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Heatmap: Cluster_35 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.11 -0.02 0.07 -0.08 -0.09 0.28 0.08 0.15 -0.25 -0.13 -0.1 -0.1
-0.72 -1.69 -0.74 0.67 0.7 -0.06 0.43 -0.72 0.8 -0.17 0.25 -0.89
- -0.13 -0.54 -0.1 -0.6 0.79 -0.29 0.24 -0.12 0.25 0.14 0.89
1.47 -0.99 -0.11 -0.73 - 0.99 0.98 - -0.56 -0.7 - 0.96
-0.25 -0.02 -0.62 -0.52 -0.2 0.96 -0.25 0.44 0.21 -0.41 -0.08 -0.07
0.4 0.21 -0.52 -0.17 -0.16 -0.15 -0.21 0.17 0.33 -0.01 -0.23 0.06
-0.98 0.45 -0.12 0.97 -1.51 0.81 - - 0.18 0.55 0.93 -0.66
- 1.37 - - - 0.68 - 1.69 0.56 0.66 0.6 -
0.87 1.33 -0.01 0.01 -0.4 -3.22 -3.62 0.66 -1.23 -0.99 0.32 -0.08
- 0.87 - 0.63 -0.16 1.0 1.12 -1.62 0.65 -1.66 -1.71 0.05
0.09 1.29 -0.87 0.77 -0.75 0.28 0.91 -1.39 -2.18 -0.46 -0.64 -0.79
- - - - 3.58 - - - - - - -
- - -2.48 0.28 1.18 -0.15 -1.28 -0.29 0.94 1.12 0.65 -0.85
-1.27 0.42 -0.74 0.9 0.25 -0.04 -1.07 -0.05 0.59 -1.25 -0.21 0.47
-0.26 -0.31 -0.24 -0.15 -0.11 0.11 0.1 0.29 0.19 0.13 -0.07 0.15
0.74 0.16 0.02 1.61 - - 1.69 - -0.09 - - -0.01
1.08 - - - - 1.04 1.06 0.48 -0.59 -0.75 1.3 -0.68
-0.17 -0.17 -0.05 -0.33 -0.47 0.51 0.5 -0.35 0.14 0.16 0.16 -0.37
-1.34 0.02 -1.19 -0.36 0.07 -0.54 -0.06 0.64 0.71 0.76 -0.01 -0.33
-0.66 -0.37 -0.65 0.26 0.06 0.26 -0.16 0.21 0.01 0.24 0.32 0.03
- - - - 3.58 - - - - - - -
0.03 - - - -0.79 -0.67 0.91 1.55 - 0.85 0.86 0.42
- - - - - - - - - 1.99 3.01 -
-0.08 -0.13 -0.16 -0.36 -0.28 0.26 0.25 0.18 0.2 0.03 -0.07 0.0
0.1 -0.24 -0.32 -0.08 0.03 0.07 0.21 -0.13 0.13 0.09 -0.08 0.12
-1.64 -0.33 0.33 0.45 0.27 0.29 -0.35 0.7 0.38 -0.59 -0.54 -0.38
- - - 1.53 0.98 - 1.0 1.01 - -0.02 - 1.1
1.06 0.96 -0.19 -0.36 -1.7 -0.6 -2.54 0.67 -0.82 -0.9 0.32 0.3
-1.02 0.03 0.23 -0.15 -0.18 -0.39 0.26 -0.22 -0.0 0.12 0.28 0.49
-0.08 0.14 -0.28 0.07 -0.09 -0.04 -0.86 0.01 0.18 0.24 0.4 -0.03
- -0.5 -0.93 0.7 0.13 0.66 -1.19 0.28 0.06 0.64 0.2 0.1
- -0.4 0.22 - -1.02 0.04 1.57 - -1.05 0.42 1.18 0.6
- -2.14 -0.71 -0.85 -0.19 0.89 0.86 0.75 0.18 0.13 0.91 -1.87
