Heatmap: Cluster_156 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.2 0.14 -0.43 0.39 0.3 0.23 -0.17 -0.25 -0.24 0.07 -0.03 -0.04
-0.8 -0.19 -0.39 0.46 0.54 0.17 -0.05 0.08 -0.06 0.11 -0.13 -0.23
- 0.22 -0.69 1.51 0.47 -0.94 -1.12 -3.26 0.38 0.12 0.19 0.46
-0.9 0.59 -0.55 0.68 0.76 -0.29 -0.36 -0.58 -0.54 0.2 -0.26 0.06
-0.1 0.22 -0.3 0.31 0.32 -0.04 -0.27 -0.45 -0.38 0.06 0.0 0.34
0.1 0.62 -0.21 0.09 0.17 -0.62 -0.55 -0.14 -0.26 0.22 0.04 0.1
-0.04 0.45 0.1 0.51 0.38 -0.35 -0.59 -0.43 -0.41 -0.18 -0.14 0.17
-0.23 0.65 -0.33 0.54 0.45 -0.63 -0.5 -0.3 -0.55 -0.1 0.01 0.23
-1.18 -0.58 -0.79 0.44 0.55 -0.13 -0.04 -0.05 -0.05 0.52 0.33 -0.02
0.15 0.53 -0.51 0.08 0.33 -0.56 -0.23 -0.24 -0.34 0.21 0.03 0.14
- 0.7 -1.36 1.47 -0.31 -2.35 -0.3 -2.34 0.39 0.15 -0.77 1.13
0.59 0.59 -0.11 0.34 0.22 -0.83 -0.36 -0.41 -0.81 0.28 -0.65 0.14
0.65 0.83 -0.03 0.16 0.26 -0.77 -1.11 -0.38 -0.79 -0.17 -0.0 0.1
0.47 0.82 0.1 0.07 0.36 -0.46 -0.7 -0.34 -0.59 0.01 -0.23 -0.31
-0.08 0.2 -0.39 0.55 0.52 -0.03 -0.3 -0.4 -0.52 -0.1 -0.02 0.11
0.73 1.11 -1.53 -1.05 0.32 -0.99 -0.19 -1.17 0.59 0.1 -1.6 0.46
0.33 0.33 -1.23 0.5 -0.0 -0.58 -0.89 -1.14 -0.08 0.42 -0.04 0.78
-0.32 0.1 -0.25 0.33 0.51 -0.19 -0.23 -0.24 -0.11 0.11 -0.11 0.13
-1.16 0.11 -0.15 0.6 0.74 0.08 -0.19 -0.22 -0.12 -0.02 -0.41 -0.1
-0.58 0.13 -0.05 0.53 0.54 0.15 -0.38 -0.72 -0.31 0.0 -0.19 0.26
-0.02 1.03 -2.64 1.36 0.47 - -1.53 -2.42 -1.16 0.15 0.18 0.71
-0.74 0.25 -0.62 0.39 -0.28 -0.05 -0.04 -0.47 0.28 0.44 -0.04 0.29
0.35 0.6 -0.35 0.17 0.21 -0.32 -0.31 -0.45 -0.24 -0.01 -0.2 0.15
0.12 0.4 -0.64 0.14 0.27 -0.71 -0.74 -0.69 -0.06 0.46 0.06 0.51
-0.06 0.41 -0.1 0.23 0.11 -0.44 -0.45 -0.41 -0.09 0.23 -0.07 0.3
-0.83 0.36 0.02 0.62 0.65 0.11 -0.07 -0.62 -0.3 -0.05 -0.72 -0.07
0.67 0.4 -0.37 0.37 0.0 -0.25 -0.35 -0.55 -0.59 -0.18 -0.25 0.4
-2.13 0.02 -1.73 0.99 0.28 -0.71 -0.17 -1.18 -0.29 1.34 -1.87 0.76
-1.48 0.45 -1.28 0.81 0.98 -0.49 -1.4 -1.32 -0.89 0.32 0.04 0.88
-0.17 0.37 -0.47 0.67 0.27 -0.37 -0.41 -0.68 -0.27 0.29 -0.16 0.26
0.04 0.2 -0.08 0.29 0.17 -0.44 -0.5 -0.45 -0.0 0.2 -0.05 0.3
-0.66 -0.1 -0.19 0.29 0.48 -0.06 -0.08 -0.22 -0.09 0.19 0.06 0.07
-0.56 0.08 -0.16 0.45 0.44 -0.05 -0.26 -0.35 -0.12 0.07 -0.03 0.16
-2.25 -0.93 -1.3 1.02 0.96 -0.27 -0.01 0.01 -0.18 0.22 -0.08 0.08
-0.57 0.56 -0.28 0.6 0.32 -0.48 -0.52 -0.48 -0.25 0.26 -0.28 0.34
