Heatmap: Cluster_83 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.7 -0.46 -0.19 -0.14 0.08 0.19 0.03 0.33 0.18 0.23 0.25 -0.16
-1.56 -0.44 -0.07 0.02 0.21 0.28 0.28 0.28 0.19 0.01 0.09 -0.08
-0.82 -0.48 -0.17 -0.1 0.1 0.23 0.11 0.26 0.11 0.12 0.21 0.07
-2.13 -0.85 -0.14 0.26 0.39 0.56 0.35 0.15 0.06 -0.05 0.07 -0.2
-3.66 -0.74 0.12 0.19 0.46 0.65 0.16 0.1 -0.02 0.17 0.1 -0.36
-1.74 -0.61 -0.15 0.13 0.15 0.05 0.3 0.05 0.22 0.19 0.31 0.14
-2.3 -0.34 0.14 0.07 0.49 0.81 0.36 0.01 -0.25 -0.2 -0.18 -0.31
-0.47 -0.29 -0.32 0.09 -0.01 0.22 0.48 0.18 -0.06 -0.01 0.15 -0.26
-2.81 -1.47 -0.33 0.07 0.16 0.58 0.52 0.53 0.34 0.08 0.11 -0.41
-0.92 -0.24 0.05 0.26 0.41 0.76 0.18 0.25 -0.5 -0.56 -0.07 -0.48
-2.33 -0.62 -0.12 -0.08 0.04 0.22 0.18 0.46 0.3 0.28 0.27 -0.1
-0.82 -0.41 -0.13 0.16 0.15 0.4 0.51 0.03 -0.03 -0.01 -0.02 -0.29
-0.73 -0.48 -0.18 -0.04 0.12 0.27 0.22 0.25 0.15 0.14 0.14 -0.21
-0.66 -0.18 0.03 0.37 0.05 0.17 0.03 0.37 -0.01 -0.2 -0.02 -0.23
-1.49 -0.44 -0.1 0.04 0.27 0.53 0.39 0.2 0.18 0.03 -0.14 -0.38
-1.13 -0.81 -0.07 0.24 0.46 0.43 0.34 -0.07 -0.05 0.09 -0.08 -0.12
-3.35 -1.3 -0.17 -0.09 0.19 0.6 0.35 0.45 0.29 0.11 0.32 -0.29
-1.78 -0.5 -0.03 0.1 0.35 0.42 0.26 0.24 0.02 0.12 0.05 -0.27
-2.24 -0.58 -0.21 -0.11 0.2 0.5 0.12 0.39 0.19 0.2 0.17 -0.06
-1.45 -0.49 -0.17 0.18 0.13 0.34 0.25 0.33 0.08 -0.02 0.17 -0.09
-1.02 -0.41 -0.06 -0.02 0.14 0.32 0.33 0.26 0.27 0.11 -0.09 -0.35
-1.09 -0.27 -0.03 0.19 0.29 0.51 0.11 -0.06 -0.16 -0.02 0.14 -0.13
-1.3 -0.28 -0.32 -0.14 0.14 0.27 0.23 0.32 0.1 0.27 0.22 -0.16
-0.7 -0.41 -0.42 0.06 0.18 0.41 0.17 0.29 0.21 0.03 0.08 -0.32
-0.95 -0.31 -0.24 0.27 0.02 0.26 0.26 0.3 0.17 -0.15 0.18 -0.27
-1.8 -0.49 -0.18 0.17 0.4 0.36 0.09 0.05 0.17 0.2 0.15 -0.14
-1.82 -1.42 -0.46 -0.08 0.31 0.17 0.38 0.15 0.17 0.04 0.53 0.38
-2.84 -0.98 -0.11 0.2 0.24 0.41 0.38 0.23 0.29 0.11 0.07 -0.11
-0.7 -0.31 -0.04 -0.08 0.09 0.31 0.27 0.21 0.07 -0.0 0.07 -0.16
-2.46 -0.56 0.02 0.49 0.38 0.28 0.09 0.07 -0.08 -0.11 0.28 0.0
-0.47 -0.24 0.07 0.38 -0.04 0.4 -0.07 0.12 0.14 -0.18 -0.03 -0.34
-2.19 -0.57 -0.08 0.34 0.31 0.36 0.2 -0.01 0.24 0.32 -0.1 -0.22
-1.08 -0.33 0.01 0.01 0.06 0.42 0.38 0.05 0.07 0.04 -0.07 -0.05
-0.94 -0.44 -0.04 -0.1 0.03 0.27 0.38 0.38 0.2 0.19 -0.03 -0.44
