Heatmap: Cluster_104 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.43 -0.53 -0.3 -0.24 -0.45 0.13 0.14 0.49 0.19 0.22 0.23 0.13
-3.74 -0.63 -0.17 -0.36 -0.21 0.04 -0.08 0.34 0.3 0.69 0.33 0.48
-1.39 -0.77 -0.12 -0.34 -0.01 0.29 0.15 0.23 0.17 0.26 0.4 0.24
-1.75 -0.53 -0.1 -0.2 -0.04 0.14 0.11 0.25 0.18 0.38 0.32 0.24
-1.22 -1.12 -0.43 0.43 0.34 0.03 0.09 0.23 0.09 0.14 0.33 0.1
-1.0 -0.39 -0.23 -0.29 0.05 0.08 -0.13 0.14 0.19 0.23 0.39 0.42
-2.62 -1.43 -0.73 -0.19 0.13 0.51 0.19 0.11 0.32 0.56 0.38 0.29
-1.59 -0.24 0.07 -0.17 -0.24 -0.18 -0.13 0.15 0.38 0.49 0.35 0.21
-3.89 -0.83 -0.19 0.27 0.35 0.06 -0.07 -0.18 0.19 0.37 0.4 0.46
-1.45 -0.76 -0.4 0.09 0.02 -0.07 -0.15 0.16 0.2 0.37 0.62 0.33
-2.76 -0.91 -0.4 -0.11 0.14 0.08 0.23 0.32 0.23 0.36 0.48 0.26
-0.76 -0.5 -0.31 -0.02 -0.22 0.12 0.17 0.29 0.22 0.18 0.28 0.15
-1.08 -0.47 -0.08 -0.23 -0.02 0.31 0.14 0.12 -0.01 0.11 0.43 0.22
-2.37 -0.56 -0.26 0.18 -0.02 -0.26 -0.1 0.25 0.14 0.32 0.59 0.44
-0.78 -1.63 -1.21 -0.32 -0.66 -0.15 -0.24 0.57 0.42 0.7 0.68 0.53
-0.5 -0.17 -0.15 -0.01 -0.02 0.14 0.13 0.14 0.06 0.08 0.13 0.05
-1.9 -0.7 0.08 0.0 -0.24 -0.36 -0.29 0.02 0.37 0.65 0.48 0.43
-1.88 -1.2 -0.6 -0.08 -0.07 0.14 -0.03 0.07 0.15 0.52 0.81 0.38
-1.91 -0.64 -0.3 0.17 0.33 0.11 -0.12 0.14 0.2 0.17 0.31 0.36
-1.33 -0.73 -0.54 0.28 0.31 0.12 -0.06 -0.1 0.13 0.3 0.17 0.52
-3.16 -0.38 -0.14 0.11 -0.15 -0.14 0.04 0.04 0.38 0.56 0.27 0.36
-3.91 -1.15 -0.33 -0.11 0.12 0.3 0.29 0.3 0.4 0.37 0.23 0.27
-1.62 -0.59 -0.07 -0.03 -0.03 0.11 0.02 0.26 0.19 0.19 0.46 0.22
-1.2 -0.58 -0.37 -0.04 -0.03 0.03 -0.2 0.29 0.23 0.26 0.48 0.38
-5.4 -1.21 -0.36 0.23 -0.03 -0.03 -0.05 0.01 0.41 0.62 0.44 0.52
-1.63 -0.82 -0.07 0.31 0.14 -0.26 -0.54 0.07 0.28 0.45 0.52 0.29
-0.89 -0.47 -0.22 0.17 0.04 -0.12 -0.2 0.09 0.22 0.36 0.36 0.18
-2.11 -0.93 -0.49 0.18 -0.06 -0.19 -0.35 0.13 0.22 0.44 0.72 0.59
-1.65 -0.28 -0.21 -0.05 0.19 0.16 -0.4 -0.12 0.09 0.37 0.52 0.38
-2.38 -0.74 -0.38 -0.23 -0.03 0.25 0.07 0.28 0.31 0.29 0.51 0.35
-3.07 -0.41 -0.23 0.41 0.16 -0.17 -0.15 0.13 0.04 0.41 0.39 0.36
-1.1 -0.47 -0.07 -0.1 -0.15 -0.13 0.03 0.02 0.47 0.18 0.43 0.27
-1.84 -0.48 -0.26 -0.12 0.14 -0.02 -0.04 0.15 0.23 0.29 0.5 0.34
