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Heatmap: Cluster_98 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.62 -0.36 -0.37 -0.13 -0.63 -0.21 0.2 0.24 0.49 0.48 0.18 0.15
-0.57 -0.38 -0.91 -0.08 -0.02 -0.44 0.33 0.3 0.43 0.36 0.09 0.24
-0.6 -0.17 -1.14 0.37 -0.63 -0.72 -0.67 0.5 0.53 0.85 0.04 0.2
-1.02 0.04 -0.15 -0.23 -0.53 -0.38 0.07 -0.19 0.29 0.6 0.51 0.23
-0.82 -0.11 -0.67 0.46 0.4 -0.26 -0.29 -0.8 -0.15 0.34 0.22 0.7
-0.23 -0.02 -0.06 0.49 0.12 -0.05 -0.35 -0.53 0.2 0.14 -0.03 0.06
-0.96 -0.16 -0.2 0.05 0.39 0.23 0.11 0.23 0.21 0.2 -0.25 -0.33
-0.31 0.23 -0.15 -0.05 0.15 -0.32 -0.66 0.15 0.06 0.19 0.38 0.04
-0.46 -0.04 0.07 0.06 -0.17 -0.11 -0.09 -0.01 0.21 0.16 0.14 0.11
-1.12 -0.03 -0.32 -0.11 0.29 0.07 -0.14 0.27 0.08 0.31 0.25 -0.04
0.21 0.15 -0.58 -0.22 -0.2 -0.55 0.34 -0.27 0.42 0.29 0.01 -0.02
-1.4 -0.5 -0.62 0.36 0.47 0.13 -0.17 0.17 0.09 0.38 0.3 -0.16
-2.26 -0.33 -0.87 -0.09 0.54 0.09 -0.22 0.39 0.13 0.41 0.46 0.02
-2.47 -0.07 -1.03 -0.22 0.71 -0.3 -0.39 0.39 -0.11 0.6 0.68 -0.06
-0.53 -0.66 -0.53 0.02 0.1 0.04 0.08 -0.21 0.08 0.38 0.14 0.58
-0.47 -0.19 -0.01 0.34 0.13 0.35 0.26 -0.09 -0.0 -0.23 -0.22 -0.11
- - - - - - - - - 2.6 - 2.57
-0.48 -0.41 0.08 -0.0 -0.34 0.35 -0.25 0.14 0.12 0.3 0.34 -0.19
-4.91 - -6.25 - -5.0 -2.3 -0.24 0.82 0.84 1.75 1.39 0.41
-1.14 0.15 -0.38 0.22 0.07 -0.26 -0.4 0.06 0.42 0.49 0.01 0.09
-1.33 -0.46 -0.59 0.03 0.44 0.76 -0.18 -0.61 -0.1 0.23 0.35 0.29
-0.43 -0.04 -0.16 -0.13 0.09 0.11 0.02 0.09 0.08 0.09 0.11 0.08
-1.45 -0.65 -0.38 0.44 0.29 0.5 0.15 -0.24 0.06 0.18 0.13 0.01
-0.26 0.13 -0.86 0.14 -0.04 0.01 0.13 0.03 0.37 0.28 -0.12 -0.16
-1.02 -0.13 -0.56 -0.4 -0.36 -0.62 -0.47 -0.74 0.31 0.8 0.79 0.76
-0.22 0.28 -3.53 - -1.51 -3.1 - -2.9 -3.23 0.7 2.17 1.59
-0.37 0.01 -0.22 0.03 -0.57 -0.4 -1.38 0.38 -0.21 0.96 0.56 -0.07
-1.09 -0.0 -0.26 -0.03 -0.13 -0.23 -0.73 0.1 0.25 0.72 0.34 0.23
-0.1 -0.68 -0.81 0.2 -0.86 -1.21 -1.74 -1.9 0.03 1.2 0.88 1.0
- -0.32 - -0.39 0.08 -0.88 -0.43 0.46 -1.13 1.1 0.76 1.28
- - - - -0.07 - 0.99 - -0.08 1.6 0.98 1.63
-4.16 -0.32 -0.3 0.46 0.06 -0.06 -0.38 0.02 0.42 0.56 0.14 0.33
