Heatmap: Cluster_46 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-2.8 -1.35 -0.27 0.15 0.3 0.33 0.15 -0.05 0.22 0.21 0.45 0.34
-0.16 -0.36 -0.32 -0.16 0.0 0.26 0.06 0.08 0.05 0.07 0.26 0.09
-0.77 -0.6 -0.42 -0.28 0.1 0.2 0.04 0.03 0.04 0.33 0.38 0.41
-1.57 -0.88 -0.73 -0.39 -0.16 -0.06 0.21 -0.37 0.46 0.56 0.58 0.69
-0.81 -0.47 -0.61 -0.77 -0.19 0.0 0.06 -0.0 0.44 0.49 0.33 0.61
-1.06 -0.77 -0.27 -0.44 -0.04 0.35 0.29 0.03 0.27 0.32 0.19 0.36
-0.08 -0.61 -0.46 -0.74 -0.36 0.17 0.25 0.22 0.18 0.17 0.34 0.37
-1.04 -0.52 -0.71 -0.68 -0.2 0.11 0.31 0.17 0.18 0.58 0.33 0.47
-0.61 -0.52 -0.51 -0.41 -0.6 -0.01 0.41 0.03 0.38 0.44 0.47 0.2
-1.14 -0.97 -1.03 -0.51 -0.06 0.13 0.23 0.03 0.28 0.49 0.43 0.71
-3.72 -1.45 -0.64 -0.54 -0.21 0.02 0.02 0.16 0.35 0.65 0.65 0.86
-4.46 -1.33 -0.65 -0.17 -0.16 0.08 0.08 0.28 0.38 0.49 0.61 0.65
-1.53 -1.33 -0.94 -0.65 -0.13 -0.08 0.04 -0.07 0.59 0.58 0.74 0.67
-3.93 -2.84 -1.2 -0.1 0.05 0.19 0.03 0.01 0.53 0.75 0.58 0.69
-2.55 -0.84 -0.88 -0.88 -0.28 0.26 0.25 0.13 0.35 0.63 0.39 0.8
-3.39 -0.84 -0.52 -0.34 0.17 0.22 -0.11 -0.07 -0.03 0.71 0.7 0.53
-1.66 -1.14 -2.12 -1.48 -0.6 0.27 0.65 0.27 0.55 0.86 0.46 0.42
-0.69 -0.55 -0.36 -0.62 -0.03 0.28 0.07 0.12 0.21 0.54 0.19 0.25
-1.55 -2.82 -3.12 -1.1 -0.09 0.49 0.43 -0.06 0.32 0.82 0.68 0.74
- -0.64 -0.52 0.27 0.27 0.64 0.42 0.14 -0.16 0.17 0.4 -0.12
-3.14 -3.4 -1.51 -1.16 -0.65 0.17 0.7 0.09 0.75 0.77 0.65 0.66
-2.33 -0.95 -0.85 -0.38 0.16 0.36 0.25 -0.2 0.33 0.47 0.36 0.65
-5.12 -3.15 -1.66 -0.5 0.19 -0.45 0.19 0.13 0.65 0.87 0.68 0.8
-3.6 -3.75 -1.63 -0.86 0.11 0.3 0.04 -0.04 0.43 0.88 0.97 0.6
-1.74 -0.68 -0.29 -0.07 0.2 0.27 0.13 -0.18 0.13 0.34 0.25 0.51
-0.68 -0.34 -0.23 -0.22 -0.24 -0.07 0.04 0.07 0.16 0.35 0.42 0.35
-1.19 -1.29 -1.13 -1.3 -1.12 -0.22 0.24 -0.24 0.18 0.73 1.09 1.02
-3.09 -1.82 -1.18 -0.28 -0.24 0.15 0.27 -0.22 0.65 0.69 0.62 0.68
-1.74 -0.84 -0.41 -0.53 -0.37 0.06 0.38 0.15 0.5 0.51 0.31 0.47
-1.31 -0.89 -0.43 -0.26 0.08 0.2 0.27 -0.22 0.28 0.53 0.37 0.33
-1.15 -0.57 -0.17 -0.14 -0.22 0.22 0.41 0.16 0.29 0.2 0.1 0.23
