Heatmap: Cluster_33 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.07 0.19 0.12 0.27 0.06 0.17 0.27 0.16 0.15 0.23 0.28 0.29
0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.09
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.02
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0
0.07 0.06 0.12 0.0 0.05 0.0 0.03 0.02 0.02 0.06 0.0 0.07
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.41 0.02 0.09 0.0 0.0 0.23 0.13 0.06 0.16 0.06 0.17 0.24
0.07 0.05 0.13 0.17 0.16 0.04 0.09 0.05 0.18 0.0 0.04 0.04
0.0 0.28 0.0 0.07 0.0 0.18 0.25 0.07 0.26 0.0 0.0 0.07
0.07 0.05 0.05 0.0 0.0 0.09 0.14 0.25 0.34 0.43 0.04 0.14
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.05 0.08 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.02
5.14 3.89 3.3 5.49 4.56 3.62 5.42 4.56 4.9 5.33 5.22 3.41
0.24 0.46 0.24 0.37 0.4 0.28 0.19 0.38 0.44 0.34 0.3 0.32
0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.2 0.65 0.27 0.44 0.72 0.69 0.37 0.7 0.82 0.33 0.72 0.7
0.1 0.49 0.33 0.13 0.16 0.2 0.19 0.05 0.11 0.27 0.04 0.09
0.13 0.04 0.05 0.0 0.05 0.04 0.05 0.04 0.09 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.13 0.12 0.05 0.04 0.19 0.02 0.07 0.12 0.11 0.1 0.12 0.02
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.05 0.08 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.06 0.0 0.0
0.13 0.11 0.08 0.17 0.05 0.04 0.14 0.09 0.13 0.3 0.27 0.74
0.07 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0
0.07 0.0 0.03 0.02 0.0 0.04 0.0 0.0 0.02 0.02 0.02 0.0
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.02 0.0 0.0
0.27 0.26 0.08 0.09 0.14 0.0 0.13 0.16 0.24 0.21 0.44 0.04
0.16 0.09 0.11 0.07 0.1 0.08 0.09 0.11 0.15 0.04 0.02 0.02
0.0 0.83 1.07 0.46 1.41 0.17 0.5 0.0 0.76 1.82 0.71 0.95
0.2 0.24 0.24 0.2 0.29 0.0 0.08 0.07 0.18 0.13 0.11 0.04
0.0 0.05 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.07
0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0
0.1 0.23 0.19 0.15 0.4 0.0 0.0 0.33 0.21 0.51 0.29 0.53
0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0
0.0 0.28 0.36 0.35 0.3 0.04 0.09 0.77 0.06 0.49 0.13 0.43
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
1.1 0.9 0.59 0.35 0.48 0.67 0.66 1.67 1.07 0.75 0.98 0.48
0.0 0.0 0.05 0.0 0.05 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.02 0.0
0.39 0.0 0.41 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.17 0.29 0.09 0.04 0.36 0.09 0.13 0.16 0.09 0.62 0.3 0.14
0.13 0.14 0.07 0.07 0.07 0.04 0.06 0.07 0.05 0.15 0.09 0.06
0.0 0.47 0.33 0.44 0.4 0.34 0.25 0.25 0.72 0.72 0.38 0.68
0.0 0.05 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.07 0.14 0.02 0.04 0.0 0.05 0.0 0.07 0.02 0.11 0.06 0.07
0.0 0.0 0.18 0.04 0.0 0.04 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.08 0.05 0.0 0.04 0.05 0.0 0.1 0.05 0.04 0.17 0.17
0.03 0.02 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.02 0.02
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.07 0.07 0.0 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02
0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.05 0.02 0.02 0.0
0.03 0.05 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.09 0.11 0.02 0.13 0.0
0.0 0.05 0.08 0.04 0.02 0.04 0.05 0.0 0.08 0.11 0.07 0.04
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.36 0.85 0.46 0.24 0.15 0.33 0.06 0.08 0.13 0.06 0.18
0.07 0.0 0.0 0.02 0.04 0.03 0.0 0.05 0.07 0.08 0.02 0.0
0.07 0.18 0.03 0.0 0.14 0.0 0.04 0.09 0.0 0.19 0.09 0.09
0.0 0.02 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.04 0.14 0.02 0.07 0.03 0.02 0.1 0.15 0.11 0.08 0.09
0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.1 0.02 0.0 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.08 0.03 0.02 0.07 0.0 0.0 0.0 0.05 0.04 0.04 0.02
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
0.03 0.26 0.31 0.18 0.15 0.1 0.02 0.1 0.02 0.02 0.02 0.09
0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.04 0.13 0.04 0.02 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.09 0.04 0.18 0.15 0.11 0.05 0.16 0.27 0.17
0.11 0.08 0.18 0.0 0.14 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.05 0.0 0.12 0.0 0.07 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0
0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.06 0.02 0.0
0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.03 0.03 0.04 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05
0.04 0.02 0.07 0.02 0.0 0.0 0.02 0.05 0.09 0.08 0.06 0.16
0.29 0.48 0.5 0.18 0.75 0.7 0.43 0.83 0.72 0.65 0.69 0.26
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02 0.0 0.03 0.05 0.0 0.0 0.0
0.1 0.08 0.19 0.18 0.2 0.25 0.29 0.23 0.66 0.55 0.28 0.31
0.13 0.56 0.32 0.4 0.43 0.18 0.23 0.37 0.4 0.79 0.38 0.36
0.0 0.05 0.08 0.07 0.0 0.03 0.02 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.04 0.04 0.0
0.0 0.0 0.08 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.14 0.19 0.11 0.07 0.04 0.02 0.0 0.02 0.0 0.02 0.05
0.0 0.05 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0
0.14 0.29 0.19 0.13 0.21 0.29 0.38 0.35 0.37 0.19 0.18 0.16
0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0
0.0 0.0 0.08 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.05 0.07 0.11 0.0 0.04 0.0 0.02 0.05 0.0 0.06 0.0
0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.02 0.02 0.02 0.04
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.05 0.07 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.04 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.02 0.02 0.02
0.0 0.04 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.05 0.11 0.04 0.22

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)