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Heatmap: Cluster_64 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-1.15 -0.56 -0.24 -0.09 0.07 0.47 0.51 0.45 0.23 0.01 -0.13 -0.37
0.57 -0.2 -0.39 -0.23 -0.17 -0.12 0.09 0.44 0.18 -0.02 -0.12 -0.37
-1.27 -0.32 -0.14 0.05 0.23 0.57 0.75 0.51 0.2 -0.32 -0.63 -1.08
-2.98 -1.45 -0.62 -0.12 0.37 0.92 0.88 0.6 0.17 -0.08 -0.38 -0.85
-2.14 -0.97 -0.38 -0.14 0.32 0.85 0.8 0.68 0.08 -0.3 -0.35 -0.89
-3.21 -1.92 -0.71 -0.56 0.14 1.1 1.17 0.99 0.4 -0.35 -0.9 -2.22
-1.56 -1.41 -0.5 -0.32 -0.02 0.89 1.08 0.49 0.27 -0.1 -0.48 -0.83
-0.41 -0.08 0.11 -0.09 0.13 0.44 0.39 0.19 0.02 -0.23 -0.36 -0.44
-1.82 -1.41 -0.52 0.25 0.56 0.61 0.47 0.44 0.18 0.06 -0.19 -0.6
-0.97 -0.46 -0.17 -0.07 0.1 0.64 0.53 0.29 0.01 -0.11 -0.22 -0.28
-2.8 -2.13 -0.59 -0.09 0.11 0.59 1.22 0.78 0.55 0.0 -1.0 -1.22
-0.36 -0.39 -0.13 -0.01 0.17 0.24 0.27 0.23 0.12 -0.04 -0.11 -0.19
-4.22 -2.38 -0.83 -0.93 0.49 1.43 0.8 0.6 0.44 -0.53 -0.45 -0.9
-1.44 -0.47 -0.36 -0.36 0.06 0.71 0.67 0.33 0.23 0.16 -0.34 -0.43
-1.21 -0.6 -0.17 -0.02 0.02 0.35 0.47 0.38 0.39 0.04 -0.06 -0.42
-1.22 -0.41 0.02 -0.08 0.29 0.76 0.52 0.2 0.07 -0.17 -0.38 -0.59
-2.23 -0.89 -0.28 -0.2 0.08 0.55 0.69 0.46 0.26 -0.07 -0.03 -0.12
-3.84 -2.6 -1.12 -0.47 -0.06 1.01 1.6 0.95 0.33 -0.32 -1.43 -2.34
-4.75 -1.63 -0.91 -0.21 0.48 1.63 1.21 0.75 0.09 -1.17 -2.79 -3.36
-3.78 -2.13 -0.55 -0.38 0.2 1.32 1.44 0.45 0.12 -0.69 -1.0 -1.74
-3.84 -3.09 -1.05 -0.34 -0.11 1.13 1.61 0.6 0.65 -0.17 -2.21 -2.41
-1.2 -0.59 -0.15 0.06 0.35 0.61 0.66 0.33 0.08 -0.16 -0.41 -0.69
-2.39 -1.09 -0.54 0.2 0.62 1.14 0.97 0.04 -0.02 -0.49 -0.85 -0.93
-1.79 -0.86 -0.49 -0.06 0.04 0.6 0.82 0.59 0.27 -0.22 0.02 -0.73
-1.71 -1.04 -0.34 -0.32 0.31 1.05 0.88 0.49 -0.05 -0.32 -0.56 -0.72
-1.51 -0.53 -0.23 0.1 0.07 0.4 0.57 0.38 0.23 0.01 -0.1 -0.39
-3.13 -1.24 -0.31 -0.25 0.12 0.96 0.7 0.49 0.31 0.07 -0.31 -0.6
-1.67 -0.42 0.02 -0.2 0.19 0.39 0.48 0.24 0.38 0.11 -0.17 -0.4
-0.74 -0.51 -0.13 0.03 0.28 0.56 0.6 0.13 0.04 -0.23 -0.38 -0.3
-2.64 -1.48 -0.47 -0.0 0.18 1.03 1.08 0.77 0.21 -0.63 -0.77 -1.35
-1.02 -0.98 -0.47 0.13 0.35 0.46 0.48 0.37 0.22 0.01 -0.13 -0.41