-0.34 0.03 -0.17 0.19 0.44 -0.09 -0.11 -0.13 -0.2 -0.08 -0.08 0.34
-0.28 0.15 0.03 0.14 0.76 -0.02 -0.3 -0.53 -0.39 0.02 -0.16 0.12
0.42 0.33 0.06 0.05 0.04 -0.27 -0.13 -0.09 -0.25 -0.26 -0.17 0.07
-0.02 0.36 -0.53 0.56 -0.03 -0.49 0.08 -0.32 -0.05 0.31 -0.49 0.13
-1.19 -0.01 -0.44 0.2 0.41 -0.29 -0.39 -0.33 -0.22 0.6 0.14 0.59
-0.46 0.12 -0.22 0.09 0.41 -0.06 -0.12 -0.04 -0.05 0.08 -0.16 0.22
0.26 0.42 -0.11 0.15 0.06 -0.36 -0.33 -0.38 -0.07 0.12 -0.12 0.12
-0.19 0.27 -0.08 0.37 0.63 -0.04 -0.41 -0.42 -0.23 -0.06 -0.17 -0.06
0.54 1.06 -0.22 0.52 0.29 -1.86 -0.67 -1.32 -1.32 0.31 -0.6 0.42
-0.94 0.03 -0.41 0.18 0.73 -0.07 0.28 -0.46 -0.18 -0.31 -0.46 0.67
-0.31 0.22 -0.34 0.39 0.39 -0.3 -0.36 -0.67 -0.32 0.24 0.14 0.39
-0.42 -0.21 -2.11 1.5 0.04 -1.79 -0.34 -0.98 -0.41 0.92 -0.67 0.53
-0.11 0.13 -0.3 0.1 0.26 -0.11 -0.14 -0.16 -0.46 0.1 0.22 0.27
0.19 0.75 -0.46 0.8 -0.06 -1.69 -0.91 -0.38 -0.53 0.43 0.04 0.11
0.29 0.57 -0.02 0.67 0.12 -1.27 -0.78 -0.67 -0.25 0.09 0.16 -0.02
0.33 0.32 -0.55 0.43 0.09 -0.27 -0.3 -0.28 -0.5 0.01 -0.08 0.35
-0.4 0.71 -0.54 0.88 0.76 -1.01 -1.26 -1.15 -0.67 -0.05 0.19 0.36
-0.79 0.23 -0.72 0.9 1.07 -0.59 -0.59 -0.96 -0.65 -0.18 -0.25 0.55
-0.81 0.14 -0.53 0.51 0.7 -0.17 -0.1 -0.55 -0.06 0.15 -0.17 0.18
-0.79 -0.13 -0.7 0.51 0.53 -0.2 -0.06 -0.26 -0.13 0.15 0.24 0.21
0.34 0.63 -0.18 0.1 0.06 -0.55 -0.79 -0.66 0.05 0.31 -0.02 0.06
-0.76 0.26 -0.27 0.49 0.56 -0.04 -0.29 -0.34 -0.29 -0.04 -0.01 0.19
0.16 0.77 -0.48 0.42 0.46 -0.63 -0.98 -0.84 -0.5 0.24 -0.32 0.43
0.21 0.75 -0.24 0.35 0.29 -1.07 -1.2 -0.6 -0.73 0.34 0.05 0.43
-2.97 -0.05 -0.72 0.92 0.66 -0.33 -0.41 -0.97 0.03 0.15 0.52 0.27
-1.47 0.45 0.09 0.81 1.01 0.47 -0.24 -1.17 -0.96 -1.19 -0.99 0.39
-0.44 -0.01 -0.48 0.82 1.16 -0.24 -0.66 -0.53 -0.63 -0.2 -0.32 0.1
0.15 0.57 -1.0 0.31 0.08 -1.16 -0.62 -0.7 -0.02 0.37 0.22 0.55
-1.83 0.03 -0.47 0.87 0.56 -0.54 -0.06 -0.82 0.26 0.51 -0.73 0.3
0.15 -0.14 -0.8 0.3 0.53 0.19 -0.2 -0.38 -0.64 -0.23 0.0 0.55
0.78 0.79 -0.07 -0.29 0.41 -0.58 -0.3 -0.97 -0.4 -0.08 -0.95 0.3
-0.73 0.16 -0.31 1.0 0.28 -0.77 -0.59 -0.46 0.0 0.25 -0.07 0.2
-0.39 0.22 -0.09 0.31 0.64 -0.15 -0.86 -0.51 -0.41 0.08 0.16 0.33
-0.39 -0.24 -1.12 0.74 0.64 -0.61 -0.13 -0.8 -0.43 0.53 0.11 0.38

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.