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Heatmap: Cluster_121 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.51 0.18 -0.14 -0.16 0.21 -0.23 -0.49 0.25 -0.01 0.18 0.43 -0.03
-0.2 -0.12 -0.26 -0.03 0.08 0.07 -0.04 0.13 0.04 0.01 0.15 0.11
-0.81 -0.14 0.05 -0.01 -0.11 0.13 -0.12 0.07 0.15 0.08 0.3 0.15
-0.21 0.16 -0.0 -0.1 -0.29 -0.23 -0.26 0.15 -0.58 0.56 0.21 0.24
-0.1 -0.08 -0.05 0.24 -0.02 -0.11 -0.48 -0.4 -0.09 0.16 0.41 0.27
0.21 0.27 -0.4 -1.38 -2.92 0.39 -1.4 0.96 -1.47 -2.04 1.57 0.2
-0.41 0.16 0.18 0.07 0.08 -0.14 -0.29 0.06 -0.09 -0.02 0.28 -0.01
-1.51 -1.14 -0.66 0.26 0.28 0.17 -0.25 0.32 0.03 0.16 0.37 0.59
-0.23 -0.06 0.1 0.05 -0.01 0.01 -0.12 0.21 0.0 -0.03 0.1 -0.08
-0.04 -0.01 0.01 0.19 0.13 0.01 -0.34 -0.13 -0.26 -0.21 0.17 0.32
-0.22 -0.05 0.01 0.05 -0.16 -0.14 -0.17 0.17 -0.07 0.05 0.33 0.1
-1.41 -0.8 -0.45 0.06 0.48 0.04 0.13 -0.0 0.12 0.26 0.43 0.17
-0.19 -0.03 0.1 -0.05 -0.27 -0.02 0.09 -0.06 0.04 0.22 0.08 0.01
-0.22 -0.02 -0.18 0.04 -0.19 -0.48 -0.37 0.18 -0.08 0.13 0.55 0.3
-0.68 -0.38 -0.16 0.17 -0.08 -0.0 0.07 -0.18 -0.09 0.47 0.41 0.09
0.08 0.45 -1.01 -0.87 0.45 -0.13 -0.21 -0.25 0.34 0.12 0.18 0.1
0.47 0.45 0.46 -0.2 -1.37 -0.22 0.31 -0.4 -0.0 -0.19 0.19 -0.43
-0.22 0.04 -0.13 0.05 -0.27 -0.23 -0.16 -0.2 0.03 0.12 0.28 0.47
-0.14 -0.08 -0.16 -0.28 -0.07 0.12 0.05 0.19 0.0 -0.07 0.25 0.09
0.39 -0.13 -0.07 0.12 -0.17 -0.24 -0.09 -0.13 -0.09 -0.22 0.36 0.09
0.08 0.07 0.02 0.09 -0.03 -0.07 0.01 -0.02 0.1 -0.13 -0.18 0.01
0.25 0.44 0.25 0.36 0.47 0.45 -0.22 -0.76 -1.1 -0.88 -0.25 -0.1
0.31 0.18 0.18 -0.04 -0.31 -0.02 0.03 -0.09 -0.14 -0.31 0.02 0.06
-0.39 -0.07 -0.07 -0.11 -0.04 -0.03 -0.17 0.44 0.05 -0.0 0.28 -0.06
-0.18 -0.23 -0.37 0.01 -0.12 0.21 0.33 0.32 -0.09 -0.06 -0.42 0.34
-0.07 -0.15 -0.1 -0.05 -0.21 -0.05 -0.08 0.14 0.11 0.16 0.28 -0.08
-0.63 0.06 0.12 0.06 0.17 0.05 -0.32 0.0 -0.09 0.05 0.17 0.17
-0.33 0.17 -0.53 0.08 -0.29 0.06 -0.24 0.13 -0.06 0.04 0.56 0.11