-2.41 -1.32 -1.48 -0.01 0.38 0.14 1.08 0.82 0.76 0.18 -1.0 -1.14
-2.05 -0.9 -0.69 -0.36 0.05 0.73 0.86 0.57 0.39 0.01 -0.3 -0.52
-0.37 -0.23 -0.01 -0.07 0.13 0.31 0.45 0.38 0.18 -0.12 -0.44 -0.64
-1.67 -0.55 -0.47 -0.18 0.36 0.71 0.55 0.31 0.22 0.19 -0.39 -0.49
-1.86 -0.78 -0.11 -0.06 0.15 0.98 1.03 0.63 0.13 -0.52 -1.13 -1.56
-2.89 -1.06 -0.76 -0.14 0.11 1.11 1.25 0.43 0.23 -0.45 -0.93 -1.03
-2.9 -2.95 -1.28 -0.7 0.03 1.13 1.68 0.92 0.37 -0.45 -1.81 -3.29
-1.26 -0.58 -0.52 -0.46 0.09 0.75 0.7 0.59 0.26 -0.01 -0.44 -0.57
-3.28 -2.11 -0.86 -0.05 0.22 0.86 1.29 0.76 0.45 -0.14 -1.18 -1.67
-3.34 -1.29 -0.47 -0.39 0.25 0.94 0.84 0.5 0.34 0.02 -0.43 -0.58
-1.14 -0.76 -0.34 -0.2 0.01 0.6 0.49 0.52 0.27 0.03 -0.08 -0.38
-3.78 -3.2 -1.38 -0.47 0.12 1.15 1.34 0.93 0.44 -0.3 -0.78 -2.24
-1.12 -0.52 -0.07 -0.04 0.06 0.4 0.56 0.52 0.27 0.01 -0.23 -0.81
-2.72 -1.9 -0.58 -0.18 0.21 0.99 1.13 1.08 0.36 -0.56 -1.3 -2.24
-2.39 -0.69 -0.13 0.11 0.13 1.11 0.99 0.59 -0.03 -0.82 -0.93 -1.41
-1.6 -0.86 -0.43 -0.26 0.09 0.72 0.83 0.41 0.22 0.06 -0.28 -0.52
-1.81 -0.92 -0.39 -0.21 0.35 0.82 0.99 0.65 0.3 -0.19 -1.0 -1.45
0.06 -0.1 -0.18 -0.03 0.04 0.05 0.09 0.15 0.15 0.05 -0.06 -0.29
-1.07 -0.87 -0.34 -0.11 0.16 0.41 0.63 0.4 0.42 0.07 -0.27 -0.45
-1.26 -1.51 -0.33 0.24 0.74 0.8 0.35 0.54 -0.27 -0.81 -0.31 -0.15
-1.64 -0.77 -0.62 -0.11 0.06 0.68 0.92 0.47 0.49 -0.08 -0.75 -0.61
-0.96 -0.74 -0.32 -0.32 0.13 0.54 0.54 0.37 0.32 0.07 -0.12 -0.34
-0.54 -0.37 -0.07 0.06 0.3 0.29 0.35 0.16 0.11 -0.05 -0.18 -0.37
-1.38 -0.75 -0.26 0.08 0.26 1.0 0.65 0.33 -0.09 -0.53 -0.33 -0.58
-2.88 -1.94 -0.43 -0.45 -0.23 0.71 1.34 0.63 0.54 -0.2 -0.49 -0.89
-3.55 -2.94 -1.0 -0.39 -0.3 0.85 1.58 1.04 0.59 -0.35 -1.55 -2.16
-2.36 -1.24 -0.51 0.15 0.41 0.89 1.08 0.61 0.23 -0.32 -1.29 -1.41
-4.25 -2.78 -0.94 -0.09 0.14 0.98 1.23 0.85 0.71 -0.15 -1.44 -2.21
-1.02 -0.44 -0.24 0.0 0.24 0.47 0.44 0.36 0.15 -0.06 -0.12 -0.46
-0.61 -0.57 -0.15 -0.08 0.17 0.6 0.58 0.32 0.05 -0.26 -0.3 -0.41
-5.3 -1.8 -0.75 0.06 0.39 0.83 0.8 0.37 0.33 0.17 -0.19 -0.58
-1.58 -0.68 -0.17 -0.18 -0.13 0.36 0.66 0.6 0.41 0.06 -0.1 -0.56
-5.4 -2.53 -0.45 -0.12 0.27 0.76 1.03 0.4 0.46 0.09 -0.4 -0.53