-1.05 -0.21 -0.21 -0.02 -0.17 -0.06 0.21 -0.1 0.39 0.32 -0.04 0.41
- - - - 3.58 - - - - - - -
-1.37 -0.11 0.22 -1.94 0.86 0.7 -0.72 1.36 -0.13 -2.03 -1.99 0.3
-1.09 - -1.81 - -0.76 0.28 0.42 1.3 0.93 0.29 0.25 0.41
-0.28 0.08 -1.21 -1.13 0.12 0.38 0.49 -0.66 0.24 -0.05 0.56 0.24
-0.11 0.11 -0.36 0.07 0.14 0.09 0.24 0.09 0.23 -0.14 -0.17 -0.33
-0.31 -0.7 -1.89 - 1.04 1.0 0.2 - 0.43 -0.35 0.66 0.48
- 0.41 - 0.66 - 0.48 - 0.72 2.0 0.43 -0.51 -
0.23 0.32 -0.04 -0.03 -0.04 0.18 -0.26 -0.06 -0.12 -0.17 -0.18 0.05
-1.27 - -1.62 -1.77 0.64 -0.26 0.14 0.19 0.1 0.91 0.95 0.54
- -0.11 0.77 0.14 0.27 - 0.39 - 0.08 - 1.16 1.3
-0.31 -0.47 -0.27 -0.44 0.32 0.37 0.26 0.18 0.31 -0.03 0.43 -1.11
0.29 0.7 -0.65 1.0 0.75 - 0.62 -1.95 -0.0 -2.09 0.01 -0.32
0.14 -0.38 -0.41 0.09 -1.4 0.14 0.21 0.17 0.87 -0.5 0.07 -0.04
-0.82 0.48 -0.41 0.31 -0.41 0.29 -0.68 -0.44 0.14 -0.22 0.07 0.77
-2.33 -0.48 -1.11 -0.85 0.54 0.25 -0.68 0.38 0.53 0.26 0.15 0.8
- -2.05 0.31 0.88 -1.85 -1.5 - 1.34 1.18 0.22 -0.22 0.29
-0.36 1.32 -0.26 -0.37 0.37 0.59 -2.93 -0.1 -0.09 -0.19 -0.66 -0.3
0.35 0.27 0.5 -0.02 -0.13 0.06 -0.42 -0.07 0.06 -0.89 -0.07 -0.1
-0.9 -0.13 -0.29 0.04 0.6 0.62 0.15 -0.47 -0.13 0.1 -0.14 -0.11
-0.01 0.0 -0.47 -0.55 0.03 0.34 -0.06 -0.12 0.18 0.22 -0.12 0.28
0.25 -0.21 -0.3 -0.35 0.19 0.29 -0.01 -0.33 0.23 0.36 -0.27 -0.14
0.42 -0.12 0.03 -0.16 -0.14 0.02 -0.16 -0.0 0.11 0.01 -0.22 0.08
- 0.86 - 0.35 - 0.38 - 1.62 - - 1.33 1.01
-0.01 -0.4 -0.32 -0.14 -0.08 0.03 0.34 0.04 0.2 0.12 -0.1 0.15
-0.01 -0.09 0.02 -0.07 -0.05 0.05 -0.08 0.05 0.03 -0.01 0.06 0.09
-1.1 -0.63 -0.08 0.1 0.1 0.64 -0.07 -0.27 -0.13 0.19 0.46 0.04
- - 0.29 0.37 2.83 - - - - - 0.22 0.26
-0.26 0.11 0.1 -0.0 -0.18 -0.18 -0.19 -0.21 0.42 -0.19 0.17 0.22
- - - - 3.58 - - - - - - -
-0.61 0.71 0.65 1.03 -0.29 0.0 0.27 0.64 -0.86 -3.27 - -0.2
-0.27 0.43 -0.21 -0.34 -0.34 0.63 0.4 -0.04 -0.22 -0.14 -0.12 -0.22
- - - - 3.58 - - - - - - -
0.17 -0.69 -0.37 -0.22 -0.36 -0.44 0.04 -0.08 0.09 0.37 0.59 0.36
