Heatmap: Cluster_60 (HCCA clusters)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
1.5 h after dark
5.5 h after dark
9.5 h after dark
-0.38 -0.22 -0.29 0.09 0.44 0.18
-0.39 -0.19 -0.19 0.01 0.46 0.14
-0.41 -0.26 -0.13 0.08 0.46 0.09
-0.38 -0.44 -0.46 -0.04 0.68 0.26
-0.26 -0.07 -0.43 -0.13 0.45 0.26
0.04 -0.18 -0.32 -0.18 0.23 0.3
-0.97 -0.91 -0.5 0.34 1.19 -0.51
-0.21 -0.23 -0.32 0.11 0.37 0.15
-0.44 -0.1 -0.11 0.17 0.48 -0.18
-0.56 -0.45 -0.11 0.36 0.44 0.02
-0.48 -0.54 -0.3 0.06 0.69 0.16
-0.49 -0.46 -0.38 0.29 0.51 0.18
-0.69 -1.16 -1.23 -0.2 0.97 0.74
-0.9 -0.99 -0.2 0.35 0.86 0.0
-2.81 -4.96 -3.57 0.88 1.17 0.72
-0.24 -0.38 -0.38 -0.07 0.49 0.34
-0.37 -0.23 -0.2 -0.0 0.45 0.19
-0.27 -0.33 -0.47 0.19 0.42 0.23
-0.19 -0.25 -0.24 0.03 0.39 0.14
-0.2 -0.41 -0.38 -0.07 0.51 0.29
-0.18 -0.24 -0.35 -0.27 0.54 0.27
-0.51 -0.75 -0.38 0.17 0.63 0.34
-0.41 -0.52 -0.38 0.25 0.63 0.07
-0.95 -1.5 -1.25 0.01 1.08 0.67
-0.95 -0.78 -0.71 0.75 0.71 -0.04
-0.35 -1.09 -0.76 -0.0 0.68 0.64
-0.18 -0.74 -1.19 0.26 0.86 0.09
-0.73 -1.28 -1.27 0.62 0.94 0.15
-0.18 -0.48 -0.28 0.02 0.41 0.31
-0.55 -0.5 -0.55 0.32 0.93 -0.38
-0.67 -0.72 -0.34 0.27 0.9 -0.13
-0.32 -1.09 -0.41 0.42 0.67 0.08
-0.27 -0.17 -0.25 0.12 0.39 0.08
-0.2 -0.33 -0.25 0.06 0.39 0.19
-0.07 -0.29 -0.13 -0.06 0.4 0.05
-0.27 -0.26 -0.49 -0.19 0.6 0.3
-1.15 -1.6 -0.33 0.84 0.58 0.19
-0.39 -0.22 -0.05 0.04 0.33 0.18
-0.65 -0.36 -0.09 0.41 0.36 0.04
-0.26 -0.35 0.04 0.28 0.19 0.01
-0.21 -0.15 0.05 0.14 0.19 -0.06
-0.34 -1.14 -0.67 0.29 0.62 0.45
-0.45 -0.52 -0.21 -0.2 0.51 0.5
-0.16 -0.26 -0.19 0.02 0.42 0.06
-0.67 -1.03 -0.67 0.42 0.89 0.09
-0.62 -0.32 -0.34 0.09 0.42 0.44
-0.24 -0.29 -0.05 0.02 0.18 0.29
-0.71 -0.4 -0.16 0.26 0.58 0.06
-0.45 -0.3 -0.16 -0.03 0.45 0.28
-0.11 0.03 -0.21 -0.08 0.16 0.16
-0.89 -0.94 -0.74 0.33 1.13 -0.17
-0.99 -1.19 -0.5 0.54 0.7 0.35
-0.55 -0.72 -0.55 0.28 0.86 -0.01
-0.02 -0.29 -0.31 0.0 0.29 0.22
-0.32 -0.23 -0.46 -0.15 0.42 0.46
-0.45 -1.43 -1.63 0.5 1.01 0.2
-0.37 -0.33 -0.3 0.25 0.49 0.04
-0.15 -0.1 -0.21 -0.05 0.29 0.16
-0.25 -0.41 -0.27 0.08 0.47 0.19
-1.14 -0.54 -0.11 0.03 0.38 0.69
-0.29 -0.67 -0.3 0.19 0.56 0.16
-0.22 -0.32 -0.39 -0.03 0.4 0.35
-0.38 -0.38 -0.44 0.09 0.62 0.18
-0.35 -0.02 -0.3 -0.08 0.46 0.14
-1.44 -1.07 -1.56 -0.21 1.63 -0.22
-0.92 -0.46 -0.23 0.26 0.73 0.05
-0.23 -0.39 -0.52 -0.32 0.58 0.47
-1.22 -1.57 -0.59 0.57 0.96 0.2
-0.28 -0.43 -0.34 -0.08 0.37 0.5
-0.11 -1.1 -1.64 0.06 0.81 0.57
-0.99 -1.11 -1.09 0.6 1.01 0.05
-0.42 -0.55 -0.07 0.29 0.43 0.07
-0.57 -0.36 -0.3 0.03 0.54 0.34
-0.8 -1.69 -0.38 0.6 0.84 0.06
-0.26 -0.13 -0.08 -0.14 0.39 0.13
-0.33 -0.39 0.0 0.02 0.36 0.19
-0.2 -0.5 -0.27 -0.1 0.48 0.34