-0.03 0.03 -0.14 0.24 0.08 -0.07 0.04 -0.0 0.16 -0.06 -0.09 -0.22
-0.82 -0.11 -0.43 -0.14 0.25 -0.1 -0.44 0.39 0.43 0.27 0.19 -0.02
-1.98 -0.72 -0.62 0.14 0.21 -0.06 -0.14 0.7 0.39 0.26 0.38 -0.1
-1.05 -0.25 -0.61 -0.19 0.29 -0.16 -0.5 0.16 0.41 0.65 0.24 0.17
-1.55 -0.76 -0.66 0.16 0.13 0.29 0.23 0.26 0.12 0.3 0.29 0.12
-0.38 -0.05 -0.25 0.16 -0.22 -0.09 0.03 0.08 0.08 0.5 -0.04 -0.01
-0.24 0.01 -0.62 -0.25 0.33 0.08 -0.04 -0.01 0.1 0.26 -0.06 0.19
-0.71 -0.15 -0.28 -0.18 -0.33 -0.58 0.11 -0.08 0.51 0.62 0.18 0.26
-0.3 -0.22 -0.03 0.07 0.2 0.17 0.06 -0.03 0.03 -0.03 -0.0 0.03
-1.38 -0.68 -0.47 0.22 -0.17 0.26 0.05 0.51 0.41 0.14 0.3 -0.15
-1.2 -0.16 -0.34 -0.23 0.08 0.19 -0.02 0.02 0.13 0.51 0.13 0.27
0.29 -0.15 - - -0.38 - - -0.07 -0.16 1.7 0.67 1.27
-0.13 -0.0 -0.04 0.1 0.03 -0.22 -0.12 0.07 0.07 0.09 0.15 -0.04
-4.09 -0.63 -0.31 -0.03 0.47 0.03 -1.55 -0.29 0.04 0.9 0.96 0.14
-0.74 -0.34 -0.23 0.12 -0.04 -0.19 -0.42 0.14 0.29 0.38 0.12 0.46
- 0.08 - 0.06 0.21 0.21 0.03 0.9 0.63 1.07 -0.91 -0.96
-0.2 -0.22 -0.22 -0.38 0.15 0.21 0.12 0.23 0.14 0.14 -0.08 -0.04
-0.01 0.04 -0.26 -0.14 0.03 -0.03 -0.23 0.14 0.2 0.3 -0.03 -0.11
0.1 -0.22 -1.66 -1.74 -1.1 -2.48 -3.35 -1.75 -1.2 0.64 1.95 1.35
0.11 0.28 -1.6 -1.57 -1.39 -2.7 -2.0 -1.09 -1.07 0.47 1.87 1.18
-1.13 0.33 -1.6 -1.91 -1.17 -2.25 -3.45 -1.6 -1.7 1.14 1.85 1.32
-0.21 -0.14 -1.51 -1.36 -1.29 -1.81 -2.22 -1.26 -0.59 0.6 1.66 1.49
-2.84 -0.28 -1.11 0.44 1.08 0.17 -0.69 0.29 0.22 0.29 -0.2 -0.2
-0.6 -1.28 -1.48 0.1 0.16 -0.37 -0.29 -1.12 -0.31 0.4 0.88 1.24
-1.34 -0.3 -1.71 -0.03 0.46 0.25 -0.19 -0.06 0.29 0.58 -0.04 0.51
-0.15 -0.16 -0.63 0.13 0.15 0.11 0.2 -0.02 0.06 0.21 -0.01 -0.09
-0.15 0.2 -0.5 -0.12 0.23 -0.01 0.01 -0.35 -0.15 0.32 0.04 0.25
-2.59 -0.16 -2.0 0.76 0.68 0.57 -1.61 0.84 -0.93 0.48 0.12 -0.36
-1.11 -0.33 -0.49 -0.71 -0.89 -0.73 -1.39 -0.75 0.03 1.14 0.99 1.06
-0.79 -0.3 -2.17 -1.14 -0.7 -0.94 -0.83 -0.04 0.0 1.19 1.14 0.83
-1.1 -0.53 -0.39 0.31 0.1 -0.13 -0.33 0.16 0.25 0.47 0.3 0.18
-0.53 0.19 -0.64 -0.06 -0.05 -0.29 -0.08 -0.19 0.39 0.36 0.27 0.22
-0.94 -0.47 -0.45 0.27 0.24 -0.15 0.0 0.3 0.22 0.41 0.13 -0.13
-4.93 -4.83 -4.52 -3.19 -2.24 -0.64 -0.04 -0.1 1.08 1.45 1.45 0.53
