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Heatmap: Cluster_177 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.71 -0.22 -0.04 -0.03 0.14 -0.19 -0.17 0.0 0.29 0.44 0.19 -0.03
-1.29 -0.26 -0.64 0.17 0.64 0.63 0.22 0.16 -0.04 -0.07 -0.15 -0.36
-2.65 -0.99 -0.12 -0.11 0.39 0.56 0.34 0.12 0.42 0.2 0.1 -0.35
-1.2 -0.42 -0.15 -0.02 0.29 0.14 0.17 0.17 0.13 0.27 0.11 -0.04
-0.77 -0.29 -0.3 -0.01 0.31 0.21 0.06 0.22 0.1 0.16 0.02 -0.01
-1.77 -0.24 -0.25 0.25 0.56 0.1 0.05 0.15 0.09 0.26 -0.01 -0.16
-0.99 -0.26 -0.48 0.02 0.34 0.4 0.3 0.37 -0.13 -0.07 -0.01 -0.06
-1.18 -0.16 -0.08 -0.06 0.46 0.43 0.36 0.1 -0.12 0.1 -0.31 -0.19
-1.95 -0.13 -0.34 0.02 0.47 0.2 0.06 0.25 0.25 0.34 -0.1 -0.2
-3.71 -1.63 -1.3 0.06 0.54 0.77 0.46 0.39 0.34 0.41 -0.15 -0.3
-2.62 -1.88 -0.95 -0.84 0.5 1.15 0.76 0.92 -0.62 -0.35 0.5 -1.3
-0.72 -0.41 -0.4 -0.11 0.24 0.29 0.06 0.18 0.23 0.25 0.04 -0.0
-0.56 -0.23 -0.29 -0.09 0.28 0.22 0.2 0.12 0.07 0.03 -0.05 0.09
-1.22 -0.21 -0.56 -0.04 0.49 0.46 0.2 0.22 0.01 0.3 -0.17 -0.27
-1.6 -0.32 -0.36 0.03 0.48 0.42 -0.02 -0.04 -0.02 0.31 0.05 0.17
-0.62 -0.06 -0.42 0.14 0.22 0.34 0.29 0.15 0.05 -0.16 -0.12 -0.12
-2.39 -0.82 -0.97 0.17 0.49 0.3 0.29 0.25 0.18 0.14 0.26 0.17
-0.33 -0.12 -0.2 -0.14 0.15 0.08 -0.02 0.12 0.17 0.16 0.08 -0.06
-2.46 -0.59 -0.24 -0.03 0.42 0.49 0.25 0.27 -0.03 0.06 0.31 -0.09
-0.51 -0.24 -0.32 -0.0 0.27 0.23 0.17 0.2 0.13 0.13 -0.09 -0.21
-3.43 -1.12 -0.5 -0.08 0.41 0.03 0.05 0.52 0.31 0.5 0.41 -0.01
-0.95 -0.28 -0.21 0.32 0.54 0.42 0.06 0.03 0.03 0.07 -0.27 -0.34
-1.79 -0.42 -0.3 0.06 0.06 0.17 0.08 0.29 0.11 0.37 0.26 0.13
-1.07 -0.3 -0.03 0.14 0.48 0.49 0.17 0.14 0.02 0.08 -0.23 -0.55
-1.11 -0.29 -0.1 -0.14 0.34 0.19 -0.2 0.2 0.11 0.28 0.19 0.03
-1.28 -0.13 -0.08 0.07 0.3 0.13 -0.0 0.26 0.13 0.28 0.03 -0.29
-1.34 -0.54 -0.37 -0.05 0.31 0.31 0.16 0.26 0.09 0.11 0.08 0.24
-0.64 0.04 -0.19 -0.03 0.22 -0.05 -0.2 0.05 0.11 0.33 0.08 0.05
-0.51 -0.28 -0.33 -0.17 0.2 0.22 0.03 0.15 0.13 0.21 0.08 0.05
-0.69 -0.17 -0.11 -0.02 0.37 0.23 -0.05 0.06 0.04 0.12 -0.01 -0.02
-1.71 -0.24 -0.04 0.15 0.32 0.29 0.11 0.42 0.07 0.28 -0.32 -0.29
