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Heatmap: Cluster_3 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
1.5 h after dark
5.5 h after dark
9.5 h after dark
1.28 -0.91 -2.79 -1.59 -0.44 0.88
0.24 -0.04 -0.3 -0.11 -0.02 0.17
0.7 0.22 0.38 -0.99 -0.79 -0.27
-0.02 1.05 -0.45 -0.77 -0.57 -0.08
0.26 0.07 -0.19 -0.24 -0.12 0.16
0.83 -0.81 -0.85 -0.39 -0.16 0.52
0.01 0.61 -0.06 -0.6 -0.33 0.08
0.3 0.01 -0.15 -0.15 -0.02 -0.04
0.25 0.23 -0.31 -0.22 -0.18 0.13
0.03 0.21 -0.09 -0.02 -0.07 -0.07
0.55 -0.54 -0.49 -0.2 0.18 0.19
0.57 0.11 -0.23 -0.58 -0.13 0.0
0.24 -0.04 -0.57 0.02 0.01 0.21
0.09 -0.43 -0.55 0.27 0.67 -0.49
0.7 -0.21 -0.21 -0.16 -0.18 -0.2
0.3 -0.02 -0.43 -0.38 -0.08 0.41
1.3 -0.89 -0.89 -1.03 -0.43 0.3
0.08 -0.16 -0.19 0.11 0.14 -0.02
0.67 -0.37 -0.35 -0.3 0.2 -0.18
0.46 -0.7 -0.46 0.0 0.49 -0.2
1.08 -0.06 -1.15 -0.82 -0.27 0.11
0.37 -0.27 -0.7 -0.3 0.33 0.25
0.85 0.15 -1.03 -0.66 -0.08 0.02
0.1 0.25 -0.27 -0.44 0.12 0.12
1.16 -0.48 0.37 -0.68 -1.09 -0.59
0.15 0.03 0.01 -0.12 -0.03 -0.05
0.6 0.09 -0.37 -0.73 -0.1 0.15
0.39 0.06 0.09 -0.31 -0.4 0.02
0.97 -1.33 -2.4 -1.18 0.24 0.87
0.22 -0.12 -0.34 -0.0 0.04 0.13
2.1 -1.45 -1.57 -1.92 -1.71 -1.23
1.44 -0.83 -0.73 -0.64 -0.64 -0.25
0.12 0.58 -0.06 -0.51 -0.4 -0.0
0.57 -0.42 -0.78 0.01 0.13 0.11
-0.69 1.78 -1.06 -1.39 -1.11 -0.67
-0.22 0.4 0.21 -0.33 -0.39 0.15
0.26 0.19 -0.06 -0.64 -0.05 0.13
1.42 -0.01 -1.8 -1.59 -1.29 0.39
0.26 0.16 -0.25 -0.19 -0.09 0.05
0.6 -0.14 -0.62 -0.8 0.22 0.25
0.22 0.09 -0.07 -0.19 -0.23 0.13
0.7 0.17 -0.7 -0.76 -0.19 0.22
0.24 0.09 -0.38 -0.21 -0.03 0.19
-0.22 0.17 0.05 -0.04 0.24 -0.28
0.69 0.0 -0.6 -0.73 -0.1 0.25
0.29 -0.35 -0.67 0.08 0.33 0.08
0.2 0.17 -0.09 -0.23 -0.16 0.05
-0.13 0.36 0.15 0.07 -0.42 -0.16
1.09 -0.33 0.04 -1.13 -0.22 -0.44
0.61 -0.69 -0.95 -0.09 0.34 0.18
0.22 0.51 -0.2 -0.77 -0.46 0.3
0.29 0.25 -0.36 -0.49 -0.01 0.14
0.56 0.11 -0.96 -0.14 -0.12 0.14
1.12 -0.54 0.29 -0.55 -0.91 -0.51
0.04 0.05 -0.38 -0.08 0.23 0.07
0.29 -0.11 0.11 -0.55 0.03 0.09
0.55 0.6 -1.41 -0.88 -0.54 0.5
0.4 0.27 0.13 -0.19 -0.4 -0.42
0.7 -0.64 -0.31 0.1 -0.13 -0.08
0.38 -0.06 0.06 -0.38 -0.1 -0.0
0.39 0.02 -0.67 -0.07 0.09 0.05
0.64 -0.0 -0.08 -0.62 -0.29 0.04
