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Heatmap: Cluster_29 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.19 0.48 -0.55 0.32 -0.16 -0.99 -0.6 -0.69 0.35 0.55 -0.13 0.55
-1.28 -0.33 -1.47 0.19 -0.12 -0.81 -0.7 -0.46 0.37 1.16 -0.36 1.1
- -3.39 -0.77 0.4 -0.15 0.19 0.95 -0.65 0.47 0.82 -0.2 0.45
- 0.55 -2.15 -0.56 0.69 0.94 0.73 0.33 -0.49 0.12 -2.14 0.22
- -4.15 -2.25 0.31 0.45 0.05 -0.07 -0.23 0.54 1.19 0.07 0.59
-0.49 -0.01 -0.64 -0.41 0.28 0.01 -0.08 -0.1 0.16 0.69 0.08 0.02
-0.58 -0.29 -0.31 -0.19 0.38 0.33 -0.01 -0.06 -0.16 0.28 0.15 0.13
-0.52 0.22 -0.69 0.28 -0.21 -0.16 -0.24 -0.31 -0.41 0.83 0.17 0.31
-0.67 0.23 -2.38 -0.37 -0.06 -0.39 0.02 -0.11 -0.03 0.69 0.34 0.77
-0.13 0.23 -0.4 0.07 -0.12 -0.52 -0.11 -0.24 0.34 0.42 -0.05 0.21
-1.55 0.12 -2.54 0.71 0.54 -2.11 0.04 - 0.6 0.42 0.17 1.06
-0.78 -0.35 -0.49 0.06 0.32 -0.08 0.52 -0.23 0.14 0.48 -0.11 -0.03
- -1.59 -0.56 0.09 -0.11 0.22 0.92 0.14 0.98 0.46 -0.38 -0.5
-1.39 0.24 -1.12 0.76 0.34 -0.99 -0.42 -0.77 0.29 0.86 -0.16 0.33
-1.25 0.04 -0.64 0.38 0.37 -0.44 -0.44 -0.06 0.06 0.62 0.2 0.2
-2.4 -0.92 -1.55 0.35 0.34 -0.2 0.15 -0.1 0.08 1.16 0.35 -0.12
-0.32 0.73 -1.1 -0.25 -0.27 -1.03 -1.27 -0.56 0.36 0.93 0.05 0.68
-0.55 -0.24 -0.92 -0.09 0.18 -0.05 0.18 -0.33 0.41 0.54 -0.1 0.34
-0.69 -0.1 -0.7 0.06 -0.08 0.26 0.17 -0.16 0.23 0.43 0.0 0.12
-1.98 0.25 -3.56 0.62 0.38 -0.97 -0.89 -3.35 0.41 1.05 0.07 1.03
-5.16 0.11 -1.71 0.22 0.15 -0.72 -0.93 -1.47 0.19 1.46 0.29 0.76
- 1.8 - 1.19 - - - - 1.0 1.1 - 1.07
-1.49 -0.38 -0.95 -0.4 0.04 -0.16 0.25 -0.42 0.44 0.51 0.39 0.72
-0.52 0.03 -0.38 -0.04 -0.13 -0.35 0.3 -0.1 0.34 0.49 -0.06 0.07
-0.24 0.18 -0.76 0.03 0.35 -0.63 -0.4 -0.02 0.19 0.45 0.01 0.31
-0.92 -0.26 -1.15 0.21 0.19 -0.54 0.12 0.03 0.21 1.03 -0.27 0.08
-0.74 0.35 -0.45 0.43 0.19 -0.47 -0.5 -0.28 0.01 0.49 -0.18 0.44
-0.43 0.45 -0.26 0.37 -0.0 -0.9 -1.07 -0.82 0.13 0.72 -0.28 0.7
-0.1 0.56 -0.54 0.34 -0.13 -1.01 -0.27 -0.27 0.34 0.36 -0.15 0.17
-2.15 -0.42 -1.54 0.69 -0.19 0.45 -0.14 -1.6 -0.0 1.13 -0.05 0.51
