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Heatmap: Cluster_97 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-2.02 -0.9 -0.55 -0.16 0.09 0.47 0.38 -0.11 0.27 0.34 0.34 0.28
-0.55 -0.56 -0.54 -0.61 -0.12 0.33 0.33 0.16 0.14 0.37 0.21 0.24
-0.28 -0.15 0.01 -0.19 -0.15 0.05 0.01 0.09 0.18 0.08 0.18 0.08
-0.03 -0.13 -0.3 -0.51 -0.02 0.18 0.22 0.3 0.21 0.16 -0.05 -0.24
0.37 -0.44 -1.15 -1.6 -0.4 0.31 0.57 0.46 0.43 0.39 -0.23 -0.27
-2.89 -1.23 -2.52 -1.65 -0.38 0.88 0.87 0.35 0.29 0.77 0.51 -0.18
-5.84 -4.12 -2.6 -0.95 0.83 1.55 0.73 0.49 0.1 0.09 -0.26 -1.01
-0.22 -0.55 -0.46 -0.17 0.15 0.3 0.39 0.29 0.13 -0.1 -0.04 -0.05
0.0 -0.33 -0.39 -0.32 0.06 0.4 0.45 0.08 0.06 0.04 -0.12 -0.23
-0.14 -0.26 -0.35 -0.53 -0.07 0.38 0.28 0.22 0.11 0.15 0.03 -0.09
-0.5 -0.57 -0.78 -0.74 -0.32 0.44 0.39 0.24 0.29 0.46 0.04 0.21
-0.88 -1.03 -0.92 -0.38 0.07 0.73 0.75 0.4 0.43 -0.12 -0.27 -0.2
-0.84 -1.17 -0.07 -1.46 -0.43 -0.04 -0.21 0.18 1.1 0.53 0.33 0.17
-2.1 0.04 -0.09 -0.74 -0.34 0.02 0.15 0.06 0.44 0.39 0.54 0.17
-0.93 -0.31 -0.49 -0.19 0.1 0.32 0.18 0.21 0.16 0.2 0.14 0.14
-0.36 -0.22 -0.63 -0.71 -0.21 0.24 0.2 0.23 0.34 0.31 0.29 0.02
-0.22 -0.63 -1.18 -0.89 -0.81 0.19 0.44 0.44 0.44 0.41 0.16 0.36
-0.39 0.2 -0.15 -0.14 0.08 0.3 0.32 0.16 0.21 -0.03 -0.44 -0.41
-0.02 -0.31 -0.44 -0.34 -0.08 0.22 0.3 0.35 0.27 0.05 -0.09 -0.18
-0.26 -0.17 -0.44 -0.49 -0.1 0.2 0.01 0.19 0.29 0.18 0.12 0.21
-7.03 -5.62 -4.57 -3.61 -0.63 0.99 0.78 0.84 0.36 0.7 0.76 0.13
-4.16 -2.73 -2.1 -2.05 -0.16 1.19 1.01 0.47 0.41 0.34 0.26 -0.07
-0.48 -0.2 -0.84 -1.0 -0.29 -0.12 -0.05 0.12 0.72 0.5 0.38 0.26
-0.17 -0.36 -1.11 -0.64 -0.23 0.27 -0.03 0.43 0.43 0.33 0.1 0.22
-1.57 -2.65 -2.35 -1.8 -0.57 0.8 0.62 0.49 0.48 0.69 0.46 0.35
-1.93 -2.14 -1.99 -1.69 -0.95 0.97 0.88 0.18 0.94 0.5 0.09 0.14
-0.38 -0.14 -0.5 -0.48 0.24 0.46 0.37 0.23 0.01 0.16 -0.19 -0.19
-5.43 -2.75 -1.46 -0.77 0.03 1.33 0.85 0.49 0.2 0.23 0.24 -0.67
-1.24 -1.74 -1.6 -1.13 -0.75 0.53 0.58 0.6 0.68 0.36 0.19 0.51
-2.83 -3.84 -1.19 -1.37 -0.05 1.41 1.03 0.21 0.73 0.15 -0.2 -0.98
-1.64 -0.51 -0.32 -0.34 0.29 1.2 0.57 0.13 -0.18 -0.28 -0.33 -0.35
-0.53 -0.44 -0.98 -0.64 -0.15 0.31 0.34 0.26 0.32 0.42 0.1 0.22
-1.29 0.01 -0.01 -0.58 0.13 0.26 0.06 0.17 0.28 0.11 0.23 -0.04
-0.41 -0.36 -0.14 -0.2 0.14 0.46 0.13 0.14 0.13 0.22 -0.2 -0.17
-2.45 -1.81 -1.17 -0.74 0.32 1.4 0.98 0.33 0.12 0.02 -0.43 -0.92
-0.48 -0.14 -0.38 -0.51 -0.04 0.53 0.63 0.29 0.42 -0.05 -0.5 -0.51
0.06 0.02 -0.66 -0.31 -0.16 0.2 0.53 0.25 0.39 0.03 -0.59 -0.27
-0.08 -0.13 -0.43 -0.68 -0.26 0.02 0.31 0.34 0.28 0.24 0.05 -0.02
0.43 0.15 -1.76 -1.46 -0.01 0.75 0.68 0.13 0.24 -0.06 -0.49 -0.59
-0.53 -0.72 -0.75 -0.95 -0.09 0.7 0.66 0.34 0.3 0.24 -0.1 -0.25
