Heatmap: Cluster_50 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
1.5 h after dark
5.5 h after dark
9.5 h after dark
0.17 0.09 -0.11 -0.18 -0.28 0.24
0.04 -0.02 -0.1 -0.11 -0.32 0.41
0.22 0.07 -0.19 -0.15 -0.21 0.19
0.2 0.07 -0.1 -0.32 -0.12 0.19
0.24 0.07 -0.15 -0.22 -0.28 0.24
0.2 0.15 -0.14 -0.23 -0.3 0.23
0.17 0.08 -0.14 -0.16 -0.23 0.22
0.17 0.08 -0.15 -0.22 -0.17 0.23
0.19 0.11 -0.12 -0.15 -0.31 0.21
0.19 0.13 -0.26 -0.04 -0.32 0.22
0.18 0.1 -0.09 -0.29 -0.26 0.26
0.13 0.03 -0.07 -0.3 -0.18 0.31
0.25 0.07 -0.16 -0.2 -0.29 0.23
0.16 0.07 -0.06 -0.27 -0.18 0.22
0.11 0.01 -0.11 -0.06 -0.16 0.18
0.24 0.08 -0.18 -0.28 -0.22 0.27
0.15 0.08 -0.19 -0.24 -0.23 0.33
0.23 0.08 -0.21 -0.13 -0.28 0.22
0.15 0.08 -0.17 -0.16 -0.24 0.26
0.26 0.11 -0.15 -0.31 -0.28 0.25
0.18 0.13 -0.13 -0.26 -0.26 0.25
0.16 0.09 -0.16 -0.16 -0.29 0.28
0.18 0.1 -0.13 -0.32 -0.17 0.26
0.21 0.09 -0.16 -0.19 -0.25 0.23
0.14 0.08 -0.09 -0.28 -0.24 0.3
0.18 0.1 -0.15 -0.17 -0.28 0.25
0.13 0.09 -0.13 -0.25 -0.24 0.31
0.19 0.08 -0.14 -0.21 -0.23 0.23
0.18 0.15 -0.14 -0.34 -0.18 0.24
0.2 0.12 -0.14 -0.27 -0.22 0.24
0.17 0.15 -0.16 -0.21 -0.28 0.24
0.19 0.13 -0.17 -0.28 -0.19 0.23
0.16 0.05 -0.17 -0.06 -0.21 0.18
0.23 0.1 -0.13 -0.26 -0.28 0.25
0.33 0.03 -0.15 -0.3 -0.29 0.25
0.15 0.06 -0.11 -0.19 -0.24 0.26
0.17 0.12 -0.18 -0.22 -0.22 0.24
0.23 0.06 -0.15 -0.21 -0.22 0.21
0.18 0.17 -0.25 -0.2 -0.19 0.2
0.18 0.1 -0.11 -0.27 -0.26 0.26
0.2 0.13 -0.17 -0.27 -0.28 0.28
0.16 0.08 -0.14 -0.12 -0.27 0.22
0.16 0.07 -0.15 -0.23 -0.15 0.23
0.12 0.07 -0.17 -0.39 -0.05 0.32
0.24 0.08 -0.12 -0.35 -0.29 0.32
0.23 0.11 -0.2 -0.27 -0.19 0.23
0.19 0.08 -0.06 -0.24 -0.29 0.23
0.21 0.13 -0.16 -0.3 -0.23 0.25
0.16 0.08 -0.19 -0.06 -0.28 0.22
0.15 0.08 -0.21 -0.09 -0.25 0.25
0.26 0.14 -0.21 -0.25 -0.25 0.21
0.02 0.05 -0.05 -0.2 -0.21 0.32
0.25 0.11 -0.13 -0.3 -0.3 0.25
0.17 0.02 -0.22 -0.31 -0.06 0.3
0.16 0.07 -0.1 -0.27 -0.2 0.26
0.25 0.1 -0.13 -0.31 -0.24 0.23
0.18 0.09 -0.13 -0.19 -0.27 0.24
0.1 0.02 -0.04 -0.18 -0.21 0.26
0.17 0.11 -0.14 -0.13 -0.29 0.21
0.22 0.17 -0.17 -0.31 -0.25 0.24
0.17 0.1 -0.15 -0.16 -0.3 0.25
0.18 0.1 -0.15 -0.21 -0.27 0.25
0.19 0.12 -0.13 -0.28 -0.25 0.25
0.19 0.1 -0.18 -0.12 -0.29 0.22
0.16 0.07 -0.17 -0.16 -0.19 0.23
0.26 0.08 -0.15 -0.24 -0.29 0.24
0.13 0.05 -0.12 -0.16 -0.19 0.24
0.15 0.09 -0.19 -0.14 -0.17 0.21
0.21 0.08 -0.09 -0.26 -0.25 0.21
0.16 0.07 -0.14 -0.14 -0.31 0.27
0.11 0.05 -0.11 -0.13 -0.27 0.29
0.16 0.12 -0.18 -0.27 -0.2 0.27
0.17 0.11 -0.2 -0.17 -0.19 0.22
0.18 0.07 -0.07 -0.29 -0.18 0.23
0.15 0.18 -0.14 -0.14 -0.31 0.17
0.16 0.13 -0.16 -0.22 -0.17 0.2
0.17 0.09 -0.15 -0.29 -0.11 0.22
0.18 0.1 -0.14 -0.22 -0.26 0.25
0.17 0.09 -0.23 -0.15 -0.24 0.27
0.19 0.08 -0.2 -0.2 -0.13 0.19
0.21 0.07 -0.13 -0.29 -0.27 0.3

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.