-1.06 0.56 -0.95 0.5 -0.18 -1.19 -0.06 -1.26 0.44 0.91 -0.1 0.31
-0.55 -0.41 -3.74 0.14 0.57 -0.15 -0.45 -1.4 0.51 0.7 -0.24 1.0
-0.95 0.05 -0.78 -0.52 -0.01 0.15 0.26 -0.34 0.08 0.35 0.48 0.44
-2.54 0.82 -1.29 -0.43 -0.21 -0.87 -0.65 -0.84 0.98 1.3 -1.72 0.66
-1.58 -0.3 -1.19 0.65 0.38 -0.96 -0.74 -0.81 0.2 1.07 0.03 0.67
-0.48 0.14 -0.64 0.28 0.31 -0.28 -0.36 -0.2 0.05 0.51 0.04 0.16
-0.89 -0.09 -1.51 0.06 0.31 -0.37 -0.32 -1.84 0.51 0.6 0.53 0.73
-3.03 -1.12 -0.83 0.42 -0.14 -0.33 0.58 -0.27 -0.09 -0.07 0.52 1.11
-0.36 0.02 -0.62 0.15 0.11 -0.04 0.17 -0.29 0.47 0.42 -0.35 -0.07
-0.47 0.62 -2.48 0.21 0.21 -0.16 -0.5 -0.88 0.11 0.49 -0.4 0.89
-0.45 0.09 -1.0 -0.12 0.1 -0.31 -0.39 -0.16 0.07 0.86 0.21 0.28
-1.96 -0.66 -0.66 -0.4 0.88 0.28 0.88 -0.08 -0.36 0.46 -0.33 -0.1
-0.77 -0.37 -1.64 0.1 -0.01 -0.09 0.33 -0.45 0.39 0.89 0.05 0.17
-0.58 -0.09 -0.41 0.29 0.3 -0.17 -0.16 -0.09 0.1 0.35 -0.01 0.17
-1.03 -0.56 -0.21 -0.02 -0.07 0.11 0.35 0.14 0.52 0.19 -0.16 0.14
-0.99 0.1 -2.87 0.52 -0.06 -1.43 -0.16 -1.39 0.29 0.99 -0.12 1.08
- 1.83 - - - - - - 2.03 2.13 - -
-0.98 0.41 -1.93 -0.75 -0.53 -0.73 0.28 -0.42 0.71 0.89 -0.11 0.71
-0.03 0.04 -0.33 0.11 -0.14 -0.18 0.03 -0.21 0.09 0.24 0.03 0.23
-1.51 0.6 -2.11 0.51 0.65 -2.01 -3.55 -1.61 -0.38 0.99 -0.42 1.46
-0.37 -0.05 -0.35 0.01 0.09 0.06 0.37 -0.09 0.13 0.07 -0.14 0.11
-0.25 -0.12 -0.87 0.18 -0.21 -0.34 -0.06 -0.33 0.16 0.52 0.08 0.62
-3.64 -0.66 -0.68 -0.05 0.16 0.11 0.4 0.39 0.66 0.38 0.0 -0.02
-2.73 -1.0 -3.78 0.43 0.27 -0.47 -0.11 -1.21 0.78 1.18 0.03 0.71
-1.03 0.73 0.14 0.22 0.58 -2.05 -1.65 -1.09 0.31 0.97 -0.83 0.38
-0.13 -0.16 -0.28 -0.14 0.13 0.27 0.11 0.02 0.04 0.09 -0.05 0.02
-0.92 -0.16 -0.89 0.26 0.34 -0.2 -0.41 -0.07 0.36 0.61 -0.2 0.39
-0.06 0.13 -0.72 -0.41 0.02 -0.35 0.14 -0.06 0.28 0.53 0.11 -0.02
- - - 0.59 - - - - 2.11 2.63 - -
-0.58 -0.07 -0.44 0.09 0.2 0.11 0.25 -0.33 0.24 0.06 -0.04 0.23
-0.42 -0.17 -0.34 -0.37 0.33 0.48 0.36 -0.14 -0.08 -0.02 0.01 0.03
-0.11 -0.15 -0.6 -0.49 0.18 0.36 0.29 0.08 -0.14 0.06 0.03 0.18