-3.44 -1.92 0.6 -0.72 -0.19 0.92 1.09 0.21 1.21 -1.07 -4.23 -0.69
-0.19 -0.36 -0.25 -0.21 -0.17 0.03 0.1 0.17 0.31 0.24 0.11 0.05
-0.07 -0.15 -0.19 -0.5 0.09 0.26 0.18 0.33 0.24 0.08 -0.2 -0.33
- -2.95 - -1.42 -0.12 1.6 1.15 -0.49 0.09 0.98 -0.17 -0.53
-1.39 -3.51 -2.1 -1.13 -0.31 0.11 0.93 0.46 0.82 0.43 0.13 0.55
-0.31 -1.08 -1.15 -0.78 -0.14 0.92 0.77 0.71 0.23 -0.02 -0.32 -0.77
-0.36 -0.53 -0.59 -0.26 0.17 0.66 0.46 0.23 0.05 -0.13 -0.1 -0.17
-0.05 0.01 -0.92 -0.74 -0.22 0.64 0.48 0.35 0.06 -0.15 -0.27 0.05
-4.08 -1.39 -0.92 -1.02 -0.35 0.32 0.68 0.45 0.78 0.54 0.04 0.42
-0.03 -0.33 -0.14 -0.13 0.05 0.34 0.28 0.19 0.04 -0.12 -0.12 -0.18
-0.13 -0.2 -0.43 -0.28 -0.19 0.14 0.19 0.36 0.26 0.16 0.03 -0.12
0.1 -0.3 -0.52 -1.1 -0.17 0.32 0.17 0.28 0.3 0.35 0.04 -0.08
-2.0 -1.19 -0.87 -0.49 0.02 0.81 0.81 0.26 0.39 0.15 -0.22 0.1
-0.65 -0.31 -0.36 -0.38 0.06 0.22 0.17 0.3 0.21 0.21 0.06 0.13
-0.25 -0.4 -0.34 -0.54 0.14 0.41 0.27 0.43 0.26 0.08 -0.09 -0.42
-0.25 -0.3 -0.51 -0.45 -0.17 0.21 0.28 0.18 0.19 0.28 0.17 0.05
-0.85 -0.03 0.06 -0.47 -0.23 0.14 0.16 0.2 0.2 0.24 0.2 0.0
-0.08 -0.5 -0.7 -0.45 -0.27 0.2 0.26 0.49 0.39 0.26 -0.02 -0.11
-0.21 -0.13 0.04 -0.33 0.04 0.21 0.13 0.14 0.24 0.0 -0.05 -0.19
-1.36 -0.02 -0.11 -0.27 -0.08 0.57 -0.27 0.13 0.04 0.22 0.15 0.28
-1.08 -0.31 -0.31 -0.28 0.28 0.52 -0.09 -0.05 0.05 0.32 0.12 0.22
-1.07 -0.74 -0.62 -0.47 0.15 0.5 0.4 0.21 0.13 0.3 0.16 0.15
-0.62 -1.17 -1.47 -1.11 0.04 0.66 0.44 0.42 0.22 0.41 0.21 0.18
0.12 -0.03 -0.31 -0.64 -0.01 0.41 0.28 0.23 0.18 0.03 -0.22 -0.39
-0.66 -0.23 -0.82 -0.76 -0.21 0.37 0.44 0.38 0.27 0.26 0.1 0.11
- -4.7 -3.12 -1.04 0.62 1.62 1.51 0.22 0.29 -0.53 -1.34 -1.23
- -3.35 -3.73 -1.27 0.34 1.91 1.2 0.59 0.06 -0.54 -0.65 -2.27
0.04 0.04 -0.43 -0.74 -0.04 0.15 0.07 0.32 0.21 0.19 0.03 -0.14
-1.54 -1.23 -0.85 -0.99 0.41 0.93 0.72 0.28 0.2 0.33 -0.15 -0.39
-0.97 -0.48 -0.61 -0.32 -0.06 0.45 0.44 0.25 0.17 0.09 0.28 0.06
-0.08 -0.08 -0.83 -0.56 -0.08 0.51 0.51 0.4 0.41 -0.04 -0.32 -0.59
-0.03 -0.42 -0.52 -0.74 0.18 0.52 0.45 0.21 0.11 0.08 -0.16 -0.22
-0.4 -0.07 0.07 -0.5 -0.08 0.15 0.18 0.16 0.21 0.07 0.08 -0.04
-0.21 -0.32 -0.19 -0.66 -0.11 0.58 0.56 0.12 0.19 0.0 -0.25 -0.21
0.21 -0.08 -0.73 -0.61 -0.0 0.42 0.26 0.28 0.18 0.27 -0.28 -0.46
-0.15 -0.28 -0.23 -0.36 -0.24 0.3 0.57 -0.12 0.5 -0.07 -0.29 -0.05
-0.03 -0.3 -0.62 -0.2 0.04 0.4 0.45 0.1 0.45 -0.16 -0.39 -0.17
-0.54 -0.43 -0.47 -0.39 0.15 0.41 0.42 0.36 0.37 -0.03 -0.3 -0.09
-0.18 -0.74 -0.98 -1.23 -0.06 0.58 0.43 0.47 0.29 0.29 0.01 -0.1
0.07 -0.41 -0.74 -1.01 -0.21 0.46 0.15 0.31 0.33 0.31 0.02 -0.0
-0.06 -0.33 -0.3 -0.27 0.01 0.27 0.22 0.35 0.24 0.02 -0.06 -0.31

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.