-0.36 -1.42 -1.27 -0.58 -0.04 0.18 0.4 0.25 0.22 0.28 0.44 0.5
-0.99 -1.34 -1.19 -1.31 -0.93 0.04 0.53 0.18 0.42 0.49 0.65 0.86
-0.66 -0.73 -0.68 -0.54 -0.24 -0.2 -0.12 0.06 0.02 0.46 0.64 0.86
-2.2 -1.37 -1.01 -0.19 0.09 0.02 0.15 0.03 0.24 0.51 0.59 0.77
-2.91 -1.26 -0.21 -0.08 0.19 0.11 0.09 -0.07 0.15 0.52 0.47 0.56
-2.26 -1.15 -1.25 -0.56 0.16 0.43 0.39 0.08 0.19 0.59 0.63 0.28
-4.64 -3.36 -2.44 -1.36 -0.74 0.03 0.22 0.14 0.38 0.81 1.15 1.08
-2.79 -0.95 -0.5 -0.35 -0.02 0.12 0.08 -0.33 0.16 0.64 0.64 0.76
-0.06 -0.38 -0.64 -0.71 -0.21 -0.02 0.48 -0.16 0.28 0.35 0.35 0.16
-1.49 -0.7 -0.53 -0.03 0.01 0.15 0.11 0.17 0.29 0.37 0.25 0.4
-3.51 -3.44 -3.4 -2.0 -0.4 0.48 0.22 -0.22 0.67 1.18 0.96 0.59
-4.62 -2.61 -0.63 -0.3 0.11 0.37 0.26 0.09 0.5 0.68 0.41 0.45
-2.85 -2.34 -1.07 -0.87 -0.28 0.13 0.52 0.24 0.5 0.65 0.61 0.68
-3.43 -4.14 -2.12 -0.81 0.28 0.28 0.01 -0.44 0.48 1.07 0.74 0.77
-2.17 -0.66 -0.49 0.05 0.21 0.04 -0.17 -0.03 0.17 0.51 0.48 0.49
-1.46 -0.62 -0.58 -0.21 0.12 -0.1 -0.07 0.15 0.28 0.52 0.43 0.46
-4.59 -3.34 -1.66 -0.8 -0.03 0.41 0.41 -0.1 0.43 0.81 0.61 0.82
-5.09 -1.82 -0.2 -0.4 -0.1 0.22 0.19 0.07 0.55 0.74 0.29 0.51
-2.68 -2.81 -2.27 -1.21 0.11 0.17 0.42 -0.23 0.56 1.0 0.72 0.61
-0.93 -0.95 -0.74 -0.59 -0.25 0.27 0.5 -0.04 0.34 0.4 0.39 0.45
-0.88 -0.86 -1.48 -2.04 -0.17 0.1 -0.12 0.07 0.17 0.69 0.76 0.95
-2.09 -1.84 -1.31 -0.84 -0.31 0.14 0.54 0.07 0.71 0.63 0.31 0.76
-2.42 -0.99 -0.37 -0.25 0.03 0.01 -0.15 -0.07 0.22 0.46 0.76 0.66
-0.88 -1.19 -1.67 -1.03 -0.73 0.36 0.29 0.05 -0.0 0.47 0.9 0.86
-1.7 -0.69 -0.51 0.0 0.36 0.67 -0.06 0.22 0.02 0.32 0.17 -0.04
-2.28 -1.34 -1.11 -0.58 0.11 0.19 0.35 -0.3 0.43 0.76 0.6 0.48
-4.9 -1.9 -1.34 -0.41 0.08 0.31 0.08 0.26 0.14 0.7 0.88 0.51
-0.77 -0.67 -0.91 -1.37 -1.01 0.04 0.27 0.07 0.3 0.67 0.51 0.88
-2.52 -1.31 -1.35 -0.45 -0.88 0.62 0.72 0.09 0.28 0.38 0.72 0.42
-0.23 -0.27 -0.0 -0.43 0.07 -0.05 0.28 -0.11 0.04 0.12 0.27 0.14
-1.56 -0.93 -0.21 -0.14 -0.18 -0.18 0.27 -0.15 0.32 0.6 0.21 0.65
-1.87 -0.58 -0.38 -0.09 -0.0 -0.05 -0.04 0.06 0.37 0.42 0.46 0.44
