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Heatmap: Cluster_105 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.27 -0.29 -0.18 -0.17 -0.12 0.16 0.36 0.32 0.2 0.12 -0.05 -0.31
-1.33 -0.77 -0.08 0.0 0.31 0.84 0.54 0.22 -0.02 -0.33 -0.15 -0.44
-1.68 -1.13 -0.84 -0.02 -0.1 0.38 0.87 0.61 0.51 0.28 -0.27 -0.66
-1.24 -0.18 -0.03 -0.21 0.25 0.8 0.05 0.02 0.02 -0.03 -0.08 -0.09
-1.67 -0.36 -0.19 -0.1 0.24 0.64 0.16 0.06 -0.02 -0.09 0.19 0.17
-1.31 -0.8 -0.32 -0.33 0.06 0.56 0.65 0.37 0.21 0.15 0.1 -0.5
-1.44 -0.75 -0.17 0.17 0.2 0.45 0.65 0.23 0.18 -0.14 -0.12 -0.31
-0.78 -0.29 -0.03 -0.01 0.41 0.67 0.35 0.2 -0.04 -0.27 -0.31 -0.56
-5.96 -1.54 -0.22 0.46 0.75 1.2 0.91 0.1 -0.1 -0.82 -0.78 -1.3
-1.0 -0.34 -0.18 -0.02 -0.06 0.35 0.52 0.31 0.06 -0.0 -0.01 -0.17
-1.85 -0.92 -0.25 0.3 0.0 0.57 0.49 0.31 0.21 -0.03 0.08 -0.32
-1.29 -0.91 -0.41 -0.1 -0.01 0.62 0.71 0.71 0.19 -0.14 -0.17 -0.66
-2.57 -2.42 -1.66 -0.46 0.01 0.43 1.05 1.01 0.66 0.34 -0.25 -1.08
-3.33 -2.55 -1.57 -0.9 -0.35 0.65 1.47 0.83 0.86 0.12 -0.59 -1.36
-0.72 -0.65 -0.15 0.15 -0.34 0.47 0.78 0.33 0.25 -0.31 -0.36 -0.29
-0.16 -0.05 -0.04 -0.09 0.05 0.33 0.53 0.19 0.09 -0.12 -0.49 -0.62
-2.21 -1.13 -0.29 0.39 0.07 0.6 0.58 0.43 0.07 -0.26 0.07 -0.23
-2.89 -1.39 -0.41 0.0 0.22 0.88 0.67 0.3 0.04 -0.16 0.23 -0.32
-3.24 -1.4 -0.43 -0.15 0.72 1.02 0.46 0.08 -0.35 -0.02 0.26 -0.31
-0.27 -0.31 -0.11 0.01 -0.14 0.25 0.52 0.3 -0.07 -0.19 -0.02 -0.24
-1.26 -0.78 -0.38 0.21 0.22 0.72 0.93 0.07 0.02 -0.29 -0.43 -0.44
-1.64 -0.9 -0.51 -0.51 0.1 0.58 0.92 0.42 0.28 0.17 -0.15 -0.52
-0.64 -0.25 0.1 0.05 -0.05 0.41 0.73 0.03 0.06 -0.14 -0.35 -0.51
-1.96 -1.32 -0.12 0.08 -0.15 1.21 1.47 0.5 -0.12 -1.26 -1.28 -2.17
-1.3 -0.81 -0.22 -0.06 -0.08 0.48 0.77 0.52 0.26 -0.07 -0.04 -0.75
-0.9 -0.58 -0.19 -0.29 -0.02 0.44 0.56 0.44 0.32 -0.08 -0.06 -0.37
-0.22 0.03 -0.04 -0.19 -0.08 0.38 0.59 0.17 0.23 -0.22 -0.51 -0.6
-1.08 -0.5 -0.1 0.29 0.47 0.5 0.43 0.03 0.05 -0.23 -0.25 -0.38
