Heatmap: Cluster_31 (HCCA clusters)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.11 0.12 0.05 0.23 0.57 0.0 0.25 0.97 0.23 1.0 0.51 0.38
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.71 0.68 0.0 0.0 1.0 0.0 0.68 0.74 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.84 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.84 1.0 0.68 0.0 0.0 0.0
0.0 0.76 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.26 0.25 0.27 0.0 0.99 0.73 1.0 0.51 0.57
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.5 0.0 0.0 0.0 0.71 0.48 1.0 0.0 0.0
0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 1.0 0.25 0.24 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 1.0 0.2 0.0 0.18 0.19
0.0 0.0 0.05 0.22 0.05 0.0 0.04 1.0 0.0 0.0 0.0 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.8 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.68 0.0 0.0
1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.92 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.85 0.0 0.22 0.6 0.23 0.92 0.41 0.47 0.71 0.68 0.67
0.0 0.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.75 1.0 0.29 0.07 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.85 0.61 0.18 0.16 0.74 0.57 0.44 1.0 0.0 0.49 0.3 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.39
0.0 0.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.68 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.57 0.62 0.81 0.31 0.57 1.0 0.77 0.87 0.69 0.62 0.7 0.56
0.21 0.69 0.0 0.13 0.41 1.0 0.0 0.87 0.0 0.58 0.0 0.67
0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.23 0.53
0.65 0.32 0.21 0.35 0.08 0.08 0.17 1.0 0.46 0.77 0.08 0.0
0.65 1.0 0.13 0.4 0.78 0.53 0.9 0.49 0.55 0.54 0.66 0.25
0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.26 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.23 0.6 0.0 0.36 0.0 0.35 0.0 0.58 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.12 0.11 0.54 0.48 1.0 0.0 0.11 0.5 0.25
0.27 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.17 1.0 0.19 0.0 0.0 0.0
0.0 0.2 0.0 0.0 1.0 0.25 0.0 0.69 0.47 0.46 0.0 0.54
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.84 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.32 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.18 0.19 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.49 0.56 0.66 0.0 0.0 0.0 0.0
0.3 0.38 0.39 0.25 0.37 0.56 0.66 1.0 0.87 0.55 0.46 0.27
0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.26
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.18 0.47 0.28 0.0 0.25 1.0 0.53 0.23 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.79 0.85 0.0 0.0 0.0 0.9
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.84 0.0 0.0
0.81 0.71 0.67 0.67 0.77 0.78 0.9 1.0 0.98 0.87 0.85 0.82
0.08 0.24 0.31 0.21 0.58 0.29 0.32 1.0 0.17 0.1 0.32 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.74 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.68 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.77 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.19 0.04 0.27 0.3 0.0 0.06 1.0 0.0 0.05 0.0 0.0
0.0 1.0 0.0 0.48 0.0 0.37 0.0 0.62 0.0 0.45 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.71 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 1.0 0.22 0.18 0.19 0.0
0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 1.0 0.68 0.0 0.36 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.82 0.26 1.0 0.0 0.71 0.26 0.0
0.12 0.2 0.0 0.16 0.0 0.09 0.6 1.0 0.22 0.43 0.12 0.34
0.0 0.59 0.55 0.0 0.0 0.74 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.1 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.84 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.71 0.0 1.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.68 0.0 0.0
0.55 0.56 0.45 0.5 0.42 0.83 0.85 1.0 0.25 0.58 0.38 0.32
0.0 0.08 0.05 0.23 0.2 0.46 0.93 0.57 0.45 1.0 0.43 0.39
0.0 0.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.55 0.0 0.0 0.0 0.34 0.3 0.74 1.0 0.72 0.73 0.0 0.0
0.0 0.51 0.09 0.0 0.0 0.25 0.55 1.0 0.11 0.77 0.0 0.13
0.0 0.41 0.23 0.6 0.22 0.12 0.51 1.0 0.61 0.59 0.44 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.81 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.0 0.51 0.49 0.0 0.0
0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.35 0.0
0.0 1.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.46 0.63 0.24 0.44 0.0 0.25
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.23 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 0.0 0.0 0.27 0.61

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)