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Heatmap: Cluster_147 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.64 0.44 0.32 -0.27 -0.1 -0.41 -0.42 -0.43 -0.36 -0.19 0.1 0.14
0.18 0.67 0.23 -0.01 -0.09 -0.8 -0.92 -0.17 -0.4 0.12 0.4 0.05
0.13 0.43 0.16 0.04 -0.13 -0.63 -0.52 0.01 -0.12 -0.01 0.25 0.07
0.66 0.67 0.47 0.3 -0.46 -1.0 -0.19 0.19 0.02 -0.56 -0.64 -0.64
0.44 0.79 0.43 0.43 -0.61 -1.41 -0.43 0.37 0.08 -0.35 -0.61 -0.62
- 0.46 1.76 - -0.63 - - -0.37 -0.7 - 0.15 2.03
0.67 0.46 -0.01 -0.05 -0.32 -0.45 -0.2 0.2 -0.16 -0.36 -0.02 -0.24
0.36 0.47 0.5 0.31 -0.16 -0.64 -0.3 -0.1 0.07 -0.24 -0.52 -0.34
1.08 1.34 1.2 0.56 -0.49 -1.67 -0.96 -0.25 -1.15 -2.43 -1.57 -2.11
1.03 0.31 0.33 0.02 -0.48 -0.91 -0.26 -0.16 -0.07 -0.46 -0.29 -0.02
0.6 0.38 0.52 0.26 -0.32 -0.38 -0.73 -0.55 -0.49 -0.41 0.09 0.24
0.64 0.5 0.09 -0.24 -0.54 -0.84 -0.63 0.16 -0.27 -0.1 0.29 0.16
1.23 0.51 -0.46 -0.63 -0.74 -0.88 -0.05 0.15 -0.21 -0.2 -0.04 -0.14
0.71 0.34 -0.4 -0.34 -0.41 -0.43 -0.08 0.45 -0.0 -0.18 -0.02 -0.2
1.08 1.01 0.86 0.23 -0.25 -0.34 -0.29 -0.71 -1.05 -1.72 -1.09 -0.78
0.9 0.23 -0.03 0.4 -0.35 -0.38 -0.05 -0.01 -0.17 -0.62 -0.6 -0.07
0.36 0.24 0.02 -0.11 -0.17 -0.1 0.13 0.04 0.06 -0.19 -0.26 -0.17
-0.05 0.2 0.57 -0.35 -0.13 -0.81 -0.28 -0.25 -0.36 0.27 0.31 0.31
0.77 0.07 -0.63 0.07 -0.25 -0.34 -0.46 0.14 0.05 -0.02 0.01 0.06
-0.8 0.99 0.82 0.62 0.17 -1.67 -1.37 -0.04 -0.49 -1.39 0.58 -0.41
0.06 0.19 0.17 0.43 -0.08 -0.44 -0.59 -0.27 -0.36 -0.08 0.34 0.23
0.48 0.25 0.11 -0.07 -0.44 -0.4 -0.16 0.07 0.06 -0.02 -0.03 -0.11
0.39 0.58 0.55 0.04 -0.25 -0.47 -0.39 0.0 -0.13 -0.39 -0.18 -0.31
0.47 0.48 0.38 0.03 -0.25 -0.31 -0.21 -0.17 -0.12 -0.24 -0.19 -0.24
0.2 0.33 0.45 0.24 -0.13 -0.2 -0.31 -0.41 -0.36 -0.29 0.02 0.13
0.88 0.56 0.35 0.37 -0.46 -1.02 -0.51 -0.16 -0.23 -0.48 -0.27 -0.15
0.68 0.53 0.25 -0.17 -0.21 -0.12 -0.11 -0.19 -0.37 -0.49 -0.16 -0.14
0.82 0.45 0.36 0.19 -0.28 -0.45 -0.55 -0.49 -0.63 -0.41 -0.06 0.18
0.61 -0.01 -0.2 0.07 -0.39 -0.08 0.15 0.17 0.09 -0.3 -0.21 -0.2
0.21 0.14 0.12 0.11 0.03 -0.25 -0.41 0.04 -0.05 0.02 0.02 -0.09
0.99 1.12 0.74 0.43 0.12 -0.75 -0.41 0.03 -0.85 -1.88 -2.12 -1.75
0.58 0.54 0.43 0.24 -0.32 -0.71 -0.73 -0.03 -0.13 -0.3 -0.1 -0.22
0.55 0.1 -0.17 0.15 0.0 -0.26 -0.37 0.07 -0.12 -0.17 -0.08 0.07
0.38 0.17 0.43 0.36 -0.28 -0.34 -0.76 -0.33 -0.17 -0.5 0.33 0.14
0.34 0.35 0.28 0.19 -0.18 -0.66 -0.65 0.15 -0.36 -0.25 0.24 0.05
0.61 0.32 0.2 0.04 -0.25 -0.13 -0.1 -0.17 -0.18 -0.34 0.01 -0.32
0.56 0.58 0.29 -0.14 -0.25 -0.24 0.13 -0.09 -0.19 -0.35 -0.43 -0.39
0.33 0.55 0.43 0.07 -0.27 -0.45 -0.31 0.26 -0.36 -0.33 -0.06 -0.33
0.23 0.19 0.32 0.06 -0.24 -0.35 -0.34 -0.3 -0.04 0.0 0.07 0.19
