Heatmap: Cluster_13 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
1.5 h after dark
5.5 h after dark
9.5 h after dark
0.21 0.12 -0.12 -0.39 -0.22 0.28
0.2 0.12 -0.17 -0.32 -0.15 0.24
0.21 0.15 -0.15 -0.39 -0.19 0.25
0.2 0.15 -0.07 -0.44 -0.24 0.26
0.2 0.11 -0.12 -0.4 -0.17 0.27
0.15 0.14 -0.17 -0.47 -0.04 0.27
0.2 0.11 -0.06 -0.39 -0.21 0.25
0.19 0.09 -0.03 -0.37 -0.24 0.25
0.16 0.15 -0.18 -0.38 -0.06 0.22
0.22 0.12 -0.12 -0.41 -0.21 0.27
0.19 0.1 -0.15 -0.44 -0.06 0.25
0.19 0.11 -0.03 -0.41 -0.25 0.27
0.2 0.11 -0.1 -0.42 -0.16 0.26
0.19 0.1 -0.11 -0.41 -0.19 0.3
0.21 0.12 -0.05 -0.43 -0.24 0.27
0.22 0.11 -0.04 -0.42 -0.26 0.26
0.18 0.09 -0.13 -0.44 -0.11 0.29
0.19 0.12 -0.06 -0.41 -0.21 0.26
0.23 0.11 -0.12 -0.42 -0.19 0.27
0.19 0.11 -0.05 -0.42 -0.21 0.27
0.19 0.14 -0.13 -0.44 -0.12 0.25
0.18 0.07 -0.18 -0.31 -0.11 0.27
0.14 0.07 -0.12 -0.26 -0.17 0.26
0.19 0.15 -0.17 -0.49 -0.02 0.22
0.19 0.11 -0.03 -0.4 -0.25 0.27
0.16 0.12 -0.18 -0.35 -0.07 0.24
0.26 0.09 -0.13 -0.41 -0.17 0.25
0.18 0.15 -0.14 -0.46 -0.15 0.28
0.19 0.1 -0.04 -0.45 -0.16 0.25
0.18 0.15 -0.07 -0.42 -0.24 0.27
0.15 0.15 -0.11 -0.44 -0.2 0.31
0.21 0.12 -0.11 -0.41 -0.21 0.28
0.15 0.09 -0.12 -0.28 -0.13 0.22
0.18 0.15 -0.23 -0.44 -0.13 0.33
0.19 0.12 -0.1 -0.36 -0.21 0.27
0.12 0.2 -0.06 -0.41 -0.14 0.2
0.22 0.1 -0.03 -0.42 -0.25 0.26
0.19 0.1 -0.05 -0.35 -0.27 0.27
0.21 0.13 -0.14 -0.42 -0.22 0.3
0.32 0.07 -0.32 -0.54 -0.1 0.35
0.19 0.11 -0.19 -0.41 -0.13 0.3
0.21 0.12 -0.11 -0.39 -0.2 0.27
0.15 0.08 -0.1 -0.44 -0.05 0.26
0.19 0.1 -0.12 -0.41 -0.18 0.3
0.22 0.1 -0.1 -0.32 -0.23 0.23
0.19 0.1 -0.03 -0.41 -0.21 0.25
0.19 0.11 -0.1 -0.41 -0.22 0.3
0.21 0.11 -0.14 -0.42 -0.14 0.27
0.19 0.12 -0.05 -0.41 -0.24 0.26
0.21 0.14 -0.16 -0.38 -0.19 0.25
0.21 0.13 -0.14 -0.38 -0.19 0.26
0.19 0.13 -0.17 -0.31 -0.17 0.24
0.21 0.11 -0.11 -0.39 -0.2 0.27
0.2 0.14 -0.07 -0.43 -0.22 0.26
0.23 0.1 -0.17 -0.39 -0.1 0.23
0.16 0.08 -0.08 -0.41 -0.19 0.32
0.19 0.11 -0.12 -0.39 -0.2 0.29
