Heatmap: Cluster_20 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.27 0.49 0.42 0.26 0.37 0.31 0.6 0.55 0.3 0.34 0.86 0.27
0.91 3.13 0.97 0.13 0.15 0.96 0.13 3.21 1.26 0.33 0.47 1.07
0.0 0.03 0.09 0.04 0.07 0.34 0.16 0.12 0.18 0.15 0.25 0.05
0.07 0.16 0.05 0.05 0.0 0.1 0.05 0.0 0.14 0.04 0.29 0.23
1.16 2.3 1.46 1.23 1.2 0.75 1.12 1.6 1.44 1.77 1.63 2.3
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0 0.04
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04
2.46 4.95 3.61 5.2 6.17 3.97 3.04 2.8 4.65 6.05 4.99 7.33
0.31 0.28 0.03 0.24 0.11 0.38 0.2 0.08 0.16 0.15 0.39 0.48
0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04
0.35 0.67 0.11 0.2 0.27 0.11 0.21 0.34 0.15 0.26 0.28 0.46
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.86 0.04 0.47 0.0 0.0 0.49 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.06 0.02 0.02 0.0 0.02 0.06 0.08 0.2
0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.1 0.04
0.0 0.0 0.03 0.02 0.02 0.0 0.03 0.0 0.05 0.02 0.11 0.04
0.03 0.04 0.0 0.0 0.06 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.24 0.09 0.04 0.33 0.09 0.13 0.26 0.57 0.38 0.09 0.79
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.04 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.09
0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04
0.41 0.59 0.32 1.06 1.1 1.06 0.75 1.65 1.84 1.12 1.39 1.27
0.86 1.61 1.11 0.55 0.39 0.45 0.95 0.74 0.98 1.18 1.1 1.43
0.79 0.79 0.49 0.09 0.4 0.45 0.82 2.15 3.14 2.89 3.47 3.61
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.07 0.04 0.11 0.15 0.04 0.16 0.03 0.0 0.02 0.02 0.04 0.24
0.0 0.12 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.02 0.02 0.02 0.02 0.04 0.04
0.0 0.13 0.0 0.0 0.04 0.02 0.0 0.06 0.0 0.06 0.04 0.09
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04
0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.13 0.05
15.94 16.75 13.25 13.72 13.23 13.74 14.56 14.91 14.58 16.23 17.31 16.81
0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.09 0.0 0.06 0.04 0.0 0.17 0.04
0.0 0.0 0.02 0.0 0.04 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.04 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.47 0.56 0.38 0.63 0.89 0.42 0.62 1.02 0.48 0.38 0.55 0.44
0.03 0.3 0.03 0.15 0.07 0.17 0.11 0.02 0.22 0.33 0.21 0.37
6.36 8.56 7.6 9.26 10.56 8.05 10.44 7.89 11.84 12.14 10.14 12.67
0.3 0.56 0.07 0.09 0.34 0.32 0.2 0.13 0.02 0.23 0.36 0.06
0.11 0.18 0.15 0.22 0.07 0.25 0.25 0.19 0.2 0.1 0.11 0.24
0.03 0.19 0.1 0.06 0.0 0.04 0.08 0.03 0.02 0.04 0.08 0.22
0.21 0.04 0.03 0.07 0.09 0.0 0.15 0.14 0.53 0.48 0.3 0.82
0.07 0.2 0.0 0.02 0.0 0.07 0.11 0.03 0.0 0.08 0.04 0.11
2.82 2.92 1.93 2.76 2.6 2.8 2.41 3.66 3.61 3.59 3.42 3.38
0.1 0.35 0.19 0.13 0.17 0.04 0.29 0.19 0.24 0.25 0.17 0.34
0.4 0.41 0.36 0.3 0.07 0.58 0.3 0.23 0.29 0.2 0.06 0.45
0.07 0.04 0.0 0.09 0.04 0.09 0.05 0.2 0.0 0.04 0.25 0.05
0.07 0.02 0.05 0.04 0.02 0.12 0.0 0.06 0.04 0.06 0.11 0.04
0.0 0.42 0.22 0.09 0.09 0.02 0.03 0.07 0.23 0.17 0.25 0.17
1.02 1.04 0.81 1.22 0.39 1.39 1.56 0.39 1.32 1.06 1.37 0.65
0.03 0.0 0.13 0.04 0.04 0.11 0.0 0.02 0.08 0.02 0.04 0.3
1.93 2.83 1.64 1.76 0.69 0.86 1.25 1.88 1.73 1.46 2.24 2.14
1.0 0.25 0.53 0.33 0.09 0.41 0.63 0.98 0.6 0.21 0.51 0.15
0.14 0.43 0.18 0.31 0.12 0.24 0.18 0.2 0.11 0.25 0.27 0.54
9.62 11.37 5.7 10.01 10.31 9.85 9.93 9.08 11.7 13.91 10.88 15.19
0.3 0.58 0.51 0.43 0.34 0.58 0.38 0.11 0.66 0.25 0.28 0.34