-0.91 -0.92 -0.48 -0.02 0.05 0.62 0.94 0.29 0.22 -0.24 -0.26 -0.58
-2.03 -0.92 -0.24 0.15 0.18 0.51 0.74 0.34 0.16 -0.16 0.05 -0.44
-1.24 -0.15 0.43 0.6 0.24 0.31 0.24 0.06 -0.12 -0.55 -0.29 -0.43
-0.79 -0.58 -0.08 0.29 -0.02 0.26 0.22 0.14 0.15 -0.04 0.12 -0.04
-0.67 -0.09 0.27 0.31 0.27 0.21 0.18 -0.07 -0.01 -0.13 -0.31 -0.26
-2.58 -1.88 -0.76 -0.63 0.15 0.73 1.04 0.45 0.33 0.17 -0.04 -0.37
-1.42 -0.28 0.18 0.41 0.45 0.38 0.18 -0.07 -0.04 -0.19 -0.15 -0.25
-2.3 -0.76 0.3 0.7 0.7 0.74 0.48 0.25 -0.04 -0.64 -1.06 -1.43
-2.76 -1.07 -0.42 0.08 0.08 0.62 0.78 0.56 0.27 -0.12 0.0 -0.64
-0.41 -0.21 0.06 0.29 0.27 0.32 0.11 -0.05 -0.03 -0.19 -0.13 -0.25
-0.35 -0.62 -0.42 -0.07 -0.39 0.28 0.84 0.61 0.22 -0.19 -0.29 -0.47
-0.61 -0.46 -0.25 0.04 -0.0 0.32 0.5 0.42 0.17 -0.12 -0.12 -0.36
-1.9 -0.81 -0.28 0.27 0.17 0.54 0.89 0.46 0.2 -0.21 -0.53 -0.68
-0.8 -0.62 -0.11 -0.12 0.39 0.85 0.05 -0.06 -0.21 -0.31 0.05 0.15
-1.2 -0.38 -0.21 -0.06 0.28 0.64 0.54 0.1 -0.07 -0.1 -0.02 -0.35
-1.69 -0.84 -0.16 0.04 0.4 0.83 0.49 0.25 -0.1 -0.19 -0.02 -0.47
-0.63 -0.17 -0.15 -0.44 0.12 0.37 0.1 0.16 0.13 0.26 0.08 -0.16
-1.77 -0.39 0.32 0.48 0.49 0.49 0.27 -0.26 -0.01 -0.2 -0.36 -0.3
-0.31 -0.35 -0.14 -0.1 -0.04 0.39 0.7 0.28 0.19 -0.13 -0.35 -0.73
-1.32 -0.23 0.09 -0.41 0.23 0.47 0.21 0.1 0.16 0.2 -0.04 -0.15
-0.26 -0.44 -0.13 -0.02 -0.1 0.29 0.66 0.48 0.08 -0.27 -0.22 -0.61
-0.67 -0.28 -0.03 0.24 0.12 0.17 0.15 0.14 -0.02 -0.09 -0.01 0.07
-0.78 -0.38 -0.07 -0.09 0.05 0.64 0.34 0.33 -0.08 -0.29 -0.01 -0.18
-1.22 -0.78 -0.23 -0.06 -0.07 0.74 0.95 0.44 0.23 -0.53 -0.35 -0.7
-1.11 -0.33 0.18 0.74 0.57 0.49 0.21 -0.24 -0.43 -0.41 -0.27 -0.46
-1.26 -0.5 -0.24 0.18 0.48 0.49 0.42 0.01 0.18 -0.12 -0.31 -0.16
-1.37 -0.17 -0.4 -0.29 0.43 0.91 0.1 -0.18 0.14 -0.09 -0.23 0.12
-3.91 -1.3 -0.01 -0.08 0.16 0.88 0.86 0.13 0.1 -0.25 0.03 -0.32
-0.4 -0.59 -0.22 -0.48 0.07 0.87 1.06 0.29 -0.19 -0.58 -0.61 -0.66
-1.18 -1.29 -0.27 -0.27 -0.34 0.39 1.41 0.34 0.68 -0.43 -0.46 -1.32
-3.18 -1.72 -1.08 -0.24 0.01 0.72 1.69 0.73 0.48 -0.27 -1.71 -2.4
