Heatmap: Cluster_28 (HCCA clusters)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.14 0.1 0.17 0.69 0.52 0.47 0.37 0.37 0.62 0.17 0.89 1.0
0.0 0.92 0.0 0.0 0.16 0.14 0.0 0.97 0.17 0.15 1.0 0.0
0.0 0.27 0.25 0.33 0.35 0.0 0.0 0.38 0.31 0.63 1.0 0.71
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.8 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.32 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.4 0.2 0.21 0.0
0.0 0.06 0.06 0.08 0.81 0.31 0.07 1.0 0.79 0.51 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.93 0.74 0.78 0.58 0.86 0.83 0.59 1.0 0.9 0.77 0.74 0.86
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.55 0.46 1.0 0.0 0.86 0.0 0.0
0.0 0.7 0.0 0.0 0.8 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.87 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.45 0.0 0.43 0.93
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.53 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.37 1.0 0.0 0.1 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.28 0.31
0.0 0.93 0.0 0.43 0.0 0.0 0.15 1.0 0.16 0.69 0.44 0.63
1.0 0.16 0.08 0.09 0.23 0.5 0.35 0.68 0.0 0.87 0.73 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.87 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.87 1.0 0.0 0.8 0.82 0.0
0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 1.0 0.0 0.98 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.31 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.14 0.15 0.29 0.17
0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.17 0.2 1.0 0.16 0.0 0.16 0.18
0.0 0.32 0.0 0.0 0.6 0.29 0.0 1.0 0.89 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.33 0.39 0.43 0.6 0.42 0.56 0.21 0.41 0.6 0.27 0.81 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 1.0 0.45 0.4 0.0 0.0
0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.43 0.42 0.0
0.0 0.07 0.09 0.13 0.24 0.75 0.5 1.0 0.84 0.55 0.69 0.46
0.0 0.7 0.32 0.84 0.0 0.0 1.0 0.0 0.87 0.43 0.0 0.42
0.0 0.63 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.31 0.27 0.84 0.31
0.22 0.55 0.27 0.0 0.28 1.0 0.26 0.74 0.14 0.26 0.25 0.4
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.0 1.0 0.0
0.0 0.27 0.4 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.36
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.82 0.0
0.07 0.66 0.24 0.58 0.71 0.72 0.68 1.0 0.58 0.96 0.62 0.54
0.09 0.05 0.0 0.11 0.12 0.2 0.06 1.0 0.29 0.17 0.23 0.0
1.0 0.59 0.47 0.14 0.51 0.73 0.29 0.96 0.35 0.48 0.14 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.45 0.0 0.0 0.0 0.29 0.27 0.0 1.0 0.5 0.27 0.0 0.26
1.0 0.85 0.53 0.93 0.74 0.81 0.85 0.58 0.81 0.82 0.67 0.84
0.0 0.25 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.21 0.17 0.34 0.19 0.33 0.33 0.49 1.0 0.1 0.31 0.29 0.39
0.0 0.28 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 1.0 0.8 0.66 0.87 0.71
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.94 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.87 0.0
0.0 0.0 0.86 0.0 0.0 0.87 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.21
1.0 0.7 0.36 0.58 0.42 0.76 0.69 0.53 0.53 0.53 0.82 0.76
0.0 0.95 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.89 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.64 0.0 0.0 0.0 0.81 1.0 0.0 0.86 0.87 0.0
0.36 0.84 0.19 0.43 0.88 0.24 0.98 0.11 0.83 0.53 0.11 1.0
0.0 0.0 0.99 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.25 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.79 1.0 0.36 0.98 0.68 0.25 0.24 0.21 0.72 0.59 0.96 0.2
0.0 0.0 0.0 0.84 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.93
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.92 0.0 0.0 0.0 0.0 0.92 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.0 0.0 0.12 0.21 1.0 0.33 0.39 0.67 0.52 0.27 0.48
0.0 0.22 0.34 0.04 0.52 1.0 0.09 0.95 0.12 0.0 0.0 0.17
0.04 0.22 0.07 0.19 0.26 0.38 0.59 1.0 0.66 0.55 0.03 0.13
0.0 0.0 0.86 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.8 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 1.0 0.0 0.87 0.0 0.0
0.0 0.0 0.26 0.52 0.0 0.26 0.29 1.0 0.26 0.0 0.0 0.0
1.0 0.08 0.6 0.09 0.49 0.52 0.0 0.61 0.43 0.09 0.19 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.88 0.66 0.64 0.77 0.72 0.97 0.66 0.83 0.68 0.59 0.88
0.0 0.17 0.29 0.3 0.64 0.15 0.17 1.0 0.15 0.0 0.3 0.0
0.0 0.35 0.32 0.0 0.0 0.35 0.0 1.0 0.0 0.0 0.87 0.92
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 1.0 0.13 0.13 0.69 0.15
0.0 0.0 0.47 0.31 0.0 1.0 0.0 0.73 0.0 0.29 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.49 0.0 0.61 0.34 0.3 1.0 0.0 0.56 0.0 0.3 0.62
0.0 0.95 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.47 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 1.0 0.84 0.4 0.41 0.0
0.0 1.0 0.91 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.92 0.0
0.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.87 0.84 1.0 0.8 0.8 0.0 0.42
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.35 0.0 0.33 0.0 0.92 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.98 0.0 0.0 0.0 0.0
0.23 0.3 0.6 0.27 0.92 0.83 0.14 1.0 0.84 0.53 0.27 0.0
0.0 0.22 0.09 0.26 0.1 0.13 0.28 1.0 0.39 0.13 0.29 0.0
0.0 0.0 0.36 0.0 1.0 0.57 0.0 0.56 0.0 0.0 0.0 0.51
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 1.0 0.0 0.43 0.42 0.0
0.0 0.0 0.86 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.87 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.3 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.43 0.35 0.6 0.41 0.44 0.96 0.85 1.0 0.48 0.74 0.47 0.41
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.55 0.0 0.51 0.55
0.72 0.72 0.71 0.43 0.89 0.62 0.26 0.49 0.62 0.33 0.54 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.81 0.0 1.0 0.67 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.53 0.47 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.8 0.0 0.0 0.0
0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.33 0.0 0.0 0.32
0.39 0.91 0.76 0.81 0.32 0.61 0.48 1.0 0.48 0.79 0.42 0.84
0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.15 0.15 1.0 0.17 0.42 0.15 0.16
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.8 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.96 1.0 0.0 0.98 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.94 0.0 0.92 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)