1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_41 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
1.46 0.85 0.79 0.75 0.71 0.91 1.22 1.06 0.96 1.19 1.13 1.25
0.03 0.02 0.0 0.02 0.0 0.09 0.04 0.1 0.05 0.02 0.02 0.02
1.09 0.75 0.8 0.99 0.86 1.31 1.47 1.55 2.65 2.12 2.1 1.76
0.98 0.38 0.44 0.38 0.1 0.21 0.47 1.11 1.03 1.4 0.76 0.7
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.05 0.0 0.02 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0
1.2 2.17 1.62 1.62 1.39 1.73 3.21 3.2 3.02 3.45 2.35 1.83
31.64 25.7 24.24 28.39 23.8 26.26 31.89 32.13 37.75 23.76 24.17 28.48
37.86 30.39 29.56 24.24 29.18 29.63 29.6 42.94 47.45 42.82 39.2 36.58
0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.14 0.04 0.09 0.12 0.15 0.05
3.79 1.79 2.55 1.26 0.95 1.55 3.22 5.33 6.58 4.84 3.63 4.04
0.3 0.1 0.09 0.24 0.1 0.2 0.22 0.69 0.8 0.51 0.32 0.42
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.04 0.0 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.08 0.12 0.0 0.02 0.02 0.0
0.14 0.05 0.05 0.0 0.0 0.1 0.89 0.7 0.7 0.31 0.22 0.11
0.07 0.0 0.03 0.04 0.09 1.24 3.69 3.97 1.96 2.4 1.25 0.74
0.1 0.17 0.07 0.02 0.14 0.05 0.57 0.84 0.58 0.74 0.6 0.19
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.15 0.14 0.1 0.02 0.21
4.43 5.1 4.85 7.45 5.0 4.66 8.36 4.3 7.49 7.72 7.2 7.62
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
0.14 0.05 0.12 0.02 0.02 0.07 0.07 0.09 0.25 0.1 0.13 0.12
0.07 0.21 0.22 0.37 0.54 0.98 1.42 1.23 1.18 1.29 1.1 0.46
0.0 0.04 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.08 0.02
0.07 0.19 0.0 0.2 0.4 0.43 0.43 0.83 0.6 0.4 0.15 0.09
0.0 0.22 0.06 0.0 0.04 0.06 0.42 0.38 0.05 0.08 0.02 0.28
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.03 0.12 0.02 0.08 0.06 0.02
0.03 0.07 0.0 0.04 0.0 0.21 0.66 0.53 0.49 0.27 0.21 0.14
0.53 0.13 0.1 0.07 0.18 0.16 0.89 1.23 0.9 0.55 0.53 0.65
0.82 0.2 0.37 0.49 0.29 0.2 0.68 0.91 1.77 0.96 0.66 0.47
0.75 0.32 0.26 0.6 0.9 2.81 3.75 2.74 2.12 2.61 2.08 0.97
3.52 1.36 1.93 0.81 0.77 1.93 3.45 4.79 4.89 4.21 3.25 2.52
2.5 1.22 0.73 0.9 0.82 0.47 2.29 3.05 3.08 3.86 2.37 3.1
3.25 1.96 1.21 0.67 0.52 1.43 2.73 5.52 5.07 4.08 4.19 3.4
0.35 0.07 0.19 0.07 0.07 0.52 0.77 1.43 1.54 1.13 0.88 0.43
0.55 0.52 0.47 0.28 0.37 0.47 1.04 1.74 1.57 1.9 1.89 1.5
1.27 0.93 0.28 0.4 0.0 0.08 0.64 1.06 2.3 1.45 1.62 1.32
0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.42 0.4 0.35 0.31 0.06 0.16
0.1 0.03 0.0 0.0 0.02 0.2 0.57 0.86 0.47 0.49 0.13 0.25
0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.7 0.8 0.49 0.23 0.21 0.09
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.19 0.24 0.14 0.1 0.04 0.07
0.47 0.13 0.09 0.13 0.17 0.34 0.5 0.57 0.71 0.8 0.55 0.51
0.5 0.22 0.39 0.16 0.23 0.58 1.23 2.37 1.56 1.19 1.15 0.56
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02
0.6 0.42 0.03 0.07 0.04 0.12 1.44 2.77 1.82 1.26 0.88 0.76
0.35 0.02 0.0 0.18 0.02 1.7 5.87 4.92 3.5 1.45 0.61 0.28
2.27 0.46 0.28 0.36 0.14 0.43 0.29 0.52 0.56 1.46 2.0 2.11
2.01 2.88 0.91 1.92 2.68 4.36 3.33 4.05 2.0 1.46 1.69 2.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.06 0.04 0.0