-4.23 -2.51 -1.05 -0.63 -0.2 0.02 0.17 0.01 0.29 0.8 0.85 0.89
-1.05 -1.81 -1.46 -0.93 -0.84 0.13 0.76 0.16 0.38 0.48 0.73 0.61
-0.58 -0.59 -0.49 -0.37 -0.06 0.09 0.04 -0.03 0.15 0.34 0.38 0.55
-1.02 -0.62 -0.47 -0.38 -0.01 0.08 0.2 0.23 0.33 0.34 0.28 0.33
-3.33 -1.56 -0.9 -0.28 0.15 0.16 0.11 0.04 0.45 0.43 0.42 0.86
-1.45 -0.26 -0.47 -0.32 -0.11 -0.11 0.18 -0.16 0.26 0.75 0.3 0.37
-2.47 -1.12 -0.29 -0.12 -0.01 0.15 0.19 0.05 0.32 0.53 0.32 0.49
-0.88 -0.3 -0.34 -0.17 0.07 0.15 0.1 -0.17 0.09 0.29 0.29 0.42
-1.85 -0.76 -0.39 -0.31 -0.22 0.14 -0.0 0.11 0.25 0.5 0.51 0.59
-2.48 -0.9 -0.46 0.04 0.12 0.09 0.28 0.19 0.25 0.24 0.42 0.4
-0.67 -0.33 -0.14 0.08 0.09 0.01 0.06 -0.1 0.12 0.21 0.28 0.16
-1.48 -1.22 -1.28 -0.97 -0.34 0.72 0.63 -0.07 0.27 0.69 0.4 0.28
-1.62 -0.89 -0.62 -0.46 0.17 0.08 0.18 0.06 0.28 0.52 0.47 0.44
-3.36 -1.25 -0.79 -0.53 -0.46 0.05 0.35 0.23 0.47 0.57 0.72 0.58
-2.61 -1.82 -1.14 -0.88 -0.26 0.22 0.3 0.14 0.8 0.79 0.38 0.54
-0.8 -0.29 -0.03 -0.34 -0.02 0.1 0.06 -0.15 0.18 0.32 0.19 0.4
-1.11 -0.46 -0.24 0.05 0.07 0.22 0.06 -0.0 0.08 0.25 0.29 0.26
-0.78 -0.88 -0.9 -0.59 -0.27 0.18 0.62 0.2 0.3 0.28 0.29 0.44
-0.55 -0.6 -0.42 -0.19 0.02 0.25 0.28 0.27 0.11 0.1 0.05 0.3
-0.89 -0.52 -0.28 -0.12 0.2 0.22 0.34 0.06 0.07 0.14 0.15 0.17
-1.64 -1.84 -1.13 -0.15 0.17 0.24 0.18 0.0 0.04 0.54 0.6 0.68
-0.79 -0.2 -0.66 -0.34 0.07 0.52 0.22 0.11 0.14 0.37 0.01 0.0
-6.8 -5.94 -2.57 -0.76 -0.04 0.51 0.32 -0.35 0.75 0.89 0.85 0.54
-0.8 -0.62 -0.48 -0.48 0.02 0.29 0.29 0.01 0.26 0.39 0.18 0.31
-1.26 -1.04 -0.96 -0.81 -0.26 0.45 0.34 0.0 0.23 0.6 0.48 0.54
-0.5 -0.38 -0.38 -0.22 -0.07 0.33 0.23 0.17 0.03 0.18 0.2 0.12
-3.88 -2.19 -0.6 0.11 0.03 0.48 0.37 0.11 0.44 0.4 0.18 0.47
-2.58 -0.74 -0.77 -0.19 -0.17 0.08 0.38 0.28 0.3 0.51 0.36 0.45
-2.32 -1.4 -1.51 -1.17 0.17 0.2 0.06 -0.08 0.63 0.8 0.46 0.77
-2.1 -1.29 -1.13 -0.64 -0.08 0.06 0.09 0.14 0.51 0.77 0.53 0.62
-3.87 -0.57 -0.43 -0.3 0.12 0.12 0.42 0.15 0.29 0.31 0.22 0.54
-1.36 -0.7 -0.35 0.05 0.03 0.3 0.14 0.21 0.12 0.23 0.22 0.32
-4.05 -2.13 -1.54 -0.88 -0.56 0.26 0.2 -0.26 0.73 1.08 0.97 0.31
