Heatmap: Cluster_15 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
1.9 1.2 0.63 -0.59 -2.18 -3.18 -1.55 -0.42 -0.64 -1.17 -0.88 -0.5
1.26 0.58 -0.38 -0.46 -0.62 -0.57 -0.21 0.21 0.0 -0.32 -0.47 -0.42
1.28 0.68 0.23 -0.64 -0.33 -0.28 -0.24 -0.2 -1.08 -0.53 -0.53 -0.06
1.41 0.81 0.25 -0.62 -0.68 -1.03 -0.19 0.12 -0.79 -1.35 -0.49 -0.01
1.43 0.29 -0.43 -0.21 -0.97 -0.72 -0.16 0.11 0.17 -0.2 -0.57 -0.47
1.21 0.85 0.66 -0.01 -0.93 -1.61 -0.81 -0.7 -0.44 -0.42 -0.33 0.0
0.99 0.83 -0.0 0.22 0.13 -0.34 -0.16 -0.14 -0.29 -0.79 -1.21 -0.86
1.66 1.01 0.34 -0.18 -1.17 -1.65 -0.8 -0.45 -1.01 -0.88 -0.51 -0.19
2.54 1.89 0.31 -1.15 -3.37 -4.56 -4.35 -2.27 -2.87 -4.87 -3.99 -2.5
1.47 1.13 0.26 -0.64 -1.07 -1.93 -1.31 -0.38 -0.82 -0.56 -0.17 0.22
1.58 1.06 0.24 -0.53 -0.93 -2.08 -1.3 -0.32 -0.77 -0.65 -0.29 0.05
1.66 1.06 0.2 -0.53 -1.29 -1.81 -1.2 -0.54 -0.63 -0.6 -0.4 0.05
1.49 0.91 0.59 -0.05 -0.47 -0.98 -0.39 -0.37 -0.98 -1.17 -1.3 -0.47
1.11 0.66 0.37 -0.4 -0.61 -0.76 -0.48 -0.18 -0.28 -0.31 -0.24 -0.16
1.75 1.15 0.46 -0.02 -0.59 -1.64 -0.9 -0.17 -1.4 -1.73 -1.3 -0.84
1.29 0.62 -0.16 0.17 -0.69 -0.66 -0.13 0.08 -0.39 -0.66 -0.66 -0.43
0.51 0.52 -0.03 0.25 -0.11 -0.6 -0.15 -0.03 0.1 -0.24 -0.26 -0.4
1.83 1.12 0.67 -0.4 -2.13 -2.88 -1.04 -0.34 -0.51 -0.95 -0.99 -0.89
1.02 0.56 -0.03 0.2 -0.29 -0.6 -0.24 -0.0 -0.13 -0.3 -0.69 -0.5
2.03 1.77 -0.25 0.2 -0.87 -3.99 -3.17 -1.23 -1.26 -2.13 -2.17 -1.04
2.1 1.51 0.02 0.37 -0.9 -3.03 -2.51 -1.26 -1.22 -2.33 -2.32 -1.08
0.9 0.73 0.29 0.33 0.11 -0.38 -0.34 -0.21 -0.74 -0.81 -0.69 -0.5
1.68 1.02 0.52 0.13 -1.71 -3.38 -1.16 -0.77 -0.99 -0.63 -0.44 -0.14
1.75 1.04 0.07 -1.4 -2.3 -2.88 -1.17 -0.18 -0.51 -0.37 -0.19 0.17
1.68 1.3 0.82 -0.17 -1.4 -2.73 -2.12 -0.73 -1.13 -1.3 -0.77 -0.21
1.21 0.32 -0.34 0.06 -0.08 -0.08 -0.28 -0.08 -0.37 -0.51 -0.24 -0.67
1.84 1.27 0.46 0.62 -0.77 -1.94 -1.7 -1.17 -1.72 -1.76 -1.79 -0.7
1.27 0.85 0.26 0.01 -0.05 -0.57 -0.49 -0.27 -0.74 -1.22 -0.95 -0.21
0.8 0.57 0.2 -0.17 -0.21 -0.33 -0.25 0.0 -0.15 -0.31 -0.38 -0.43
