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Heatmap: Cluster_114 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
1.5 h after dark
5.5 h after dark
9.5 h after dark
-0.64 -0.51 0.02 0.34 0.4 0.08
-0.6 -0.37 -0.59 0.05 0.7 0.31
-0.17 -0.17 -0.24 -0.04 0.41 0.11
-0.3 -0.7 -0.04 0.45 0.43 -0.17
-1.1 -1.41 -0.31 0.52 0.97 -0.07
-0.36 -0.16 -0.15 0.16 0.45 -0.09
-0.3 -0.37 -0.07 0.13 0.35 0.12
-0.58 -1.11 -0.3 0.42 0.87 -0.17
-0.49 -0.82 -0.19 0.23 0.67 0.11
-0.32 -0.24 -0.07 0.09 0.45 -0.05
-0.5 -0.41 -0.32 0.39 0.65 -0.22
-0.44 -0.53 -0.28 0.03 0.59 0.28
-0.22 -0.27 0.01 0.09 0.27 0.05
-0.62 -0.9 -0.61 0.33 0.8 0.21
-0.63 -0.57 -0.09 0.21 0.5 0.23
-0.28 -0.85 0.11 0.22 0.48 -0.03
-0.24 -0.26 -0.31 -0.01 0.53 0.1
-0.67 -0.84 -0.58 0.36 0.84 0.1
-0.47 -0.7 -0.34 0.28 0.67 0.1
-0.73 -0.47 -0.08 0.45 0.39 0.06
-0.87 -0.88 -0.64 0.68 0.77 -0.05
-0.63 -0.22 -0.53 0.34 0.39 0.28
-0.83 -0.54 0.02 0.16 0.45 0.33
-0.19 -0.12 -0.08 -0.01 0.36 -0.02
-0.33 -0.5 -0.1 0.34 0.45 -0.1
-0.19 -0.25 0.03 0.01 0.26 0.08
-0.35 -0.94 -0.3 0.48 0.72 -0.25
-0.43 -1.41 -0.57 0.27 0.83 0.3
-0.14 -0.32 -0.26 0.27 0.36 -0.05
-0.45 -0.59 -0.11 0.18 0.6 0.04
-0.36 -0.5 -0.41 0.16 0.75 -0.06
-0.27 -0.43 -0.29 0.26 0.67 -0.28
-0.72 -1.73 -0.45 0.47 0.72 0.4
-0.37 -0.53 -0.15 0.34 0.5 -0.06
-0.25 -0.22 -0.4 0.05 0.44 0.2
-2.66 -3.8 -2.27 0.68 1.36 0.49
-0.18 -0.24 -0.09 0.03 0.44 -0.07
-0.17 -0.2 -0.01 0.05 0.13 0.17
-0.48 -0.7 -0.18 0.48 0.51 -0.07
-0.39 -0.48 -0.37 0.51 0.45 -0.06
-0.29 -0.27 -0.01 0.19 0.24 0.06
-0.38 -0.76 -0.36 0.4 0.78 -0.27
-0.69 -0.41 -0.02 0.51 0.56 -0.41
-0.31 -0.23 -0.08 0.11 0.34 0.07
-0.55 -0.33 -0.14 0.3 0.59 -0.18
-0.47 -0.48 -0.18 0.25 0.54 0.05
-0.58 -0.62 -0.5 0.28 0.63 0.27
-0.9 -0.68 -0.33 0.36 0.6 0.31
-0.57 -1.56 -0.44 0.31 0.8 0.34
-0.72 -0.44 -0.14 0.2 0.58 0.14
-2.25 -1.68 -0.24 0.59 1.14 -0.12
-0.28 -0.39 -0.28 0.19 0.61 -0.11
-0.69 -0.27 -0.15 0.36 0.64 -0.31
-0.67 -0.84 -0.42 0.68 0.52 0.04
-0.09 -0.19 -0.17 -0.1 0.38 0.09
-0.26 -0.2 0.08 0.18 0.11 0.04
-0.81 -0.84 -0.4 0.48 0.79 -0.01
-0.28 -0.23 -0.02 0.11 0.2 0.15
-0.17 -0.25 -0.12 0.1 0.32 0.05
-0.84 -0.69 -0.45 0.45 0.65 0.21
-1.04 -1.14 -0.31 0.61 1.02 -0.53
-0.15 -0.33 0.02 0.16 0.19 0.05
-0.26 -0.16 -0.06 0.14 0.42 -0.2
-0.4 -0.16 -0.03 0.08 0.38 0.01
-1.2 -1.25 -0.3 0.56 1.02 -0.27
-0.9 -0.58 -0.1 0.19 0.79 -0.01