-0.68 -0.31 -0.66 0.16 0.24 -0.07 -0.03 -0.19 0.29 0.48 -0.04 0.32
- -1.27 -1.85 1.23 0.17 -2.78 - -1.81 0.75 1.47 -0.31 1.1
-0.86 0.01 -0.46 0.18 0.17 -0.03 0.12 -0.26 0.26 0.58 -0.29 0.06
-1.73 -0.39 -1.84 -0.34 0.39 -0.38 0.4 -0.4 0.43 0.56 0.39 0.65
0.01 0.15 -0.52 0.11 0.05 -0.19 -0.09 -0.05 0.23 0.27 -0.11 -0.02
-1.22 -0.45 -0.46 -0.3 -0.06 -0.28 0.14 -0.0 0.47 0.6 0.3 0.36
-0.63 0.62 -0.79 0.11 -0.03 0.17 -0.52 -0.67 0.41 0.58 -0.35 0.16
0.41 1.51 - -0.23 - - - - 1.58 1.26 - 0.66
-0.5 0.47 -0.12 -0.27 -0.24 -0.37 -0.08 -0.72 0.27 0.61 -0.26 0.5
-1.13 0.16 -1.1 0.51 -0.43 -0.12 -0.42 -0.91 0.62 0.43 0.11 0.71
-0.87 0.01 -0.49 -0.11 0.27 0.04 0.16 -0.08 0.08 0.4 0.03 0.15
-1.01 -0.62 -1.73 0.22 0.29 -0.18 0.47 0.08 0.41 0.74 -0.09 -0.16
- - - - - - - - 2.53 2.63 - -
- 0.55 -3.27 1.09 -0.45 -3.14 -1.74 -0.63 1.0 0.69 0.31 0.74
- -0.77 - 0.53 -0.19 -1.76 0.02 -1.56 0.49 1.49 0.22 1.05
-0.07 1.05 - 0.94 0.54 -0.63 - -0.62 0.83 0.34 -0.64 -0.68
- - - - - - - - 2.53 2.63 - -
-1.56 0.24 -1.5 -0.25 0.39 -0.09 0.11 -0.91 0.73 1.39 -0.71 -0.92
-0.62 0.31 -0.34 0.22 0.05 -0.4 -0.27 -0.09 0.29 0.5 -0.04 -0.0
-1.91 -0.7 - 0.46 0.65 -1.05 -0.43 -0.97 0.02 0.47 0.67 1.29
-0.59 0.38 -1.25 0.24 0.25 -0.34 -0.52 -0.04 0.24 0.66 0.07 -0.03
-1.36 -0.36 -0.79 0.14 -0.03 -0.08 -0.35 0.12 0.38 0.8 0.08 0.33
- 0.22 -0.9 -0.4 0.71 -0.23 - - -0.59 1.47 0.53 1.12
-0.29 0.12 -0.41 0.08 0.16 -0.06 0.18 -0.02 0.29 0.17 -0.48 0.03
-2.2 0.5 -1.09 0.47 0.15 -0.78 -0.84 -1.84 0.19 0.69 0.26 1.03
-0.11 0.15 -0.58 0.09 0.34 0.08 -0.27 -0.09 -0.07 0.1 -0.12 0.25
-1.67 0.68 - 0.11 0.66 -2.0 -0.58 -0.91 0.25 1.17 0.34 0.35
-0.65 0.69 -0.1 0.31 -0.04 -0.56 -1.17 -1.35 -0.19 0.56 0.45 0.45
-1.71 -0.12 -2.21 1.13 -0.3 - - -2.85 0.38 1.04 0.02 1.61
-0.09 -0.04 -0.57 -0.25 -0.0 -0.0 -0.1 -0.08 0.11 0.38 0.18 0.26
-0.99 -0.08 -1.24 -0.22 0.06 0.16 -0.41 -0.06 0.48 0.38 0.42 0.45
-0.07 0.01 -0.41 -0.03 -0.06 -0.2 0.02 -0.07 0.05 0.33 0.08 0.23
-0.5 0.44 -0.51 0.29 -0.02 -0.35 0.13 -0.37 0.23 0.58 -0.67 0.11

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.