Heatmap: Cluster_53 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-4.77 -1.26 -0.25 0.2 0.29 0.27 0.01 -0.15 0.58 0.54 0.35 0.02
-1.66 -0.32 -0.05 0.39 0.57 0.11 -0.33 -0.26 0.03 0.2 -0.0 0.3
-0.66 -0.02 0.13 0.1 0.28 0.18 -0.31 -0.24 -0.0 0.31 0.04 -0.08
-1.62 -0.24 0.03 0.36 0.46 0.4 -0.24 -0.06 0.15 0.13 -0.2 -0.07
-2.69 -0.44 -0.09 0.32 0.23 0.1 -0.19 -0.48 0.24 0.54 0.25 0.33
-0.93 -0.02 0.16 0.11 0.14 0.07 -0.25 0.18 0.1 0.09 0.07 -0.03
-0.96 -0.29 0.14 -0.09 0.37 0.33 0.09 -0.08 0.06 0.09 -0.08 0.03
-2.11 -0.4 0.05 0.16 0.37 0.33 -0.05 0.05 0.28 0.21 -0.1 0.0
-1.69 -0.47 -0.16 0.36 0.47 0.27 0.09 -0.12 -0.05 0.13 -0.03 0.24
-1.52 -0.25 0.07 0.24 0.22 0.12 -0.43 0.47 0.03 -0.02 0.27 -0.02
-1.49 -0.3 -0.04 0.29 0.47 0.05 0.1 -0.06 -0.1 0.17 0.32 -0.18
-1.63 -0.5 -0.09 0.1 0.52 0.47 0.05 -0.05 -0.17 0.06 0.06 0.23
-2.57 -0.18 0.1 0.17 0.07 0.14 0.11 0.26 0.14 0.0 0.11 0.2
-2.69 -0.93 -0.38 0.68 0.5 -0.01 0.09 -0.15 0.07 0.47 -0.02 0.19
-1.21 -0.3 0.04 0.06 0.21 0.33 0.11 0.15 0.01 -0.03 0.03 0.09
-1.37 -0.35 0.19 0.07 0.3 0.25 -0.06 0.22 -0.09 0.25 -0.0 -0.05
-1.32 -0.26 0.13 -0.1 0.3 0.44 0.1 -0.0 -0.02 0.05 0.02 0.07
-1.09 -0.15 -0.09 0.24 0.31 0.14 -0.24 -0.46 0.17 0.28 0.12 0.23
-3.38 -1.65 -0.51 0.32 0.42 0.2 0.11 0.15 0.3 0.4 0.3 0.25
-1.55 -0.1 -0.07 0.31 0.35 -0.18 -0.36 -0.18 0.06 0.27 0.19 0.4
-4.92 -3.68 -1.4 0.61 1.25 1.06 -0.21 -0.73 -0.65 0.49 -0.03 0.04
-3.47 -0.97 -0.07 0.35 0.27 0.36 -0.03 -0.05 0.15 0.56 0.22 0.0
-1.16 -0.28 0.02 0.15 0.41 0.35 -0.03 -0.01 -0.05 0.02 0.04 0.02
-1.01 -0.15 0.17 0.03 0.21 0.08 0.06 0.14 0.17 0.08 -0.11 -0.01
-1.05 -0.18 0.03 -0.04 0.2 0.19 -0.03 0.16 0.17 0.19 -0.0 -0.01
-1.05 -0.07 -0.04 0.19 0.29 -0.03 -0.03 0.25 0.12 0.01 -0.02 -0.01
-0.83 -0.53 -0.28 0.3 0.19 0.05 -0.1 0.03 0.14 0.24 0.17 0.2
-0.86 -0.3 -0.13 -0.04 0.25 0.15 -0.28 0.48 0.09 0.07 0.23 -0.07
-2.5 -1.65 -1.78 0.22 0.35 -0.01 0.11 0.09 0.53 0.78 0.47 0.13
-3.36 -0.79 -0.22 0.34 0.56 0.4 -0.08 -0.55 -0.07 0.38 0.2 0.45
-1.56 -0.2 -0.07 0.22 -0.09 -0.05 0.13 -0.4 0.19 0.1 0.39 0.48
-0.69 -0.2 -0.0 -0.02 0.32 0.05 -0.12 0.06 0.12 0.09 0.19 -0.02
-0.75 -0.06 0.24 0.09 0.18 -0.01 -0.27 0.19 -0.02 0.15 0.11 -0.1
-0.89 0.05 0.2 0.09 0.31 -0.13 -0.41 0.2 0.07 0.12 0.21 -0.23
-1.15 -0.03 0.17 -0.02 0.14 -0.0 -0.16 0.19 0.16 0.12 0.13 0.03
