Heatmap: Cluster_61 (HCCA clusters)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
1.5 h after dark
5.5 h after dark
9.5 h after dark
-0.93 -1.71 -1.51 0.38 0.88 0.75
-0.7 -1.25 -0.84 0.2 0.66 0.75
-0.32 -0.81 -1.56 -0.38 1.34 -0.01
-0.7 -1.25 -1.12 0.21 0.8 0.68
-0.16 -0.42 -0.3 -0.2 0.6 0.21
-0.16 -0.25 -0.4 0.05 0.41 0.2
-0.82 -1.44 -1.25 0.2 1.12 0.4
-0.11 -0.51 -0.5 0.17 0.57 0.09
-0.33 -1.32 -0.45 0.32 0.63 0.35
-0.49 -0.7 -0.35 0.16 0.48 0.46
-0.06 -0.38 -0.73 -0.09 0.64 0.22
-0.07 -0.49 -0.93 -0.15 0.75 0.3
-0.16 -0.21 -0.19 -0.04 0.45 0.02
-0.22 -0.39 -0.41 0.06 0.47 0.25
-0.24 -0.76 -0.8 0.2 0.99 -0.23
-0.16 -0.16 -0.16 -0.06 0.34 0.12
-0.36 -0.4 -0.55 0.17 0.61 0.18
-0.18 -0.84 -0.85 0.05 0.71 0.41
-0.05 -1.24 -0.85 0.1 0.63 0.53
-0.42 -0.46 -0.73 -0.05 0.86 0.2
-0.57 -0.76 -0.51 0.38 0.67 0.19
-0.59 -0.48 -1.5 -0.16 1.18 0.14
-0.3 -0.46 -0.54 0.01 0.7 0.19
-0.58 -0.67 -0.6 0.16 0.98 -0.07
-0.14 -0.99 -0.87 0.21 0.73 0.29
0.03 -0.19 -0.41 -0.11 0.36 0.19
-0.45 -0.9 -0.92 0.14 0.94 0.24
-0.28 -0.89 -1.3 0.14 0.92 0.3
-0.12 -0.1 -0.24 -0.08 0.39 0.06
-0.58 -0.53 -0.84 0.13 1.02 -0.06
-0.72 -1.67 -1.07 0.6 0.9 0.28
-0.83 -1.39 -2.12 0.13 1.14 0.61
-0.36 -0.74 -0.72 -0.09 0.68 0.56
-0.58 -0.94 -0.7 0.11 0.77 0.49
-0.16 -0.41 -0.12 0.04 0.4 0.12
-0.38 -0.84 -0.8 0.18 0.76 0.34
-0.16 -0.21 -0.35 -0.3 0.54 0.24
-0.2 -1.06 -0.31 0.31 0.4 0.37
-0.33 -0.38 -0.52 0.12 0.44 0.37
-0.05 -0.6 -0.33 0.07 0.4 0.29
-0.45 -0.78 -0.63 0.36 0.64 0.26
-0.33 -1.25 -1.03 0.3 0.92 0.23
0.13 -0.11 -0.44 -0.08 0.36 0.02
-0.07 -0.59 -0.55 -0.03 0.68 0.16
-0.44 -0.8 -0.77 0.08 0.73 0.47
-0.26 -1.3 -0.99 0.25 0.65 0.58
-0.07 -0.47 -0.56 0.06 0.5 0.25
-0.24 -0.43 -0.38 0.29 0.37 0.19
-0.17 -0.35 -0.51 -0.0 0.51 0.26
-0.47 -0.79 -1.07 0.36 0.58 0.53
-0.18 -0.22 -0.42 0.12 0.48 0.05
-0.32 -0.54 -0.5 -0.06 0.65 0.34
-0.23 -0.29 -0.52 -0.08 0.69 0.09
-0.44 -0.99 -0.71 0.42 0.78 0.14
0.1 -0.93 -0.98 0.19 0.8 0.03
-0.09 -0.26 -0.29 -0.0 0.35 0.18
-0.24 -0.7 -0.81 0.06 0.81 0.22
-0.56 -0.8 -0.54 0.1 0.82 0.29
-0.13 -0.88 -0.94 -0.13 0.85 0.38
-0.08 -0.13 -0.14 -0.11 0.32 0.08
-0.36 -1.32 -1.15 0.44 0.79 0.35
-0.35 -0.58 -0.55 0.12 0.57 0.37