-0.21 -0.21 -0.25 -0.13 0.45 0.2
-0.29 -0.16 -0.07 0.09 0.33 0.03
-0.34 -0.32 -0.49 -0.13 0.6 0.35
-0.46 -0.33 -0.3 0.03 0.67 0.09
-0.41 -0.47 -0.27 0.15 0.61 0.09
0.01 -0.5 -0.51 -0.01 0.51 0.22
-0.24 -0.31 -0.41 0.01 0.47 0.27
-0.47 -0.37 -0.21 0.11 0.56 0.11
-0.07 -0.45 -0.66 0.09 0.49 0.27
-0.03 -0.21 -0.43 -0.05 0.29 0.29
-0.16 -0.24 -0.22 -0.04 0.46 0.08
-0.58 -0.42 -0.47 0.16 0.67 0.2
-0.51 -0.57 -0.09 0.37 0.77 -0.54
-0.13 -0.88 -0.82 0.29 0.74 0.12
-0.14 -0.22 -0.29 -0.1 0.34 0.28
-0.37 -0.19 -0.13 0.18 0.47 -0.13
-0.34 -0.2 -0.09 0.02 0.36 0.13
-0.18 -0.49 -0.43 -0.14 0.78 0.05
-0.93 -1.04 -0.64 0.28 0.88 0.36
-0.35 -0.65 -0.45 0.07 0.67 0.26
-0.33 -0.32 -0.25 0.3 0.4 0.02
-0.39 -0.31 -0.75 0.04 0.35 0.62
-0.16 -0.22 -0.28 0.04 0.37 0.13
-0.19 -0.06 -0.16 -0.08 0.31 0.12
-0.37 -0.2 0.04 0.16 0.24 0.04
-0.93 -0.62 -0.54 0.47 0.75 0.1
-0.25 -1.03 -1.16 0.23 0.72 0.49
-1.06 -0.75 -0.16 0.59 0.49 0.16
-0.72 -0.38 -0.13 0.35 0.66 -0.22
-0.59 -0.47 -0.44 0.26 0.51 0.33
-0.36 -0.4 -0.27 0.3 0.37 0.16
-0.54 -1.15 -0.49 0.64 0.58 0.13
-0.1 -0.12 -0.28 -0.03 0.19 0.26
-2.09 -2.26 -2.24 -0.02 1.41 0.77
-1.84 -1.42 0.4 0.61 0.67 -0.14
-0.61 -1.01 -0.8 0.17 0.84 0.44
-0.15 -0.17 -0.44 -0.05 0.46 0.18
-0.6 -0.53 -0.1 0.41 0.61 -0.22
-0.69 -0.83 -0.2 0.32 0.63 0.22
-0.23 -0.37 -0.24 0.16 0.41 0.11
-0.55 -0.6 -0.6 -0.23 0.95 0.27
-0.53 -1.69 -1.25 0.04 1.19 0.35
-0.48 -0.57 -0.56 -0.12 0.52 0.65
-0.36 -0.3 -0.37 -0.13 0.44 0.45
-0.27 -0.59 -0.22 -0.17 0.56 0.36
-0.27 -0.16 -0.06 0.03 0.31 0.08
-0.66 -0.39 -0.04 0.48 0.26 0.05
-0.2 -0.39 -0.49 -0.45 0.72 0.35
-0.31 -0.16 -0.22 0.09 0.32 0.17
-1.31 -1.42 -0.25 0.7 0.91 -0.18
-0.45 -0.26 -0.16 0.06 0.57 0.03
-0.88 -0.64 -0.27 0.59 0.62 -0.08
-0.4 -0.12 -0.12 -0.14 0.41 0.22
-0.26 -1.49 -1.84 -0.08 0.99 0.67
-0.64 -0.88 -0.24 0.56 0.4 0.23
-0.58 -0.25 -0.12 -0.06 0.29 0.47
-0.29 -0.12 -0.4 0.11 0.26 0.29
-0.23 -0.3 -0.5 -0.05 0.59 0.21
-0.19 -0.43 -0.35 0.2 0.53 0.0
-0.49 -1.33 -0.65 0.23 0.79 0.44
-0.47 -0.33 -0.35 0.16 0.57 0.13
-0.31 -0.32 -0.26 0.15 0.53 0.01
-0.08 -0.23 -0.19 0.04 0.31 0.08
-0.2 -0.3 -0.48 -0.13 0.49 0.35
-0.57 -0.44 -0.28 0.24 0.44 0.29
-0.73 -0.34 -0.42 0.51 0.51 0.03
-0.68 -0.62 -0.35 -0.06 0.87 0.2
-0.46 -0.8 -0.27 0.21 0.45 0.44
-0.46 -0.23 -0.04 0.06 0.32 0.21
-0.71 -0.87 0.07 0.3 0.19 0.5
-0.44 -0.24 -0.07 0.23 0.33 0.04
-0.17 -0.14 -0.36 -0.2 0.45 0.25
-0.22 -0.22 -0.22 0.23 0.4 -0.1
-0.44 -0.42 -0.06 0.1 0.36 0.27
-0.56 -1.21 -0.64 0.27 0.99 0.08
-0.15 -0.22 -0.33 -0.09 0.41 0.24
-0.73 -0.52 -0.43 0.45 0.74 -0.14
-0.34 -0.25 -0.14 0.06 0.49 0.02
-0.13 -0.29 -0.35 -0.12 0.41 0.31
-0.1 -0.16 -0.12 -0.02 0.33 0.01

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.