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Heatmap: Cluster_70 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.16 0.08 0.21 0.18 -0.09 0.05 0.12 0.05 -0.04 -0.53 -0.18 -0.17
0.12 0.01 0.19 0.12 0.06 0.16 0.26 0.02 0.09 -0.29 -0.4 -0.58
-1.55 0.1 -1.86 0.06 0.23 -0.08 0.53 -0.05 0.04 0.59 -0.24 0.44
-0.28 -0.12 -0.16 -0.08 -0.03 0.25 0.57 -0.12 -0.04 0.09 -0.2 -0.09
-0.59 0.0 0.44 0.32 0.23 0.1 0.22 -0.02 -0.07 -0.17 -0.42 -0.42
0.06 0.37 -0.08 0.24 -0.06 0.21 0.56 0.15 -0.37 -0.59 -0.49 -0.55
-0.0 0.04 0.26 0.24 0.06 0.12 -0.01 -0.07 -0.02 -0.26 -0.21 -0.25
0.18 -0.04 -0.05 0.15 0.13 0.13 0.05 -0.09 -0.02 -0.15 -0.21 -0.15
0.09 0.19 0.03 0.2 -0.1 0.19 0.29 -0.12 -0.17 -0.15 -0.29 -0.3
0.09 0.33 0.3 0.39 0.21 0.24 -0.02 -0.31 -0.38 -0.42 -0.31 -0.57
0.51 0.32 0.33 0.42 -0.16 0.2 0.3 -0.14 -0.46 -0.95 -0.5 -0.75
-0.59 0.11 0.35 0.26 -0.12 0.28 0.24 -0.01 -0.07 -0.07 -0.43 -0.27
-0.09 -0.1 0.27 0.23 -0.09 0.33 0.19 0.12 -0.13 -0.4 -0.27 -0.29
0.04 -0.11 0.08 0.15 -0.0 0.15 0.31 0.14 -0.03 -0.28 -0.22 -0.4
0.25 0.01 -0.03 -0.02 -0.31 0.03 0.28 0.1 0.07 -0.35 -0.15 -0.03
-0.13 0.12 0.41 0.41 0.18 0.07 -0.07 -0.2 -0.12 -0.18 -0.32 -0.44
-0.04 -0.03 0.24 0.15 -0.02 0.19 0.34 0.13 -0.01 -0.28 -0.42 -0.47
0.03 0.14 0.29 0.23 -0.08 0.22 0.29 -0.03 -0.01 -0.45 -0.41 -0.56
-0.13 0.24 0.37 0.46 0.15 0.18 0.13 -0.22 -0.04 -0.39 -0.64 -0.57
-0.0 -0.02 -0.12 -0.23 0.06 0.24 0.2 -0.19 0.12 -0.04 -0.02 -0.07
0.12 0.11 0.09 0.21 0.03 0.33 0.33 0.03 -0.03 -0.53 -0.51 -0.54
0.08 0.14 0.28 0.18 -0.03 0.18 0.19 0.09 -0.05 -0.32 -0.35 -0.68
0.16 0.17 0.27 0.1 -0.13 0.17 0.08 -0.11 -0.13 -0.29 -0.28 -0.16
0.15 0.08 0.29 0.17 -0.15 0.11 0.28 0.2 0.04 -0.42 -0.43 -0.68
-0.58 0.07 -0.71 -0.29 0.14 0.32 0.32 -0.49 0.1 0.1 0.08 0.42
-0.08 0.06 0.21 0.57 0.28 0.04 -0.06 -0.25 -0.12 -0.3 -0.38 -0.28
-0.25 0.28 0.33 0.37 0.19 0.2 0.16 -0.17 -0.14 -0.27 -0.58 -0.54
0.41 -0.05 0.01 0.04 -0.18 0.12 0.34 -0.07 -0.05 -0.47 -0.18 -0.13
0.29 0.04 0.07 0.16 -0.3 0.14 0.14 0.04 -0.04 -0.32 -0.24 -0.12
0.27 0.11 0.12 0.09 -0.08 0.17 0.31 0.08 -0.08 -0.41 -0.26 -0.57
-0.37 0.28 0.39 0.65 0.23 0.53 0.9 -0.76 -1.28 -1.57 -0.58 -0.62
- 1.04 -0.66 - 0.84 - 0.66 -0.22 - 1.33 - 1.35
0.23 0.13 0.4 0.46 0.06 0.26 0.33 -0.14 -0.21 -0.74 -0.75 -0.85
0.55 0.12 0.19 -0.05 -0.33 -0.15 0.18 -0.09 -0.1 -0.38 -0.25 0.05
0.24 0.1 0.22 0.2 -0.2 0.09 0.3 0.02 -0.01 -0.3 -0.48 -0.43
-0.16 -0.24 0.04 0.36 0.24 0.16 -0.02 -0.1 0.08 -0.13 -0.23 -0.15
-2.63 -0.88 -0.03 -1.06 0.36 0.38 0.32 -1.47 0.47 0.6 0.06 0.77
-0.04 -0.31 -0.09 0.12 -0.13 -0.04 0.38 0.25 0.17 -0.16 -0.12 -0.19
-2.33 1.1 0.05 0.57 -0.3 0.64 0.91 0.66 -0.91 -3.02 -1.95 -1.31
-0.68 -0.11 0.06 0.4 0.4 0.18 0.1 -0.22 0.04 -0.06 -0.2 -0.26
-0.78 0.67 -0.19 -0.4 1.5 0.15 1.45 - - - -1.4 0.2
-0.5 -0.04 0.27 0.25 0.17 0.42 0.34 -0.01 -0.21 -0.27 -0.33 -0.51
-0.61 0.18 -0.23 -0.2 0.11 0.1 0.46 -0.11 -0.19 -0.11 -0.02 0.31
-1.46 -0.1 0.51 0.33 0.27 0.42 0.28 0.07 -0.39 -0.21 -0.19 -0.48
0.3 0.06 0.1 0.1 -0.13 0.12 0.29 -0.2 -0.12 -0.36 -0.24 -0.09
0.42 0.0 0.06 -0.03 -0.08 0.47 0.43 -0.05 -0.15 -0.59 -0.4 -0.59
- -1.16 -2.28 -2.9 0.81 0.0 0.72 -0.72 0.96 0.97 0.27 0.12
-0.09 0.05 0.08 0.24 -0.14 0.1 0.33 -0.33 0.02 0.06 -0.12 -0.37
-0.38 -0.09 0.0 0.35 -0.02 0.13 0.61 0.01 -0.02 -0.39 -0.2 -0.36
0.19 0.03 0.15 0.33 0.09 0.12 0.1 -0.23 -0.1 -0.42 -0.27 -0.18
-0.34 0.09 -0.32 -0.15 -0.09 0.16 0.12 -0.38 0.3 0.35 -0.24 0.25
0.1 0.07 0.06 0.17 -0.04 0.2 0.41 0.1 -0.36 -0.45 -0.16 -0.36
-0.24 -0.1 -0.29 0.5 0.02 0.19 0.27 -0.34 -0.15 0.01 -0.05 -0.06
-0.57 0.24 0.29 0.53 0.3 0.05 0.15 -0.31 -0.07 -0.36 -0.5 -0.22
0.26 -0.01 0.08 0.19 -0.44 -0.02 0.11 0.22 0.0 -0.28 -0.13 -0.14
0.2 -0.1 -0.05 0.17 -0.13 0.54 0.6 -0.01 -0.02 -0.58 -0.75 -0.53
0.24 0.04 -0.02 0.14 -0.29 -0.15 0.24 -0.07 0.06 -0.23 -0.22 0.14

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.