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Heatmap: Cluster_4 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
1.5 h after dark
5.5 h after dark
9.5 h after dark
-1.47 -1.32 0.44 0.84 0.46 -0.46
-0.33 -0.17 0.01 0.2 0.31 -0.14
-0.73 -0.17 0.1 0.27 0.4 -0.13
-0.72 -0.51 0.24 0.35 0.55 -0.37
-1.03 -0.51 0.04 0.46 0.62 -0.21
-1.36 -1.11 0.63 0.8 0.46 -1.06
-0.99 -1.07 -0.19 0.51 0.64 0.22
-1.17 -0.64 0.26 0.47 0.48 -0.1
-2.9 -1.81 0.79 0.95 0.51 -1.02
-0.42 -0.19 -0.07 0.17 0.36 0.02
-1.04 -0.78 0.18 0.45 0.81 -0.59
-1.12 -0.66 0.32 0.45 0.5 -0.19
-1.8 -1.77 0.19 0.81 0.67 -0.1
-1.22 -0.23 0.32 0.54 0.25 -0.28
-1.88 -1.66 0.68 0.84 0.53 -0.8
-0.95 -0.33 0.38 0.33 0.41 -0.31
-0.67 -0.26 0.27 0.32 0.27 -0.2
-0.52 -0.34 0.06 0.2 0.45 -0.06
-0.52 -0.07 0.37 0.21 0.16 -0.34
-0.97 -0.71 0.17 0.58 0.35 -0.02
-0.57 -0.55 0.24 0.3 0.45 -0.2
-1.26 -0.49 0.48 0.55 0.38 -0.48
-1.2 -0.7 0.09 0.43 0.53 0.13
-1.3 -1.04 0.23 0.91 0.37 -0.39
-1.05 -0.82 0.25 0.49 0.58 -0.21
-0.96 -0.23 0.36 0.23 0.42 -0.25
-1.08 -0.43 0.28 0.36 0.4 -0.05
-0.39 -0.24 0.25 0.26 0.14 -0.15
-0.57 -0.62 -0.07 0.37 0.44 0.11
-0.76 -0.24 -0.02 0.24 0.44 0.06
-0.91 -0.39 0.09 0.38 0.43 -0.01
-1.16 -0.61 0.26 0.43 0.65 -0.36
-2.19 -1.46 -0.03 1.03 0.83 -0.71
-0.83 -0.6 -0.07 0.42 0.52 0.07
-1.19 -0.87 0.05 0.5 0.48 0.22
-0.66 0.04 0.22 0.24 0.26 -0.33
-1.89 -1.09 0.55 0.93 0.49 -1.03
-0.68 -0.07 0.35 0.29 0.16 -0.31
-0.53 -0.16 0.1 0.18 0.3 -0.04
-0.99 -0.74 -0.04 0.65 0.44 -0.01
-0.53 -0.31 0.25 0.41 0.23 -0.31
-0.39 -0.22 -0.01 0.16 0.29 0.07
-1.5 -0.98 0.51 0.58 0.53 -0.36
-0.7 -0.12 0.34 0.29 0.4 -0.63
-1.37 -0.56 0.06 0.87 0.55 -0.75
-2.4 -4.47 -0.21 1.04 0.84 0.09
-0.48 -0.2 0.0 0.32 0.28 -0.07
-0.49 -0.27 -0.06 0.24 0.39 0.01
-1.54 -0.98 0.31 0.78 0.59 -0.54
-0.66 -0.31 0.37 0.35 0.24 -0.32
-0.5 -0.2 0.22 0.31 0.22 -0.23
-1.19 -0.84 0.55 0.79 0.38 -0.98
-1.22 -0.9 0.06 0.71 0.58 -0.22
-1.25 -0.37 0.13 0.36 0.61 -0.15
-1.0 -0.42 0.06 0.56 0.41 -0.14
-0.82 -0.38 0.28 0.29 0.33 -0.04
-0.55 -0.48 0.21 0.55 0.32 -0.46
