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Heatmap: Cluster_80 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.38 0.48 -0.29 -0.23 -0.75 -0.82 -0.37 -0.25 -0.42 0.33 0.46 0.56
-0.17 -0.5 -0.42 -0.86 -0.9 -0.64 0.1 0.25 0.79 0.71 0.21 0.2
-0.03 0.54 0.01 -0.31 -0.79 -1.35 -0.81 -0.53 -0.29 0.24 0.72 0.91
0.86 0.61 -1.23 -1.0 0.66 -1.34 -0.83 -1.59 0.27 0.24 -0.51 0.83
- -0.56 -2.03 0.43 -2.96 -1.56 -0.99 -0.34 1.07 0.67 1.06 1.13
-1.78 0.37 0.05 0.33 0.51 -1.5 -1.24 0.2 -0.45 0.24 0.85 0.08
-1.47 0.22 0.43 0.57 0.4 -0.49 -0.88 -0.17 -0.11 -0.01 0.31 0.01
- 0.69 - - 1.08 - 1.2 - 0.88 0.98 - 1.11
-0.61 0.46 -0.16 0.16 -0.54 -1.43 -0.93 -0.34 0.27 0.74 0.54 0.32
- 0.55 0.85 0.81 - - - - - 1.8 0.78 0.82
0.28 0.51 0.37 0.21 -0.14 -0.93 -0.78 -0.39 -0.18 0.14 0.17 0.04
0.16 0.72 0.45 0.09 -0.11 -0.79 -0.74 -0.33 -0.37 0.2 -0.21 0.14
-0.33 0.61 0.29 0.45 -0.27 -1.18 -0.86 -0.27 -0.23 0.27 0.36 0.12
-0.12 0.62 0.18 -0.42 -0.31 -1.07 -0.78 -0.11 0.16 0.39 0.28 0.29
-0.21 0.6 0.07 0.24 -0.7 -1.27 -1.35 -0.35 0.14 0.45 0.51 0.38
-1.65 0.17 -0.44 -0.02 0.09 -1.92 -0.88 -0.03 0.51 0.88 0.69 0.14
-0.36 -0.1 -0.47 -0.03 -0.14 -0.95 -0.84 0.1 0.58 0.73 0.52 -0.09
0.2 0.24 0.16 0.48 0.19 0.08 -0.17 -0.21 -0.31 -0.53 -0.58 0.05
-0.04 0.21 0.44 0.36 -0.73 -1.79 -0.97 -0.12 0.14 0.3 0.31 0.42
-0.13 -0.25 -0.97 -0.78 -1.17 -1.74 -0.55 0.06 0.88 1.03 0.06 0.81
- - - - - 1.01 - - - 1.29 1.32 2.34
-0.25 -0.0 0.19 0.06 -0.34 -0.47 -0.34 -0.23 0.01 0.15 0.39 0.48
-0.29 0.59 -0.42 0.0 -0.17 -0.57 -0.48 0.24 -0.56 0.08 0.66 0.2
-0.68 0.16 0.0 -0.62 -1.34 -1.86 -0.88 -0.4 0.79 1.14 0.47 0.41
0.54 0.9 - -0.03 0.96 -0.33 - - - -0.04 0.91 1.07
-0.96 0.39 0.7 0.96 -0.13 -1.09 -1.13 -0.84 -0.54 -0.32 0.2 0.65
-0.49 0.35 -0.01 -0.85 -1.6 -1.63 -0.6 0.24 0.52 0.69 0.67 0.4
-0.12 0.15 0.03 0.12 -0.61 -0.62 -1.16 0.06 0.01 0.17 0.6 0.5
0.96 0.36 - -0.95 -2.13 -0.43 -2.02 -0.26 0.39 1.11 -0.07 0.83
-0.06 0.27 0.21 -0.69 -1.06 -1.05 -0.37 0.07 0.24 0.64 0.37 0.31
-0.33 0.11 0.35 0.32 0.12 -0.28 -0.45 -0.18 0.03 0.09 0.01 -0.02
-0.21 0.16 0.11 -0.33 -0.67 -0.42 -0.03 0.08 0.28 0.54 0.07 0.03
-0.06 0.19 0.15 -0.44 -1.2 -1.87 -1.38 -0.21 0.42 0.66 0.69 0.65
0.18 -0.11 -0.08 -0.27 -0.8 -1.0 -0.44 0.07 0.26 0.42 0.5 0.44
0.85 -0.3 -0.77 0.22 -2.5 -2.57 - -2.56 -0.26 1.55 0.7 0.79
-1.63 -0.36 -1.66 -0.87 -0.54 0.08 0.48 -0.36 -0.43 0.92 -0.08 1.35
-0.29 0.11 0.23 0.42 0.01 -0.82 -0.89 -0.23 0.13 0.18 0.27 0.25
-1.08 0.57 0.03 0.43 0.47 -0.71 -0.91 -0.29 -0.78 -0.03 0.72 0.14
-0.65 0.1 0.27 0.03 -0.21 -0.65 -0.23 -0.12 0.04 0.23 0.29 0.44
-1.4 0.42 0.37 -0.54 -0.97 -0.95 -0.45 -1.05 -0.27 0.23 0.96 1.08
- - - - - 3.1 - - - - - 1.79
0.2 0.34 0.23 -0.32 -1.12 -1.5 -0.72 0.05 0.31 0.48 0.38 0.29
