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Heatmap: Cluster_1 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
1.5 h after dark
5.5 h after dark
9.5 h after dark
0.09 -0.09 0.12 -0.48 -0.03 0.28
0.19 0.24 -0.69 -0.41 -0.76 0.78
0.08 -0.06 -0.16 -0.25 -0.12 0.4
0.06 0.06 -0.48 -0.13 -0.2 0.5
0.11 -0.03 -0.19 -0.6 -0.33 0.69
-0.04 -0.28 -1.69 -0.77 -0.96 1.48
0.26 0.07 -0.12 -0.46 -0.22 0.33
0.04 -0.05 0.07 -0.28 -0.05 0.23
0.03 -0.09 -0.12 -0.21 0.03 0.3
0.02 -0.18 -0.23 -0.29 0.1 0.45
0.09 0.02 -0.12 -0.19 -0.23 0.35
-0.11 -0.07 -0.23 -0.35 0.07 0.52
0.21 -0.26 -0.47 -0.39 0.19 0.47
0.02 -0.08 -0.3 -0.22 0.06 0.4
0.07 0.03 -0.32 -0.14 -0.06 0.34
0.11 -0.42 -0.28 -0.06 -0.21 0.61
0.09 -0.26 -0.16 -0.16 0.02 0.37
-0.04 -1.73 -1.32 -0.6 0.28 1.29
-0.27 -0.37 0.05 -0.28 0.22 0.46
0.46 -0.66 -0.72 -0.33 -0.29 0.82
-0.08 -0.51 0.14 -0.03 -0.21 0.49
0.15 -0.19 0.05 -0.26 -0.17 0.32
-0.2 0.09 -0.27 -0.49 -0.65 0.92
-0.05 -0.06 -0.02 -0.12 0.04 0.19
0.01 -0.1 -0.53 -0.25 -0.16 0.71
0.01 0.27 -0.02 -0.47 -0.39 0.4
0.01 -0.08 0.1 -0.41 0.03 0.27
0.08 -0.13 -0.09 -0.73 0.15 0.47
-0.6 -2.48 -2.48 -0.29 0.27 1.57
0.08 -0.05 0.07 -0.45 0.05 0.22
0.11 0.02 -0.2 -0.52 0.0 0.42
-0.0 0.22 -0.35 -0.42 -0.11 0.46
0.17 -0.14 -0.11 -0.45 -0.06 0.43
-0.4 -0.2 -0.34 -0.34 0.41 0.55
0.04 -0.13 -0.01 -0.18 -0.12 0.34
0.09 -0.04 -0.24 -0.33 -0.0 0.4
0.02 -0.05 -0.46 -0.42 -0.44 0.86
0.22 0.0 -0.32 -0.16 -0.21 0.35
-0.21 0.19 -0.56 -0.26 -0.29 0.74
0.02 0.21 -0.22 -0.27 -0.22 0.36
-0.14 0.06 -0.15 -0.34 -0.2 0.57
0.14 0.14 -0.31 -0.22 -0.24 0.36
0.34 -0.22 -0.26 -0.49 -0.4 0.65
-0.12 0.04 -0.09 -0.19 -0.37 0.55
0.13 -0.26 -0.08 -0.12 -0.06 0.31
0.13 0.03 -0.32 -0.52 0.02 0.45
-0.06 -0.18 -0.06 0.03 -0.23 0.4
0.19 -0.04 -0.51 -0.63 -0.53 0.88
0.36 0.02 -0.24 -0.5 -0.34 0.45
-0.21 -0.03 -0.22 -0.41 0.25 0.44
0.05 0.05 -0.12 -0.41 -0.12 0.42
-0.18 -0.19 0.13 -0.15 -0.29 0.52
0.06 0.0 -0.54 -0.44 -0.13 0.69
0.21 0.0 -0.2 -0.38 -0.31 0.48
-0.09 -0.02 -0.21 -0.43 0.02 0.54
-0.0 -0.08 -0.02 -0.46 0.12 0.34
-0.05 0.08 -0.3 -0.04 -0.16 0.37
0.03 -0.08 0.07 -0.38 -0.12 0.38
-0.16 -0.11 -0.3 -0.05 0.08 0.43
0.3 0.07 -0.04 -0.38 -0.31 0.23
0.28 0.05 -0.19 -0.45 -0.3 0.41
0.06 0.13 -0.52 -0.19 -0.46 0.64
-0.7 -0.4 0.15 0.12 -0.24 0.66
0.02 -0.06 0.0 -0.37 -0.07 0.38
0.01 -0.13 0.03 -0.23 -0.07 0.33
-0.15 -0.06 -0.04 -0.51 -0.04 0.58
-0.03 -0.11 -0.15 -0.42 -0.12 0.61
0.33 -0.06 -0.14 -0.68 -0.17 0.45
-0.07 -0.24 0.06 -0.09 -0.23 0.46
0.28 -0.15 -0.24 -0.46 -0.45 0.65
0.55 -0.22 -0.34 -0.57 -0.1 0.36
0.26 -0.1 -0.07 -0.22 -0.24 0.28
-0.12 0.13 -0.38 -0.03 -0.38 0.56
0.29 -1.09 -1.55 -0.85 0.05 1.25
0.09 0.01 -0.21 -0.08 -0.23 0.33
0.09 -0.36 -0.74 -0.33 0.12 0.74