-0.31 0.26 -0.1 0.03 -0.04 0.1 0.3 0.03 -0.05 0.14 -0.48 -0.07
-0.19 -0.16 -0.36 -0.23 -0.27 -0.11 -0.22 0.11 0.15 0.44 0.39 0.17
-0.96 -0.09 -0.78 -0.1 0.01 -0.04 0.29 0.15 0.32 0.57 -0.1 0.07
-0.67 0.12 0.04 0.21 0.18 -0.0 -0.08 0.27 -0.02 -0.04 -0.03 -0.2
-0.93 -0.31 -0.42 -0.16 0.24 0.26 0.05 0.16 0.16 0.22 0.25 0.03
-0.85 0.16 -0.19 0.05 0.32 0.04 0.08 -0.16 0.15 0.16 -0.18 0.11
- 0.01 - 0.27 - - - - - 1.89 1.3 1.86
-1.21 -0.1 -0.75 -0.11 -0.11 0.17 0.35 0.33 0.58 0.54 -0.51 -0.19
-1.26 -0.32 -0.88 -0.55 0.17 0.18 0.57 0.47 0.46 0.4 -0.03 -0.38
-1.66 -0.94 -0.66 0.26 0.37 0.34 -0.04 -0.05 0.34 0.1 0.1 0.5
-0.61 0.12 -0.08 0.06 0.4 0.2 -0.19 0.37 0.15 -0.09 -0.15 -0.56
-2.27 -0.38 0.05 0.27 -0.27 -0.7 -0.68 -0.48 0.52 0.65 0.47 0.69
-0.89 0.32 -0.28 -0.17 0.23 0.18 -0.07 0.1 0.24 0.24 -0.02 -0.28
-2.04 -0.51 -0.25 -0.1 0.4 0.01 -0.56 -0.0 0.11 0.57 0.55 0.31
-0.39 -0.03 -0.3 -0.05 -0.26 -0.04 0.05 0.08 0.27 0.19 0.19 0.13
-0.83 -0.37 -0.09 0.0 0.16 0.18 -0.11 0.11 0.05 0.24 0.3 0.01
-1.65 -0.85 -1.02 -0.85 -0.17 -0.98 -1.24 -0.1 0.59 1.39 0.67 0.68
-1.52 -0.08 -0.33 -0.13 0.16 -0.06 -0.04 0.19 0.17 0.49 0.32 0.04
- - - 2.02 - - - - - 2.0 - 1.98
-1.82 -0.86 -0.55 0.5 0.62 0.17 -0.22 -0.01 0.14 0.19 0.16 0.25
-4.98 -5.67 -5.96 -8.18 -7.95 -4.34 -1.05 -0.43 1.0 1.79 1.73 0.91
-4.81 -5.9 - - -8.28 -4.25 -0.87 -0.24 1.23 1.84 1.56 0.68
-4.62 -1.0 -0.61 -0.55 0.09 0.22 -0.11 0.27 0.37 0.84 0.54 0.3
-0.45 0.12 -0.05 0.11 0.16 0.1 -0.22 0.09 0.05 -0.01 -0.02 0.01
-0.58 -0.01 -0.12 0.03 0.41 0.25 -0.18 -0.01 -0.0 0.02 0.09 -0.1
-2.0 -0.03 -0.91 -0.33 0.32 -0.06 -0.17 0.16 0.29 0.83 0.13 0.2
- 0.43 - 0.19 0.86 -1.14 -0.84 -0.4 0.63 1.46 -0.89 0.12
-1.07 0.13 -0.44 -0.27 0.52 -1.25 0.26 0.22 0.57 0.64 0.04 -0.77
-1.03 0.46 -0.63 0.24 -1.15 -4.0 -0.62 -0.34 -0.2 1.05 0.66 0.88
-0.41 -0.28 -0.47 -0.42 -0.29 -0.01 -0.06 0.12 0.3 0.36 0.35 0.38
-0.36 -0.42 -0.66 -0.06 -0.02 -0.01 -0.09 0.55 0.58 0.37 -0.13 -0.33
-2.69 0.21 0.24 0.76 0.46 0.47 -1.61 -0.26 -0.06 0.03 -0.07 -0.07
-3.47 -0.93 -0.86 -0.45 0.34 -0.69 -0.36 0.46 0.44 0.89 0.57 0.44
-5.94 -2.35 -1.49 -0.91 0.33 0.86 0.2 1.05 0.05 0.96 -0.01 -0.61