-1.11 -0.27 0.19 0.31 0.55 -0.21
-1.19 -0.88 0.51 0.49 0.39 -0.18
-0.72 -0.73 0.22 0.59 0.3 -0.17
-1.16 -0.24 0.44 0.39 0.4 -0.47
-0.87 -0.93 0.34 0.54 0.33 -0.08
-0.64 -0.49 0.39 0.7 0.2 -0.83
-0.48 -0.19 0.05 0.22 0.32 -0.07
-1.23 -0.3 0.21 0.49 0.47 -0.3
-0.63 -0.54 0.2 0.46 0.26 -0.08
-1.03 -0.78 0.42 0.61 0.3 -0.29
-0.72 -0.43 0.19 0.37 0.44 -0.21
-1.03 -0.79 0.06 0.54 0.64 -0.2
-1.56 -1.21 0.54 0.63 0.51 -0.33
-0.35 -0.44 -0.08 0.19 0.38 0.12
-0.68 -0.41 0.02 0.38 0.41 -0.03
-1.08 -0.1 0.43 0.4 0.24 -0.42
-1.59 -0.62 0.2 0.46 0.73 -0.27
-1.92 -1.47 0.64 0.89 0.47 -0.79
-0.69 -0.35 0.02 0.38 0.36 -0.01
-0.28 -0.2 0.0 0.16 0.23 0.02
-1.32 -0.68 0.42 0.58 0.53 -0.52
-0.92 -0.59 0.36 0.48 0.25 -0.09
-0.9 -1.13 0.11 0.56 0.59 -0.07
-1.32 -1.23 -0.05 0.64 0.81 -0.17
-0.78 -0.34 0.09 0.32 0.49 -0.15
-1.44 -0.43 0.35 0.58 0.43 -0.37
-1.29 -0.7 0.45 0.59 0.44 -0.43
-2.18 -3.18 -0.19 0.78 0.93 0.22
-0.85 -0.69 -0.0 0.48 0.58 -0.1
-1.21 -0.63 0.24 0.75 0.53 -0.71
-1.65 -1.18 0.12 0.62 0.64 0.07
-1.27 -0.04 0.61 0.31 0.3 -0.69
-0.67 -0.64 -0.04 0.29 0.5 0.17
-0.62 -0.52 0.07 0.23 0.59 -0.12
-0.64 -0.6 0.31 0.43 0.33 -0.23
-1.27 -0.1 0.54 0.25 0.41 -0.55
-1.45 -1.08 0.18 0.88 0.67 -0.74
-0.98 -0.03 0.51 0.42 0.14 -0.61
-0.63 -0.41 0.08 0.35 0.29 0.06
-0.74 -0.26 0.28 0.3 0.3 -0.16
-0.4 -0.05 0.32 0.2 0.05 -0.25
-0.65 -0.42 0.35 0.39 0.19 -0.17
-0.57 -0.09 0.17 0.24 0.2 -0.11
-1.56 -1.11 0.49 0.69 0.57 -0.52
-0.95 -0.74 -0.04 0.54 0.62 -0.12
-0.51 -0.65 0.15 0.26 0.75 -0.58
-1.68 -0.97 0.05 0.75 0.58 -0.06
-0.43 -0.63 0.14 0.36 0.34 -0.06
-1.15 -0.95 0.31 0.77 0.47 -0.5
-0.43 -0.2 -0.03 0.22 0.34 -0.03
-0.76 -0.31 0.42 0.31 0.26 -0.27
-0.81 -0.47 0.07 0.35 0.52 -0.07
-0.7 -0.67 0.02 0.33 0.53 0.06
-1.09 -0.39 0.31 0.31 0.53 -0.25
-0.89 -0.32 0.39 0.4 0.32 -0.36
-1.08 -0.64 0.38 0.53 0.41 -0.32
-1.27 -0.71 0.32 0.67 0.46 -0.39
-0.88 -0.1 0.25 0.27 0.35 -0.23
-0.28 -0.22 0.11 0.27 0.19 -0.17
-1.0 -1.04 -0.13 0.76 0.71 -0.4
-1.08 -0.54 0.16 0.59 0.41 -0.15
-0.48 -0.4 -0.02 0.32 0.42 -0.06
-0.58 -0.05 0.19 0.23 0.17 -0.11