1.33 0.99 0.47 -0.25 -0.39 -0.62 -0.86 -0.57 -0.91 -0.84 -0.51 -0.26
0.56 0.45 0.05 0.02 0.01 -0.16 -0.37 -0.03 -0.31 -0.2 -0.28 -0.08
2.65 2.2 -1.32 -3.59 -4.92 -5.85 -6.03 -5.84 -5.77 -5.01 -6.02 -1.02
1.82 1.34 0.4 -0.45 -0.62 -1.22 -1.34 -0.83 -1.68 -1.52 -1.11 -0.47
1.1 0.62 0.37 -0.26 -0.34 -0.54 -0.19 0.03 -0.46 -0.64 -0.59 -0.37
1.74 1.2 -0.16 -0.43 -1.2 -2.81 -1.89 -1.09 -0.7 -0.44 -0.27 0.29
1.68 1.27 -0.02 -0.39 -1.06 -2.63 -2.64 -0.72 -1.01 -0.74 -0.2 0.34
1.03 0.57 0.54 -0.04 -0.25 -0.71 -0.45 -0.36 -0.6 -0.59 -0.3 -0.08
1.8 0.99 0.02 0.18 -0.74 -1.16 -0.73 -0.39 -0.85 -1.67 -1.33 -0.52
1.98 1.38 0.64 0.35 -0.58 -2.11 -2.34 -1.67 -2.41 -3.41 -2.17 -0.5
1.56 0.87 0.21 -0.13 -1.11 -1.28 -0.36 0.32 -0.23 -1.07 -1.21 -1.02
2.04 1.27 -0.02 -0.38 -1.31 -1.29 -0.96 -0.56 -1.1 -1.7 -1.33 -0.85
1.3 1.02 0.28 -0.38 -0.4 -0.79 -0.42 -0.2 -0.74 -0.58 -0.67 -0.55
0.51 0.17 -0.1 -0.16 -0.2 -0.07 0.12 0.1 0.07 -0.19 -0.29 -0.15
1.26 1.24 0.58 0.35 -0.08 -0.86 -0.64 -0.44 -1.23 -1.77 -1.49 -0.94
0.97 0.67 0.1 -0.14 -0.18 -0.91 -0.78 -0.1 -0.28 -0.22 -0.24 0.02
1.04 0.64 0.04 0.34 0.38 -0.12 -0.17 -0.05 -0.9 -1.21 -1.11 -0.77
1.29 0.8 0.28 0.27 -0.32 -0.29 -0.47 -0.5 -0.54 -1.03 -1.0 -0.61
2.23 1.42 0.26 -0.46 -2.4 -3.62 -2.36 -0.94 -1.2 -2.04 -1.29 -0.68
0.56 0.38 -0.12 0.24 -0.23 -0.26 -0.03 0.08 0.12 -0.23 -0.39 -0.54
1.18 0.78 0.2 -0.02 -0.66 -0.88 -0.2 0.12 -0.44 -0.51 -0.77 -0.48
1.3 0.9 0.08 -0.62 -0.62 -0.55 -0.45 -0.14 -0.43 -0.51 -0.5 -0.24
1.03 0.58 -0.21 -0.04 -0.18 -0.32 -0.19 0.2 -0.12 -0.49 -0.72 -0.58
1.27 1.09 0.18 0.31 -0.31 -1.66 -0.67 -0.1 -0.68 -1.04 -0.85 -0.43
0.99 0.48 0.21 0.13 -0.25 -0.27 -0.41 -0.19 -0.33 -0.43 -0.74 -0.12
0.83 0.52 0.12 0.05 0.05 0.04 0.11 -0.15 -0.33 -0.71 -0.87 -0.6
1.14 0.89 0.44 0.11 -0.63 -1.76 -0.75 -0.03 -0.45 -0.68 -0.4 -0.19
1.33 0.78 0.28 0.12 -0.92 -1.93 -0.57 -0.18 -0.38 -0.55 -0.39 -0.14
0.94 0.71 -0.08 0.08 -0.52 -0.69 0.19 0.45 0.21 -0.69 -1.31 -1.18
1.35 1.19 0.24 0.43 -0.2 -1.66 -0.91 -0.46 -0.98 -0.94 -0.92 -0.64