-2.75 -1.27 -0.53 0.06 0.19 0.6 0.46 0.65 0.23 0.16 0.04 -0.39
-0.8 -0.51 0.01 0.05 0.26 0.65 0.44 -0.08 -0.18 -0.09 -0.14 -0.17
-0.81 -0.45 -0.16 0.01 0.13 0.34 0.28 0.3 0.06 0.01 0.08 -0.18
-3.33 -1.2 -0.54 0.21 0.14 0.44 0.61 0.48 0.16 0.1 0.1 -0.02
-1.77 -0.63 -0.22 0.06 0.14 0.43 0.36 0.13 0.26 0.14 0.09 -0.05
-1.8 -0.54 -0.35 0.06 0.25 0.53 0.32 0.08 0.19 0.21 -0.14 0.1
-1.47 -0.62 -0.27 -0.28 0.02 0.53 0.47 0.24 0.21 0.06 0.11 0.05
-0.52 -0.44 -0.22 -0.02 0.05 0.19 0.19 0.24 0.28 0.09 0.09 -0.19
-2.91 -1.04 -0.3 0.13 0.26 0.52 0.54 0.21 0.22 0.17 0.12 -0.21
-1.56 -0.69 0.06 -0.01 0.36 1.21 0.52 0.22 -0.54 -0.63 -0.23 -0.71
-1.2 -0.35 0.07 -0.07 0.14 0.39 0.09 0.24 0.11 0.11 0.08 -0.15
-3.59 -0.81 -0.05 0.06 0.16 0.31 0.37 0.52 0.31 0.26 0.04 -0.34
-0.9 -0.12 0.05 0.11 0.35 0.42 0.1 -0.05 -0.11 0.12 0.03 -0.43
-2.1 -0.79 -0.1 0.0 0.24 0.39 0.48 0.11 0.28 0.2 -0.03 -0.1
-2.17 -1.0 -0.22 0.05 0.64 0.82 0.43 0.34 -0.38 -0.05 -0.01 -0.48
-1.91 -0.5 0.02 0.56 0.38 0.37 0.21 0.27 -0.05 -0.23 -0.02 -0.37
-4.08 -1.61 -0.17 0.3 0.24 0.59 0.54 0.09 0.46 0.21 -0.15 -0.22
-1.97 -0.4 0.14 0.37 0.42 0.28 0.24 0.09 0.33 0.1 -0.37 -0.55
-1.03 -0.35 0.03 -0.09 0.18 0.31 0.16 0.29 0.16 0.17 0.03 -0.36
-2.15 -0.67 0.25 0.37 0.25 0.29 -0.01 0.34 -0.43 0.18 0.31 -0.19
-1.51 -0.78 -0.13 0.2 0.17 0.48 0.4 0.07 0.01 0.11 0.09 -0.05
-1.46 -0.36 0.1 0.05 0.21 0.24 0.1 0.14 0.08 0.3 0.04 -0.13
-2.57 -0.66 -0.0 0.07 0.34 0.42 0.33 0.15 0.08 0.14 0.11 -0.08
-2.97 -0.97 -0.38 -0.17 0.0 0.45 0.23 0.43 0.46 0.39 0.22 -0.05
-1.4 -0.59 -0.05 -0.08 0.19 0.37 0.36 0.14 0.31 0.18 -0.03 -0.21
-2.53 -0.58 0.1 0.31 0.47 0.76 0.4 -0.04 -0.15 -0.18 -0.17 -0.3
-1.74 -0.55 0.03 0.24 0.16 0.33 0.08 0.18 0.02 0.05 0.24 0.04
-1.43 -0.35 0.01 0.34 0.31 0.43 0.04 0.18 0.08 0.02 -0.18 -0.2
-3.03 -0.92 0.11 0.03 0.4 0.48 0.29 0.24 0.09 0.14 0.25 -0.39
-1.25 -0.43 -0.11 -0.09 0.22 0.5 0.33 0.24 0.1 -0.0 0.08 -0.29
-1.23 -0.47 -0.18 -0.06 0.18 0.41 0.32 0.13 0.09 0.1 0.02 0.09
-1.13 -0.6 -0.02 -0.03 0.12 0.47 0.3 0.28 0.15 0.03 0.07 -0.3
-3.89 -0.87 0.02 0.14 0.32 0.47 0.39 0.35 0.17 0.16 0.06 -0.38
-2.8 -0.43 -0.11 0.13 0.07 0.45 0.18 0.2 0.27 0.11 0.24 -0.1
-1.29 -0.23 -0.04 0.1 0.3 0.36 0.28 0.18 0.11 -0.07 -0.08 -0.24
-0.51 -0.4 -0.03 0.04 0.1 0.32 0.31 -0.04 0.14 0.08 -0.11 -0.13