-0.19 -0.67 -0.74 -0.28 1.06 -0.01
-0.15 -0.22 -0.25 0.1 0.33 0.1
-0.45 -0.65 -0.5 0.31 0.78 -0.05
-0.04 -0.08 -0.11 -0.02 0.16 0.07
-0.68 -2.52 -2.67 0.6 1.31 0.08
-0.55 -0.85 -0.13 0.12 0.62 0.29
-0.08 -0.13 -0.16 -0.0 0.31 0.01
-1.01 -1.18 -1.07 0.13 1.32 -0.0
-0.45 -1.17 -0.65 0.29 0.75 0.37
-0.2 -0.32 -0.75 -0.14 0.84 0.06
-0.05 -0.22 -0.31 0.0 0.29 0.19
-0.26 -0.48 -0.47 -0.02 0.58 0.32
-0.4 -0.72 -0.61 0.12 0.56 0.5
-0.47 -1.59 -1.87 0.1 1.16 0.46
-0.55 -0.55 -0.47 -0.15 0.8 0.35
-0.6 -0.5 -0.56 -0.06 1.02 -0.05
-0.14 -0.27 -0.28 -0.2 0.46 0.25
-0.52 -0.68 -0.65 0.23 0.61 0.42
-0.1 -0.54 -0.44 0.23 0.56 -0.0
-0.15 -0.53 -0.44 0.06 0.47 0.32
-0.4 -0.49 -0.38 -0.03 0.57 0.36
-0.25 -0.85 -1.24 -0.12 0.89 0.49
-0.17 -0.15 -0.19 0.05 0.27 0.12
-0.19 -0.33 -0.36 -0.09 0.41 0.35
-0.27 -1.24 -0.77 0.51 0.83 -0.06
-0.43 -0.49 -0.51 -0.05 0.82 0.16
0.16 -0.25 -0.23 -0.15 0.27 0.12
-0.92 -1.57 -2.08 0.0 1.31 0.51
-0.3 -1.74 -2.27 -1.03 1.42 0.61
-0.6 -0.57 -0.24 0.24 0.56 0.22
-0.59 -1.56 -1.63 0.31 0.93 0.61
-0.7 -1.08 -0.66 0.41 0.88 0.15
-0.6 -1.56 -0.93 0.46 0.85 0.38
-0.19 -0.34 -0.35 -0.02 0.33 0.39
-0.57 -1.7 -1.67 0.19 1.04 0.59
-0.49 -0.38 -0.59 -0.18 0.54 0.6
-0.61 -1.32 -1.34 0.37 0.91 0.47
-0.18 -0.29 -0.12 0.16 0.28 0.07
-0.28 -0.33 -0.6 -0.06 0.53 0.4
-0.46 -0.43 -0.56 -0.42 0.93 0.27
-0.21 -0.11 -0.17 -0.05 0.33 0.14
-0.46 -1.53 -1.05 0.51 0.84 0.29
-0.3 -0.31 -0.46 0.0 0.62 0.16
0.05 -0.5 -0.55 -0.02 0.44 0.29
-0.29 -0.48 -0.83 -0.1 0.5 0.64
-0.44 -0.55 -0.78 0.02 0.92 0.13
-0.15 -0.37 -0.52 -0.05 0.53 0.29
-0.19 -0.07 -0.07 -0.02 0.26 0.05
-0.06 -2.12 -2.49 -0.09 1.32 0.24
-1.79 -4.17 -4.26 -0.59 1.29 1.31
-0.34 -1.86 -1.12 0.46 0.62 0.64
-0.46 -1.84 -1.26 0.53 0.67 0.63
-0.3 -0.5 -0.47 0.17 0.74 -0.05
-0.13 -0.18 -0.36 0.02 0.34 0.19
-0.42 -0.74 -0.65 0.18 0.82 0.15
-0.24 -0.26 -0.46 0.1 0.4 0.26
-0.01 -0.29 -0.05 0.06 0.16 0.08
-0.3 -0.53 -0.45 -0.05 0.64 0.31
-0.22 -0.37 -0.4 0.09 0.38 0.31
-0.09 -0.62 -0.43 0.04 0.37 0.42
-0.35 -0.71 -0.49 0.26 0.44 0.42
-0.08 -0.27 -0.4 -0.02 0.44 0.17
-0.08 -0.23 -0.37 -0.12 0.46 0.18
-0.38 -0.36 -1.14 -0.05 0.67 0.53
-0.45 -0.48 -0.35 0.07 0.63 0.22
0.22 -0.37 -0.65 0.02 0.38 0.15