-0.43 -0.29 -0.06 0.25 -0.07 -0.17 0.07 0.17 0.28 0.23 -0.06 -0.12
-1.31 -0.13 -0.04 -0.08 -0.06 -0.25 0.29 -0.15 0.31 0.25 -0.23 0.64
-0.51 -0.06 0.03 -0.02 0.08 -0.04 0.08 0.13 0.11 0.06 -0.12 0.15
0.4 -0.23 -0.58 0.12 -0.47 0.0 0.5 0.17 0.26 -0.3 -0.09 -0.23
- 1.54 - - 3.19 - - - - - - -
-1.1 -1.49 -0.49 -0.59 -0.24 0.43 -0.17 0.49 0.17 0.54 0.42 0.48
-0.12 0.11 -0.36 0.53 -0.14 0.45 -0.64 0.31 0.01 -0.4 -0.27 0.04
-0.23 -1.11 0.26 -0.01 0.36 0.27 0.45 -1.19 0.11 0.04 -0.73 0.57
- - - - - - - 3.58 - - - -
0.03 -0.11 0.02 -0.27 -0.29 0.15 0.21 0.21 0.32 -0.05 -0.3 -0.09
0.52 0.62 -0.3 -1.67 0.51 0.43 -1.13 0.42 -0.66 0.71 -0.41 -1.66
- - - - 3.58 - - - - - - -
0.45 0.09 -0.57 -0.4 0.04 0.41 0.38 0.03 -0.15 -0.31 -0.49 0.05
-0.08 0.12 0.12 -0.27 -0.3 -0.2 0.16 0.14 0.09 -0.05 -0.0 0.17
-0.15 0.45 -0.32 0.12 -0.07 -0.15 0.12 0.08 0.32 -0.56 0.25 -0.47
-0.35 -1.03 0.09 -0.07 0.15 0.16 0.11 0.44 0.31 -0.21 -0.31 0.18
- -1.75 0.38 -0.34 0.28 0.51 -1.93 0.21 0.97 0.92 0.02 -0.55
0.35 0.03 -0.89 -0.63 -0.25 0.18 0.21 0.13 -0.28 -0.72 0.48 0.56
-0.93 -0.49 0.23 -0.07 -0.13 -0.12 0.04 -0.09 -0.08 0.52 0.33 0.27
0.0 -0.18 -0.1 -0.18 -0.01 0.15 0.09 0.03 0.1 0.04 -0.05 0.07
- 0.16 -1.57 -1.59 0.32 1.46 -0.19 -1.55 0.03 -0.07 0.98 0.07
- 0.53 - - -1.42 1.85 -0.12 0.28 0.36 0.22 0.19 -0.23
-0.49 0.34 -0.99 -0.13 0.54 0.1 -0.05 0.41 -0.25 -0.35 0.24 -0.03
-0.78 0.54 -0.77 0.38 -0.36 0.03 0.49 0.49 -1.56 0.17 -0.14 0.13
- - - 1.22 - - 1.12 1.67 - 2.12 - -
- -1.51 - 0.36 -1.56 0.06 - 0.81 0.07 2.18 - 0.73
-0.36 -0.22 -0.08 -0.13 0.29 0.29 0.38 0.16 -0.06 0.13 -0.49 -0.2
1.0 -1.59 -0.71 -0.52 -0.54 1.03 0.34 -0.91 -1.55 -0.25 0.66 0.08
- 0.04 -1.72 - -0.41 -0.01 -0.29 0.87 1.18 0.55 -0.4 0.83
-0.14 -0.15 0.03 0.26 0.04 0.06 -0.17 0.35 0.15 0.07 -0.3 -0.36
- - - - 3.58 - - - - - - -
-0.32 -0.01 0.24 -0.4 -0.39 0.11 0.32 0.18 0.02 -0.1 0.07 0.07
-2.36 0.21 0.05 0.61 0.56 0.43 -0.23 -0.96 0.01 0.17 -0.11 -0.27
-0.33 0.12 -0.1 -0.41 -0.0 0.15 -0.37 0.35 0.1 0.11 0.22 -0.08