1.57 0.82 0.56 0.69 0.52 0.44 1.27 2.01 2.44 2.07 2.66 2.77
0.14 0.07 0.02 0.04 0.02 0.04 0.31 0.56 0.44 0.45 0.26 0.21
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.23 0.12 0.14 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.24 0.34 0.23 0.1 0.06 0.02
0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.08 0.15 0.04 0.12 0.0 0.09
0.07 0.02 0.05 0.04 0.0 0.07 0.47 0.56 0.77 0.69 0.38 0.39
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0
3.3 2.4 2.1 2.51 2.68 2.86 4.36 5.06 3.56 3.25 2.45 2.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.09 0.2 0.1 0.18 0.0 0.0
0.07 0.25 0.0 0.04 0.0 0.16 0.29 0.73 0.47 0.24 0.13 0.21
1.45 0.47 1.36 0.35 0.12 0.25 0.44 1.07 1.45 2.7 1.79 1.33
0.13 0.05 0.03 0.02 0.02 0.02 0.1 0.15 0.18 0.1 0.02 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.32 0.32 0.09 0.08 0.0 0.05
1.5 0.7 0.49 0.36 0.35 0.47 2.06 2.89 2.37 3.23 2.83 2.3
0.72 0.8 0.33 0.17 0.11 0.05 0.31 0.6 0.86 1.08 1.13 0.75
0.38 0.23 0.21 0.21 0.11 0.03 0.08 0.42 0.4 0.54 0.28 0.4
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.09 0.17 0.02 0.0 0.02 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.03 0.05 0.06 0.04 0.05
0.34 0.12 0.07 0.02 0.04 0.1 0.2 0.43 0.42 0.29 0.17 0.21
0.23 0.14 0.05 0.07 0.09 0.29 0.41 0.69 0.46 0.47 0.21 0.21
0.2 0.02 0.05 0.11 0.0 0.55 1.13 1.28 0.88 0.51 0.35 0.25
0.07 0.05 0.09 0.0 0.0 0.0 0.09 0.05 0.09 0.25 0.13 0.19
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.02 0.05 0.04 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.09 0.05 0.0 0.0 0.0
0.66 0.5 0.28 0.31 0.37 0.37 0.6 1.0 1.03 1.37 0.94 0.7
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.14 0.12 0.04 0.02 0.0
0.38 0.0 0.05 0.06 0.05 0.06 0.22 0.67 0.46 0.78 0.55 0.44
0.72 0.35 0.44 0.28 0.12 0.53 1.08 1.41 1.08 1.19 0.88 0.81
0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.05 0.12 0.1 0.09 0.02
1.01 0.15 0.05 0.04 0.02 0.02 0.26 0.43 0.33 0.47 0.67 0.49
0.51 0.18 0.07 0.07 0.17 0.21 0.48 0.41 0.65 0.59 0.75 0.44
69.85 55.26 43.97 43.93 44.7 48.57 61.82 72.15 76.12 71.88 71.09 63.08
0.2 0.32 0.49 0.5 0.29 1.13 1.45 1.18 1.19 1.0 0.77 0.72
0.38 0.25 0.23 0.23 0.27 0.17 0.12 0.12 0.18 0.57 0.28 0.49
0.31 0.24 0.1 0.21 0.38 0.77 0.91 1.07 0.84 0.69 0.58 0.23
0.07 0.07 0.02 0.11 0.02 0.03 0.13 0.19 0.05 0.26 0.19 0.12
0.14 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.07 0.09 0.14 0.16 0.09 0.02
0.77 0.44 0.23 0.37 0.31 0.17 0.24 0.57 0.56 0.94 0.73 0.84
0.26 0.26 0.0 0.04 0.09 0.05 0.39 0.2 0.25 0.39 0.53 0.21
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
2.33 2.65 1.55 1.46 1.84 2.53 2.66 3.88 4.04 5.01 2.76 3.98
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.23 0.16 0.02 0.0 0.0
0.13 0.24 0.05 0.13 0.09 0.1 0.36 0.49 0.48 0.33 0.28 0.35
0.5 0.0 0.07 0.07 0.0 0.21 0.08 0.13 0.2 0.56 0.44 0.35
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.06 0.0 0.07 0.0 0.07 0.07
0.17 0.13 0.04 0.11 0.05 0.07 0.19 0.0 0.12 0.06 0.11 0.16
0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.29 0.12 0.06 0.06 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)