- - - - - - - - - 2.6 2.57 -
-1.66 -0.2 -1.09 -0.2 -0.1 0.43 0.54 -0.1 0.46 0.62 -0.22 0.05
- -1.9 0.07 -0.17 -0.51 -1.05 -0.24 -0.14 0.09 1.34 1.03 0.27
-0.65 -0.4 -0.25 0.05 0.29 -0.19 -0.38 0.05 0.18 0.45 0.29 0.16
-1.01 0.17 0.04 0.11 0.42 0.29 -0.07 0.04 0.03 0.01 -0.27 -0.2
-0.3 0.17 -0.1 -0.12 0.03 0.05 -0.31 0.12 0.17 0.2 0.01 -0.01
-1.74 -0.15 -0.13 0.37 0.02 -0.25 0.02 0.15 0.09 0.35 0.16 0.22
-0.39 0.3 -0.39 -0.01 0.16 -0.24 -0.46 0.22 0.17 0.33 0.19 -0.21
-0.59 0.42 -0.31 -0.03 0.17 -0.39 -0.65 -0.06 0.08 0.41 0.32 0.13
-1.0 -0.24 -0.15 0.01 0.18 0.05 0.11 -0.32 0.05 0.24 0.08 0.52
-0.8 -0.34 -0.57 -0.4 -0.26 -0.72 0.47 0.04 0.62 0.72 -0.25 0.4
-0.91 0.07 -0.49 -0.27 0.38 0.17 -0.26 -0.12 0.21 0.56 -0.02 0.11
0.25 -0.53 -2.54 -1.61 -1.6 -2.65 -0.76 -0.11 -0.7 0.5 1.79 1.09
-0.18 -2.06 -1.52 -1.8 -1.85 - -1.75 -0.08 -0.87 1.34 1.78 1.14
-1.17 0.02 -0.53 0.06 0.38 0.03 -0.23 0.01 -0.01 0.34 0.1 0.36
0.22 0.45 -1.0 -0.05 0.26 -0.32 -0.35 -0.22 -0.05 0.36 -0.1 0.23
-0.17 -0.11 -1.17 0.61 0.47 -1.0 -0.44 -0.47 0.38 0.04 0.35 0.33
-0.47 -0.1 -0.18 -0.03 0.13 -0.12 -0.24 0.11 0.07 0.3 0.29 0.06
-0.51 -0.01 -1.03 -0.69 -0.46 -0.31 -0.8 0.08 0.22 0.71 0.6 0.77
-0.56 -0.07 0.07 0.21 0.25 0.1 0.23 -0.45 0.21 -0.08 -0.13 -0.03
-0.49 0.22 -0.02 -0.12 -0.21 -0.01 0.13 0.0 -0.02 0.03 0.25 0.1
-0.24 -0.2 -0.48 0.18 -0.11 0.17 0.09 -0.03 0.11 0.15 0.15 0.03
-1.48 -0.39 -0.27 0.56 0.56 0.36 0.02 0.14 -0.19 0.03 -0.26 -0.04
-1.46 -0.46 -0.54 -0.12 0.32 0.1 0.17 0.08 -0.05 0.34 0.49 0.22
-0.25 0.25 -0.05 0.29 0.04 -0.35 -0.62 0.05 -0.02 0.21 -0.02 0.2
-0.18 0.0 0.18 0.22 0.17 0.14 -0.37 -0.07 -0.01 0.03 -0.05 -0.16
-3.1 -0.0 -1.41 -1.41 -0.55 -0.28 -0.81 0.24 1.0 1.08 0.02 0.8
-0.53 -0.33 -0.23 -0.91 0.03 -0.1 -0.09 0.15 0.08 0.43 0.48 0.4
-1.4 -0.0 -1.01 -0.54 -0.4 -0.85 -2.17 -0.07 -0.01 1.35 1.16 0.23
-0.55 0.15 0.32 0.09 -0.03 -0.48 -0.42 0.0 0.33 0.18 0.04 0.05
-0.45 1.17 -0.1 -0.82 -0.02 0.41 -2.19 -2.07 -0.29 0.15 0.44 0.53
-0.49 0.03 -0.05 -0.14 0.16 -0.05 -0.24 -0.05 0.12 0.3 0.17 0.08
-2.62 -0.17 -0.61 -0.15 -0.54 -0.73 -0.28 -1.2 0.64 1.0 0.68 0.75

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.