-0.07 -0.29 -0.33 -0.48 -0.58 -0.24 0.28 0.17 0.16 0.11 0.32 0.51
- 0.55 0.85 - - - - - - 1.81 1.8 0.82
0.13 0.19 -0.08 -0.32 -0.38 -0.21 -0.1 -0.01 0.11 0.29 0.15 0.09
0.2 -0.23 -0.07 -0.27 -0.31 -0.2 0.09 0.01 0.09 0.14 0.19 0.23
-0.28 0.88 -0.17 0.14 -0.67 -1.14 -0.93 0.19 -0.4 0.29 0.5 0.28
-0.14 -0.09 -0.0 -0.03 -0.3 -0.23 0.08 -0.09 0.02 0.34 0.03 0.29
-1.55 -0.42 0.14 0.08 -0.09 -0.18 -0.31 -0.1 0.45 0.36 0.33 0.34
-1.78 -0.37 -0.01 -0.0 0.11 -0.13 -0.2 0.03 0.37 0.47 -0.03 0.49
0.25 0.14 -0.17 -0.83 -1.06 -0.87 -0.4 -0.08 0.26 0.79 0.21 0.53
0.09 0.22 0.43 -0.29 -1.04 -1.61 -0.7 -0.09 -0.07 0.33 0.58 0.62
-0.62 0.09 0.31 0.11 -0.28 -0.5 -0.09 -0.27 0.31 0.43 -0.01 0.1
-1.01 -0.14 0.07 0.23 -0.46 -0.75 -0.16 -0.17 0.32 0.24 0.5 0.5
-0.31 0.45 0.19 0.01 -0.38 -0.92 -0.65 -0.07 -0.12 0.21 0.35 0.52
0.22 0.4 -0.74 -0.38 -1.66 -1.87 -0.32 -0.91 0.81 0.94 0.54 0.16
0.6 0.47 0.47 0.74 -0.13 -0.94 -0.69 -0.45 -0.5 -0.87 0.01 -0.02
0.13 0.45 0.48 -0.23 -0.95 -1.51 -1.01 -0.39 -0.26 0.49 0.49 0.6
0.17 0.4 0.01 0.66 -0.07 -0.38 -1.01 -0.03 -0.32 0.1 -0.09 -0.06
-0.77 0.42 0.45 -0.49 -0.4 -1.65 -1.8 -0.7 -0.17 0.54 0.81 0.94
0.25 0.42 0.37 -0.14 -0.54 -1.11 -1.18 -0.46 -0.14 0.25 0.4 0.63
0.07 0.43 0.28 -0.2 -0.4 -1.3 -1.34 -0.4 -0.31 0.3 0.6 0.72
-1.43 -2.46 -0.75 -0.07 -0.45 -1.9 0.13 0.81 -0.45 1.83 -0.48 0.1
-0.11 0.17 0.26 -0.21 -0.21 -0.25 -0.45 -0.15 0.02 0.15 0.21 0.36
-0.23 0.17 0.38 0.26 0.07 -0.36 -0.53 -0.29 -0.03 -0.05 0.11 0.21
-0.61 0.43 0.45 -0.07 -0.76 -1.24 -1.1 -0.49 -0.04 0.4 0.73 0.63
0.05 0.3 0.3 0.73 0.04 -1.12 -0.79 -0.19 -0.34 -0.2 0.07 0.25
0.19 0.24 0.1 0.51 0.19 -0.18 -0.4 -0.33 -0.36 -0.42 -0.17 0.25
-0.68 0.28 -0.27 -0.2 -0.28 -0.54 -0.41 -0.65 0.37 0.81 0.37 0.29
0.36 0.33 0.3 0.48 -0.01 -0.38 -0.41 -0.4 -0.3 -0.4 -0.22 0.17
0.0 0.19 0.23 0.35 0.21 -0.35 -0.48 -0.1 -0.15 -0.01 -0.05 -0.05
-0.18 0.29 0.29 -0.02 -0.03 -0.66 -0.56 -0.49 -0.16 0.23 0.34 0.42
-0.22 0.45 0.19 0.03 -0.06 -0.72 -0.83 -0.31 -0.47 0.29 0.31 0.59
-0.11 0.24 0.55 0.63 0.02 -0.63 -0.39 -0.41 -0.11 -0.23 -0.22 0.09
0.09 1.02 0.16 -0.75 -2.21 -5.21 -2.11 -1.23 -0.53 0.27 0.91 1.33
-0.76 0.61 0.69 1.07 -0.39 -0.95 -3.12 -2.0 -0.66 0.06 0.39 0.61
-0.15 0.5 0.38 0.42 -0.63 -1.44 -1.04 -0.45 -0.0 0.31 0.3 0.43
-0.82 0.06 0.1 0.07 -0.13 -0.34 -0.22 -0.09 0.2 0.17 0.27 0.38
0.51 0.45 0.39 0.82 -0.43 -1.31 -0.78 -0.45 -0.14 -0.46 -0.18 0.21
0.14 -0.24 -0.23 -0.43 -0.47 -0.34 -0.02 -0.01 0.25 0.39 0.24 0.35
-0.53 -0.11 -0.27 0.13 0.07 -0.07 -0.02 -0.41 -0.28 0.32 -0.13 0.79
-1.37 -0.07 0.39 -0.53 -0.14 -0.46 -0.0 -0.22 0.17 0.4 0.32 0.55
- - - - - - - - - 3.58 - -
0.24 0.54 0.43 0.78 0.05 -0.54 -1.13 -0.89 -0.39 -0.25 -0.17 0.12

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.