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Heatmap: Cluster_122 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-2.35 -0.53 -0.6 0.19 0.47 0.03 -0.45 -0.27 0.21 0.61 0.46 0.35
-1.07 -0.3 -0.5 0.03 0.26 0.08 -0.0 -0.18 0.12 0.35 0.21 0.42
-1.15 -0.28 0.26 0.32 0.22 0.29 0.05 -0.12 -0.06 -0.06 -0.04 0.06
-0.44 -0.2 -0.02 0.16 0.19 0.06 0.01 0.01 0.04 0.13 0.08 -0.13
-2.38 -0.55 -0.79 -0.19 0.19 0.37 0.1 -0.1 0.08 0.48 0.37 0.57
-0.61 -0.98 -0.68 -1.52 -0.49 0.13 0.21 0.12 0.68 0.45 0.66 0.36
-0.02 -0.91 -1.02 0.1 0.71 0.5 -0.15 -0.94 -0.57 -0.04 0.22 0.72
-1.53 0.03 0.06 0.21 0.21 0.02 -0.0 -0.19 0.15 0.29 -0.02 0.11
-0.28 -0.51 -0.36 -0.2 0.02 0.26 0.0 -0.3 -0.12 0.16 0.39 0.54
-0.11 -0.22 -0.26 -0.12 0.01 0.06 -0.12 -0.29 0.02 0.07 0.2 0.55
-0.04 -0.13 -0.28 -0.37 0.03 0.12 -0.06 -0.01 0.08 0.15 0.1 0.29
-1.95 -0.65 -0.1 0.03 0.32 -0.03 0.01 0.0 0.31 0.43 0.18 0.26
0.0 -0.08 -0.07 -0.25 -0.13 -0.17 0.04 0.03 0.12 0.09 0.14 0.21
-0.1 -0.14 -0.24 -0.06 0.02 -0.02 -0.18 -0.15 0.05 0.17 0.21 0.33
-0.79 0.06 -1.04 -0.82 -0.24 0.28 -0.44 0.22 0.27 -0.05 0.6 0.74
-2.69 -0.65 -0.24 0.47 0.34 0.04 -0.01 0.12 0.11 0.15 0.28 0.26
-0.52 -0.2 -0.11 -0.09 0.28 0.28 0.12 -0.22 -0.13 -0.03 0.11 0.29
-1.72 -0.05 -0.15 0.21 0.15 -0.07 -0.03 0.16 0.17 0.52 0.2 -0.32
-1.38 -0.17 -0.64 -0.17 0.66 0.16 -0.28 -0.05 -0.15 0.47 0.29 0.26
0.03 -0.01 -0.05 -0.17 -0.09 0.03 -0.07 0.03 0.01 0.06 0.11 0.07
-0.15 -0.1 -0.06 -0.06 0.14 0.06 -0.1 0.0 -0.08 -0.0 0.01 0.29
-0.71 -0.01 -0.82 0.04 -0.06 -0.04 -0.27 -0.22 -0.05 0.3 0.45 0.7
-3.95 -1.81 -0.82 -0.1 0.33 0.34 0.02 0.03 0.19 0.7 0.62 0.36
-0.04 -0.26 -0.22 -0.17 -0.01 -0.03 0.04 0.08 0.16 0.21 0.11 0.06
-1.83 -0.56 -0.85 -0.17 0.29 0.02 0.02 -0.24 0.25 0.73 0.25 0.56
-0.54 -0.52 -0.2 -0.02 0.3 0.23 -0.16 -0.25 -0.13 0.1 0.29 0.51
-0.97 -0.1 0.08 0.17 0.13 -0.11 0.12 -0.0 0.12 0.28 0.02 -0.06
-0.13 -0.26 -0.58 -0.56 0.44 0.39 -0.14 -0.17 -0.01 0.11 0.24 0.25
-0.93 0.07 -0.06 0.16 0.28 -0.04 -0.14 -0.15 -0.04 0.27 0.1 0.15
-0.77 -0.1 -0.06 -0.03 0.23 0.03 -0.18 -0.01 0.12 0.09 0.02 0.39
0.04 -0.23 -0.51 -0.52 0.05 0.09 0.12 -0.3 0.02 0.31 0.17 0.42
-0.75 -0.31 -0.59 0.15 0.4 -0.03 -0.42 0.02 -0.05 0.41 0.27 0.32
-2.06 -1.27 -0.7 -0.21 0.3 0.01 0.12 0.07 0.19 0.63 0.45 0.51
-1.15 0.0 -0.22 -0.12 0.2 -0.08 -0.11 -0.08 -0.28 0.28 0.34 0.58
-2.55 -1.57 - 0.81 -0.03 0.46 -0.54 -0.99 -0.91 0.22 0.94 1.36
-0.61 -0.41 -0.34 -0.15 0.31 0.16 -0.1 -0.13 0.11 0.35 0.16 0.3
-0.27 -0.32 -0.58 -0.03 0.17 0.08 0.09 -0.31 0.25 0.22 0.07 0.35
-0.03 -0.05 -0.36 -0.27 -0.11 0.03 -0.26 -0.27 0.13 0.33 0.41 0.2
-1.17 -0.43 -0.46 0.26 0.49 0.26 -0.0 -0.28 -0.09 0.32 0.05 0.31
-0.48 -0.23 -0.09 -0.02 0.19 0.14 -0.25 -0.17 0.14 0.2 0.17 0.23
0.21 -0.06 -0.33 -0.23 -0.11 -0.03 -0.03 -0.38 -0.08 0.05 0.15 0.57