0.0 -0.08 -0.14 0.03 0.08 0.15 0.22 0.23 0.21 -0.04 -0.33 -0.51
-3.2 -1.91 -0.49 -0.25 0.39 1.17 1.17 0.68 0.31 -0.47 -1.55 -1.47
-0.3 -0.1 -0.01 -0.11 0.08 0.24 0.34 0.3 0.15 -0.13 -0.31 -0.39
-1.5 -0.81 0.1 0.17 0.26 1.05 1.04 0.3 -0.09 -1.02 -0.98 -1.39
-1.32 -0.96 -0.41 -0.07 0.29 0.68 0.57 0.41 0.14 0.13 -0.34 -0.42
-3.57 -1.99 -0.8 -0.07 0.21 1.05 1.27 0.8 0.48 -0.33 -1.56 -2.16
-0.85 -0.07 -0.03 -0.05 0.18 0.4 0.61 0.25 0.1 -0.19 -0.51 -0.44
-3.74 -1.66 -0.68 -0.36 0.36 1.36 1.38 0.52 0.16 -0.93 -1.29 -1.9
-2.28 -0.65 -0.08 0.06 0.21 0.5 0.64 0.48 0.2 -0.05 -0.24 -0.55
-1.38 -1.21 -0.6 -0.28 -0.29 0.72 1.15 0.78 0.32 -0.3 -0.33 -1.17
-0.32 -0.28 -0.2 0.07 0.17 0.31 0.31 0.3 0.21 -0.01 -0.46 -0.44
-0.67 -0.26 -0.03 -0.0 -0.03 0.44 0.75 0.38 0.12 -0.23 -0.53 -0.7
-2.29 -1.37 -0.36 -0.08 -0.01 0.82 0.64 0.47 0.21 0.01 0.01 -0.31
-0.59 -0.32 -0.1 0.03 0.23 0.42 0.42 0.29 0.16 -0.14 -0.4 -0.46
-0.77 -0.27 -0.01 0.07 0.3 0.41 0.43 0.39 0.11 -0.2 -0.48 -0.6
-1.51 -0.78 -0.08 -0.01 0.05 0.86 0.83 0.76 0.06 -0.56 -0.62 -1.21
-2.17 -0.63 -0.42 -0.6 0.22 0.78 0.59 0.59 0.48 -0.16 -0.03 -0.83
-1.88 -1.13 -0.46 0.09 0.31 0.4 0.68 0.52 0.13 0.02 -0.22 -0.13
-2.06 -1.11 -0.49 -0.01 0.32 1.03 1.09 0.89 0.04 -0.8 -1.17 -1.91
-2.1 -1.06 -0.37 0.2 0.55 0.66 0.59 0.36 0.18 -0.04 -0.37 -0.6
-2.43 -1.46 -0.43 -0.2 0.25 1.04 0.99 0.85 0.18 -0.29 -0.87 -1.71
-3.99 -1.28 -0.13 -0.05 0.33 1.27 0.96 0.39 -0.13 -0.34 -0.7 -1.3
-0.47 -0.39 -0.07 -0.09 0.15 0.39 0.28 0.28 0.09 -0.01 -0.06 -0.41
-2.88 -1.01 -0.11 0.21 0.52 0.86 0.81 0.32 -0.12 -0.38 -0.59 -0.58
0.28 0.03 -0.13 -0.16 -0.1 -0.02 0.17 0.21 0.07 0.02 -0.26 -0.23
-1.15 -0.25 0.1 -0.07 0.16 0.4 0.41 0.32 0.28 -0.06 -0.31 -0.52
-1.88 -0.44 -0.03 -0.08 0.22 1.11 0.81 0.51 -0.13 -0.42 -1.05 -1.27
-1.89 -1.21 -0.3 -0.07 0.26 0.65 0.67 0.4 0.35 -0.08 -0.24 -0.32
-2.0 -1.22 -0.39 -0.1 0.1 0.9 1.13 0.6 0.18 -0.37 -0.61 -1.25
-1.69 -0.68 -0.27 -0.06 0.06 0.49 0.51 0.41 0.24 0.07 -0.03 -0.21
-1.05 -0.31 -0.04 -0.06 0.18 0.33 0.47 0.18 0.38 0.04 -0.28 -0.48
-0.6 -0.55 -0.32 -0.26 0.15 0.34 0.46 0.35 0.22 0.11 -0.11 -0.25