-0.97 -0.31 0.3 0.46 0.29 -0.23
-0.36 -0.11 0.07 0.11 0.3 -0.11
-0.64 -0.47 0.02 0.27 0.33 0.21
-0.78 -0.63 0.27 0.49 0.35 -0.16
-0.38 -0.43 -0.05 0.3 0.43 -0.07
-1.78 -1.57 0.5 0.9 0.5 -0.57
-0.6 -0.12 0.1 0.21 0.26 -0.01
-0.74 -0.22 0.1 0.29 0.33 -0.01
-0.73 -0.4 0.42 0.39 0.24 -0.3
-0.8 -0.65 0.24 0.41 0.31 0.06
-0.91 -0.07 0.35 0.37 0.23 -0.36
-0.63 -0.51 0.18 0.46 0.36 -0.21
-0.68 -0.32 -0.02 0.3 0.42 0.03
-0.79 -0.21 0.35 0.33 0.23 -0.23
-0.68 -0.06 0.33 0.23 0.16 -0.19
-1.08 -0.58 0.14 0.48 0.57 -0.18
-1.58 -0.93 0.33 0.54 0.66 -0.22
-0.86 -0.57 0.09 0.6 0.45 -0.26
-1.03 -0.72 0.11 0.56 0.65 -0.35
-0.91 -0.46 0.31 0.48 0.41 -0.37
-0.5 -0.24 0.08 0.32 0.45 -0.37
-0.86 -1.13 -0.12 0.68 0.61 -0.09
-1.08 -1.88 0.27 0.85 0.42 -0.13
-2.39 -1.86 0.35 0.99 0.72 -0.66
-1.12 -0.68 0.07 0.4 0.66 -0.05
-0.79 -0.59 -0.05 0.39 0.46 0.15
-0.52 -0.44 0.19 0.38 0.25 -0.1
-0.45 -0.35 0.14 0.29 0.3 -0.12
-0.95 -0.15 0.14 0.35 0.44 -0.24
-1.33 -0.51 0.56 0.34 0.33 -0.15
-0.65 -0.21 0.28 0.35 0.26 -0.31
-0.53 -0.64 -0.09 0.39 0.56 -0.08
-0.99 -0.7 -0.0 0.58 0.61 -0.21
-0.94 -0.25 0.58 0.48 0.21 -0.74
-0.62 -0.45 0.1 0.54 0.43 -0.44
-1.03 -0.51 0.09 0.57 0.46 -0.19
-1.59 -0.94 0.61 0.79 0.58 -1.33
-0.54 -0.36 0.32 0.36 0.23 -0.28
-1.08 -0.45 0.2 0.46 0.43 -0.12
-0.87 -0.71 0.34 0.54 0.3 -0.17
-1.05 -0.7 -0.01 0.74 0.58 -0.43
-2.25 -2.2 -0.04 1.15 0.78 -0.6
-1.03 -0.45 0.21 0.25 0.55 -0.05
-0.57 -0.34 0.17 0.27 0.42 -0.2
-1.27 -0.3 0.31 0.5 0.33 -0.22
-0.37 -0.29 -0.07 0.2 0.46 -0.09
-0.47 -0.41 0.07 0.45 0.39 -0.32
-0.62 -0.3 -0.06 0.28 0.4 0.06
-0.93 -0.42 0.47 0.36 0.29 -0.25
-0.78 -0.28 0.37 0.19 0.37 -0.21
-0.54 -0.36 -0.04 0.29 0.36 0.08
-0.5 -0.26 0.05 0.23 0.36 -0.05
-0.44 -0.11 0.1 0.24 0.2 -0.1
-0.79 -0.2 0.08 0.23 0.38 0.03
-1.28 -0.65 -0.14 0.48 0.98 -0.58
-1.13 -0.63 0.59 0.53 0.28 -0.44
-0.67 -1.02 0.04 0.7 0.41 -0.15
-0.81 -0.08 0.15 0.35 0.33 -0.26
-0.57 -0.57 0.02 0.37 0.45 -0.04
-1.41 -0.47 0.13 0.53 0.53 -0.12
-0.86 -0.7 0.14 0.46 0.6 -0.27

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.