-2.36 -0.36 -0.17 0.1 0.39 0.03 -0.18 -0.03 0.18 0.46 0.36 0.12
-3.25 -0.34 -0.17 0.24 0.27 0.17 -0.16 -0.21 0.22 0.35 0.29 0.36
-2.35 -0.27 -0.18 -0.13 0.52 -0.46 -0.38 -0.12 -0.02 0.6 0.34 0.64
-0.9 -0.22 -0.33 -0.1 0.39 0.07 -0.14 -0.11 -0.23 0.3 0.3 0.45
-0.48 -0.26 -0.16 -0.2 0.06 0.08 0.03 0.08 0.12 0.19 0.14 0.23
0.0 -0.28 -0.69 -0.47 0.1 -0.06 0.26 -0.09 0.31 0.35 0.08 0.15
-2.69 -0.45 -0.36 0.11 0.03 0.0 -0.08 0.19 0.42 0.47 0.25 0.29
-2.51 -1.29 -0.78 -0.21 0.36 0.35 -0.14 -0.33 0.11 0.67 0.57 0.63
-1.34 -0.7 -0.32 -0.03 0.26 0.07 -0.08 -0.16 0.22 0.46 0.24 0.48
-0.03 0.04 -0.12 -0.08 0.2 -0.14 -0.34 -0.05 -0.08 0.1 0.19 0.21
- -2.73 -1.75 -2.79 -1.27 0.88 -0.43 0.34 0.3 0.7 1.09 1.1
-1.43 -0.05 0.05 0.04 0.29 0.08 0.05 -0.21 -0.13 0.19 0.07 0.41
-2.31 -0.34 -0.2 -0.31 0.16 0.11 -0.15 0.01 0.14 0.59 0.26 0.51
-2.41 -0.22 -0.17 -0.03 0.36 -0.12 -0.21 0.04 0.2 0.49 0.29 0.26
-0.86 0.02 0.03 0.27 0.35 0.22 -0.04 -0.22 0.04 -0.07 -0.08 0.02
-0.2 -0.19 -0.23 -0.02 0.18 0.17 -0.12 -0.17 -0.04 0.11 0.1 0.3
-3.81 -0.35 0.27 0.58 0.49 0.11 -0.22 -0.29 -0.07 0.22 0.04 0.18
0.05 0.01 -0.06 -0.12 0.16 -0.02 -0.31 -0.12 -0.18 0.1 0.14 0.25
-0.07 -0.0 -0.24 -0.24 -0.27 0.13 -0.1 -0.05 0.12 0.15 0.16 0.28
-2.79 -1.35 -0.77 -1.12 0.13 0.18 0.25 -0.0 0.26 0.9 0.23 0.81
-0.77 -1.1 -1.34 -0.46 0.7 0.49 -0.16 -0.52 0.09 0.67 0.2 0.49
0.28 0.08 -0.62 -0.21 -0.11 0.0 -0.08 0.04 -0.2 -0.05 0.26 0.35
-0.77 -0.12 -0.38 -0.18 0.53 0.04 -0.14 -0.18 -0.17 0.38 0.26 0.25
-1.42 -0.52 -0.1 0.2 0.36 0.33 -0.11 -0.18 -0.25 0.12 0.38 0.35
-0.31 0.03 -0.14 0.08 0.14 -0.26 -0.18 -0.05 0.07 0.0 0.05 0.41
-0.4 -0.22 -0.17 -0.09 0.1 0.01 -0.04 0.09 -0.04 0.22 0.11 0.29
-1.69 -1.25 -0.42 0.03 0.53 0.15 0.03 -0.06 0.14 0.48 0.37 0.25
-0.34 -0.29 -0.23 -0.01 0.16 0.03 -0.1 -0.12 0.14 0.26 0.17 0.18
-0.23 -0.03 -0.09 -0.29 -0.23 0.07 -0.08 -0.15 -0.08 0.12 0.31 0.47
-1.21 -0.12 -0.38 0.13 0.45 0.06 -0.16 -0.08 0.01 0.32 0.11 0.27
-0.98 -0.51 -0.78 0.19 0.43 -0.04 -0.11 -0.21 0.0 0.44 0.29 0.46
-0.81 -0.16 -0.05 0.01 -0.11 -0.21 -0.18 -0.14 0.11 0.09 0.3 0.67
-1.25 -0.09 -0.36 -0.14 0.09 -0.08 -0.07 -0.22 0.16 0.55 0.33 0.37
-0.65 -0.17 -0.46 -0.07 0.15 0.11 -0.39 -0.09 0.2 0.37 0.24 0.36
-2.42 -0.86 -0.45 -0.7 -0.03 0.35 0.28 0.21 0.36 0.5 0.49 0.28
-0.88 -0.25 -0.37 0.17 0.44 0.14 -0.18 -0.26 0.01 0.43 0.12 0.13
-0.3 -0.19 -0.32 -0.59 0.02 -0.02 0.08 0.25 0.38 0.31 0.06 0.03
-0.32 -0.08 -0.01 -0.02 0.22 0.14 -0.18 -0.0 -0.08 0.09 0.09 0.07
-0.28 -0.3 -0.19 -0.02 -0.21 0.13 -0.1 -0.06 -0.01 0.19 0.24 0.43
-0.31 -0.17 0.01 -0.11 0.25 0.21 -0.42 -0.12 -0.38 0.22 0.23 0.32
-0.8 -0.36 -0.36 -0.17 0.28 0.21 -0.03 0.05 0.2 0.27 0.28 0.03
-2.15 -1.48 -0.82 -0.28 0.32 0.29 -0.09 -0.48 0.28 0.79 0.5 0.62
-0.87 -0.02 0.32 0.53 0.36 0.25 -0.24 -0.23 -0.57 -0.19 -0.09 0.16

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.