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Heatmap: Cluster_40 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.43 0.15 -0.02 -0.15 -0.24 -0.07 -0.12 0.12 -0.15 -0.21 0.12 -0.02
-0.23 -0.49 -0.33 -0.41 -0.23 0.29 0.31 0.01 -0.02 0.16 0.27 0.33
-1.26 -0.89 -0.2 -0.68 -0.88 -0.16 -0.26 -0.19 0.46 0.33 0.81 1.01
- -0.5 -1.44 -0.48 -1.36 - -1.43 -0.41 -0.55 1.5 1.54 1.19
-0.46 -0.41 -0.19 -0.16 -0.62 -0.14 0.07 0.21 0.25 0.19 0.52 0.29
-0.65 0.17 0.24 -0.14 -0.26 -0.31 -0.22 0.01 0.2 0.3 0.31 0.04
-0.75 -0.54 -0.15 -0.81 -0.45 -0.12 -0.27 0.29 0.44 0.57 0.44 0.43
-0.4 -0.23 -0.17 -0.2 -0.15 -0.15 0.17 0.15 0.2 0.09 0.27 0.23
-0.31 -0.38 -0.49 -0.63 -0.14 -0.67 0.09 0.36 0.8 0.77 -0.06 -0.37
-0.47 0.31 0.06 -0.79 -1.46 -1.67 -0.79 -0.09 0.13 0.65 0.84 0.83
-0.31 -0.06 0.11 -0.01 -0.01 0.04 -0.07 -0.23 0.08 0.22 0.11 0.07
0.17 -0.3 -0.44 -1.9 -3.14 -2.83 0.04 0.18 0.13 0.79 1.13 0.7
- -2.51 -1.16 -0.85 -4.95 -1.92 -0.42 0.29 0.15 2.28 0.87 -0.39
- - -1.25 -1.15 - -3.14 -1.04 0.82 0.45 1.88 1.45 0.01
-0.84 -0.3 0.3 0.08 -0.16 -0.06 -0.05 -0.47 0.33 0.43 -0.0 0.25
0.15 -0.02 -0.15 -0.2 -0.29 -0.23 -0.41 -0.05 -0.05 0.16 0.43 0.39
0.17 -0.24 -0.1 -0.59 -0.33 -0.2 -0.21 0.0 0.25 0.33 0.4 0.19
-0.27 -0.03 -0.08 -0.26 -0.39 -0.41 -0.13 0.12 0.27 0.2 0.48 0.21
-0.09 0.23 0.1 0.1 -0.25 -0.18 -0.07 -0.06 0.21 0.08 -0.06 -0.11
0.71 -0.5 -0.42 -1.09 -0.76 - -2.18 -0.9 -0.79 0.15 1.62 1.22
-0.94 -0.79 -0.31 -0.33 -0.4 -0.14 -0.35 -0.19 0.42 0.62 0.78 0.47
-0.03 -0.44 0.07 -0.68 -1.33 -0.7 -0.03 0.22 0.32 0.39 0.46 0.59
0.38 0.26 -0.09 -0.5 -0.64 -0.51 -0.12 0.16 0.01 0.2 0.28 0.14
1.94 0.28 0.27 -2.36 - -0.61 -1.21 -0.87 -0.79 -1.38 0.82 0.25
0.28 - - -3.61 -3.67 -1.32 -1.56 -3.55 -0.47 0.42 1.39 2.36
0.18 -0.28 -0.29 -3.02 -2.03 -1.98 -1.07 0.47 0.48 0.85 0.87 0.77
0.21 -0.07 0.0 -1.25 -1.79 -1.34 -0.24 0.15 0.25 0.71 0.81 0.32
-0.27 -0.18 -0.22 -0.33 -0.89 -0.73 -0.47 -0.13 0.14 0.76 0.74 0.47
0.22 -0.14 -0.23 -0.4 -0.39 -0.25 -0.36 0.05 -0.01 0.11 0.61 0.37
-0.03 -0.01 -0.07 -0.03 -0.05 -0.05 -0.14 -0.07 -0.03 0.11 0.17 0.15
0.16 0.08 0.12 -0.36 -0.26 0.08 -0.14 -0.03 0.04 0.02 0.11 0.09
-0.07 -0.07 -0.2 -0.08 -0.26 -0.24 -0.02 0.1 0.17 0.32 0.17 0.07
-0.22 -0.18 -0.03 -0.5 -0.89 -0.59 -0.08 0.26 0.18 0.42 0.52 0.39
-0.19 -0.48 -0.41 -0.74 -0.68 -0.38 -0.07 0.01 0.19 0.37 0.61 0.8
-0.38 -0.01 0.32 -0.03 0.08 -0.02 0.02 0.13 0.13 0.02 -0.11 -0.29
0.95 -0.21 0.07 -0.79 -0.23 -0.39 -0.52 0.47 -0.66 0.16 0.33 -0.22