-2.98 -1.16 -1.07 -0.65 -0.33 0.07 0.5 0.1 0.48 0.7 0.56 0.57
-1.15 -0.83 -0.45 -0.47 0.18 0.37 0.35 -0.02 0.23 0.35 0.32 0.21
-1.25 -0.96 -0.66 -0.45 -0.06 0.16 0.41 0.09 0.19 0.33 0.38 0.62
-2.84 -2.95 -1.2 -1.03 0.05 0.37 0.13 -0.03 0.58 1.13 0.43 0.45
-5.18 -1.89 -1.03 -0.46 0.1 0.09 0.24 -0.16 0.46 0.95 0.5 0.64
-0.45 -0.66 -0.66 -0.46 -0.09 0.21 0.09 0.11 0.46 0.37 0.21 0.28
-1.25 -0.33 -0.33 0.15 0.16 0.49 0.19 0.14 -0.04 0.2 -0.01 0.01
-3.17 -2.23 -0.86 -0.35 -0.26 0.14 0.25 -0.19 0.59 0.74 0.45 0.85
-0.62 -0.52 -0.5 -0.56 0.15 0.12 -0.03 -0.01 0.2 0.48 0.37 0.33
-0.99 -0.49 -0.34 -0.45 -0.25 0.06 -0.16 -0.21 0.05 0.7 0.62 0.51
- -2.96 -1.95 -0.85 -0.18 0.3 0.18 0.26 0.36 0.9 0.69 0.89
-0.33 -0.25 -0.34 -0.07 0.15 0.07 0.19 0.14 0.04 0.1 0.15 0.02
-1.15 -1.02 -0.58 -0.49 -0.29 0.09 0.38 0.21 0.38 0.47 0.4 0.42
-1.57 -0.69 -0.46 -0.53 0.06 0.02 0.04 0.14 0.43 0.6 0.4 0.33
-0.82 -1.11 -0.55 -0.37 0.01 0.1 0.36 -0.12 0.18 0.12 0.62 0.56
-1.7 -0.93 -0.49 -0.16 0.27 0.21 0.1 -0.06 0.17 0.41 0.38 0.5
-5.59 -1.93 -0.94 -0.42 -0.22 0.26 0.41 -0.0 0.43 0.62 0.59 0.75
-0.7 -0.38 -0.6 -0.38 -0.09 0.12 0.03 0.06 0.22 0.36 0.41 0.4
-1.52 -0.54 -0.27 -0.33 -0.05 0.12 0.01 0.09 0.07 0.57 0.37 0.48
-1.5 -1.28 -0.43 -1.0 -0.04 0.26 0.21 0.26 0.17 0.44 0.56 0.6
-1.85 -1.25 -1.0 -0.65 -0.11 0.3 0.01 0.14 0.37 0.57 0.63 0.65
-5.38 -2.2 -0.66 -0.49 0.12 0.24 0.28 -0.19 0.33 0.82 0.61 0.59
-1.47 -0.81 -0.28 -0.08 0.12 -0.03 0.07 -0.15 0.16 0.46 0.39 0.56
-3.65 -4.2 -3.66 -2.77 -1.64 -0.03 0.98 0.38 1.01 1.14 0.69 0.29
-0.87 -0.62 -0.32 -0.31 -0.14 -0.02 0.41 0.2 0.36 0.23 0.18 0.31
-1.1 -0.81 -0.55 -0.37 0.09 0.09 0.24 0.09 0.12 0.47 0.33 0.49
-1.34 -0.84 -0.54 -0.35 -0.17 0.05 0.23 0.28 0.3 0.56 0.36 0.34
-3.12 -1.5 -0.75 -0.65 -0.28 0.45 0.15 -0.23 0.54 0.88 0.55 0.49
-1.9 -1.57 -1.13 -0.55 -0.02 0.29 0.16 0.08 0.29 0.79 0.53 0.57
-1.38 -0.74 -0.34 -0.49 -0.18 0.01 0.15 0.27 0.44 0.32 0.5 0.36
-1.4 -1.15 -0.73 -0.37 -0.2 0.17 0.2 0.28 0.49 0.35 0.4 0.51

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.