-0.53 -0.15 -0.08 -0.15 0.07 0.08 -0.15 0.3 -0.17 0.0 0.6 -0.11
-0.87 -0.46 -0.08 0.01 0.12 0.34 0.3 -0.17 -0.15 -0.0 0.1 0.4
-0.11 0.03 -0.01 0.06 0.14 -0.03 -0.23 0.07 0.01 -0.03 0.01 0.05
-0.11 -0.07 -0.19 -0.07 0.08 -0.02 -0.09 0.1 -0.02 0.07 0.12 0.17
-2.63 -0.61 -0.14 0.25 0.09 0.27 0.07 0.06 0.3 0.18 0.08 0.39
-0.57 -0.37 -0.12 0.19 -0.12 -0.18 -0.06 -0.1 -0.02 0.1 0.25 0.64
-2.09 -0.49 -0.27 -0.15 0.51 -0.18 -0.03 -0.11 0.46 0.36 0.3 0.28
-0.71 -0.06 -0.23 -0.05 0.34 -0.38 -0.66 0.35 -0.19 0.04 0.67 0.23
-0.5 -0.08 0.08 -0.11 -0.05 -0.05 -0.27 0.23 0.06 0.15 0.31 0.04
0.03 -0.17 -0.31 -0.29 0.18 0.27 0.07 0.24 -0.13 -0.22 0.18 -0.01
-0.1 -0.37 -0.17 0.02 -0.04 -0.03 0.16 -0.11 0.07 -0.01 0.15 0.31
0.06 0.03 -0.02 0.0 0.03 -0.06 -0.17 0.03 -0.07 0.02 0.06 0.08
-0.13 -0.21 -0.07 -0.32 0.16 0.28 -0.12 0.07 -0.04 -0.06 0.03 0.27
-0.46 -0.08 -0.23 -0.03 0.03 -0.08 -0.07 0.15 -0.16 0.15 0.47 0.09
-0.1 -0.08 -0.35 -0.19 -0.11 0.07 -0.1 0.25 0.06 0.01 0.37 0.02
-0.26 0.06 -0.27 -0.07 -0.04 -0.06 -0.23 0.29 -0.12 -0.09 0.57 -0.0
-0.26 -0.07 -0.11 -0.15 -0.09 0.11 0.04 0.22 -0.06 -0.0 0.29 -0.01
-1.43 -0.65 -0.32 0.05 0.44 0.32 -0.49 0.26 -0.01 0.24 0.62 -0.1
-0.12 -0.07 -0.08 0.25 0.27 -0.04 -0.25 -0.28 -0.18 -0.03 0.17 0.21
-0.24 -0.06 -0.37 -0.05 -0.02 0.11 -0.2 0.25 -0.14 -0.06 0.5 0.08
-0.46 0.09 -0.32 -0.05 0.14 -0.33 -0.52 0.16 -0.28 0.13 0.61 0.35
0.03 0.11 0.02 -0.08 -0.16 0.02 -0.06 -0.06 -0.16 -0.11 0.3 0.09
-0.16 0.02 -0.15 -0.14 0.09 0.1 -0.11 0.32 -0.19 -0.1 0.32 -0.14
-0.88 -0.14 -0.36 0.06 0.23 -0.01 -0.21 0.17 -0.01 0.14 0.52 0.06
0.15 -0.15 -0.15 -0.27 -0.06 0.24 -0.14 0.16 -0.27 -0.01 0.37 -0.03
-0.43 0.04 0.06 0.08 0.14 0.12 0.09 -0.15 -0.2 0.03 0.09 0.03
-0.74 -0.56 -0.07 0.17 -0.05 -0.04 0.21 -0.07 0.08 0.02 0.17 0.49
0.1 -0.13 -0.04 0.16 -0.09 -0.02 0.02 -0.05 -0.12 -0.21 0.01 0.28
-1.05 0.07 -0.13 0.18 -0.1 0.15 0.23 0.01 0.12 -0.1 0.02 0.22
-1.17 0.08 0.07 -0.03 0.15 0.23 -0.3 0.0 -0.12 0.01 0.41 0.15