-1.31 0.16 -1.18 -0.54 0.07 -0.25 -0.01 0.07 0.11 0.75 0.11 0.65
-0.12 -0.26 -0.16 -0.24 -0.37 -0.32 0.06 0.18 0.12 0.18 0.35 0.34
-1.2 0.04 -0.19 -0.63 -3.51 -3.29 -1.38 -0.38 0.27 0.9 1.17 1.23
0.08 -0.01 0.03 -0.34 -0.58 -0.2 0.03 0.09 0.11 0.07 0.22 0.29
-2.55 -0.38 -0.25 0.54 -0.14 0.29 0.58 0.26 -0.08 -0.12 -0.18 0.24
-3.26 -0.18 0.3 -0.14 0.01 -0.14 0.02 0.14 0.37 0.49 -0.24 0.38
-0.13 -0.55 -0.48 -1.01 -0.68 0.03 0.15 0.24 0.24 0.23 0.48 0.58
0.21 -0.66 -1.47 -2.42 -1.4 -0.3 0.2 0.42 0.33 0.43 0.8 0.72
-0.68 -0.91 -0.11 -0.48 -1.81 -1.52 -0.5 -0.21 0.17 1.19 1.08 0.56
-1.66 0.62 0.39 -0.01 -0.34 -0.54 -0.39 -0.07 0.18 0.36 0.36 -0.1
-0.3 0.12 0.11 -0.1 -0.39 -0.62 -0.32 0.21 0.01 0.29 0.2 0.42
-0.33 -0.32 -0.02 -0.38 -0.57 -0.58 -0.29 0.18 0.24 0.53 0.53 0.36
-0.36 -0.26 -0.47 -0.15 -0.7 -0.45 -0.04 0.41 0.28 0.85 0.31 -0.22
0.38 -0.18 -0.3 -1.08 -0.94 -0.26 0.18 0.38 0.22 0.09 0.44 0.2
-0.25 -0.66 -0.49 -0.44 -0.55 -0.21 0.07 0.29 0.38 0.3 0.61 0.26
-0.7 -0.18 0.52 -0.09 -0.68 -0.61 -0.15 0.26 0.32 0.2 0.37 0.09
-0.1 -0.23 -0.34 -0.43 -0.18 0.04 -0.2 0.01 0.31 0.42 0.41 -0.02
-1.06 - 0.44 -0.8 -0.17 0.43 0.23 0.04 0.25 0.94 -0.84 0.57
-0.3 -0.53 -0.09 -0.44 -0.6 -0.47 0.09 0.17 0.31 0.29 0.53 0.43
-0.13 0.01 -0.1 -0.13 -0.54 -0.22 -0.12 0.09 0.08 0.29 0.33 0.21
-0.53 -0.08 -0.0 -0.08 -0.13 0.04 0.06 -0.08 0.18 0.27 0.31 -0.14
-1.02 -1.02 -0.89 -1.63 -3.16 -0.82 -0.62 -0.76 -0.11 0.39 1.46 1.7
0.07 -0.28 -0.14 -0.14 -0.25 -0.37 -0.46 0.12 -0.01 0.11 0.52 0.46
-0.59 -0.27 -0.0 -0.33 -0.57 -0.46 -0.22 0.09 0.32 0.41 0.57 0.41
-0.13 0.15 -0.41 -0.17 -0.42 -1.23 -0.9 -0.43 -0.16 0.61 0.72 0.86
-0.01 0.24 0.04 -0.79 -0.75 -0.49 -0.41 -0.12 0.08 0.39 0.6 0.44
-0.77 -0.16 0.08 0.33 0.06 -0.04 0.04 0.11 0.18 0.08 0.01 -0.17
-1.42 0.25 -0.19 -0.27 -1.14 -1.44 -0.59 0.08 -0.07 0.62 0.88 0.89
0.27 0.05 0.11 -0.28 -0.29 -0.3 -0.12 -0.02 0.06 -0.06 0.31 0.1
-0.37 -0.25 0.05 -0.39 -0.6 -0.03 0.11 -0.03 0.1 0.24 0.38 0.42
0.16 0.07 0.08 -0.41 -0.39 -0.29 -0.22 -0.04 0.14 0.18 0.26 0.24
-0.57 -0.3 0.19 -0.19 -0.47 -0.32 0.1 0.16 0.18 0.02 0.37 0.43
0.09 0.11 0.14 -0.21 -0.4 -0.32 -0.23 -0.1 0.03 0.18 0.24 0.28
0.17 -0.01 -0.05 -0.52 -0.65 -0.19 -0.07 0.11 0.12 0.17 0.38 0.21
-2.65 -0.84 -0.39 -1.91 -2.41 -2.66 -0.26 0.13 0.75 0.91 1.23 1.05
-0.0 -0.31 -0.16 -0.39 -0.69 -0.43 0.03 -0.12 0.16 0.52 0.48 0.36

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.