1.52 0.77 0.16 -0.55 -0.75 -0.67 0.1 0.63 -0.66 -2.15 -1.4 -0.88
0.73 0.8 0.19 0.26 0.17 -0.38 -0.39 -0.17 -0.55 -0.58 -0.71 -0.41
1.52 1.08 0.75 0.2 -1.56 -3.11 -1.52 -0.54 -0.59 -1.01 -0.69 -0.14
1.6 0.79 0.19 -0.43 -0.56 -0.78 -0.19 -0.28 -0.81 -1.02 -0.77 -0.41
0.87 0.61 0.18 -0.0 -0.39 -0.78 -0.12 0.15 -0.3 -0.67 -0.47 -0.03
1.57 1.38 0.7 0.08 -0.36 -1.34 -1.34 -0.67 -1.19 -1.78 -1.49 -1.16
1.51 0.67 0.08 -0.83 -1.14 -1.1 -0.01 0.46 -0.04 -0.57 -1.13 -0.88
1.08 0.52 -0.2 0.14 -0.18 -0.47 -0.18 -0.08 -0.23 -0.48 -0.51 -0.38
0.71 0.51 0.07 -0.12 0.24 0.2 -0.45 -0.15 -0.46 -0.53 -0.39 -0.28
0.83 0.47 -0.03 -0.12 0.18 0.2 -0.08 -0.2 -0.36 -0.57 -0.73 -0.35
0.85 0.94 0.22 0.04 0.26 0.17 -0.23 -0.17 -0.69 -1.11 -1.12 -1.07
1.27 0.62 -0.2 -0.06 -0.62 -1.11 -0.23 -0.3 -0.07 -0.27 -0.54 -0.05
0.59 0.2 0.07 0.24 -0.09 -0.16 -0.08 -0.12 -0.18 -0.23 -0.34 -0.16
2.06 1.32 -0.23 -0.99 -2.17 -2.77 -1.05 0.08 -1.08 -1.77 -0.97 -0.35
1.23 0.67 0.12 -0.17 -0.19 -0.39 -0.21 -0.08 -0.93 -0.88 -0.6 -0.12
0.76 0.49 0.15 -0.06 0.22 0.07 -0.16 0.04 -0.45 -0.8 -0.64 -0.43
1.2 0.75 -0.01 -0.25 -0.29 -0.44 -0.27 0.02 -0.28 -0.59 -0.78 -0.5
0.76 0.49 0.09 0.05 0.2 0.06 -0.21 -0.07 -0.45 -0.55 -0.62 -0.45
1.37 1.0 0.55 -0.02 -0.47 -0.59 -0.11 -0.06 -1.09 -1.56 -1.5 -0.92
1.73 1.38 0.49 -0.41 -0.94 -1.23 -1.78 -1.21 -1.4 -1.28 -0.72 -0.21
1.72 1.26 0.47 -0.4 -0.96 -1.04 -1.52 -1.15 -1.15 -1.2 -0.81 -0.11
0.42 0.42 -0.11 -0.17 -0.18 -0.05 0.04 0.05 0.29 -0.04 -0.5 -0.53
1.22 0.57 -0.09 0.22 -0.38 -0.84 -0.36 0.28 -0.08 -0.68 -0.67 -0.83
1.42 1.11 0.57 0.26 -0.21 -1.07 -0.63 -0.03 -1.04 -1.94 -1.75 -1.11
1.93 0.75 0.1 -0.14 -1.5 -1.61 -0.66 -0.24 -0.39 -1.13 -0.95 -0.64
1.58 0.8 0.02 -0.96 -1.59 -1.33 -0.54 -0.04 -0.49 -0.69 -0.31 0.29
1.37 1.23 0.42 0.15 -0.61 -1.66 -1.22 -0.42 -0.97 -1.04 -0.55 -0.35
1.46 1.14 0.43 0.12 -0.75 -1.53 -1.11 -0.5 -0.9 -1.0 -0.64 -0.26
0.85 0.57 0.28 -0.16 -0.13 -0.37 -0.22 -0.1 -0.24 -0.45 -0.49 -0.23
1.75 1.2 0.28 -0.64 -0.99 -1.42 -0.78 0.0 -0.58 -1.51 -1.23 -0.81