-0.95 -0.07 -0.2 -0.1 0.24 -0.03 -0.22 -0.05 0.29 0.42 0.25 -0.01
-2.02 -0.26 -0.28 0.0 0.63 0.01 -0.2 0.32 -0.13 0.41 0.38 -0.19
-0.66 -0.18 -0.04 -0.01 0.37 0.28 0.11 0.3 0.13 0.12 -0.24 -0.6
-1.78 -0.51 -0.43 0.08 0.5 0.24 0.06 0.35 -0.24 0.26 0.33 -0.01
-1.34 -0.38 -0.35 0.11 0.37 0.39 0.12 0.21 -0.02 0.16 0.07 -0.03
-1.36 -0.41 -0.44 0.01 0.42 0.29 -0.14 0.03 0.12 0.38 0.3 0.01
-0.78 -0.46 -0.39 -0.07 0.18 0.31 0.23 0.29 0.05 0.06 0.05 0.13
-1.82 -0.48 -0.56 0.04 0.5 0.32 0.28 0.3 -0.27 0.27 0.22 -0.05
-3.25 -0.63 -0.42 -0.09 0.46 0.07 0.03 0.46 0.3 0.43 0.35 -0.17
-1.23 -0.27 -0.4 -0.01 0.36 0.2 0.07 0.16 0.2 0.3 0.03 -0.0
-0.29 -0.21 -0.14 0.01 0.29 0.17 -0.03 0.14 0.0 0.07 -0.05 -0.07
-1.48 -0.69 -0.75 -0.12 0.33 0.43 0.26 0.34 0.21 0.33 0.12 -0.08
-1.9 -0.55 -0.55 -0.33 0.44 0.02 0.22 0.4 -0.08 0.46 0.42 0.09
-1.61 -0.46 -0.6 -0.13 0.3 0.24 0.34 0.27 0.1 0.28 0.23 0.03
-0.66 -0.18 -0.53 -0.14 0.33 0.12 0.13 0.18 0.04 0.22 0.2 -0.05
-3.73 -1.03 -1.21 -1.28 0.48 0.74 1.0 0.63 0.25 0.13 -0.49 -0.03
-1.53 -0.31 -0.18 0.14 0.54 0.25 0.09 -0.03 0.13 0.35 -0.26 -0.05
-1.55 -0.45 -0.65 0.19 0.49 0.02 -0.07 0.32 0.0 0.36 0.38 -0.08
-2.01 -0.25 -0.45 0.08 0.5 0.5 0.48 0.24 -0.09 0.11 -0.16 -0.3
-0.6 -0.0 -0.31 0.07 0.38 -0.24 -0.14 0.15 0.12 0.35 -0.01 -0.05
-2.47 -1.1 -0.45 -0.02 0.36 -0.01 0.17 0.35 0.25 0.53 0.38 0.04
-1.07 -0.15 -0.29 -0.34 0.45 0.4 0.39 0.24 0.22 -0.03 -0.14 -0.33
-0.56 0.14 -0.1 0.13 0.22 -0.13 -0.13 0.09 -0.09 0.19 0.05 0.02
-1.61 -0.08 -0.29 0.53 0.65 0.56 0.18 0.35 -0.34 -0.29 -0.62 -0.38
-1.27 -0.16 0.01 0.07 0.5 0.5 0.3 0.21 -0.1 0.04 -0.38 -0.54
-1.3 -0.15 -0.21 -0.02 0.42 0.06 -0.24 0.06 0.33 0.44 0.1 -0.17
-1.71 -0.04 -0.37 0.22 0.6 0.12 0.1 0.36 0.04 0.23 -0.19 -0.43
-3.04 -1.29 -1.72 -0.56 0.47 0.72 0.96 0.4 0.44 0.36 -0.96 0.05
-1.51 -0.49 -0.38 0.14 0.42 0.46 0.44 0.42 0.04 -0.08 -0.22 -0.27
-0.63 -0.12 -0.16 0.03 0.43 0.06 0.12 0.14 0.12 0.13 -0.13 -0.24
-0.95 -0.19 -0.23 0.08 0.14 0.19 0.26 0.32 0.15 0.23 -0.11 -0.3
-3.73 -1.06 -0.45 -0.34 0.55 0.49 0.1 0.11 -0.03 0.41 0.52 0.22
-3.65 -0.88 0.01 0.03 0.4 0.33 0.23 0.57 0.0 0.23 0.07 -0.15

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.