-0.38 -0.5 -0.39 -0.06 0.26 0.27 0.48 0.1 0.1 0.08 -0.06 -0.24
-3.39 -0.88 -0.29 -0.2 0.34 0.97 0.8 0.48 0.02 -0.23 -0.45 -0.5
-3.89 -2.22 -1.12 0.14 -0.18 0.97 1.48 0.96 0.34 -0.67 -1.26 -1.85
-0.77 -0.58 -0.18 -0.22 0.15 0.54 0.46 0.35 0.28 0.04 -0.2 -0.58
-1.0 -0.38 -0.09 -0.06 0.18 0.46 0.42 0.39 0.16 -0.22 -0.07 -0.43
-0.85 -0.81 -0.23 -0.29 0.13 0.71 0.59 0.43 0.33 -0.06 -0.32 -0.74
-0.98 -0.43 -0.16 -0.38 0.1 0.52 0.58 0.37 0.19 0.04 -0.01 -0.65
-1.98 -0.81 -0.04 -0.01 0.33 0.87 0.83 0.46 -0.05 -0.48 -0.41 -0.94
-0.73 -0.94 -1.02 0.13 0.11 0.37 0.96 0.68 0.37 -0.03 -0.95 -0.79
-2.66 -0.61 -0.15 -0.0 0.24 0.7 0.63 0.43 0.22 -0.03 -0.18 -0.85
-1.39 -0.82 -0.39 -0.17 0.14 0.53 0.56 0.36 0.31 -0.12 0.18 -0.32
-1.9 -0.93 -0.44 -0.18 -0.05 0.64 0.96 0.53 0.37 0.06 -0.46 -0.69
-3.0 -2.18 -1.24 -0.25 -0.15 0.94 1.52 0.83 0.62 -0.36 -1.45 -1.9
-2.72 -1.38 -0.57 -0.42 0.14 1.0 1.06 0.96 0.39 -0.2 -1.02 -2.03
-1.53 -0.48 -0.09 -0.13 0.41 0.47 0.5 0.26 0.3 0.04 -0.28 -0.58
-2.02 -1.98 -1.14 -0.53 0.03 0.91 1.36 0.92 0.42 -0.3 -0.85 -1.81
-2.46 -1.56 -0.81 -0.33 -0.18 0.71 1.07 0.82 0.46 0.01 -0.32 -0.87
-2.77 -1.46 -0.42 -0.38 0.22 1.02 0.79 0.53 0.24 0.05 -0.38 -0.7
0.41 -0.21 -0.65 -0.22 -0.05 -0.19 0.17 0.48 0.48 0.12 -0.29 -0.61
-3.51 -2.52 -1.36 -0.5 -0.2 1.07 1.52 1.05 0.53 -0.32 -1.46 -2.77
-2.6 -1.66 -1.17 -0.3 -0.1 0.86 1.39 0.89 0.7 -0.26 -1.8 -1.8
-3.51 -1.48 -0.57 -0.05 0.44 0.67 0.99 0.61 0.24 -0.06 -0.46 -0.76
-2.61 -1.74 -0.66 -0.41 0.32 1.17 1.12 1.04 0.36 -0.59 -1.63 -2.79
-2.21 -1.3 -0.25 0.05 0.25 1.01 1.0 0.44 0.23 -0.46 -0.73 -1.19
-0.45 -0.43 -0.36 -0.33 0.04 0.39 0.49 0.22 0.18 0.13 -0.1 -0.18
-2.53 -2.36 -2.78 -0.02 -0.31 1.17 1.59 1.04 0.54 -0.76 -2.72 -2.46
-3.32 -1.22 -0.42 -0.05 0.28 1.05 1.08 0.6 0.06 -0.62 -0.62 -1.03
-1.28 -0.77 -0.29 -0.18 0.29 0.74 0.76 0.69 0.21 -0.16 -0.64 -1.32
-1.35 -0.92 -0.22 -0.24 0.14 1.21 0.95 0.56 -0.17 -0.78 -0.64 -1.17
-2.54 -0.98 -0.55 0.16 0.47 1.02 1.01 0.29 0.02 -0.64 -0.66 -0.77
-2.3 -1.35 -0.63 -0.1 0.22 0.64 0.71 0.48 0.35 0.18 -0.06 -0.5
-2.44 -0.75 -0.22 -0.04 0.1 0.5 0.61 0.33 0.36 0.0 -0.05 -0.19
-1.78 -0.95 -0.27 0.22 0.38 0.55 0.49 0.38 0.26 0.06 -0.19 -0.69