-1.2 -0.19 0.06 -0.04 0.36 0.41 0.25 0.01 0.02 0.03 -0.23 -0.06
-1.09 -0.89 -0.68 0.38 0.31 0.09 -0.21 -0.24 0.25 0.55 0.27 0.25
-4.1 -1.43 -0.57 0.37 0.43 0.23 0.13 -0.13 0.31 0.37 0.25 0.45
-4.02 -0.8 -0.13 0.67 0.36 0.01 -0.23 0.18 0.14 0.25 0.12 0.27
-2.78 -0.24 0.11 0.17 0.56 0.24 -0.22 -0.2 0.03 0.29 0.14 0.09
-0.99 -0.43 -0.17 0.15 0.21 0.15 0.09 -0.05 0.14 0.3 0.16 0.01
-3.04 -1.32 -0.74 0.49 0.02 0.24 0.32 -0.15 0.47 0.45 0.05 0.42
-2.09 -0.4 -0.4 0.12 0.49 0.35 0.04 0.07 0.1 0.2 -0.07 0.3
-1.28 -0.42 -0.13 0.13 0.33 0.47 0.09 0.21 0.11 -0.13 0.0 -0.01
-0.99 -0.34 -0.16 0.17 0.26 0.42 0.12 0.08 0.02 -0.02 0.0 0.0
-6.41 -1.01 -0.16 0.12 0.57 0.31 0.23 0.18 0.43 0.36 0.08 -0.35
-2.94 0.03 0.27 0.05 0.62 0.22 -0.15 -0.23 -0.02 0.13 0.25 -0.16
-3.64 -0.71 0.01 -0.16 0.4 -0.16 -0.21 0.57 0.22 0.08 0.5 0.26
-1.65 0.01 0.05 0.13 0.4 -0.04 -0.24 0.16 -0.06 0.13 0.22 0.11
-0.95 -0.28 0.18 -0.19 0.13 -0.25 -0.31 0.29 0.33 0.18 0.34 0.04
-1.87 -0.48 -0.24 0.4 0.31 0.23 0.4 0.09 0.15 -0.08 -0.24 0.18
-1.19 -0.03 -0.03 0.12 0.44 0.03 -0.22 0.04 0.06 0.19 0.24 -0.15
-4.31 -1.81 -0.87 -0.36 1.07 0.86 0.06 -0.33 -0.03 0.53 0.23 -0.02
-1.61 -0.17 -0.18 0.39 0.33 0.27 0.6 0.07 -0.34 -0.17 -0.29 0.09
-2.19 -0.26 -0.1 0.31 0.37 0.37 -0.06 0.01 0.03 0.23 -0.08 0.12
-1.49 -0.17 -0.09 0.25 0.18 -0.14 0.29 0.38 0.07 0.15 -0.12 -0.02
-4.08 -0.76 -0.06 -0.34 0.57 0.06 -0.1 -0.02 -0.27 0.57 0.74 0.22
-5.25 -0.55 -0.62 0.29 0.38 0.28 0.17 -0.35 0.26 0.71 -0.0 0.22
-2.03 -0.51 0.06 0.41 0.55 0.27 -0.26 -0.09 0.06 0.03 0.14 0.09
-3.58 -0.89 0.06 0.48 0.51 0.12 -0.34 0.08 -0.07 0.26 0.38 0.17
-2.84 -0.49 -0.0 0.2 0.22 0.23 -0.08 0.1 0.32 0.17 0.02 0.33
-1.8 -0.29 -0.11 0.2 0.28 0.18 -0.08 -0.08 0.16 0.26 0.03 0.32
-3.09 -0.19 0.29 0.04 0.73 0.27 -0.16 0.11 -0.13 -0.19 0.12 0.05
-2.15 -0.58 -0.16 0.05 0.6 0.44 -0.56 -0.09 0.24 0.24 0.29 0.13
-1.54 -0.09 -0.0 0.38 0.26 -0.21 -0.19 -0.16 0.04 0.34 0.17 0.23
-0.93 -0.04 0.13 0.24 0.36 -0.05 -0.36 0.11 -0.03 0.13 0.07 0.01
-1.81 -0.6 -0.42 0.41 -0.13 0.09 0.31 -0.12 0.01 0.74 0.17 0.05
-2.64 -0.83 -0.31 0.53 0.57 0.11 -0.17 -0.16 0.21 0.28 0.08 0.32
-1.63 -0.21 -0.35 0.24 0.54 0.35 -0.09 0.25 -0.09 0.25 -0.12 -0.09
-1.12 -0.35 -0.04 0.1 0.02 -0.03 -0.07 -0.06 0.17 0.47 0.18 0.21
-0.57 -0.21 -0.18 0.25 0.31 0.21 0.02 -0.11 -0.06 0.12 0.0 0.01

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.