-0.38 -0.52 -0.42 0.1 0.71 0.11
-1.14 -1.24 -1.33 0.33 1.12 0.37
-0.63 -1.7 -1.52 0.27 0.83 0.77
-0.0 -0.42 -0.47 -0.07 0.53 0.18
-0.5 -1.0 -1.18 0.34 0.81 0.4
-0.08 -0.28 -0.37 -0.09 0.51 0.12
-0.44 -0.92 -0.49 0.17 0.82 0.18
-0.08 -0.22 -0.24 -0.03 0.26 0.22
-0.66 -0.92 -0.6 0.34 0.85 0.15
-0.17 -0.48 -0.34 0.26 0.48 0.02
-0.25 -1.52 -1.38 0.12 1.02 0.39
-0.07 -0.09 -0.16 -0.05 0.24 0.09
-0.64 -0.66 -0.88 0.0 0.85 0.46
-0.2 -0.3 -0.18 0.06 0.4 0.1
-1.22 -1.88 -1.1 0.54 1.01 0.45
0.15 -0.53 -0.29 -0.16 0.56 0.02
-0.89 -1.66 -1.75 0.47 0.83 0.75
-1.04 -1.37 -1.16 0.36 1.26 -0.01
-0.22 -0.76 -0.46 -0.13 0.95 -0.03
-0.16 -0.28 -0.2 -0.1 0.45 0.15
-0.65 -0.92 -0.73 0.2 0.96 0.18
-0.23 -0.89 -1.11 0.17 0.75 0.43
-0.17 -0.36 -0.33 0.22 0.34 0.14
-0.76 -1.59 -0.93 0.21 0.95 0.56
-0.04 -0.19 -0.35 0.03 0.32 0.13
-0.92 -1.36 -0.67 0.36 0.77 0.55
-0.92 -1.72 -1.44 0.59 1.06 0.26
-0.32 -0.4 -0.57 -0.12 0.77 0.2
-0.71 -0.85 -1.17 0.12 1.22 -0.02
-0.55 -1.03 -0.77 0.15 1.03 0.11
-0.35 -0.67 -0.42 -0.01 0.79 0.16
-0.18 -0.37 -0.37 0.02 0.44 0.26
-0.53 -0.46 -0.5 0.18 0.47 0.44
-0.32 -0.15 -0.21 -0.16 0.35 0.34
-2.78 -5.01 -3.78 -0.09 1.47 1.03
-0.41 -0.4 -0.71 0.12 0.73 0.18
-0.84 -1.64 -0.74 0.47 1.01 0.16
-0.25 -0.44 -0.47 0.11 0.56 0.21
-0.16 -0.73 -0.33 0.18 0.49 0.22
-0.4 -0.91 -0.76 0.08 0.84 0.34
-0.59 -0.58 -0.29 0.37 0.64 -0.01
-2.43 -5.76 -5.8 -0.44 1.41 1.25
-0.01 -0.67 -0.64 0.19 0.57 0.15
-0.27 -0.75 -0.7 -0.08 0.58 0.6
-1.01 -1.87 -1.22 0.35 0.81 0.83
-0.52 -1.0 -0.44 0.39 0.75 0.1
-0.08 -0.39 -0.4 -0.1 0.42 0.34
-0.69 -0.49 -0.51 0.3 0.67 0.2
-0.46 -0.94 -0.62 0.06 0.87 0.29
-0.55 -1.44 -1.01 0.48 0.97 0.15
-0.34 -0.48 -0.65 -0.07 0.7 0.35
-0.36 -1.45 -0.87 0.14 0.71 0.65
-0.07 -1.05 -0.82 0.17 0.52 0.52
-0.29 -0.71 -0.75 0.29 0.61 0.29
-0.53 -1.11 -0.83 0.47 0.82 0.18
-0.03 -0.44 -0.64 -0.05 0.55 0.27
-0.29 -0.98 -1.63 -0.29 1.27 0.17
-0.25 -0.68 -0.65 -0.06 0.6 0.5
-0.19 -0.34 -0.5 0.13 0.48 0.18
-0.19 -0.83 -0.72 -0.13 0.79 0.39
-0.26 -0.4 -0.34 -0.05 0.65 0.11
-0.23 -0.2 -0.23 0.0 0.34 0.21
-0.07 -0.39 -0.45 0.01 0.49 0.2
-0.32 -0.46 -0.55 -0.1 0.64 0.37

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.