75 -0.79 -0.58 -1.4 -1.22 0.07 -0.1 0.57 0.86 0.67
0.37 0.18 -0.84 -0.62 -0.71 -1.34 -1.04 -0.08 0.16 0.63 0.66 0.75
-0.43 -1.06 -1.84 -1.78 -1.5 -1.22 -0.68 -0.0 0.02 1.01 1.33 1.18
0.39 0.1 -2.1 -2.72 -1.91 -0.83 -0.65 -0.21 0.64 0.7 0.85 0.94
0.35 0.05 -0.27 -0.6 -1.07 -0.43 -0.26 -0.24 -0.03 0.43 0.42 0.7
0.77 -0.52 -2.34 -2.91 -2.84 -1.73 -0.09 0.03 0.68 0.96 0.66 0.8
0.34 0.11 -0.38 -0.72 -0.81 -1.13 -0.08 -0.0 0.4 0.54 0.31 0.38
0.05 -0.03 -0.96 -0.93 -1.34 -2.11 -1.25 -0.47 0.0 0.89 0.99 1.23
0.58 0.08 -0.42 -1.18 -1.64 -1.2 -0.39 0.08 0.34 0.41 0.55 0.7
0.29 0.08 -0.64 -0.63 -0.34 -0.78 -0.45 -0.14 0.2 0.46 0.38 0.67
0.35 -0.08 -0.62 -0.7 -0.7 -0.66 -0.39 -0.15 0.14 0.55 0.49 0.71
0.14 0.01 -0.22 -0.49 -0.81 -0.54 -0.41 0.28 0.27 0.52 0.49 0.07
0.37 -0.17 -0.16 -1.07 -1.33 -1.22 -0.18 0.17 0.36 0.37 0.56 0.66
0.5 0.06 -0.31 -0.78 -0.71 -0.54 -0.49 -0.33 -0.04 0.26 0.51 0.81
0.01 -0.02 -0.93 -0.98 -1.79 -1.4 -0.44 -0.05 0.63 0.98 0.55 0.69
-0.07 0.25 -0.6 -0.9 -0.97 -1.99 -0.7 0.11 0.35 0.55 0.87 0.71
0.17 -0.11 -0.98 -0.58 -0.99 -1.95 -0.64 0.36 0.31 0.69 0.67 0.71
-1.07 0.05 -0.18 -0.55 -0.47 -0.29 -0.05 -0.28 0.33 0.56 0.43 0.61
0.09 -0.07 -0.83 -1.46 -1.38 -1.53 -1.09 -0.86 -0.15 0.91 0.82 1.46
-0.44 0.14 -0.92 -0.9 -0.68 -0.43 -0.38 -0.22 0.19 0.89 0.61 0.66
0.5 0.07 -0.1 -1.2 -1.7 -1.39 -0.52 0.06 0.2 0.59 0.58 0.67
0.54 0.3 -0.55 -1.51 -1.45 -0.88 -0.28 0.14 0.39 0.61 0.32 0.46
-0.09 0.23 -0.21 -0.64 -0.96 -1.36 -0.72 -0.19 0.31 0.46 0.68 0.83
-0.36 0.03 -0.28 -0.89 -1.38 -1.21 -0.79 -0.35 0.05 0.8 0.97 0.94
0.42 -0.08 -0.45 -1.14 -0.58 -0.34 -0.26 0.12 0.0 0.48 0.41 0.5
0.79 0.03 -1.42 -1.18 -2.37 -3.35 -1.52 -0.08 0.49 1.02 0.76 0.79
0.1 -0.14 -0.45 -1.02 -1.21 -0.49 -0.18 -0.25 0.22 0.6 0.59 0.81
-0.51 -0.12 -0.2 -0.5 -0.38 -0.06 -0.26 -0.08 0.3 0.43 0.32 0.55
-0.01 -0.06 -0.3 -0.63 -0.5 -0.29 -0.12 -0.05 -0.0 0.43 0.45 0.55
0.42 0.09 -0.29 -0.33 -0.24 -0.58 -0.43 0.06 0.02 0.28 0.31 0.28
0.29 -0.05 -0.25 -0.67 -0.43 -0.32 -0.27 -0.42 0.02 0.32 0.39 0.72
0.33 0.28 -0.21 -0.87 -1.49 -0.94 -0.25 -0.11 0.16 0.41 0.49 0.7
0.0 -0.11 -0.99 -0.25 -0.01 -0.58 -0.52 -0.19 -0.15 0.56 0.55 0.72
1.08 0.5 -0.98 -1.95 -1.74 -1.48 -0.82 -0.35 0.3 0.61 0.38 0.71