1.07 0.63 0.43 -0.05 -0.52 -0.7 -0.24 0.04 -0.39 -0.7 -0.57 -0.31
1.57 1.18 0.08 -0.72 -1.32 -1.49 -1.17 -0.67 -0.53 -0.47 -0.44 0.15
1.42 1.19 0.44 -0.42 -1.22 -2.07 -1.05 0.11 -0.42 -0.89 -0.77 -0.28
0.85 0.62 0.26 0.11 -0.08 -0.12 -0.2 -0.05 -0.48 -0.76 -0.67 -0.43
0.79 0.74 0.19 0.21 0.2 -0.5 -0.34 -0.18 -0.51 -0.75 -0.63 -0.27
1.21 0.9 0.56 -0.18 -0.39 -0.8 -0.94 -0.49 -0.72 -0.72 -0.45 -0.08
1.7 1.15 0.1 -0.67 -0.92 -1.05 -1.04 -0.29 -0.69 -0.94 -0.8 -0.3
1.9 1.27 0.52 -0.16 -2.15 -3.46 -2.19 -0.77 -0.98 -1.34 -0.67 -0.2
1.37 0.69 0.21 0.12 -0.97 -1.09 -0.12 0.49 0.08 -0.89 -1.44 -1.7
1.26 0.91 0.27 0.21 -0.1 -1.2 -0.66 -0.24 -0.54 -0.86 -0.74 -0.56
1.01 0.56 0.18 0.07 -0.48 -0.38 -0.01 -0.03 -0.15 -0.46 -0.74 -0.64
1.11 0.68 0.12 0.13 -0.23 -0.59 -0.32 0.15 -0.39 -0.76 -0.58 -0.71
1.55 0.85 -0.02 -0.43 -1.18 -1.66 -0.51 0.12 -0.4 -0.95 -0.53 0.02
1.73 1.44 0.87 -0.29 -1.4 -2.4 -1.94 -0.94 -1.26 -1.35 -1.13 -0.48
1.13 1.16 -0.24 0.04 -0.57 -0.61 0.02 -0.1 -0.35 -1.29 -0.75 -0.62
1.41 0.8 -0.11 -0.62 -0.72 -0.23 -0.01 0.05 -0.63 -0.84 -0.66 -0.55
1.3 0.67 0.05 0.08 -0.96 -0.98 -0.23 -0.1 -0.2 -0.64 -0.58 -0.2
0.54 0.32 0.08 -0.02 -0.26 -0.23 -0.07 0.07 -0.07 -0.28 -0.21 -0.12
1.35 0.74 0.4 -0.16 -0.77 -0.9 0.02 -0.16 -0.58 -0.97 -0.69 -0.41
1.31 0.9 0.51 -0.12 -0.37 -1.5 -0.18 0.12 -0.85 -1.81 -0.73 -0.4
1.0 0.48 0.22 -0.18 -0.25 -0.68 -0.18 0.11 -0.32 -0.52 -0.44 -0.16
0.97 0.35 -0.11 0.06 -0.31 -0.14 0.09 0.29 0.0 -0.6 -0.8 -0.84
1.15 0.83 0.26 0.09 -0.32 -0.76 -0.7 -0.55 -0.7 -0.63 -0.44 0.08
1.44 0.8 -0.02 0.34 -0.53 -0.45 -0.41 -0.61 -0.61 -0.65 -1.31 -0.39
1.04 0.78 0.15 0.22 -0.27 -0.66 -0.18 -0.22 -0.17 -0.79 -0.75 -0.52
0.62 0.22 -0.3 0.01 -0.09 -0.24 0.15 0.25 0.16 -0.26 -0.42 -0.52
0.88 0.8 0.31 -0.04 -0.5 -0.41 -0.21 0.08 -0.44 -0.86 -0.58 -0.21
0.89 0.67 0.21 -0.11 -0.12 -0.27 -0.42 -0.5 -0.37 -0.52 -0.31 -0.03
1.12 0.51 0.07 0.01 -0.22 -0.35 -0.12 0.06 -0.07 -0.63 -0.83 -0.75
1.7 1.24 0.41 -0.11 -0.81 -1.89 -0.95 -0.62 -1.31 -1.39 -1.02 -0.24
0.97 0.6 -0.09 -0.21 -0.39 -0.59 -0.23 -0.12 -0.11 -0.36 -0.25 -0.03