-1.06 -0.55 -0.15 -0.17 0.1 0.55 0.68 0.21 0.14 0.06 -0.05 -0.66
-1.1 -0.23 0.07 0.46 0.31 0.37 0.23 0.29 -0.03 -0.28 -0.31 -0.48
-0.42 -0.46 -0.34 -0.31 -0.13 0.13 0.37 0.58 0.35 0.14 -0.02 -0.35
-0.97 -0.56 0.05 0.27 0.39 0.43 0.2 0.05 0.07 0.04 -0.09 -0.5
-2.07 -1.14 -0.41 -0.99 0.51 0.88 0.53 0.02 0.38 -0.01 0.01 0.04
-1.58 -0.54 -0.12 0.17 0.13 0.42 0.57 0.29 0.2 -0.1 -0.03 -0.43
-1.63 -0.76 -0.55 -0.57 0.14 0.78 0.65 0.44 0.13 0.02 -0.01 -0.18
-2.8 -2.13 -0.57 -0.13 0.13 1.01 1.01 0.27 0.23 -0.25 -0.18 -0.28
-0.34 -0.46 -0.24 -0.11 -0.2 0.4 0.75 0.26 0.2 -0.2 -0.09 -0.58
-0.8 -0.45 -0.21 0.2 -0.08 0.44 0.59 0.41 0.07 -0.34 -0.15 -0.32
-0.58 -0.5 -0.08 -0.24 -0.09 0.41 0.71 0.18 0.13 -0.15 -0.06 -0.28
-0.66 -0.17 0.12 0.33 0.27 0.19 0.17 -0.05 -0.01 -0.02 -0.27 -0.16
-0.47 -1.25 -1.26 -0.23 -0.35 0.42 1.1 0.94 0.53 -0.11 -0.79 -1.14
-2.85 -0.95 0.13 0.64 0.65 0.68 0.44 0.27 -0.04 -0.22 -0.58 -1.1
-3.68 -3.36 -1.76 -0.61 -0.7 0.43 1.6 1.17 0.86 0.05 -0.96 -1.96
-0.49 -0.4 -0.12 -0.43 0.0 0.43 0.82 0.24 0.12 -0.16 -0.31 -0.36
-1.35 -0.63 -0.3 0.07 0.41 0.75 0.3 0.21 0.11 0.02 -0.09 -0.58
-0.62 -0.56 -0.1 -0.05 0.01 0.35 0.43 0.34 0.12 -0.02 -0.01 -0.31
-0.33 0.08 0.13 0.18 0.19 0.2 0.21 -0.22 0.03 -0.13 -0.19 -0.32
-4.93 -2.11 -0.61 0.24 0.71 1.21 0.96 0.38 -0.23 -0.52 -0.68 -0.96
-2.34 -1.04 -0.48 0.12 0.37 1.02 0.82 0.4 -0.07 -0.31 -0.32 -0.86
-0.49 -0.4 -0.07 -0.12 -0.01 0.38 0.71 0.37 0.24 -0.16 -0.48 -0.66
-1.4 -0.97 -0.2 -0.04 -0.02 0.57 0.8 0.54 0.26 -0.1 -0.14 -0.81
-0.88 -0.44 -0.07 -0.09 0.04 0.37 0.52 0.33 0.17 -0.14 -0.05 -0.31
-1.34 -2.0 -1.2 -0.87 -0.65 0.41 1.03 1.14 0.75 0.27 -0.25 -1.22
-2.32 -0.82 0.51 0.48 0.2 0.73 0.55 0.1 -0.07 -0.33 -0.2 -1.12
-1.49 -1.35 -0.8 -0.27 0.04 0.58 1.07 0.85 0.3 0.04 -0.38 -1.34
-1.62 -0.67 -0.03 0.27 0.21 0.57 0.86 -0.09 0.08 -0.25 -0.29 -0.41
-2.66 -0.34 0.49 0.71 0.56 0.51 0.42 -0.21 -0.21 -0.44 -0.61 -0.59

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.