0.8 0.41 -0.48 -1.58 -2.89 -3.75 -2.24 -0.67 -0.27 0.65 1.1 1.19
0.54 0.31 -0.22 -0.93 -0.38 -0.32 -0.33 -0.25 0.08 0.26 0.29 0.3
0.1 -0.11 -0.42 -0.63 -0.45 -1.16 -0.29 0.22 0.12 0.74 0.34 0.52
0.83 0.4 -0.3 -2.09 -3.61 -4.24 -2.65 -0.5 0.13 0.79 0.93 1.09
1.01 0.22 -0.45 -1.82 -2.77 -2.93 -1.26 0.09 0.27 0.67 0.69 0.7
-0.24 -0.01 -0.24 -0.42 -0.38 -0.45 -0.25 0.15 0.29 0.48 0.36 0.28
0.03 -0.12 -0.52 -0.62 -0.35 -0.32 -0.42 -0.28 -0.05 0.5 0.58 0.76
0.23 0.01 -0.04 -0.58 -0.88 -0.54 -0.23 -0.09 0.18 0.29 0.43 0.53
0.9 -0.2 -0.83 -2.78 -2.73 -1.21 -0.38 -0.03 0.12 0.46 0.76 1.04
0.85 0.17 -0.39 -1.13 -1.53 -1.99 -1.1 -0.18 0.18 0.62 0.64 0.74
0.17 -0.06 -0.74 -0.5 -0.96 -1.29 -0.94 -0.25 -0.01 0.67 0.66 1.11
1.02 -0.03 -0.18 -1.87 -2.15 -1.34 -0.54 0.05 0.07 0.49 0.53 0.67
-0.21 -0.34 -0.65 -0.5 -0.29 -0.35 -0.36 -0.25 -0.02 0.43 0.66 0.9
0.4 0.09 -0.11 -0.56 -0.78 -0.56 -0.19 -0.08 0.18 0.24 0.24 0.52
0.47 0.12 -0.15 -1.08 -1.56 -1.13 -0.63 -0.01 0.29 0.48 0.58 0.68
-0.03 -0.28 -0.91 -0.68 -0.29 -0.18 -0.43 -0.01 0.06 0.4 0.61 0.78
-0.27 -0.32 -0.86 -0.75 -0.07 -0.29 -0.56 0.15 -0.14 0.41 0.73 0.82
-0.15 -0.13 -1.43 -0.99 -1.75 -1.48 -0.51 0.39 0.6 0.73 0.88 0.71
0.46 0.13 -0.22 -0.71 -1.18 -1.16 -0.66 -0.17 0.1 0.4 0.58 0.82
0.08 -0.1 -0.52 -1.11 -1.1 -0.57 -0.23 0.16 0.23 0.53 0.62 0.67
0.54 0.44 -0.37 -1.47 -1.28 -1.13 -0.71 -0.3 -0.08 0.49 0.6 0.92
0.52 -0.62 -1.73 -1.12 -0.56 -0.58 -0.26 -0.36 0.23 0.69 0.62 0.91
0.7 0.12 -0.42 -1.3 -1.54 -1.23 -0.63 -0.1 0.13 0.39 0.63 0.88
0.78 -0.03 -0.56 -1.22 -1.16 -1.04 -0.19 0.13 0.24 0.5 0.38 0.49
0.29 0.07 -0.56 -1.6 -1.13 -0.5 0.16 0.37 0.65 0.5 0.16 0.05
-1.02 -0.36 -0.45 -1.09 -0.37 -0.54 0.04 0.3 0.55 0.55 0.61 0.44
0.57 0.06 -0.39 -1.18 -1.44 -1.18 -0.54 -0.06 0.14 0.45 0.62 0.85
0.92 0.12 -0.49 -0.84 -0.94 -1.42 -0.6 -0.27 0.23 0.22 0.31 0.84
0.73 0.07 -0.14 -1.08 -2.34 -2.37 -1.17 -0.02 0.17 0.72 0.68 0.78
-0.05 0.08 -0.55 -0.56 -0.53 -0.38 -0.24 0.15 0.21 0.48 0.35 0.46
-0.12 -0.35 -0.99 -1.48 -0.62 -0.57 -0.25 -0.02 0.19 0.75 0.83 0.76
0.31 0.27 -0.76 -0.68 -0.51 -0.56 -0.52 -0.19 -0.04 0.62 0.56 0.48
0.39 -0.11 -0.92 -0.52 -0.34 -0.64 -0.23 -0.05 0.38 0.41 0.33 0.48
0.02 0.22 -0.8 -0.92 -0.91 -1.05 -0.41 -0.05 0.15 0.78 0.74 0.58