0.0 0.13 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.04 0.04
0.0 0.02 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.1 0.23 0.17 0.29
0.2 0.48 0.17 0.27 0.05 0.11 0.19 0.1 0.19 0.19 0.4 0.46
0.03 0.27 0.05 0.0 0.13 0.1 0.0 0.15 0.02 0.1 0.25 0.3
1.21 1.53 0.92 1.11 0.91 0.97 1.38 1.14 1.48 1.6 1.81 1.75
0.52 0.51 0.27 0.47 0.06 0.26 0.02 0.27 0.14 0.17 0.32 0.46
0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02
0.0 0.05 0.0 0.06 0.02 0.05 0.13 0.0 0.0 0.02 0.13 0.0
0.49 0.5 0.29 0.44 0.35 0.36 0.46 0.51 0.33 0.46 0.66 0.38
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.09 0.07 0.04 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.04 0.17
0.0 0.05 0.0 0.09 0.05 0.38 0.16 0.1 0.09 0.19 0.13 0.13
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02
0.03 0.0 0.02 0.11 0.12 0.08 0.0 0.21 0.0 0.11 0.46 0.2
0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.04 0.0 0.03 0.0 0.0 0.06 0.02
0.0 0.07 0.02 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.02
0.11 0.02 0.0 0.0 0.05 0.02 0.05 0.14 0.02 0.0 0.06 0.02
0.0 0.04 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.07
72.69 69.48 64.58 68.41 74.73 80.99 71.43 75.0 77.93 74.5 80.41 82.43
0.13 0.32 0.08 0.18 0.55 0.04 0.04 0.24 0.0 0.04 0.08 0.05
0.07 0.04 0.0 0.0 0.12 0.11 0.13 0.07 0.18 0.08 0.27 0.27
0.21 0.13 0.19 0.09 0.16 0.11 0.22 0.25 0.11 0.13 0.17 0.13
0.0 0.43 0.32 0.13 0.24 0.34 0.18 0.15 0.41 0.31 0.47 0.44
0.0 0.0 0.03 0.04 0.0 0.04 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.09
0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.12 0.0 0.07 0.0 0.0 0.06 0.0
0.71 1.47 1.04 0.94 1.03 1.84 0.68 0.77 1.43 1.62 1.99 1.9
0.0 0.17 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.05 0.04 0.15 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02
0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.04 0.06
0.0 0.19 0.09 0.04 0.22 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.1 0.04
0.1 0.05 0.03 0.04 0.0 0.09 0.03 0.18 0.05 0.04 0.0 0.22
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04
0.1 0.32 0.15 0.28 0.21 0.07 0.07 0.04 0.04 0.08 0.24 0.16
0.03 0.04 0.02 0.11 0.07 0.07 0.05 0.18 0.11 0.12 0.17 0.15
0.21 0.0 0.13 0.07 0.24 0.28 0.3 0.94 0.32 0.52 0.92 0.7
0.32 0.0 0.0 0.38 0.17 0.16 0.31 0.0 0.55 0.93 0.08 0.97
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.0 0.11 0.02
0.44 0.77 0.43 0.55 0.15 0.36 0.25 0.44 0.37 0.42 0.36 0.35
0.0 0.07 0.07 0.02 0.02 0.0 0.02 0.0 0.04 0.08 0.09 0.07
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.08 0.0 0.05 0.04 0.14 0.15 0.04 0.04 0.25 0.05
0.0 0.03 0.02 0.04 0.0 0.11 0.0 0.07 0.04 0.06 0.08 0.02
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.04 0.0
0.0 0.0 0.1 0.09 0.05 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.15 0.0
0.0 0.09 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.04
2.66 2.93 2.93 2.66 3.01 3.42 3.0 2.51 2.97 2.99 3.09 3.85
0.04 0.03 0.0 0.0 0.02 0.02 0.07 0.11 0.02 0.0 0.11 0.05
0.0 0.02 0.0 0.0 0.09 0.0 0.02 0.02 0.02 0.02 0.04 0.07
0.0 0.11 0.0 0.02 0.13 0.06 0.04 0.11 0.19 0.0 0.21 0.38
0.04 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.04
0.0 0.07 0.0 0.04 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.09
0.0 0.19 0.03 0.09 0.08 0.08 0.07 0.05 0.05 0.02 0.04 0.11
0.07 0.17 0.03 0.04 0.0 0.0 0.0 0.09 0.09 0.04 0.08 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)