0.81 0.5 0.03 0.14 -0.04 -0.32 -0.17 0.04 -0.3 -0.4 -0.4 -0.55
0.73 0.64 0.48 -0.01 -0.3 -0.57 -0.36 -0.12 -0.33 -0.36 -0.41 -0.18
1.29 0.85 0.32 0.15 -0.11 -0.75 -1.11 -0.69 -0.95 -0.83 -0.55 0.06
0.91 0.55 0.09 -0.08 -0.6 -0.42 -0.12 -0.03 -0.09 -0.3 -0.46 -0.22
1.71 0.83 -0.1 -0.12 -0.97 -1.51 -1.14 -0.73 -0.61 -0.55 -0.28 0.03
1.66 1.09 0.22 -0.39 -1.83 -3.11 -1.29 -0.73 -0.57 -0.29 -0.34 0.15
1.02 0.65 0.05 -0.27 -0.06 0.05 -0.02 0.2 -0.56 -1.05 -0.82 -0.54
1.39 1.15 0.2 -0.03 -0.3 -0.76 -0.42 -0.2 -0.86 -1.38 -1.2 -0.67
1.34 0.54 -0.27 -0.51 -0.63 -0.23 -0.01 -0.09 -0.17 -0.48 -0.61 -0.36
1.17 0.67 -0.1 -0.25 -0.35 -0.39 -0.08 0.11 -0.4 -0.54 -0.57 -0.51
1.55 1.14 0.05 0.32 -0.05 -0.21 -0.8 -0.45 -0.79 -1.51 -1.92 -1.9
1.52 1.19 0.61 -0.32 -1.25 -2.17 -1.44 -0.39 -0.78 -0.86 -0.47 -0.15
2.21 1.49 0.01 0.46 -1.4 -4.18 -3.85 -2.73 -2.78 -3.02 -1.59 -0.15
1.54 1.27 0.59 0.05 -0.5 -1.26 -0.54 -0.05 -1.15 -2.5 -1.77 -1.14
2.06 1.7 -0.7 0.27 -0.89 -0.99 -1.09 -0.98 -1.33 -2.43 -4.23 -3.0
1.33 1.01 0.63 -0.03 -0.58 -1.16 -0.69 -0.28 -0.83 -0.88 -0.77 -0.52
1.93 1.46 0.47 -0.08 -2.98 -4.15 -4.38 -2.42 -1.75 -1.4 -0.31 0.28
1.82 1.52 0.68 0.17 -1.93 -5.01 -4.59 -3.11 -1.5 -1.4 -0.62 0.05
1.15 0.89 0.14 0.03 -0.24 -0.74 -0.44 0.01 -0.44 -0.62 -0.69 -0.68
1.8 1.69 0.48 -0.31 -0.91 -1.25 -0.87 -0.66 -1.78 -3.12 -2.21 -1.6
1.42 1.03 0.54 0.07 -0.76 -0.99 -0.59 0.02 -1.09 -1.57 -0.84 -0.68
1.26 1.16 0.33 -0.13 -0.62 -1.21 -1.09 -0.62 -0.52 -0.59 -0.52 -0.09
1.45 1.27 0.5 -0.23 -0.64 -1.4 -0.62 -0.25 -1.16 -1.42 -0.97 -0.43
1.25 1.08 0.07 -0.56 -0.42 -0.7 -0.65 -0.41 -0.54 -0.42 -0.48 -0.18
0.96 0.82 0.44 -0.04 -0.14 -0.53 -0.35 -0.34 -0.51 -0.54 -0.7 -0.37
1.16 0.68 0.5 0.18 -0.08 -0.63 -0.44 -0.56 -0.62 -0.69 -1.13 -0.16
0.79 0.63 0.15 0.03 0.07 -0.44 -0.55 0.02 -0.38 -0.4 -0.38 -0.33
0.91 0.5 0.24 0.05 -0.15 -0.26 -0.15 -0.01 -0.29 -0.61 -0.59 -0.48
1.58 1.16 0.35 -0.06 -0.52 -1.12 -0.55 -0.19 -0.78 -1.31 -1.44 -1.07
1.52 1.22 0.66 0.19 -0.41 -1.32 -0.36 -0.01 -1.23 -2.96 -2.39 -1.33