-1.59 -1.54 -0.64 -0.4 -0.17 0.78 1.2 0.88 0.48 -0.52 -0.61 -1.16
-3.56 -2.38 -0.94 -0.44 0.19 0.92 1.15 0.84 0.44 -0.13 -0.51 -1.14
-2.16 -1.21 -0.61 0.05 0.39 0.62 0.74 0.75 0.31 0.01 -0.46 -1.04
-1.99 -0.96 -0.29 -0.05 0.13 0.63 0.73 0.51 0.32 -0.03 -0.17 -0.68
-2.64 -2.2 -0.98 0.38 0.75 1.1 0.96 0.14 -0.4 -0.37 -0.39 -0.64
-3.63 -1.59 -0.72 0.29 0.93 1.14 0.68 0.03 -0.31 -0.24 -0.31 -0.83
-3.57 -2.9 -1.09 0.33 0.89 1.28 1.08 0.21 -0.48 -0.47 -0.66 -1.22
-2.33 -0.93 -1.57 -0.01 0.21 0.35 1.14 0.58 0.84 0.26 -1.4 -1.19
-1.88 -1.01 -0.35 -0.16 0.16 0.83 0.84 0.51 0.21 -0.1 -0.49 -0.65
-2.93 -1.21 -0.35 0.09 0.34 0.79 0.81 0.61 0.24 -0.06 -0.62 -0.96
-1.04 -0.5 -0.9 0.36 0.28 0.61 0.79 0.41 0.11 -0.13 -0.49 -1.09
-2.51 -1.72 -0.5 0.19 0.61 0.57 0.52 0.58 0.26 0.05 -0.3 -0.53
-1.86 -0.5 -0.9 0.01 0.13 0.56 0.93 0.39 0.28 0.12 -0.7 -0.39
-1.2 -1.05 -0.46 0.04 0.56 0.6 0.61 0.19 0.07 0.05 -0.25 -0.4
-0.9 -0.5 -0.25 -0.02 0.12 0.58 0.85 0.78 0.32 -0.3 -1.08 -1.69
-2.09 -1.87 -0.87 -0.01 0.48 0.84 0.78 0.41 0.25 0.07 -0.3 -0.59
-1.06 -0.43 0.1 0.08 0.19 0.86 0.71 0.19 -0.17 -0.44 -0.46 -0.85
-0.44 -0.2 -0.09 -0.18 0.09 0.32 0.38 0.47 0.39 -0.04 -0.56 -0.74
-2.89 -1.48 -0.35 -0.16 0.39 1.19 1.01 0.85 -0.01 -0.63 -1.08 -1.68
-0.92 -0.51 -0.13 -0.15 0.03 0.52 0.62 0.36 0.21 -0.01 -0.23 -0.56
-1.34 -0.69 -0.3 -0.18 0.09 0.52 0.72 0.25 0.27 0.09 -0.08 -0.45
-0.74 -0.36 -0.03 -0.07 0.2 0.4 0.46 0.49 0.31 -0.06 -0.5 -0.88
-2.39 -1.89 -0.91 -0.26 0.07 1.05 1.35 0.89 0.31 -0.5 -1.37 -1.64
-0.59 -0.31 -0.08 0.16 0.15 0.38 0.49 0.48 0.27 -0.22 -0.55 -0.98
-3.94 -1.76 -0.95 -0.07 0.36 0.84 1.08 0.49 0.3 0.25 -0.7 -0.89
-0.51 -0.49 -0.18 -0.02 0.14 0.56 0.62 0.61 0.23 -0.25 -0.68 -1.17
-2.07 -0.97 -0.71 -0.02 0.4 0.54 1.03 0.54 0.33 0.09 -0.78 -1.07
-3.24 -1.96 -0.54 0.06 0.36 0.81 1.21 0.79 0.67 -0.34 -1.85 -2.55
-2.48 -1.27 -0.63 0.05 0.01 0.79 1.09 0.64 0.18 -0.42 -0.33 -0.65
-2.88 -1.77 -0.79 -0.11 0.07 0.91 1.17 0.75 0.45 -0.16 -0.92 -1.23
-5.62 -2.23 -0.55 -0.61 0.22 1.3 1.04 0.47 0.37 -0.09 -0.85 -0.79
-2.7 -1.45 -0.37 -0.01 0.27 1.21 1.11 0.72 0.01 -0.7 -0.97 -1.93

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.