0.48 0.34 0.53 0.11 -0.54 -0.67 -0.84 -0.38 -0.05 -0.09 0.22 0.14
0.28 0.24 0.18 -0.07 -0.07 -0.0 -0.13 0.17 -0.16 -0.16 -0.09 -0.33
1.0 0.54 0.49 0.38 -0.89 -1.89 -0.92 -0.41 -0.19 -0.27 -0.12 0.18
0.71 0.41 0.27 0.09 -0.36 -0.36 -0.41 -0.38 -0.27 -0.29 -0.05 0.1
1.27 1.24 0.69 0.05 -0.48 -0.81 -1.38 -0.95 -0.73 -2.91 -0.11 -0.45
0.16 0.35 0.37 0.36 -0.03 -0.25 -0.1 0.04 -0.02 -0.31 -0.41 -0.5
0.52 0.16 -0.15 -0.25 -0.15 -0.13 0.08 0.34 -0.11 -0.35 -0.09 -0.14
1.06 0.69 0.29 -0.07 -0.6 -0.97 -0.28 -0.33 -0.15 -0.76 -0.35 0.07
0.85 0.18 -0.1 0.18 -0.43 -0.4 -0.17 0.26 -0.19 -0.41 -0.1 -0.24
1.19 0.66 0.3 -0.2 -0.4 -0.43 -0.37 -0.43 -0.43 -0.85 -0.26 -0.17
0.41 0.39 0.58 0.05 -0.17 -0.16 -0.31 -0.23 -0.46 -0.25 -0.11 -0.16
0.73 0.59 0.31 0.39 -0.61 -1.55 -0.8 -0.25 -0.08 -0.02 -0.08 0.01
0.3 0.38 0.32 0.12 -0.02 -0.22 -0.36 -0.07 -0.31 -0.26 -0.06 -0.08
1.05 0.97 0.43 0.05 -1.18 -1.65 -0.75 -0.55 -0.18 -0.28 -0.25 0.01
1.1 0.68 0.24 0.15 -0.31 -0.9 -0.67 -0.52 -0.41 -0.51 -0.27 0.03
0.95 1.0 0.73 -0.04 -0.11 -0.18 -0.4 -0.29 -1.07 -0.92 -1.09 -0.78
- - 2.0 - 1.17 - - 0.54 0.22 0.08 - 1.06
0.29 0.3 0.22 -0.16 -0.27 -0.46 -0.47 -0.07 -0.31 0.03 0.37 0.19
1.29 1.21 1.1 0.43 -0.36 -1.14 -1.01 -0.57 -1.37 -2.21 -1.78 -1.17
0.87 0.45 -0.18 0.1 -0.31 -0.38 0.04 -0.09 0.07 -0.33 -0.41 -0.49
0.71 0.61 0.27 0.14 -0.23 -0.76 -0.73 -0.39 -0.55 -0.48 -0.02 0.41
0.98 0.5 0.17 0.32 -0.13 -0.39 -0.42 0.21 -0.26 -0.74 -0.5 -0.94
0.66 0.67 0.68 0.29 -0.27 -0.55 -0.65 -0.37 -0.72 -0.81 -0.14 -0.03
1.03 0.47 0.13 -0.1 -0.63 -0.83 -0.34 -0.18 -0.11 -0.3 -0.21 0.08
0.72 0.63 0.36 0.26 -0.05 -0.35 -0.28 -0.24 -0.39 -0.65 -0.73 -0.15
- 0.69 -0.01 1.0 0.7 0.07 - -1.11 0.15 -0.34 0.63 -0.29
0.67 0.45 0.22 0.09 -0.18 -0.59 -0.38 0.07 0.1 -0.28 -0.49 -0.27
1.02 0.72 0.74 0.18 -0.39 -0.34 -0.16 -0.56 -0.78 -0.82 -0.65 -0.75
- - 1.47 0.26 1.38 - - 0.76 0.43 - 0.24 0.27
0.15 0.52 0.44 0.16 -0.27 -0.74 -0.71 -0.06 -0.37 -0.31 0.34 0.18
0.49 0.4 0.55 0.02 -0.46 -0.32 -0.29 -0.11 -0.23 -0.43 0.07 -0.19
0.59 0.6 0.74 0.56 -0.47 -0.92 -1.19 -0.8 -0.81 -0.54 0.14 0.29
0.24 0.54 0.43 0.3 -0.12 -0.51 -0.59 -0.18 -0.67 -0.5 0.1 0.28
0.51 0.54 0.51 -0.04 -0.54 -0.67 -0.31 0.27 -0.26 -0.47 -0.0 -0.25
0.84 0.87 0.59 0.45 -0.61 -1.15 -0.79 -0.87 -0.48 -0.53 -0.43 0.18
0.72 0.37 0.17 0.04 -0.41 -0.54 0.01 0.14 -0.06 -0.34 -0.35 -0.28
0.53 0.55 0.43 0.24 -0.25 -0.43 -0.37 -0.06 -0.4 -0.33 -0.24 -0.25
-0.16 0.59 0.26 0.3 0.07 -0.19 -0.43 -0.66 -0.55 -0.54 0.24 0.4
0.33 0.43 0.41 0.04 -0.36 -0.51 -0.34 -0.32 -0.25 -0.02 -0.14 0.3
0.43 0.44 0.69 0.59 -0.21 -0.59 -0.54 -1.13 -0.56 -0.49 -0.13 0.26

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.