-0.5 -0.43 -0.32 0.14 0.56 0.24
-0.15 -0.12 -0.05 0.1 0.3 -0.12
-0.38 -0.15 -0.06 0.17 0.34 -0.03
-0.53 -0.55 -0.26 0.53 0.52 -0.13
-0.4 -0.52 -0.0 0.24 0.4 0.06
-0.28 -0.22 -0.26 0.11 0.58 -0.13
-0.53 -0.2 -0.11 0.09 0.45 0.12
-0.55 -0.73 -0.35 0.55 0.71 -0.27
-0.36 -0.48 -0.23 0.47 0.46 -0.17
-0.34 -0.69 -0.12 0.17 0.55 0.11
-0.56 -0.24 -0.19 -0.02 0.68 0.01
-0.46 -0.47 -0.31 0.47 0.35 0.11
-0.82 -0.72 -0.19 0.46 0.83 -0.33
-0.44 -0.3 -0.13 0.5 0.57 -0.67
-0.32 -1.58 -0.68 0.33 0.85 0.23
-1.44 -1.28 -0.42 0.4 1.04 0.12
-0.7 -1.03 -0.67 0.25 0.99 0.13
-0.44 -0.78 -0.34 0.23 0.66 0.19
-0.43 -0.27 0.05 0.2 0.28 0.04
-0.26 -0.19 -0.27 0.0 0.37 0.22
-0.13 -0.41 -0.15 0.24 0.2 0.14
-0.2 -0.16 -0.2 0.03 0.41 0.01
-0.32 -0.36 -0.66 -0.03 0.63 0.33
-0.27 -0.12 -0.27 -0.02 0.37 0.2
-0.19 -0.59 -0.21 0.28 0.41 0.07
-0.43 -0.44 -0.23 0.25 0.44 0.17
-0.59 -0.49 -0.15 0.24 0.53 0.14
-0.65 -2.23 -0.65 0.3 1.0 0.37
-0.5 -0.93 -0.06 0.41 0.6 -0.04
-0.61 -0.45 -0.34 0.16 0.71 0.1
-0.51 -0.72 -1.21 0.41 1.0 -0.1
-0.18 -0.21 -0.1 0.12 0.28 0.04
-0.28 -0.33 0.02 0.0 0.36 0.12
-0.85 -0.74 -0.25 0.33 0.64 0.25
-0.31 -0.42 -0.28 0.34 0.33 0.13
-0.38 -0.52 -0.22 0.16 0.48 0.22
-0.53 -0.21 -0.34 0.08 0.54 0.19
-0.21 -0.27 -0.1 0.13 0.39 -0.03
-0.34 -0.17 -0.08 -0.0 0.43 0.05
-0.25 -0.16 -0.03 0.07 0.28 0.02
-0.17 -0.05 -0.09 0.03 0.33 -0.1
-0.32 -0.18 -0.08 0.27 0.37 -0.19
-0.28 -0.11 -0.13 0.1 0.35 -0.01
-0.72 -0.5 0.06 0.51 0.5 -0.33
-1.3 -1.75 -1.34 0.26 1.09 0.65
-0.39 -0.31 -0.21 0.23 0.34 0.17
-1.22 -1.3 -0.43 0.65 0.63 0.38
-0.28 -0.3 -0.13 0.17 0.41 -0.01
-0.53 -0.46 -0.35 0.47 0.46 0.06
-0.24 -0.43 -0.14 0.13 0.44 0.08
-0.81 -0.47 -0.01 0.26 0.75 -0.26
-0.57 -0.66 -0.63 0.18 0.61 0.47
-0.15 -0.13 -0.3 -0.12 0.44 0.12
-0.16 -0.65 -0.32 0.38 0.44 0.01
-0.3 -0.13 -0.05 0.05 0.28 0.08
-0.47 -0.42 -0.49 0.22 0.63 0.14
-0.66 -1.17 -0.78 0.41 0.81 0.33
-0.25 -0.63 -0.47 0.13 0.49 0.38
-0.68 -0.57 -0.05 0.5 0.62 -0.34
-0.73 -0.33 -0.12 0.26 0.6 -0.04
-0.67 -0.61 -0.3 0.12 0.68 0.28
-0.29 -0.43 -0.22 0.05 0.52 0.16
-0.94 -1.16 -0.13 0.43 0.87 -0.09
-0.3 -0.53 -0.21 0.5 0.43 -0.21
-0.75 -0.55 -0.13 0.42 0.56 -0.01
-0.42 -0.66 -0.2 0.28 0.56 0.08
-0.3 -0.2 0.05 0.16 0.22 -0.01
-1.01 -0.49 -0.32 0.22 0.68 0.3
-0.42 -0.45 -0.33 -0.07 0.58 0.36
-0.27 -0.32 -0.08 0.21 0.41 -0.09
-0.39 -0.39 -0.15 -0.04 0.49 0.26
