Heatmap: Cluster_72 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
1.5 h after dark
5.5 h after dark
9.5 h after dark
0.14 0.07 -0.21 -0.14 -0.14 0.22
0.16 0.11 -0.18 -0.19 -0.22 0.25
0.2 0.15 -0.2 -0.3 -0.29 0.31
0.19 0.19 -0.16 -0.29 -0.27 0.24
0.17 0.08 -0.04 -0.44 -0.11 0.24
0.17 0.1 -0.12 -0.23 -0.29 0.29
0.18 0.16 -0.17 -0.25 -0.28 0.26
0.19 0.11 -0.18 -0.24 -0.19 0.23
0.17 0.11 -0.17 -0.22 -0.3 0.31
0.21 0.13 -0.2 -0.29 -0.23 0.27
0.16 0.1 -0.14 -0.36 -0.09 0.24
0.25 0.05 -0.17 -0.32 -0.19 0.28
0.19 0.1 -0.13 -0.25 -0.26 0.26
0.21 0.12 -0.09 -0.37 -0.24 0.26
0.17 0.09 -0.17 -0.44 -0.03 0.27
0.18 0.11 -0.16 -0.34 -0.17 0.28
0.21 0.09 -0.14 -0.25 -0.27 0.26
0.18 0.22 -0.15 -0.34 -0.29 0.25
0.23 0.11 -0.13 -0.33 -0.24 0.25
0.18 0.15 -0.19 -0.27 -0.25 0.29
0.18 0.12 -0.2 -0.23 -0.18 0.23
0.18 0.09 -0.12 -0.3 -0.16 0.24
0.2 0.12 -0.11 -0.33 -0.24 0.26
0.24 0.13 -0.17 -0.34 -0.22 0.24
0.19 0.1 -0.11 -0.34 -0.17 0.25
0.2 0.12 -0.13 -0.31 -0.24 0.26
0.17 0.09 -0.16 -0.2 -0.17 0.22
0.13 0.06 -0.09 -0.24 -0.13 0.21
0.19 0.1 -0.16 -0.35 -0.15 0.26
0.17 0.09 -0.15 -0.44 -0.02 0.24
0.18 0.12 -0.17 -0.3 -0.19 0.26
0.18 0.13 -0.07 -0.34 -0.26 0.26
0.18 0.1 -0.15 -0.29 -0.26 0.31
0.19 0.1 -0.13 -0.29 -0.24 0.26
0.19 0.1 -0.13 -0.23 -0.27 0.25
0.18 0.21 -0.13 -0.36 -0.3 0.27
0.2 0.09 -0.15 -0.3 -0.17 0.24
0.21 0.14 -0.22 -0.21 -0.27 0.25
0.15 0.14 -0.08 -0.26 -0.24 0.22
0.2 0.11 -0.12 -0.32 -0.23 0.26
0.18 0.09 -0.16 -0.29 -0.13 0.22
0.12 0.04 -0.07 -0.21 -0.09 0.18
0.15 0.07 -0.13 -0.24 -0.16 0.24
0.2 0.12 -0.24 -0.18 -0.22 0.23
0.18 0.18 -0.17 -0.27 -0.3 0.26
0.18 0.09 -0.15 -0.3 -0.16 0.25
0.21 0.15 -0.17 -0.3 -0.26 0.26
0.21 0.11 -0.13 -0.32 -0.25 0.27
0.2 0.1 -0.12 -0.3 -0.23 0.26
0.16 0.07 -0.1 -0.36 -0.11 0.26
0.18 0.12 -0.15 -0.24 -0.26 0.25
0.17 0.09 -0.14 -0.34 -0.13 0.25
0.27 0.14 -0.23 -0.31 -0.31 0.29
0.2 0.11 -0.12 -0.3 -0.26 0.27
0.21 0.11 -0.14 -0.29 -0.24 0.25
0.19 0.11 -0.17 -0.2 -0.26 0.24
0.16 0.08 -0.13 -0.28 -0.14 0.23
0.2 0.11 -0.11 -0.3 -0.27 0.27
0.19 0.19 -0.21 -0.29 -0.27 0.26
0.18 0.09 -0.13 -0.28 -0.19 0.24
0.21 0.12 -0.13 -0.31 -0.25 0.26
0.18 0.08 -0.14 -0.28 -0.25 0.3
0.19 0.11 -0.17 -0.27 -0.22 0.27
0.16 0.07 -0.14 -0.13 -0.22 0.21
0.21 0.14 -0.15 -0.31 -0.25 0.25
0.16 0.08 -0.16 -0.24 -0.28 0.32
0.2 0.13 -0.17 -0.27 -0.26 0.26
0.17 0.08 -0.15 -0.25 -0.22 0.29

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.