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Heatmap: Cluster_107 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.76 -0.36 -0.11 0.03 0.28 0.37 -0.3 0.09 -0.09 0.04 0.3 0.13
-0.28 0.16 -0.12 -0.76 -0.55 -0.67 -0.94 -0.31 -0.13 0.38 0.86 0.91
-1.46 0.18 -1.23 - 0.0 -0.1 -2.03 -0.58 0.29 0.73 0.73 1.43
0.91 -0.45 -1.04 -1.97 -1.08 -1.01 -0.84 -0.31 -0.24 0.5 1.12 0.92
-0.16 -0.15 -1.22 -0.61 -1.47 -0.41 -0.12 -0.96 -0.78 0.89 0.46 1.46
-0.88 0.77 -1.8 -0.91 -0.28 -1.06 -2.49 - 0.56 0.46 0.38 1.73
-0.43 0.01 -0.23 -0.5 -0.24 0.07 0.07 0.03 0.21 0.45 0.01 0.27
-0.3 -0.21 -0.25 -0.28 -0.01 0.17 0.08 -0.09 0.08 0.23 0.09 0.32
-0.54 -0.28 -0.49 -0.24 0.22 0.17 -0.18 0.12 0.16 0.3 0.19 0.24
-0.46 -0.3 -0.32 -0.01 0.24 0.17 -0.35 -0.37 -0.38 0.15 0.46 0.62
-0.58 -0.08 -0.14 -0.22 -0.06 -0.08 -0.2 0.06 0.07 0.24 0.24 0.47
-0.03 -0.22 -0.25 -0.39 -0.23 -0.01 -0.09 0.19 0.12 0.22 0.3 0.21
0.11 0.83 -1.34 -1.49 -0.87 -0.63 -0.45 -0.64 0.04 0.37 0.79 0.84
-2.3 0.39 0.04 -0.72 0.0 0.24 -0.5 0.15 -0.36 0.45 0.55 0.33
-0.49 -0.65 -0.73 -0.77 -0.06 0.1 -0.01 0.15 -0.02 0.63 0.59 0.36
0.4 -0.25 -1.57 -2.23 -1.66 -1.83 -0.9 -0.41 -0.92 0.18 1.37 1.66
- 2.45 - 0.43 - - - - 0.32 - - 1.98
-0.33 0.28 -0.4 -0.75 -0.35 -0.24 -0.23 -0.11 -0.18 0.36 0.42 0.79
0.57 -0.04 -0.77 -1.28 -2.74 -1.53 -2.46 -2.62 -0.7 0.52 1.19 1.75
-0.51 -0.53 -0.95 -0.51 0.17 0.26 0.12 -0.07 -0.12 0.28 0.49 0.58
-0.77 -0.1 -0.51 -0.36 -0.44 -0.54 -0.34 -0.46 -0.03 -0.14 1.05 1.07
-0.45 -0.2 -0.27 -0.31 -0.1 0.19 -0.31 0.01 0.13 0.15 0.43 0.4
-2.39 -1.34 -1.94 -1.27 0.09 0.53 -0.04 0.97 -0.06 0.59 0.75 0.22
-0.82 -0.09 -0.05 -0.0 0.01 0.49 0.1 0.04 0.05 0.03 0.0 -0.06
-0.28 -0.38 -0.12 -0.33 -0.23 -0.0 0.07 0.1 0.3 0.04 0.38 0.22
- 1.38 - - - - - - - - 1.64 2.65
-1.01 -0.56 -0.37 -0.06 -0.19 0.37 -0.11 0.25 0.1 0.12 0.53 0.26
-1.21 0.67 -1.08 -1.61 -2.05 -2.11 -1.38 -1.33 -0.42 1.48 1.01 1.25
-2.93 0.38 0.41 -1.32 -1.62 -1.63 -0.82 0.03 0.29 0.53 0.39 1.4