0.51 -0.02 -0.33 -0.16 -0.14 -0.01
0.64 -0.57 -1.23 0.25 0.09 0.13
0.5 0.02 -0.17 -0.24 -0.44 0.15
1.02 -0.17 -0.41 -0.57 -0.55 -0.02
0.12 0.22 -0.18 -0.22 0.02 -0.01
0.29 0.2 -0.22 -0.46 -0.09 0.15
0.47 0.07 -0.32 -0.36 -0.31 0.23
0.6 -0.63 -1.23 0.21 0.15 0.19
0.45 -0.52 -0.96 0.02 0.38 0.14
0.25 0.15 -0.12 -0.37 -0.02 0.02
0.0 0.81 0.03 -0.77 -0.59 -0.05
1.28 -1.29 -2.66 -1.56 -0.41 0.94
0.4 0.06 0.08 -0.28 -0.58 0.12
0.2 -0.1 -0.07 -0.02 0.28 -0.38
0.3 0.03 -0.22 0.01 -0.58 0.28
0.17 0.12 -0.19 -0.05 -0.13 0.04
0.7 0.25 -0.56 -0.61 -0.01 -0.21
0.32 0.27 0.13 -0.71 -0.31 0.04
0.48 0.42 -0.39 -0.89 0.05 -0.1
0.55 -0.21 0.18 -0.74 -0.1 0.02
1.21 -0.16 -0.85 -0.79 -0.57 -0.03
0.39 0.3 -0.86 -0.73 0.07 0.33
0.49 -0.36 -0.38 -0.12 0.03 0.15
1.05 -1.09 -1.47 -1.65 -1.53 1.29
0.17 -0.77 -0.53 0.15 0.57 0.01
0.69 0.22 -1.14 -0.59 0.04 0.11
-0.55 1.07 -0.36 -0.39 -0.28 -0.23
0.8 -0.55 -0.81 -1.01 -0.64 0.9
0.19 0.31 -0.23 -0.33 -0.11 0.06
-0.02 0.47 -0.32 -0.09 -0.14 -0.03
0.7 0.04 -0.94 -1.14 0.16 0.33
0.09 -0.23 -0.41 0.01 0.24 0.19
-0.22 0.57 0.09 -0.1 0.03 -0.66
0.72 0.25 -0.62 0.17 -0.4 -0.68
-0.17 1.15 -0.39 -0.72 -0.68 -0.17
0.17 0.14 -0.15 -0.25 -0.07 0.11
0.2 0.21 -0.13 -0.33 -0.16 0.11
1.28 0.58 -1.22 -1.59 -1.66 0.01
1.67 -0.16 -3.13 -2.28 -0.87 0.07
0.49 -0.19 -0.46 -0.13 0.19 -0.08
0.61 -0.44 -0.33 -0.95 -0.67 0.85
0.21 0.2 -0.09 -0.44 0.34 -0.41
0.26 0.09 -0.21 -0.23 -0.21 0.21
0.68 0.2 0.38 -0.9 -0.39 -0.64
0.35 -0.0 -0.29 -0.13 -0.02 0.01
-0.06 0.18 -0.11 -0.21 0.35 -0.24
0.31 -0.12 -0.25 -0.09 -0.08 0.15
0.97 -0.21 -0.24 -0.53 -0.65 0.01
0.39 -0.11 -0.46 -0.17 0.07 0.14
1.17 0.34 -0.55 -0.86 -0.7 -0.64
0.23 0.12 -0.18 -0.28 -0.02 0.07
0.35 0.17 0.21 -0.3 -0.67 -0.0
0.01 0.29 0.18 -0.22 -0.37 0.02
0.18 -0.46 -0.61 0.17 0.45 0.0
0.12 -0.51 0.01 -0.08 0.5 -0.25
0.45 0.34 -0.41 -0.66 -0.11 0.08
0.76 -0.09 -1.33 -0.34 0.56 -0.5
0.05 -0.01 -0.12 0.02 -0.11 0.15
0.45 -0.45 0.23 -0.11 -0.39 0.06
0.25 -0.09 -0.22 -0.26 0.1 0.14
1.28 -0.17 -0.28 -0.49 -0.8 -0.82
0.3 -0.49 -0.88 -0.61 0.74 0.25
0.4 0.3 -0.43 -0.6 -0.1 0.16
0.36 -0.36 -0.03 -0.1 -0.07 0.1
0.71 -0.14 -0.5 -0.43 -0.08 0.08
0.57 -0.54 -0.97 -0.32 0.14 0.5
0.74 -0.72 -1.41 -0.07 0.17 0.34
0.06 -0.14 0.09 -0.1 0.08 0.01
