Heatmap: Cluster_89 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.06 0.13 0.18 0.1 0.15 0.05
0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 1.53 0.04 0.0 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.05 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0
0.03 0.04 0.17 0.3 0.09 0.18 0.21 0.08 0.05 0.16 0.02 0.3
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.07 0.02 0.05 0.02 0.03 0.11 0.02 0.09 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.05 0.04 0.0 0.0 0.0 0.05
0.07 0.0 0.03 0.02 0.14 0.19 0.28 0.1 0.13 0.1 0.02 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.17 1.69 1.51 2.1 2.25 2.25 2.49 2.15 2.0 1.21 2.36 2.75
0.0 0.0 0.05 0.0 0.04 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.14 0.02 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.05 0.04 0.0 0.02 0.0 0.14 0.0 0.61 0.0 0.02 0.14
0.0 0.09 0.16 0.18 0.17 0.03 0.17 0.14 0.06 0.23 0.02 0.16
0.0 0.0 0.02 0.04 0.02 0.1 0.02 0.0 0.16 0.04 0.06 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.07 0.09 0.04 0.16 0.04 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.04 0.02 0.05 0.02 0.02 0.02 0.02 0.04 0.02 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.09 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.05 0.08 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02
0.07 0.41 0.37 0.93 0.71 0.08 0.92 0.58 0.16 0.82 0.26 0.82
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0
0.0 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.1 0.03 0.02 0.02 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.19 0.17 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.13 0.08 0.04 0.02 0.07 0.07 0.34 0.05 0.18 0.2 0.13 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.09 0.03 0.11 0.0 0.0 0.0
0.1 0.05 0.02 0.02 0.02 0.0 0.05 0.1 0.14 0.16 0.11 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.08 1.66 1.58 2.17 1.69 2.01 1.51 1.4 1.76 1.6 1.29 2.15
0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.02 0.16 0.12 0.0 0.0
0.11 0.09 0.14 0.15 0.05 0.23 0.12 0.08 0.11 0.14 0.21 0.23
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
1.63 1.44 1.19 1.47 1.38 1.74 1.36 1.26 1.59 1.73 1.44 2.56
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.04 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0
0.18 0.0 0.0 0.05 0.12 0.0 0.13 0.11 0.04 0.15 0.1 0.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.05 0.0 0.0 0.0
0.0 0.05 0.25 0.16 0.16 0.25 0.55 0.2 0.28 0.43 0.32 0.2

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)