-1.06 -0.32 -0.56 -0.41 0.08 0.05 -0.11 -0.48 0.33 0.41 0.55 0.59
-0.11 0.31 -0.41 -0.35 -0.26 -0.29 -0.48 -0.18 0.0 0.35 0.33 0.59
-3.64 -1.26 -1.18 -0.3 0.28 0.26 0.43 -0.05 0.44 0.84 -0.05 0.5
-2.25 0.11 0.37 -0.78 -0.1 -0.65 -0.16 -0.38 -0.16 0.41 0.71 0.8
-0.51 -0.38 -0.51 -0.52 -0.33 0.22 0.17 -0.0 -0.16 0.15 0.47 0.72
-0.51 0.69 -1.54 -2.26 -1.22 -1.09 -0.83 -0.52 -1.04 0.7 1.28 1.29
-0.32 0.62 -0.94 -0.59 -0.18 -0.02 -0.3 -0.15 -0.39 0.25 0.63 0.48
-0.4 -1.04 -1.15 -0.27 0.23 -0.57 0.02 -0.23 -0.29 0.07 1.01 0.92
-0.66 0.36 -0.87 -0.59 -0.14 -0.48 -0.4 0.16 0.11 0.57 0.47 0.49
0.44 1.09 -1.27 -1.69 -1.92 -3.41 -2.7 -1.75 -1.73 0.18 1.54 1.4
0.06 1.33 -1.61 -0.98 -1.5 - - - -2.42 0.18 1.31 1.79
-0.05 0.07 -2.89 -1.76 -1.99 -3.0 -3.53 -1.99 -0.98 0.79 1.79 1.65
-0.79 -0.92 -0.79 -0.29 0.38 0.49 0.29 0.01 0.12 0.21 0.08 0.34
-2.51 -0.87 -1.23 -4.27 -0.63 0.44 -0.51 0.01 0.42 0.2 0.63 1.61
-0.86 0.21 -1.99 -3.31 -2.58 -0.81 0.06 -0.04 -0.29 0.94 1.17 1.15
-1.08 -0.49 -0.68 -0.45 -0.01 0.17 0.27 -0.12 -0.31 -0.04 0.86 0.7
-0.64 -0.6 -0.5 -0.34 0.01 0.62 0.47 -0.1 0.21 -0.0 0.12 0.14
-0.48 1.24 -2.18 -0.23 -0.73 -1.53 -2.39 -0.53 -0.83 0.57 0.63 1.28
-0.84 1.13 -1.04 -1.12 -0.16 -1.1 -1.4 -1.75 -0.54 0.68 0.64 1.27
-0.97 0.61 - -0.97 -0.52 -1.68 -0.43 -0.15 0.32 0.7 0.57 1.29
-0.28 -0.53 -0.99 -0.68 0.23 -0.27 -0.28 -0.21 0.24 0.55 0.51 0.68
-0.7 -0.23 -0.34 -0.48 -0.26 -0.12 0.08 0.12 0.27 0.29 0.38 0.5
-0.53 -0.43 -0.18 -0.29 -0.3 0.2 0.12 0.02 0.1 0.19 0.45 0.28
-0.74 -0.61 -0.79 -0.61 0.3 0.01 -0.02 -0.11 -0.17 0.6 0.53 0.6
0.71 -0.04 -0.64 -0.62 -0.42 -0.68 -1.05 -1.77 -1.45 -0.0 1.1 1.29
-0.24 1.08 -0.26 -0.54 -0.27 -0.84 -0.98 -0.29 -0.19 0.25 0.27 0.62
-0.77 -0.27 -0.2 -0.16 -0.14 0.07 0.22 0.18 -0.01 0.22 0.29 0.25
-0.52 -0.75 -0.33 -0.23 -0.38 0.35 0.21 0.12 0.26 0.19 0.36 0.21
-0.42 -0.21 -0.14 -0.07 0.04 0.14 0.02 0.13 -0.04 0.1 0.17 0.16
-1.96 -0.67 -0.86 -0.83 -0.34 0.01 0.4 -0.23 0.3 0.65 0.49 0.87
-0.05 0.58 -0.71 -0.27 -0.24 -0.33 -2.25 -0.92 -0.31 0.69 0.86 0.57