-2.31 0.47 0.22 -0.53 -0.54 -1.29 -1.13 0.78 0.13 0.28 -0.04 1.01
-0.07 -0.17 -0.15 -0.24 0.07 0.19 0.18 -0.03 -0.03 0.04 -0.03 0.16
-0.38 0.09 -0.17 -0.23 0.11 0.06 0.37 0.29 0.31 -0.07 -0.28 -0.37
-0.99 -0.34 -0.07 0.05 0.17 -0.37 0.05 0.19 -0.24 0.22 0.28 0.51
- - - - 3.58 - - - - - - -
-1.59 -1.56 -0.62 -0.15 -0.33 0.66 -0.26 0.21 0.04 0.83 0.77 -0.14
0.29 -0.62 -0.61 -2.14 -0.23 0.42 0.47 0.35 0.39 0.35 -0.02 -0.27
- - - - 3.58 - - - - - - -
0.26 0.03 -0.02 -0.34 -0.33 -0.05 -0.22 -0.19 -0.03 0.24 -0.17 0.53
-1.1 0.08 -0.19 0.39 -0.09 -0.17 -0.16 0.12 0.33 -0.04 0.01 0.3
- - - - 3.58 - - - - - - -
- - -0.62 1.44 - -0.37 -0.42 1.05 1.31 0.33 0.39 -
-0.15 -1.2 -0.72 -0.13 0.1 0.55 0.72 0.42 0.29 -0.64 0.08 -0.53
-1.6 0.56 -1.01 -0.59 -0.12 -1.04 -1.06 0.52 0.41 0.93 -0.19 0.68
0.25 -0.51 -2.13 0.65 0.45 -1.12 -0.77 1.2 -0.07 -1.38 0.76 -0.82
- - - - 3.58 - - - - - - -
-0.31 -2.33 -0.22 0.29 -2.57 -2.22 0.54 -1.35 -0.4 0.61 1.55 0.55
-0.49 0.24 -0.54 -0.89 -0.21 0.03 0.52 0.07 0.53 0.2 -0.03 -0.11
0.17 0.28 0.09 -0.03 0.01 0.16 -0.04 -0.25 0.14 -0.18 -0.3 -0.18
- - - - 3.58 - - - - - - -
0.08 0.09 -0.04 -0.12 0.08 0.21 0.02 -0.13 0.01 -0.07 -0.24 0.05
-0.1 -0.04 0.03 -0.04 0.14 0.22 0.06 0.0 -0.02 -0.12 -0.05 -0.12
- - 0.57 0.94 2.11 - 0.99 1.2 - - - -
-0.06 0.1 -1.13 0.24 0.46 -0.38 0.69 -0.11 -0.24 -0.68 -0.15 0.36
- 0.13 - 0.99 0.07 -0.31 -0.0 0.44 - 1.9 - -0.05
-1.22 0.15 -0.31 0.35 0.37 0.46 -0.21 0.82 -0.11 -0.32 -0.93 -0.27
- - - - 3.58 - - - - - - -
-1.03 -0.12 - -0.61 -0.12 1.32 -1.6 0.51 0.38 -0.72 1.33 -1.5
-0.28 -0.32 0.06 -0.26 -0.21 0.07 -0.22 0.34 0.48 0.21 -0.19 0.06
0.1 -0.23 -0.54 -0.14 -0.26 0.66 0.28 -0.17 -0.27 0.06 0.16 -0.05
-0.46 -1.04 - - - 1.52 0.78 -0.06 0.7 0.03 1.08 -1.08
- 0.14 0.2 -0.84 -0.72 0.79 - 0.65 - - 0.76 1.84
-2.21 -0.12 -0.98 0.57 0.45 0.48 0.06 1.02 1.02 -1.85 -1.84 -1.14
0.78 -0.11 -0.75 1.1 0.05 -0.82 0.14 1.02 -0.25 -3.01 -0.64 -1.85
-1.39 -0.52 0.64 -0.11 0.5 0.4 0.23 -0.05 -0.05 0.1 -0.04 -0.85