-0.75 -0.33 -0.14 0.02 0.06 0.22 0.09 0.25 0.15 0.12 0.14 -0.12
-2.22 -1.11 -0.25 0.08 0.2 0.45 0.36 0.24 0.24 0.25 0.3 -0.24
-1.38 -0.47 0.06 0.17 0.22 0.45 0.37 0.25 0.1 0.01 -0.08 -0.53
-1.48 -0.49 -0.06 -0.01 0.36 0.43 0.31 0.22 0.08 -0.04 0.05 -0.2
-1.64 -0.23 0.08 0.16 0.26 0.51 0.32 0.17 -0.12 -0.24 -0.01 -0.18
-1.26 -0.36 -0.02 0.35 0.5 0.56 0.0 0.18 -0.24 -0.15 -0.05 -0.33
-1.96 -0.75 0.06 0.43 0.22 0.27 0.08 0.12 0.09 0.04 0.33 -0.16
-1.16 -0.33 -0.23 0.11 0.44 0.52 0.29 -0.06 -0.11 -0.06 -0.04 -0.03
-1.17 -0.66 -0.14 -0.01 0.22 0.41 0.4 0.2 0.09 0.03 -0.04 -0.01
-1.83 -0.57 -0.16 0.09 0.39 0.53 0.27 0.16 0.11 0.08 -0.01 -0.19
-1.53 -0.6 -0.21 -0.43 0.32 0.99 0.62 -0.03 -0.21 -0.05 -0.03 -0.26
-1.44 -0.57 -0.06 -0.09 0.13 0.43 0.28 0.15 0.11 0.08 0.19 0.02
-1.19 -0.46 -0.01 0.05 0.18 0.22 0.04 0.26 0.1 0.07 0.18 0.04
-1.06 -0.49 -0.13 0.32 0.28 0.43 0.31 0.0 0.11 0.07 -0.18 -0.28
-0.56 -0.14 -0.16 0.24 0.1 0.14 0.12 0.0 -0.02 0.08 0.12 -0.1
-1.2 -0.38 -0.2 0.12 0.31 0.3 0.24 0.33 0.08 -0.06 0.03 -0.17
-0.84 -0.18 -0.13 0.0 0.34 0.37 0.14 0.05 0.0 -0.08 0.15 -0.17
-1.28 -0.41 -0.25 -0.19 0.05 0.38 0.47 0.23 0.25 0.15 -0.1 0.0
-1.94 -0.6 -0.0 0.42 0.25 0.51 0.15 0.22 0.17 -0.04 -0.06 -0.3
-1.05 -0.31 -0.09 0.01 0.2 0.36 0.18 0.13 -0.05 0.04 0.18 -0.03
-2.13 -0.51 -0.02 0.25 0.45 0.39 -0.05 -0.1 0.06 0.32 0.24 -0.24
-1.66 -0.18 0.25 0.39 0.38 0.15 0.06 -0.2 -0.06 -0.0 0.08 -0.05
-2.77 -0.78 -0.24 0.25 0.25 0.26 0.27 0.05 0.19 0.14 0.35 0.14
-1.55 -0.34 0.3 0.32 0.53 0.81 0.34 0.38 -0.42 -0.78 -0.44 -0.85
-1.59 -0.58 0.04 -0.15 0.07 0.39 0.33 0.41 0.14 0.07 0.16 -0.22
-3.93 -0.98 -0.44 -0.02 0.62 0.83 0.39 0.16 0.31 0.07 -0.13 -0.41
-2.61 -0.61 -0.45 0.13 0.21 0.61 0.51 0.39 0.15 -0.02 0.23 -0.58
-2.55 -0.98 -0.71 -0.06 0.49 0.73 0.15 0.57 0.39 -0.14 0.17 -0.4
-0.82 -0.26 0.03 0.23 0.22 0.27 0.06 0.13 0.06 -0.05 0.02 -0.17
-1.0 -0.48 0.02 0.12 0.25 0.35 0.17 0.15 0.03 0.04 0.04 -0.15
-0.77 -0.23 0.18 0.21 0.23 0.17 0.11 0.03 0.04 0.0 -0.12 -0.11
-2.58 -0.75 -0.21 0.09 0.21 0.57 0.49 0.4 0.17 0.07 0.03 -0.41
-2.31 -0.75 -0.01 0.21 0.36 0.73 0.48 0.0 -0.04 -0.15 0.1 -0.38
-1.6 -0.57 -0.1 0.1 0.32 0.33 0.25 0.28 0.12 0.12 0.13 -0.3
-2.24 -0.7 -0.08 -0.01 0.13 0.42 0.54 0.54 0.11 -0.12 0.05 -0.24

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.