-0.24 -0.36 -0.29 -0.12 0.13 0.17 0.06 0.14 0.17 0.08 -0.04 0.16
-1.75 0.34 -0.66 -0.32 -2.43 -1.46 -0.17 0.02 0.01 -0.08 0.96 1.41
-2.18 -1.61 -1.94 -0.67 0.38 0.66 0.16 0.65 0.19 0.27 0.34 0.48
-0.37 -0.15 -0.31 -0.12 0.11 0.04 -0.03 0.13 0.12 0.19 0.03 0.24
-0.34 -0.16 -0.42 -0.43 -0.19 0.24 0.07 0.04 0.13 0.27 0.22 0.3
-0.92 -0.39 -0.51 -0.14 -0.34 -0.18 0.11 -0.12 0.54 0.37 -0.11 0.81
-1.54 -1.08 -0.68 -0.42 -0.11 0.42 0.4 0.06 -0.01 0.21 0.68 0.52
-0.96 -1.0 -0.33 -0.26 -0.25 0.14 0.51 0.23 0.2 0.11 0.3 0.43
-1.53 0.47 -1.13 -0.3 0.15 -0.3 0.01 -0.85 -0.6 0.67 0.29 1.02
-0.98 -0.4 -0.98 -0.57 -0.25 0.09 -0.13 -0.43 -0.14 0.49 0.64 1.08
-0.86 0.38 -0.33 -0.06 -0.24 0.12 -0.3 -1.82 -0.09 0.34 0.89 0.38
-0.16 -0.02 -0.27 -0.19 -0.09 -0.21 -0.06 -0.02 0.08 0.31 0.11 0.36
-0.22 0.15 -0.69 0.2 0.2 -0.71 -0.47 -0.92 -0.03 0.48 0.3 0.73
-0.17 0.06 -0.48 -0.97 -0.39 0.14 0.03 -0.21 0.19 0.45 0.39 0.35
-0.75 0.41 -1.07 -0.57 -0.57 -1.57 -0.38 -0.57 -0.06 1.14 0.48 0.94
-0.51 1.07 0.22 -0.34 -0.64 -1.81 - -0.6 -2.78 0.06 1.45 0.79
-0.12 -0.29 -0.36 -0.39 -0.17 0.09 0.15 -0.08 0.17 0.22 0.29 0.26
-0.23 -0.49 -0.47 -0.47 -0.34 0.05 0.03 0.15 0.22 0.25 0.4 0.45
-0.26 -0.41 -0.26 -0.11 -0.09 0.2 0.17 0.03 -0.05 -0.05 0.26 0.36
-0.83 -0.36 -0.39 -0.27 -0.08 0.26 0.08 0.02 0.28 0.22 0.27 0.35
-0.03 -0.15 -0.16 -0.3 -0.55 -0.05 -0.04 0.04 0.0 0.12 0.49 0.34
-1.88 -0.99 -0.82 -0.41 -0.28 0.22 0.2 0.09 0.2 0.3 0.74 0.74
0.16 0.51 -1.73 -0.91 -0.18 -0.55 -0.72 -1.6 -1.75 -0.21 0.9 1.63
-1.45 -0.99 -0.86 -0.84 -0.28 -0.71 0.1 0.04 -0.16 0.91 0.63 1.12
-1.6 1.59 -1.01 -0.6 -0.06 - -1.97 - -2.29 0.54 1.37 1.03
-3.52 0.51 -1.6 -2.23 -1.29 -0.07 -0.89 -0.89 0.41 0.5 0.82 1.59
1.09 0.18 -0.58 -1.0 -1.45 -1.63 -1.66 -1.0 -0.61 0.6 0.91 1.01
-0.74 -0.26 -0.22 -0.14 0.1 0.18 0.07 0.13 0.0 0.2 0.35 0.05
-0.95 0.01 -0.56 -0.31 -0.06 -0.03 0.11 0.1 0.18 0.31 0.18 0.45
-1.2 0.52 -0.79 -0.36 0.06 -0.55 -0.62 -0.27 0.19 0.64 0.4 0.64