0.25 0.2 -0.39 -0.02 0.18 -0.36
0.03 0.74 -0.37 -0.62 -0.21 0.03
1.12 -0.82 -0.66 -0.61 -0.46 0.32
0.42 0.14 -0.43 -0.05 -0.3 0.06
0.36 -0.01 -0.29 -0.38 -0.25 0.38
0.4 -0.53 -0.42 -0.4 0.55 0.03
0.06 0.17 -0.02 -0.0 -0.28 0.03
0.38 -0.31 -0.72 0.07 0.31 -0.01
0.12 0.26 -0.19 -0.27 0.08 -0.07
0.7 -0.12 -0.33 -0.62 -0.03 0.04
0.04 0.15 0.07 -0.33 -0.01 0.03
1.76 -0.85 -2.33 -2.73 -2.26 0.59
0.06 -0.3 0.09 -0.07 -0.39 0.45
0.36 -0.25 -1.17 -0.14 0.51 0.14
-0.01 -0.32 -0.12 0.11 0.16 0.12
0.46 -0.58 -0.71 0.21 0.11 0.14
0.11 -0.23 -0.6 0.13 0.33 0.08
0.22 -0.12 -0.1 0.04 0.21 -0.33
0.95 -0.48 -1.07 -0.38 -0.9 0.65
-1.08 2.0 -1.37 -1.69 -1.55 -1.05
-0.01 0.63 -0.28 -0.56 -0.24 0.15
1.71 0.51 -2.3 -2.74 -2.6 -0.34
0.7 -0.1 -0.11 -0.51 -0.21 -0.09
0.49 -0.35 -0.5 -0.43 0.62 -0.28
0.17 -0.22 -0.02 0.23 -0.38 0.12
-0.07 0.1 -0.04 0.07 0.03 -0.09
0.42 0.17 0.16 -0.21 -0.37 -0.36
0.23 0.0 -0.26 -0.13 -0.13 0.22
0.63 -0.69 -0.8 -0.36 0.07 0.51
0.35 -0.48 -0.3 0.07 0.2 -0.02
0.05 -0.17 -0.32 0.0 0.26 0.1
0.81 0.07 -0.47 -0.53 -0.37 -0.0
0.27 -0.13 -0.23 -0.15 0.05 0.12
0.34 0.04 -0.13 -0.38 -0.06 0.09
0.13 -0.23 -0.9 0.19 0.32 0.17
-0.16 -0.05 -0.18 -0.0 0.3 0.04
0.88 -0.21 -0.35 -0.32 -0.57 0.05
0.22 -0.35 -0.32 0.18 0.38 -0.31
0.06 0.35 0.16 -0.47 -0.26 0.01
0.63 0.34 -0.11 -0.43 -0.3 -0.51
0.66 -0.09 -0.45 -0.4 0.13 -0.15
0.08 0.08 -0.11 -0.06 0.12 -0.14
0.66 -0.55 -0.69 0.37 0.08 -0.38
0.33 0.27 -0.23 -0.35 -0.35 0.16
0.23 -0.01 -0.22 -0.29 0.08 0.13
0.92 0.18 -0.43 -0.77 -0.51 -0.09
0.52 0.44 -0.52 -1.09 0.52 -0.71
-0.04 1.07 -0.56 -0.34 -0.81 -0.17
0.27 -0.11 0.25 -0.81 -0.82 0.62
0.22 0.19 -0.18 -0.18 -0.23 0.11
0.25 -0.05 -0.14 -0.05 0.17 -0.24
0.7 -0.08 -0.19 -0.25 -0.19 -0.27
0.25 -0.13 -0.32 0.08 -0.07 0.11
1.13 0.17 -1.12 -1.4 -0.87 0.37
0.11 0.1 -0.17 -0.16 0.03 0.06
0.35 0.41 -2.04 -0.78 -0.1 0.71
0.46 0.13 -0.22 -0.22 -0.23 -0.05
0.08 0.43 -0.44 -0.23 0.23 -0.28
0.6 -0.08 -0.51 -0.3 -0.17 0.19
2.14 -1.49 -1.72 -1.87 -1.83 -1.44
-0.51 0.53 0.08 -0.24 0.08 -0.16
1.17 -0.49 -0.88 -0.99 -1.06 0.6
0.53 -0.04 -0.13 -0.04 -0.34 -0.14
0.16 0.08 0.11 -0.43 -0.07 0.07
0.95 0.18 -0.59 -0.43 -0.53 -0.26

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.