Heatmap: Cluster_30 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
1.5 h after dark
5.5 h after dark
9.5 h after dark
0.11 0.13 -0.42 0.41 -0.37 -0.04
0.16 -0.06 -0.12 -0.07 -0.31 0.32
0.09 0.1 -0.16 0.02 -0.2 0.13
0.21 -0.02 -0.17 -0.21 -0.28 0.36
0.01 -0.03 -0.08 -0.1 0.04 0.14
0.06 0.08 -0.24 0.1 -0.21 0.17
0.0 -0.05 -0.33 0.5 -0.37 0.06
0.07 0.03 -0.16 -0.13 -0.21 0.33
0.38 0.03 -0.24 -0.53 0.03 0.16
0.33 -0.04 -0.27 -0.46 0.12 0.17
-0.0 -0.01 -0.15 0.36 -0.48 0.15
0.1 -0.08 -0.19 0.33 -0.31 0.07
0.13 0.25 -0.29 -0.33 -0.06 0.19
0.19 0.08 -0.15 -0.41 -0.16 0.31
0.1 0.13 -0.36 0.17 -0.43 0.25
0.32 -0.07 -0.33 -0.38 0.03 0.28
-0.1 -0.08 -0.37 0.34 -0.44 0.43
0.19 0.11 -0.32 0.08 -0.25 0.11
0.12 -0.01 -0.31 -0.21 0.0 0.31
0.08 0.07 -0.19 -0.02 -0.12 0.16
0.12 -0.02 -0.27 -0.35 0.12 0.29
0.07 -0.17 -0.29 -0.09 0.26 0.15
-0.05 0.29 -0.48 0.18 -0.44 0.29
0.27 0.09 -0.23 -0.0 -0.39 0.16
0.06 0.17 -0.33 0.11 -0.42 0.28
0.03 -0.03 -0.3 0.17 -0.22 0.26
0.3 0.0 -0.18 -0.06 -0.3 0.15
0.12 0.09 -0.31 0.16 -0.37 0.2
0.03 -0.05 -0.19 -0.2 -0.08 0.4
0.2 0.06 -0.35 -0.12 -0.23 0.32
0.25 -0.07 -0.09 -0.02 -0.19 0.08
0.2 0.07 -0.32 0.08 -0.36 0.22
-0.05 0.25 -0.33 0.2 -0.42 0.2
0.24 -0.07 -0.19 0.12 -0.4 0.21
0.14 -0.06 -0.08 -0.18 0.02 0.14
0.02 -0.04 -0.29 0.33 -0.44 0.27
0.1 -0.06 -0.28 -0.18 0.13 0.22
0.06 0.06 -0.31 0.22 -0.33 0.2
0.17 0.13 -0.28 0.04 -0.35 0.2
0.23 -0.15 -0.28 -0.04 -0.13 0.28
0.15 0.02 -0.08 -0.27 -0.17 0.27
0.11 0.04 -0.24 0.08 -0.36 0.26
0.17 0.03 -0.34 0.07 -0.26 0.23
-0.14 0.18 -0.43 0.16 -0.1 0.22
0.14 0.13 -0.27 -0.18 -0.31 0.36
0.12 0.05 -0.2 -0.03 -0.15 0.17
0.23 0.01 -0.37 0.02 -0.35 0.32
0.14 0.07 -0.25 -0.07 -0.14 0.19
0.12 0.04 -0.2 0.09 -0.3 0.19
-0.07 -0.13 -0.19 0.65 -0.52 -0.02
0.09 -0.04 -0.42 0.3 -0.46 0.32
-0.07 0.01 -0.4 0.1 -0.17 0.4
0.17 0.01 -0.22 -0.23 -0.16 0.34
0.17 -0.01 -0.21 -0.17 -0.18 0.31
-0.1 0.17 -0.48 0.51 -0.35 0.03
0.3 0.04 -0.23 -0.12 -0.35 0.25
0.15 -0.02 -0.21 -0.08 -0.31 0.36
0.26 -0.04 -0.15 -0.47 0.12 0.16
0.28 0.05 -0.35 0.05 -0.38 0.21
0.21 -0.07 -0.3 -0.21 0.01 0.27
0.09 0.11 -0.23 0.11 -0.32 0.16
0.19 0.09 -0.2 -0.19 -0.08 0.15
0.13 0.05 -0.13 -0.03 -0.34 0.25
0.2 -0.02 -0.24 0.14 -0.23 0.08
0.13 -0.02 0.01 0.08 -0.39 0.12
0.14 0.09 -0.18 -0.04 -0.31 0.23
0.07 -0.04 -0.31 0.31 -0.24 0.12
0.11 0.06 -0.27 -0.16 -0.05 0.24
0.24 0.12 -0.24 -0.53 -0.37 0.51
0.27 0.04 -0.32 0.08 -0.34 0.16
0.03 0.04 -0.29 -0.29 0.02 0.38
0.12 0.01 -0.3 -0.19 -0.01 0.3

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.