0.85 0.65 -0.93 -2.32 -1.64 -2.12 -1.55 -1.2 -0.35 0.17 1.18 1.27
-2.06 -0.77 -1.18 -0.93 0.04 -0.11 -1.33 0.21 0.39 0.71 0.78 1.03
-0.89 -0.5 -0.93 -0.96 0.1 -0.97 -0.2 -0.74 -0.38 0.86 0.88 1.15
0.01 -0.68 -0.76 -0.54 0.15 -0.1 -0.32 -0.67 -0.42 0.19 0.92 0.88
-0.13 0.06 -0.37 -0.07 -0.01 -0.02 -0.11 -0.33 -0.1 0.08 0.32 0.45
-0.99 -0.97 -2.45 -1.17 -1.31 0.01 -0.8 -0.43 -0.62 1.06 0.95 1.57
0.04 -0.84 -0.42 -2.17 -1.13 -0.42 - 0.36 -0.05 -0.62 1.63 1.16
-0.99 -0.86 -1.08 -0.94 -0.12 0.37 0.06 0.22 -0.06 0.41 0.79 0.59
-0.81 0.52 -1.19 -0.32 -0.4 -0.74 -0.54 -0.47 0.07 0.77 0.57 0.81
-0.54 -0.14 -0.13 -0.31 -0.11 0.23 -0.22 -0.04 0.18 0.11 0.19 0.49
- - 1.74 - - - - - - - 2.11 2.12
0.19 0.0 -0.16 -0.13 -0.12 -0.11 -0.13 0.01 0.06 0.07 0.1 0.15
0.05 0.42 -0.51 -0.24 -0.22 -0.46 -0.28 -0.22 -0.04 0.16 0.21 0.65
-0.52 0.57 -0.35 -0.28 -0.65 -1.35 -1.09 -0.82 -0.59 0.46 0.86 1.2
-1.02 -0.03 -1.17 -0.02 -0.41 -0.72 -0.34 -0.27 0.56 0.7 0.32 0.83
0.25 0.52 -0.33 -0.35 -0.07 -0.46 -0.91 -1.17 -0.44 0.29 0.4 0.9
-0.4 -0.09 -1.08 -0.46 -0.06 -0.25 -0.33 0.12 0.17 0.62 0.32 0.6
0.2 0.56 -1.84 -1.04 -1.4 -2.4 -1.58 -1.08 -0.61 0.03 1.25 1.67
-1.46 -2.12 -1.13 -1.39 -1.75 0.07 -0.19 0.16 -0.04 0.96 1.3 0.89
-0.27 -0.73 -0.41 -0.67 -0.1 -0.22 0.06 0.14 0.2 0.18 0.35 0.75
-0.27 -0.42 -0.24 -0.31 -0.24 -0.01 -0.02 0.13 0.06 0.03 0.53 0.42
-0.42 -0.3 -0.14 -0.21 -0.24 0.25 0.29 -0.03 0.11 0.0 0.2 0.26
-1.53 -1.95 -1.95 -1.12 -0.21 -0.04 -1.47 0.02 0.12 0.81 1.17 1.25
-2.73 1.02 0.39 -0.89 -0.46 -0.33 -0.76 -0.33 -0.13 0.26 0.51 0.6
-0.33 -0.05 0.23 0.03 0.16 0.02 -0.49 -0.51 -0.03 -0.0 0.51 0.13
-1.01 -0.86 -1.27 -1.01 -0.28 0.08 -0.19 0.22 0.22 0.45 0.91 0.77
-2.19 -0.57 -1.33 -0.67 0.55 0.47 -0.14 -0.76 0.64 0.92 0.28 0.09
-0.68 0.55 -0.75 -0.13 -0.1 -0.36 -0.37 -0.73 -0.34 0.46 0.51 0.79
-0.72 -0.72 -0.4 -0.16 -0.01 0.15 0.17 -0.0 0.13 0.29 0.53 0.21
-1.07 -0.69 -0.41 -0.16 0.0 0.26 0.05 0.08 0.06 0.19 0.58 0.36
- -1.79 - -0.14 0.74 0.29 -0.7 -1.47 -0.15 0.63 0.65 1.55