2.04 1.23 0.29 0.38 -1.64 -4.26 -2.54 -0.92 -1.42 -1.75 -0.97 -0.38
2.09 1.17 -0.08 -0.94 -1.83 -2.54 -1.24 -0.16 -1.15 -1.3 -0.79 -0.3
1.61 1.29 0.56 0.01 -1.1 -2.05 -1.96 -1.12 -1.43 -1.2 -0.62 0.19
1.51 0.82 0.07 0.33 0.13 -0.33 -0.31 -0.16 -1.25 -1.82 -1.66 -1.09
1.16 0.84 0.32 -0.06 -0.43 -0.79 -0.64 -0.07 -0.37 -0.46 -0.86 -0.33
1.44 0.68 -0.03 -0.34 -0.79 -1.1 -0.24 -0.09 -0.82 -0.54 -0.47 0.17
1.42 1.0 0.68 0.07 -0.95 -1.56 -1.06 -0.59 -0.63 -0.69 -0.71 -0.34
1.75 1.48 0.59 0.17 -0.51 -2.81 -2.52 -1.29 -1.43 -1.81 -1.18 -0.5
1.64 1.3 0.67 0.04 -1.09 -1.96 -1.34 -0.53 -1.35 -1.61 -0.85 -0.47
0.76 0.59 -0.01 0.04 -0.22 -0.27 -0.12 0.21 -0.1 -0.45 -0.52 -0.61
1.49 0.69 -0.17 -0.59 -1.83 -1.52 -0.4 0.14 -0.18 -0.58 -0.25 0.18
1.44 0.71 -0.41 -0.65 -1.49 -1.5 -0.5 0.33 -0.29 -0.55 -0.11 0.2
1.56 0.99 0.11 -0.19 -0.95 -1.37 -0.49 -0.05 -0.3 -0.84 -0.97 -0.61
1.81 1.36 0.47 -0.19 -0.88 -1.79 -1.27 -0.64 -1.33 -1.87 -1.23 -0.53
1.52 1.04 0.52 -0.21 -0.8 -1.57 -1.37 -0.6 -0.63 -0.81 -0.61 -0.08
2.05 1.47 -0.03 -1.49 -1.86 -2.93 -2.0 -1.2 -0.48 -0.92 -0.85 -0.21
1.67 1.27 0.42 -0.16 -0.42 -0.97 -0.37 -0.36 -1.34 -1.4 -2.2 -1.46
1.1 0.65 -0.06 0.09 -0.24 -0.64 -0.4 -0.22 -0.29 -0.36 -0.42 -0.3
1.31 0.58 -0.13 -0.42 -0.75 -0.66 -0.03 0.17 0.04 -0.65 -0.72 -0.39
0.79 0.87 0.19 0.04 0.17 -0.43 -0.57 0.01 -0.6 -0.53 -0.56 -0.51
1.55 0.86 0.12 -0.64 -0.71 -0.3 -0.32 -0.36 -0.79 -1.0 -0.8 -0.19
1.49 1.01 0.15 -0.29 -0.62 -1.05 -0.34 -0.06 -0.88 -1.1 -0.73 -0.42
1.13 0.86 0.32 0.26 0.09 -0.04 0.17 0.09 -0.84 -1.81 -2.18 -1.93
1.2 1.12 0.1 -0.05 -0.1 -0.53 -0.24 0.23 -0.76 -1.48 -1.34 -1.04
1.37 0.46 -0.78 -0.26 -0.3 -0.29 -0.03 0.17 -0.19 -0.59 -0.72 -0.45
0.68 0.33 -0.06 0.06 -0.23 -0.27 -0.05 0.02 0.04 -0.17 -0.52 -0.21
1.17 0.72 0.24 -0.48 -0.78 -0.75 -0.38 -0.05 -0.44 -0.58 -0.29 0.09
1.06 0.72 0.28 0.44 0.12 -0.43 -0.13 -0.02 -1.01 -1.12 -1.17 -0.82
2.06 1.61 0.32 -0.52 -1.54 -2.88 -1.32 0.03 -1.04 -3.96 -3.03 -2.01

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.