-0.23 -0.35 -0.25 0.11 0.55 -0.02
-0.54 -0.41 0.17 -0.05 0.47 0.11
-0.3 -0.65 -0.44 -0.02 0.52 0.48
-0.54 -0.6 -0.39 0.2 0.52 0.39
-1.03 -0.85 -0.39 0.56 0.64 0.21
-0.44 -0.6 -0.75 0.34 0.87 -0.14
-0.71 -0.69 -0.31 0.25 0.91 -0.15
-0.61 -0.55 -0.06 0.35 0.5 0.02
-0.15 -0.35 -0.29 0.22 0.44 -0.04
-0.36 -0.43 -0.24 0.22 0.47 0.1
-0.49 -0.4 -0.2 0.13 0.71 -0.1
-0.52 -0.22 -0.23 0.36 0.52 -0.2
-0.21 -0.36 -0.17 0.18 0.32 0.11
-0.91 -0.7 -0.09 0.5 0.59 -0.02
-0.33 -0.36 -0.44 -0.02 0.58 0.28
-0.51 -0.72 -0.44 0.39 0.73 -0.02
-0.35 -0.58 -0.31 0.01 0.63 0.26
-0.54 -0.63 0.09 0.12 0.71 -0.2
-0.34 -0.55 -0.43 0.39 0.32 0.29
-0.75 -0.79 -0.4 0.17 0.91 0.09
-0.55 -0.38 -0.18 0.28 0.62 -0.12
-0.12 -0.33 -0.23 0.17 0.44 -0.07
-0.23 -0.15 -0.11 0.05 0.34 0.03
-0.65 -0.88 -0.1 0.17 0.7 0.19
-0.3 -0.48 -0.62 0.22 0.76 -0.05
-0.73 -0.79 -0.12 0.31 0.61 0.17
-0.16 -0.52 -0.31 0.27 0.34 0.18
-0.47 -0.35 -0.57 0.01 0.72 0.22
0.07 -0.44 -0.23 0.05 0.36 0.06
-1.29 -1.44 -1.54 0.65 1.24 -0.07
-0.34 -0.17 -0.25 0.21 0.35 0.06
-0.2 -0.34 -0.02 0.18 0.23 0.07
-0.15 -0.43 0.0 0.28 0.25 -0.07
-0.56 -0.45 -0.75 0.45 0.81 -0.21
-0.43 -0.81 -0.11 0.07 0.58 0.28
-0.44 -0.5 -0.06 0.22 0.5 0.03
-0.51 -0.64 -0.09 0.31 0.52 0.06
-0.43 -0.4 -0.23 0.01 0.61 0.16
-0.83 -1.87 -0.2 0.46 0.85 0.17
-0.32 -0.46 -0.05 0.13 0.41 0.12
-1.25 -1.66 -0.44 0.52 1.02 0.09
-0.15 -0.47 -0.52 0.08 0.63 0.1
-0.43 -0.45 -0.45 0.23 0.6 0.14
-0.55 -0.66 -0.51 0.42 0.73 -0.02
-0.63 -0.72 -0.28 0.23 0.66 0.22
-0.4 -0.2 -0.34 0.38 0.58 -0.34
-0.52 -0.6 -0.03 0.28 0.56 -0.03
-0.62 -0.33 -0.16 0.29 0.48 0.07
-0.53 -0.36 -0.02 0.26 0.43 0.01
-0.54 -0.63 0.02 0.15 0.62 0.01
-0.5 -0.52 -0.54 0.32 0.65 0.13
-0.12 -0.39 -0.46 0.09 0.28 0.39
-0.13 -0.17 -0.08 0.03 0.22 0.1
-0.41 -0.28 -0.31 -0.08 0.55 0.27
-0.41 -0.5 -0.67 0.18 0.8 0.05
-0.33 -0.5 -0.25 0.07 0.56 0.18
-0.24 -0.16 -0.17 0.09 0.35 0.05
-0.4 -0.58 -0.09 0.18 0.55 0.05
-0.46 -0.17 -0.13 0.3 0.33 -0.03
-0.2 -1.89 -0.7 0.41 0.7 0.37
-0.83 -0.34 -0.23 0.02 0.8 0.05
-0.3 -0.32 -0.16 0.17 0.39 0.09
-0.24 -0.69 -0.72 -0.07 0.71 0.41
-0.75 -0.62 -0.01 0.41 0.36 0.21
-0.97 -0.82 -0.1 0.53 0.85 -0.41
-0.12 -0.26 -0.02 0.07 0.31 -0.04
-1.2 -1.23 -0.51 0.73 0.65 0.27
-0.94 -0.9 -0.29 0.29 0.81 0.2
-0.45 -0.68 -0.04 0.36 0.47 0.01
-0.46 -0.31 0.03 0.08 0.38 0.11

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.