Heatmap: Cluster_57 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.05 0.02 0.02 0.04 0.13 0.0
0.07 0.02 0.0 0.02 0.02 0.07 0.12 0.09 0.13 0.1 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.0 0.08 0.0 0.0
0.0 0.03 0.24 0.32 0.16 0.1 0.15 0.3 0.2 0.55 0.27 0.2
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.14 0.0 0.07 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.25 0.18 0.0
0.17 0.28 0.14 0.07 0.39 0.27 0.52 0.36 0.15 0.1 0.38 0.3
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.11 0.05 0.0 0.0 0.0 0.04 0.81 0.0 0.05 0.64 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.9 2.07 1.52 2.31 2.6 2.51 1.86 2.02 2.42 2.87 1.69 2.11
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.12 0.21 0.14 0.16 0.02 0.02
0.0 0.05 0.0 0.0 0.05 0.0 0.08 0.0 0.0 0.08 0.0 0.04
0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.16 0.15 0.04 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.04 0.0 0.08 0.04 0.0
0.41 0.26 0.29 0.44 0.63 0.78 1.05 0.65 0.36 0.9 0.75 0.88
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.04 0.04 0.04 0.04 0.0
0.2 0.05 0.0 0.0 0.04 0.14 0.1 0.18 0.18 0.16 0.04 0.09
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.02 0.08 0.0 0.02
0.6 2.28 2.23 3.16 2.45 5.38 6.33 6.76 6.16 4.2 4.7 4.59
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.02 0.13 0.12 0.04 0.04 0.19 0.12
1.9 3.54 4.26 3.6 4.85 6.15 4.94 6.42 4.85 6.05 4.36 4.18
0.04 0.0 0.0 0.02 0.0 0.05 0.08 0.33 0.05 0.04 0.15 0.06
0.0 0.09 0.17 0.11 0.09 0.05 0.12 0.11 0.27 0.19 0.17 0.09
0.4 0.79 0.37 0.53 0.68 1.06 0.73 0.83 0.66 0.81 1.23 0.9
0.47 0.54 0.29 0.62 0.64 1.2 0.62 0.84 0.88 1.08 0.51 0.55
0.34 0.26 0.07 0.2 0.02 0.18 0.39 0.51 0.44 0.25 0.24 0.36
0.11 0.0 0.0 0.05 0.0 0.02 0.2 0.08 0.09 0.12 0.04 0.13
0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.1 0.13 0.12
0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.05 0.05 0.02 0.0 0.02
1.87 1.02 0.91 1.27 2.47 0.91 3.14 4.83 1.69 2.08 0.83 0.91
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.09 0.07 0.0 0.02 0.0 0.04
0.18 0.77 0.0 0.61 0.35 0.57 0.44 0.52 1.29 0.33 0.92 0.6
0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.44 0.36 0.16 0.0 0.0 0.05
0.46 1.72 1.32 1.24 1.42 5.0 1.85 4.38 1.6 1.86 0.78 0.41
0.62 0.67 0.95 1.03 0.79 0.59 0.76 0.76 1.03 1.11 0.78 0.68
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.09 0.0 0.06 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.02 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.06 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.05 0.02 0.02 0.17 0.02
0.0 0.0 0.04 0.0 0.16 0.11 0.16 0.51 0.16 0.16 0.04 0.0
0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.13 0.05 0.0 0.1 0.0 0.11
0.0 0.02 0.0 0.0 0.05 0.14 0.32 0.3 0.38 0.31 0.11 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.02 0.02 0.0
0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.04 0.0 0.0 0.0 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.07 0.0 0.06 0.0 0.0
0.03 0.12 0.02 0.06 0.07 0.17 0.29 0.35 0.2 0.14 0.21 0.27
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.05 0.0 0.04 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.04 0.05 0.04 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
2.42 2.17 1.61 1.34 2.17 2.79 4.28 3.79 4.8 4.13 3.18 3.18
1.1 1.31 0.96 0.81 1.32 1.39 2.69 2.81 2.72 1.91 1.53 1.88
0.3 0.42 0.37 0.42 0.66 1.22 2.81 3.15 1.25 1.44 1.5 1.21
0.36 0.2 0.5 0.86 0.37 1.67 2.02 2.51 2.31 1.13 0.0 0.53
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.07 0.0 0.06 0.06 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.02 0.0 0.07 0.09 0.0 0.0 0.04 0.12 0.13 0.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
2.92 3.13 2.23 2.77 2.94 4.02 6.52 5.02 5.07 4.66 4.29 4.97
0.0 0.0 0.0 0.05 0.04 0.0 0.45 0.18 0.0 0.04 0.04 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.02 0.0 0.04 0.02 0.0
0.42 0.69 0.94 0.75 0.8 0.87 0.86 0.92 1.29 1.65 1.05 0.62
0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.15 0.38 0.07 0.12 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.09 0.04 0.0 0.02 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)