0.2 0.11 -0.07 -0.39 -0.25 0.27
0.16 0.08 -0.15 -0.36 -0.05 0.24
0.18 0.09 -0.14 -0.31 -0.18 0.27
0.21 0.12 -0.06 -0.39 -0.26 0.27
0.19 0.11 -0.12 -0.4 -0.2 0.3
0.2 0.14 -0.06 -0.4 -0.26 0.26
0.21 0.11 -0.04 -0.41 -0.26 0.27
0.16 0.07 -0.11 -0.35 -0.11 0.25
0.2 0.12 -0.1 -0.43 -0.25 0.32
0.21 0.11 -0.14 -0.41 -0.11 0.25
0.15 0.08 -0.16 -0.36 -0.1 0.29
0.19 0.12 -0.12 -0.41 -0.16 0.27
0.14 0.12 -0.07 -0.38 -0.18 0.26
0.27 0.04 -0.21 -0.49 -0.1 0.32
0.2 0.11 -0.09 -0.41 -0.27 0.32
0.23 0.15 -0.19 -0.35 -0.17 0.22
0.2 0.13 -0.16 -0.41 -0.11 0.25
0.21 0.12 -0.15 -0.34 -0.2 0.26
0.17 0.16 -0.16 -0.33 -0.18 0.24
0.19 0.11 -0.03 -0.42 -0.24 0.27
0.2 0.12 -0.06 -0.39 -0.22 0.24
0.21 0.1 -0.12 -0.38 -0.18 0.26
0.17 0.12 -0.15 -0.44 -0.05 0.24
0.2 0.12 -0.15 -0.42 -0.12 0.26
0.18 0.12 -0.06 -0.41 -0.2 0.25
0.19 0.11 -0.06 -0.42 -0.27 0.31
0.2 0.15 -0.22 -0.43 -0.06 0.24
0.18 0.09 -0.15 -0.41 -0.04 0.24
0.18 0.12 -0.15 -0.44 -0.05 0.23
0.22 0.11 -0.14 -0.39 -0.18 0.26
0.16 0.07 -0.16 -0.34 -0.09 0.27
0.2 0.12 -0.14 -0.38 -0.17 0.26
0.15 0.09 -0.06 -0.4 -0.17 0.28
0.22 0.12 -0.14 -0.39 -0.17 0.25
0.19 0.11 -0.06 -0.41 -0.19 0.26
0.19 0.1 -0.04 -0.35 -0.22 0.23
0.23 0.08 -0.15 -0.44 -0.08 0.24
0.2 0.11 -0.13 -0.39 -0.25 0.33
0.17 0.09 -0.04 -0.37 -0.15 0.21
0.21 0.12 -0.05 -0.44 -0.23 0.27
0.21 0.13 -0.19 -0.37 -0.13 0.25
0.2 0.12 -0.16 -0.39 -0.2 0.31
0.2 0.11 -0.13 -0.36 -0.26 0.31
0.19 0.15 -0.05 -0.41 -0.25 0.26
0.13 0.17 -0.11 -0.43 -0.06 0.22
0.16 0.12 -0.06 -0.4 -0.14 0.23
0.19 0.1 -0.13 -0.37 -0.19 0.3
0.2 0.1 -0.13 -0.42 -0.19 0.31
0.2 0.12 -0.06 -0.4 -0.24 0.26
0.2 0.12 -0.17 -0.36 -0.12 0.24
0.2 0.11 -0.13 -0.38 -0.2 0.29
0.18 0.09 -0.11 -0.44 -0.06 0.24
0.18 0.09 -0.03 -0.4 -0.23 0.27
0.2 0.11 -0.12 -0.41 -0.24 0.33
0.2 0.12 -0.07 -0.38 -0.25 0.27
0.19 0.14 -0.14 -0.4 -0.16 0.26
0.19 0.11 -0.13 -0.44 -0.13 0.28
0.2 0.11 -0.13 -0.42 -0.24 0.34
0.2 0.11 -0.13 -0.43 -0.16 0.29
0.15 0.06 -0.12 -0.37 -0.15 0.32

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.