0.1 0.16 -0.25 -0.29 -0.25 0.39
-0.21 -0.33 -0.35 -0.67 0.41 0.68
-0.13 0.07 -0.44 0.07 -0.44 0.59
-0.03 -0.16 -0.34 -0.01 -0.1 0.5
0.25 -0.03 -0.31 -0.33 -0.09 0.36
-0.32 -0.17 -0.71 -1.0 -0.31 1.26
-0.14 -0.23 -0.49 -0.06 -0.24 0.78
0.03 0.04 -0.33 -0.23 0.01 0.37
-0.02 0.17 -0.56 -0.15 -0.11 0.47
0.32 -0.14 -0.14 0.03 -0.43 0.22
0.17 -0.09 -0.21 -0.6 -0.35 0.71
0.01 0.04 0.05 -0.47 -0.31 0.48
-0.05 -0.02 -0.05 -0.19 -0.21 0.42
0.01 -0.59 -1.28 -0.56 -0.84 1.42
0.08 0.16 -0.16 -0.35 -0.22 0.36
0.43 -0.01 -0.25 -0.55 -0.34 0.42
0.02 0.05 -0.29 -0.46 -0.26 0.65
0.05 0.08 -0.23 -0.24 0.03 0.26
0.02 0.15 0.02 -0.34 -0.34 0.35
0.23 -0.04 -0.28 -0.2 -0.22 0.37
-0.08 -0.07 -0.06 -0.33 0.13 0.33
-0.15 0.2 -0.44 -0.35 0.06 0.46
-0.36 -0.39 -0.23 0.12 -0.11 0.67
0.06 0.13 -0.49 -0.24 -0.21 0.52
-0.04 0.0 -0.2 -0.17 -0.16 0.46
0.07 -0.28 -0.26 -0.11 -0.15 0.55
0.07 0.15 -0.3 -0.26 -0.18 0.39
0.16 0.2 -0.18 -0.58 -0.4 0.51
0.02 0.18 -0.26 -0.24 -0.42 0.51
0.14 -0.02 0.15 -0.55 -0.39 0.44
0.03 0.05 -0.4 -0.49 -0.46 0.81
0.04 -0.07 -0.15 -0.05 -0.05 0.23
0.07 -0.16 -0.17 0.04 -0.15 0.3
-0.03 0.05 -0.17 -0.52 -0.32 0.68
0.32 -0.21 -0.04 -0.35 -0.02 0.2
0.15 -0.13 -0.33 -0.46 0.12 0.46
-0.04 -0.1 0.0 -0.42 -0.07 0.47
-0.19 -0.17 -0.15 -0.21 0.15 0.44
0.03 0.01 -0.25 -0.02 -0.15 0.32
-0.17 -0.24 -0.05 -0.07 -0.34 0.64
0.14 -0.21 -0.13 -0.36 -0.16 0.53
-0.24 0.29 0.28 -1.02 -0.21 0.44
0.02 0.1 -0.34 -0.46 0.04 0.45
0.2 0.02 -0.06 -0.52 -0.22 0.4
-0.11 -0.06 -0.21 -0.3 -0.16 0.63
-0.23 0.12 -0.1 -0.19 -0.03 0.35
-0.03 -0.48 -0.02 -0.12 -0.29 0.66
0.08 0.07 -0.15 -0.31 -0.11 0.33
-0.18 -0.42 -0.09 0.13 -0.24 0.58
-0.01 0.03 0.2 -0.42 -0.19 0.28
0.13 -0.15 -0.11 -0.5 -0.0 0.45
-0.02 -0.06 -0.17 -0.09 -0.08 0.36
0.28 -0.18 -0.02 -0.69 0.02 0.36
-0.04 -0.11 -0.23 -0.53 0.07 0.59
-0.07 -0.6 -0.31 0.08 -0.13 0.68
0.04 0.14 -0.07 -0.59 -0.25 0.5
0.11 0.01 -0.21 -0.25 -0.2 0.42
0.17 0.13 -0.31 -0.19 -0.31 0.37
-0.25 -0.21 -0.13 0.12 -0.16 0.48
-0.26 -0.53 -0.12 0.2 -0.07 0.53
0.02 -0.15 -0.01 -0.2 -0.08 0.35
-0.1 -0.3 -0.12 -0.12 -0.17 0.61
0.29 -0.35 -0.28 -0.36 0.09 0.4
0.07 0.06 -0.21 -0.35 -0.03 0.35
0.07 -0.18 0.02 -0.34 -0.16 0.45
-0.14 -0.26 -0.02 0.04 -0.29 0.51
-0.13 -0.21 -0.44 -0.3 -0.57 1.0
-0.3 -0.53 0.14 0.18 -0.07 0.38
-0.29 -0.53 0.08 0.11 -0.24 0.59
-0.12 -0.38 -0.03 -0.52 -0.42 0.92
-0.02 0.1 -0.23 -0.11 -0.15 0.33
-0.19 -0.54 -0.19 -0.06 -0.01 0.69
-0.03 0.09 -0.32 -0.14 -0.14 0.42
-0.07 -0.1 -0.19 -0.16 0.14 0.31
-0.31 -0.51 0.23 0.1 -0.39 0.57
0.03 -0.02 -0.14 -0.53 -0.11 0.54
-0.04 -0.17 -0.29 -0.47 -0.23 0.8
0.05 -0.08 -0.26 -0.32 -0.3 0.65
0.1 -0.19 0.07 -0.39 -0.17 0.43
-0.11 -0.05 -0.01 -0.25 -0.05 0.38

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.