-1.65 -0.76 -0.37 0.07 0.1 -0.03 -0.17 0.1 0.13 0.4 0.62 0.39
-3.21 -0.58 -0.29 0.22 0.01 -0.26 0.09 0.1 0.41 0.37 0.45 0.35
-2.7 -0.79 -0.34 0.22 0.37 0.07 -0.2 -0.23 0.09 0.46 0.52 0.45
-1.67 -2.05 -1.38 -1.06 -0.23 0.22 0.22 0.05 -0.12 0.81 1.02 0.74
-1.06 -0.18 -0.16 -0.19 -0.04 0.22 0.04 0.1 0.14 0.2 0.26 0.23
-0.89 -0.57 -0.46 -0.18 0.0 0.34 0.29 0.51 0.19 -0.04 0.17 0.03
-1.96 -0.47 -0.26 -0.21 -0.03 -0.01 0.21 0.25 0.33 0.23 0.43 0.29
-2.96 -0.62 -0.2 -0.88 -0.44 -0.04 0.07 0.18 0.51 0.73 0.53 0.47
-0.48 -0.35 -0.14 -0.18 0.01 0.24 0.12 0.23 0.18 0.11 0.18 -0.13
-1.78 -0.62 -0.2 0.35 0.12 0.28 -0.1 -0.3 -0.49 0.67 0.46 0.24
-3.55 -0.65 -0.2 0.01 0.26 -0.51 0.12 0.04 0.27 0.61 0.39 0.44
-2.02 -0.8 -0.17 -0.14 0.12 0.32 0.07 0.05 0.17 0.44 0.29 0.33
-1.98 -1.64 -0.86 -0.31 0.13 0.37 0.06 0.16 0.08 0.39 0.73 0.59
-2.33 -2.22 -2.05 -0.39 0.07 0.4 -0.05 -0.22 -0.18 0.64 1.09 0.86
-2.42 -2.53 -1.64 -0.58 0.12 0.23 -0.25 -0.12 -0.54 0.64 1.38 0.84
-1.49 -0.31 -0.05 -0.0 0.04 -0.15 0.09 0.06 0.21 0.22 0.34 0.33
-2.56 -0.56 0.24 0.53 -0.15 -0.75 -0.62 -0.12 0.01 0.21 0.83 0.61
-2.47 -0.33 0.26 0.17 -0.42 -0.49 -0.13 0.26 0.23 0.26 0.48 0.45
-0.91 -0.25 -0.44 -0.16 0.11 0.35 -0.0 0.34 0.26 0.17 0.24 -0.18
-2.12 -1.13 -0.68 0.23 -0.31 -0.26 -0.17 0.28 0.32 0.54 0.73 0.5
-2.54 -0.31 0.02 -0.37 0.0 0.2 -0.5 -0.14 0.43 0.4 0.64 0.32
-1.83 -0.56 -0.03 0.02 -0.12 -0.18 0.24 -0.05 0.34 0.32 0.44 0.3
-1.71 -0.93 -0.19 0.26 0.2 0.12 -0.29 0.03 0.32 0.44 0.38 0.14
-0.44 -0.32 -0.01 -0.12 -0.19 0.22 -0.4 -0.11 -0.11 0.36 0.42 0.35
-0.73 -0.43 -0.24 -0.27 -0.01 0.18 -0.07 0.08 0.1 0.35 0.38 0.25
-2.33 -1.0 -0.49 -0.32 -0.26 0.13 0.51 0.53 0.44 0.32 0.43 0.05
-1.31 -0.49 -0.04 -0.03 -0.05 0.07 -0.1 0.03 0.25 0.38 0.38 0.23
-2.01 -0.83 -0.15 -0.37 0.19 0.26 0.16 -0.09 0.4 0.36 0.19 0.47
-3.6 -2.12 -1.14 -0.29 0.05 0.07 0.08 0.19 0.15 0.52 0.96 0.72
-1.66 -0.68 -0.47 -0.1 0.06 0.15 -0.03 0.02 0.26 0.06 0.38 0.78
-1.37 -0.34 0.25 0.2 -0.03 -0.07 0.04 0.18 0.06 0.07 0.25 0.16
-1.39 -0.41 0.22 -0.03 -0.03 -0.08 0.04 0.16 0.16 0.3 0.27 0.12
-1.41 -0.31 0.33 -0.02 -0.08 -0.22 -0.19 0.37 0.18 0.28 0.29 0.04
-2.76 -0.3 -0.49 -0.42 0.08 0.11 -0.22 0.38 0.39 0.47 0.38 0.37

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.