0.22 0.21 -0.06 0.13 -0.02 -0.32 0.3 -0.26 0.06 -0.02 -0.44 -0.0
-0.17 0.59 -0.55 -0.22 -0.34 -0.61 0.13 -0.12 0.69 0.08 0.21 -0.37
- - - - - 3.58 - - - - - -
- 0.14 1.39 - - 1.46 - - 0.49 0.43 - 1.47
-0.16 0.58 -2.82 -0.25 0.18 -0.23 -0.89 1.0 -1.5 -0.82 1.15 -0.05
0.47 0.19 -0.3 -0.4 -0.91 0.01 -0.79 0.44 0.27 0.06 0.59 -0.57
-0.21 -0.4 -0.15 0.01 0.31 0.7 0.13 0.1 0.61 -0.61 -1.16 -0.31
-2.69 -0.89 -3.69 0.51 -2.21 - -0.19 -0.58 1.76 0.87 0.58 0.42
- - - - 2.97 - - 1.2 0.88 - - -
- - - - 3.58 - - - - - - -
- - - - - - - - - 3.58 - -
-1.56 -0.03 -0.63 -0.26 0.41 -0.42 0.08 0.25 0.36 0.4 -0.06 0.4
0.32 -0.14 -0.1 -0.17 0.12 0.01 0.04 -0.29 -0.16 0.05 0.09 0.11
-0.03 -0.07 -0.34 -0.01 -0.16 -0.06 0.22 0.06 0.15 0.43 -0.64 0.18
- - - - 3.58 - - - - - - -
- - - - 3.58 - - - - - - -
- - - - 3.58 - - - - - - -
-1.12 -0.5 -0.98 -0.47 -0.73 0.57 1.02 0.14 0.62 -0.25 -1.04 0.62
- 1.3 -0.42 - -1.46 - 0.37 0.44 0.25 -1.45 1.39 0.67
1.85 0.0 - 1.69 - -1.12 - 0.12 - -1.22 1.13 -
- -1.04 0.21 -1.96 -0.9 -0.25 0.41 0.26 -0.56 0.89 1.27 0.33
- - - - 3.58 - - - - - - -
- - - - 3.58 - - - - - - -
- 0.92 - - 1.3 1.09 0.12 - - 2.15 - -
- 1.35 - - - 1.67 - 1.68 - - 1.61 -
- - - - 3.58 - - - - - - -
- - - 1.34 - - - 1.29 1.15 1.25 1.27 -
-0.97 0.0 - -0.1 -0.56 -0.3 0.32 -0.57 -1.57 1.7 -0.72 0.97
0.29 -0.07 -0.07 0.25 0.04 0.2 -0.39 -0.04 0.1 -0.16 0.12 -0.48
-1.26 0.19 -0.95 -0.48 0.27 0.52 -0.13 0.79 -0.26 -0.4 0.27 0.17
-0.39 0.89 -0.96 - 0.74 -0.95 - 1.11 - 0.56 0.59 0.64
1.63 - - - - 1.31 2.17 - 0.95 - - -
0.67 -0.09 -1.54 -3.0 -0.51 -0.06 0.01 -0.2 -0.64 1.26 0.09 0.45
-0.16 0.35 -0.23 -0.25 -0.09 -0.15 -0.28 0.12 -0.15 0.23 0.0 0.4
- -1.48 - 0.45 -0.12 0.96 - 0.43 1.14 1.36 - 0.38
-0.02 0.42 0.26 -0.06 -0.57 -0.63 0.27 0.52 -0.42 -0.61 -0.2 0.37
0.75 0.66 -0.59 0.47 -0.85 0.31 -0.35 0.82 -0.86 -0.43 -0.97 -0.87
-0.61 -0.31 0.18 -1.2 0.41 -0.15 -0.46 -1.77 -0.35 0.4 1.24 0.32
0.01 - 0.03 -0.08 -1.74 1.12 0.47 -0.62 1.2 - 0.91 -1.53
