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Heatmap: Cluster_85 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.35 0.41 0.02 -0.13 0.07 -0.01 -0.19 0.07 -0.04 -0.29 -0.29 -0.14
0.85 1.05 0.14 0.51 0.0 -0.05 -0.3 0.21 -0.55 -1.14 -1.78 -2.12
0.32 0.48 0.23 -0.07 0.16 0.0 -0.41 -0.16 -0.27 -0.21 -0.17 -0.19
0.99 0.52 -0.05 -0.2 -0.33 -0.44 -0.1 0.35 -0.31 -0.34 -0.51 -0.5
0.46 0.27 -0.02 -0.06 0.3 0.28 0.08 0.17 -0.22 -0.51 -0.75 -0.54
0.83 0.63 0.11 -0.28 -0.14 -0.38 -0.17 0.3 -0.43 -0.56 -0.38 -0.34
1.19 0.58 -2.25 -1.01 -0.24 0.54 -0.91 -0.04 -1.96 -0.31 0.48 0.33
0.41 0.57 -0.18 0.38 -0.06 -0.32 -0.06 -0.15 0.11 -0.3 -0.67 -0.21
0.49 0.48 0.06 -0.36 0.02 0.05 -0.15 0.27 -0.32 -0.33 -0.18 -0.43
0.58 0.49 -0.05 0.19 -0.07 -0.26 -0.26 0.07 -0.3 -0.27 -0.24 -0.28
0.33 0.1 -0.07 -0.01 0.17 0.15 -0.02 0.18 -0.01 -0.18 -0.4 -0.43
-0.02 0.23 -0.27 -0.23 0.02 0.33 0.23 0.2 -0.05 -0.04 -0.29 -0.3
0.24 -0.03 -0.18 -0.21 0.06 0.08 0.1 0.16 0.07 -0.05 -0.11 -0.2
0.16 0.02 -0.01 0.12 0.18 0.1 -0.48 -0.11 -0.32 0.01 0.26 -0.1
0.14 0.13 -0.22 0.02 0.29 0.4 0.16 0.11 -0.14 -0.13 -0.65 -0.44
-0.01 0.15 -0.05 0.27 0.21 -0.1 -0.18 -0.02 -0.26 -0.19 -0.14 0.19
0.81 0.64 -1.69 -0.79 -0.29 -0.04 -0.71 0.49 -0.82 -0.14 -0.12 0.68
0.83 0.69 -0.2 -0.28 -0.0 -0.12 -0.12 0.23 -0.36 -0.51 -0.55 -0.42
0.63 0.89 0.52 -0.06 0.42 0.28 -0.64 -0.42 -1.12 -0.59 -0.91 -0.72
0.56 0.47 0.12 -0.22 -0.07 -0.17 -0.2 0.09 -0.1 -0.16 -0.32 -0.32
0.25 0.32 -0.09 -0.03 0.27 0.14 -0.04 0.35 0.0 -0.21 -0.58 -0.86
0.71 0.97 -0.41 -0.33 -0.6 -0.15 -0.47 0.57 -0.53 -0.55 0.15 -0.71
0.29 0.34 -0.12 -0.03 0.27 0.08 -0.01 0.17 -0.1 -0.31 -0.46 -0.39
0.18 0.25 -0.03 -0.17 0.06 0.2 -0.17 0.08 -0.22 -0.01 -0.1 -0.19
0.5 0.53 -0.01 0.16 -0.05 0.02 -0.01 -0.05 -0.28 -0.34 -0.41 -0.47
0.29 0.36 0.14 -0.22 0.06 0.08 -0.04 0.19 -0.05 -0.16 -0.41 -0.49
0.28 0.31 0.2 0.02 0.2 -0.04 0.0 0.08 -0.16 -0.36 -0.47 -0.32
0.32 0.1 -0.08 -0.13 0.21 0.24 0.15 0.28 -0.11 -0.29 -0.53 -0.48
0.76 0.57 0.1 -0.33 -0.21 -0.04 -0.19 0.3 -0.09 -0.39 -0.48 -0.73
0.5 0.51 0.11 -0.0 0.17 -0.14 -0.34 -0.21 -0.06 -0.15 -0.45 -0.33
0.53 0.27 0.06 -0.12 0.03 -0.04 -0.2 0.09 -0.05 -0.24 -0.29 -0.28
0.45 0.48 0.16 0.09 -0.05 -0.37 -0.47 0.09 -0.24 -0.21 -0.14 -0.14
0.71 0.66 0.25 -0.42 0.11 0.49 0.18 0.34 -0.4 -0.87 -1.46 -1.73
0.25 0.15 0.01 -0.16 -0.0 0.01 -0.0 0.23 -0.01 -0.05 -0.16 -0.37