1.07 0.47 -0.5 -1.82 -3.06 -3.44 -1.75 -0.31 0.05 0.49 0.81 1.02
0.04 -0.36 -0.87 -0.78 -0.35 -0.78 -0.69 -0.03 -0.33 0.46 1.01 0.94
0.03 0.06 -0.73 -0.64 -0.61 -0.82 -0.51 -0.23 -0.0 0.49 0.71 0.91
0.19 -0.41 -1.37 -1.54 -1.25 -1.03 -0.21 0.12 0.36 0.7 0.8 0.9
-0.3 0.07 -0.57 -0.49 -0.61 -0.71 -0.23 -0.0 0.04 0.75 0.38 0.7
0.41 0.05 -0.27 -0.62 -0.52 -0.61 -0.29 0.03 0.14 0.32 0.22 0.54
0.48 0.05 -0.29 -0.59 -0.66 -0.41 -0.23 -0.19 0.11 0.25 0.38 0.49
-0.57 -0.39 -1.09 -0.98 -0.4 -0.63 -0.46 -0.16 0.09 0.83 0.75 1.02
0.59 -0.21 -0.83 -1.73 -1.91 -1.3 -0.6 -0.07 0.17 0.55 0.88 1.04
0.36 0.18 -0.18 -0.88 -0.94 -0.6 -0.32 -0.15 0.03 0.35 0.42 0.71
0.29 -0.24 -0.66 -1.29 -2.02 -2.02 -1.12 -0.02 0.35 0.77 1.0 0.98
0.24 0.07 -0.8 -1.11 -2.28 -2.94 -1.26 -0.1 0.34 0.83 1.02 0.98
-0.23 -0.45 -0.79 -0.63 -1.03 -0.73 0.09 0.16 0.48 0.53 0.47 0.75
-0.15 -0.23 -0.21 -0.27 -0.27 -0.19 -0.14 0.03 0.34 0.44 0.26 0.12
-0.52 -0.88 -1.5 -1.49 -1.1 -0.98 -0.59 -0.28 0.04 1.05 1.11 1.23
-0.07 -0.18 -0.36 -0.89 -0.81 -0.97 -0.87 -0.04 0.16 0.68 0.88 0.76
-0.23 -0.01 -0.5 -0.72 -0.64 -1.19 -1.07 -0.05 -0.13 0.76 1.05 0.73
-0.46 -1.18 -1.49 -0.85 -0.43 0.14 -0.63 0.3 0.51 1.04 0.34 0.54
0.13 -0.03 -0.4 -1.12 -0.91 -0.44 -0.31 0.27 0.24 0.51 0.63 0.34
0.75 -0.31 -1.15 -3.38 -3.15 -1.69 -0.43 0.01 0.29 0.68 0.85 1.12
-0.21 -0.49 -2.41 -4.84 - -5.79 -3.74 -1.86 0.06 1.55 1.57 1.52
-0.11 -0.06 -0.46 -0.57 -0.47 -0.55 -0.47 0.27 0.21 0.45 0.52 0.51
-0.72 -1.28 -1.12 -1.12 -2.84 -4.1 -2.95 -0.48 0.43 1.35 1.37 1.34
-0.76 -1.73 -1.29 -1.0 -2.05 -3.63 -3.28 -0.29 -0.05 1.38 1.48 1.38
0.02 -0.13 -0.18 -0.33 -0.31 -0.36 -0.3 -0.09 0.04 0.33 0.47 0.48
-0.19 -0.35 -0.99 -0.59 -0.04 -0.51 -0.68 -0.12 -0.05 0.51 0.79 0.87
-0.28 -0.64 -2.19 -1.07 -0.57 -0.57 -0.49 -0.55 -0.26 0.93 1.06 1.18
-0.25 -0.77 -2.03 -0.8 -0.13 -0.67 -0.27 -0.3 -0.43 0.72 1.05 1.08
-0.72 -0.69 -1.48 -0.9 -0.65 -0.9 -0.52 -0.37 0.04 0.79 0.92 1.37
0.16 0.0 -0.44 -0.74 -1.6 -1.35 -0.53 -0.34 0.16 0.65 0.64 1.07
0.73 -0.05 -0.44 -1.55 -1.61 -1.48 -0.51 0.11 0.35 0.61 0.64 0.56
0.48 0.13 -0.52 -0.73 -0.49 -0.55 -0.52 -0.44 0.13 0.47 0.38 0.68

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.