-1.58 -0.52 -0.01 -0.92 0.04 0.18 0.59 -1.27 -0.1 0.28 0.39 0.93
0.21 0.4 0.05 0.06 -0.36 -0.25 -0.28 -0.12 -0.01 0.24 -0.17 0.0
-0.76 -0.01 -0.47 -0.47 0.17 0.06 -0.6 0.51 -0.21 0.17 0.41 0.5
-0.61 1.98 - - 1.05 0.69 - - 1.05 - -1.32 0.3
0.36 -0.71 - - -1.95 0.25 1.6 -0.63 1.19 -0.34 0.41 -0.82
- - - - - 2.17 - - 1.96 - 1.85 -
- 1.81 - - - - 2.12 - - - 2.05 -
- - - - - - 2.58 - - 2.59 - -
0.76 0.48 -0.43 -0.68 -0.6 -0.03 -0.62 0.01 -0.15 0.52 -0.12 -0.0
-1.0 -0.88 -0.3 -0.52 -1.74 0.47 0.28 -0.18 1.0 0.21 0.7 -0.2
- -0.19 - 0.96 2.92 0.69 - - - - - -
- - - - 3.58 - - - - - - -
-2.15 -0.2 -0.09 0.15 -0.04 0.35 0.05 0.6 0.63 0.12 -1.06 -0.08
0.03 0.04 -0.06 0.16 0.28 0.09 -0.18 -0.22 0.07 -0.1 -0.18 -0.02
-1.12 -1.48 -0.52 -0.6 0.03 -0.05 -0.32 0.38 0.25 0.73 0.74 0.28
- 1.29 -0.95 -0.45 1.12 0.48 0.48 -0.51 0.36 - -0.57 -0.56
-0.47 1.62 - 0.51 0.04 1.03 - 0.21 1.04 - -1.03 -
- - - - 2.33 - - 1.18 1.45 - -0.06 0.04
- - - - 3.58 - - - - - - -
- - - - 3.58 - - - - - - -
- - - - - - 1.61 - 1.65 - 2.54 -
- - - -0.39 - 1.48 1.14 - 1.28 -0.36 1.6 -
0.05 -0.0 0.04 -0.18 0.09 0.15 0.28 -0.01 0.08 -0.08 -0.26 -0.25
- - - - 3.58 - - - - - - -
0.06 0.45 0.29 -0.09 0.08 0.0 -0.82 -0.09 0.16 -0.36 -0.37 0.25
- - - - 3.58 - - - - - - -
- - - - - 2.19 - 1.96 1.83 - - -
0.2 0.39 -0.11 -0.66 0.14 -0.13 -0.2 0.33 0.18 -0.28 -0.03 -0.16
0.71 0.06 -0.6 -0.74 -1.99 0.32 0.62 -0.07 0.55 -0.26 -0.99 0.36
0.3 0.07 -0.12 0.15 0.19 0.31 -0.31 -0.21 -0.35 -0.3 -0.04 0.1
- - - - - 3.58 - - - - - -
- - - - 3.58 - - - - - - -
-1.24 0.0 -0.2 0.39 0.16 0.34 -0.15 -0.59 0.58 0.03 -0.24 0.12
0.22 0.05 -0.17 0.04 -0.26 0.14 -0.42 0.04 0.06 0.03 -0.13 0.26
0.08 0.17 0.06 -0.05 -0.05 0.09 -0.02 -0.12 -0.08 -0.01 -0.12 0.02
0.37 0.18 -0.25 0.15 -0.14 -0.16 -0.45 0.61 0.05 -0.29 -0.24 -0.21
-0.64 -0.25 0.07 -0.32 -0.35 -0.09 0.37 0.34 -0.12 -0.05 0.32 0.33
- - - - - - 2.62 - - - 2.55 -
- - - - 3.58 - - - - - - -
- - - - 3.47 - - -0.15 - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.