-0.02 0.19 -0.24 0.19 0.16 -0.27 -0.46 0.08 -0.02 0.1 -0.02 0.17
-0.8 -0.29 -0.04 0.19 0.11 0.08 -0.2 -0.07 -0.01 0.2 0.32 0.2
- -1.35 0.25 0.07 -0.05 0.03 0.8 0.1 -0.01 -0.35 0.69 0.23
-0.81 -0.18 -0.07 -0.15 0.13 0.22 -0.15 0.19 -0.15 0.15 0.44 0.03
-0.38 0.11 -0.53 -0.18 0.19 0.34 -0.11 -0.08 -0.15 0.25 0.03 0.25
-0.66 0.03 0.08 0.12 0.07 -0.08 -0.21 0.07 -0.14 0.07 0.3 0.14
-0.6 -0.14 0.07 -0.19 -0.07 -0.03 -0.01 0.26 0.14 0.09 0.29 -0.01
-0.45 -0.1 0.06 -0.05 -0.06 0.02 -0.12 0.13 -0.04 0.1 0.29 0.1
-0.27 0.03 -0.02 0.11 0.22 -0.11 -0.19 -0.02 -0.04 0.03 0.08 0.09
0.52 0.26 0.13 0.15 -0.62 -0.52 0.13 0.12 -0.08 -0.14 -0.19 -0.14
0.12 0.1 -0.1 0.02 -0.14 -0.21 -0.31 0.12 0.02 0.2 -0.03 0.13
-0.41 0.08 -0.39 0.07 0.17 -0.31 -0.13 0.2 0.11 0.01 0.1 0.29
-0.63 0.09 -0.26 0.15 -0.4 -0.57 -0.34 0.04 0.16 0.19 0.47 0.53
-1.17 -0.14 -0.3 0.23 0.18 -0.86 -0.67 -0.64 -0.39 0.53 0.86 0.76
-0.11 -0.26 -0.09 0.08 -0.08 0.18 0.15 -0.15 -0.52 -0.27 0.3 0.48
-2.22 -0.42 -0.4 0.24 0.46 0.12 -0.38 -0.19 -0.32 0.24 0.63 0.54
-0.28 -0.18 -0.56 0.19 0.19 -0.13 -0.49 0.06 -0.18 0.09 0.49 0.4
-1.04 -1.06 -2.18 0.56 -1.68 -0.62 1.17 -1.31 -0.87 1.02 1.36 -0.79
-0.7 -0.53 -0.3 -0.1 -0.06 0.07 -0.11 0.32 0.14 0.17 0.51 0.15
-1.15 -0.17 -0.26 0.03 -0.4 0.27 0.5 0.38 -0.49 -0.06 0.59 -0.06
-0.05 0.02 0.07 -0.09 0.05 0.21 0.01 0.08 -0.24 -0.25 0.16 -0.05
-0.42 -0.11 -0.4 -0.18 0.3 0.21 -0.23 -0.05 -0.32 0.12 0.51 0.24
-1.56 -0.66 -0.29 0.27 0.04 0.14 0.14 -0.2 -0.02 0.25 0.36 0.53
0.21 0.22 0.01 0.03 -0.07 0.1 -0.04 -0.14 -0.3 -0.28 -0.03 0.17
- 0.75 0.63 - - 0.76 - 1.5 - - 1.01 1.16
-0.32 0.02 -0.07 -0.17 -0.15 0.04 -0.22 0.15 -0.52 0.29 0.23 0.43
-1.68 -0.48 -0.13 0.09 0.02 -0.02 0.11 0.12 0.15 0.38 0.49 0.0
0.36 0.06 0.02 -0.2 0.07 0.06 -0.11 0.03 0.21 0.35 -1.02 -0.27
-1.32 -1.02 0.02 0.1 0.16 0.13 0.3 -0.14 -0.01 0.1 0.3 0.45
-0.21 -0.22 -0.63 -0.08 -0.01 -0.18 -0.05 0.28 0.28 0.16 0.33 0.06

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.