0.73 0.58 0.1 -0.05 0.04 -0.31 -0.19 0.03 -0.33 -0.29 -0.5 -0.4
0.24 0.23 -0.13 -0.19 0.22 -0.04 -0.4 -0.16 -0.09 -0.06 0.05 0.18
0.17 0.42 -0.01 -0.12 -0.06 -0.15 -0.3 0.3 -0.03 -0.03 -0.16 -0.21
0.22 0.26 0.03 0.21 0.14 0.12 -0.44 -0.12 -0.37 -0.15 -0.05 -0.04
0.28 0.28 -0.01 -0.02 0.04 0.17 -0.26 -0.23 -0.19 -0.2 0.02 -0.02
0.28 0.4 0.13 -0.2 0.08 -0.05 -0.21 0.34 -0.05 -0.23 -0.18 -0.61
0.69 0.56 0.16 0.25 0.19 -0.1 -0.27 -0.07 -0.47 -0.46 -0.66 -0.57
0.39 0.42 0.13 -0.22 0.03 0.16 0.07 0.31 -0.01 -0.21 -0.76 -0.9
0.15 0.13 -0.04 -0.03 0.07 0.03 -0.13 0.05 -0.03 -0.05 -0.14 -0.05
0.17 0.11 -0.06 0.06 0.12 0.09 -0.17 0.12 -0.25 -0.16 -0.11 -0.0
0.41 0.38 0.12 -0.07 0.1 -0.07 -0.24 0.05 -0.1 -0.17 -0.33 -0.29
0.44 0.09 -0.1 0.05 0.19 -0.05 -0.16 -0.28 -0.12 0.05 -0.18 -0.09
0.2 0.87 -0.19 -0.29 0.05 0.13 -0.8 0.42 -0.35 -0.12 -0.2 -0.47
0.52 0.18 -0.27 -0.24 0.04 0.15 0.16 0.29 -0.03 -0.26 -0.47 -0.43
0.39 0.26 -0.05 -0.01 0.06 0.23 -0.24 -0.12 -0.35 -0.23 -0.06 -0.05
0.82 0.51 0.14 -0.06 -0.14 -0.33 -0.19 0.23 -0.29 -0.08 -0.4 -1.08
0.27 0.1 -0.16 -0.34 0.15 0.06 -0.29 0.19 -0.33 0.13 -0.04 0.1
0.61 0.4 -0.02 -0.12 -0.1 -0.11 0.02 0.01 -0.03 -0.17 -0.53 -0.3
0.83 0.58 -0.47 -0.38 0.21 0.55 -0.29 -0.14 -0.49 -0.56 -1.0 0.01
0.54 0.49 0.17 -0.01 0.01 0.15 -0.21 -0.3 -0.75 -0.39 -0.23 0.03
0.47 0.47 -0.17 -0.25 0.34 0.3 0.07 0.3 -0.12 -0.39 -0.84 -1.09
0.35 0.48 -0.07 -0.07 0.28 0.09 0.07 -0.01 -0.13 -0.21 -0.6 -0.58
0.23 0.08 -0.39 -0.13 0.16 0.41 0.19 0.26 0.14 -0.14 -0.59 -0.65
0.37 0.75 0.28 0.33 0.49 0.13 -0.43 -0.0 -0.68 -0.83 -0.77 -0.86
0.28 0.22 0.04 -0.34 0.16 0.15 -0.1 0.06 0.0 0.05 -0.34 -0.38
0.23 1.2 0.29 0.03 0.17 -0.05 -0.19 -0.13 -0.6 -0.27 -1.14 -1.15
0.18 0.02 -0.18 -0.16 0.11 0.19 -0.04 -0.04 -0.12 0.01 -0.06 0.03
0.33 0.54 -0.01 -0.08 0.3 0.33 -0.09 0.02 -0.44 -0.39 -0.52 -0.48
0.99 0.62 -0.49 -0.22 0.0 -0.29 -0.58 0.33 -0.05 -0.32 -0.45 -0.57
0.29 0.17 -0.16 0.26 0.43 -0.01 -0.77 0.08 -0.87 -0.17 -0.02 0.21
0.49 0.37 -0.08 -0.02 0.12 0.01 -0.07 0.03 -0.16 -0.19 -0.46 -0.32
0.45 0.21 0.15 -0.22 -0.05 -0.03 -0.15 0.09 -0.05 -0.13 -0.11 -0.32
0.31 0.36 -0.25 0.16 0.11 -0.08 -0.1 -0.13 0.06 0.09 -0.46 -0.32
-0.22 -0.07 -0.49 -0.2 -0.13 0.44 0.44 0.26 0.02 0.1 -0.53 -0.0
0.56 0.59 0.1 -0.02 -0.27 -0.63 -0.36 0.26 -0.09 -0.23 -0.23 -0.23
1.08 1.15 -0.21 0.48 -0.11 -0.26 -0.21 0.23 -0.23 -1.05 -3.34 -2.54

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.