- -1.78 -2.91 -2.51 -0.67 0.41 0.42 0.09 0.3 0.77 1.17 0.88
- 2.24 - 0.54 - - - - - - 1.5 1.58
- 1.84 -0.6 -0.18 -0.1 - - - -0.29 - 0.77 1.78
-0.86 -0.36 -0.45 -0.64 0.33 0.46 0.1 -0.12 -0.17 0.09 0.43 0.46
0.41 0.19 0.45 -0.19 -0.38 -0.21 -1.17 -1.0 -0.09 -0.37 0.68 0.47
-0.66 -0.0 -0.5 -0.58 -0.02 0.0 -0.75 -0.21 -0.19 0.3 0.66 0.89
-1.06 0.24 -0.44 0.01 -0.26 -0.83 -0.3 -0.44 -0.35 0.57 0.58 0.91
- -1.46 - -0.58 0.24 0.65 0.49 -0.49 0.13 1.24 0.39 0.41
-0.56 -0.31 -0.27 -0.36 -0.2 0.05 0.14 0.05 0.13 0.26 0.42 0.3
-2.97 -0.73 -1.06 -0.7 -0.59 0.57 0.18 0.53 0.21 0.61 0.58 0.34
-0.49 1.45 -0.84 -1.19 -0.32 -0.56 -1.47 -0.2 -0.37 -0.37 0.59 0.84
-0.71 -0.27 -0.53 -0.3 -0.16 -0.15 -0.61 -0.64 -0.21 0.28 1.1 0.79
-0.46 -0.57 -0.43 -0.13 0.04 0.06 0.21 0.07 0.26 0.33 0.24 0.06
0.38 0.61 0.67 -1.27 -0.75 - -1.26 -1.64 0.4 -2.97 1.24 1.02
-0.99 -0.88 -1.57 -0.95 -0.28 0.16 0.13 -0.32 -0.47 0.29 1.04 1.18
-0.57 -0.78 -0.64 -0.77 -0.39 0.01 0.02 0.33 0.3 0.49 0.63 0.38
-0.43 -0.49 -0.39 -0.19 -0.02 0.23 0.1 0.16 -0.01 0.18 0.41 0.14
-0.34 -0.38 -0.33 -0.27 -0.25 -0.01 -0.03 0.08 0.18 0.46 0.18 0.39
-0.1 0.63 -1.35 -0.09 0.04 -0.63 -1.06 -0.94 -0.67 0.31 0.69 1.01
-0.06 -0.21 -0.2 -0.26 -0.11 -0.02 -0.13 0.11 0.03 0.25 0.28 0.17
- 1.45 -0.09 -0.95 0.4 - -2.09 -0.74 -2.1 -0.05 0.77 1.46
-0.06 -0.26 -0.32 -0.38 -0.24 0.09 0.08 0.02 -0.11 -0.03 0.44 0.48
-1.4 -0.93 -0.99 -0.06 -1.97 -1.76 0.03 0.33 0.35 0.6 1.3 0.64
0.29 0.6 -0.63 -0.12 0.04 -0.74 -0.93 -0.15 -0.41 0.5 0.21 0.4
- 1.07 -0.28 0.26 0.24 -0.64 -3.08 -1.97 -0.15 0.56 -0.3 1.31
-0.57 -0.78 -1.43 -0.5 0.27 0.13 -0.23 -0.24 0.61 0.65 0.23 0.5
-2.32 -0.36 -0.37 0.05 -0.13 0.13 0.04 -0.34 0.19 0.13 0.47 0.83
-1.58 -0.66 -0.98 -0.43 -0.08 0.1 0.31 -0.64 0.39 0.3 0.34 1.05
-2.05 -0.84 -2.07 -0.85 0.06 -0.09 0.59 -0.95 0.3 0.61 0.5 1.15
- 0.73 - - - - 1.15 - 0.08 0.98 -0.03 2.04
0.91 -0.45 -0.55 -0.65 -2.46 -1.26 -1.2 -0.31 -0.13 0.48 1.02 0.92

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.