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Heatmap: cluster_0001 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
-1.45 0.09 -0.65 1.06 -0.92 0.4
-1.94 -1.37 -2.09 1.52 -0.65 0.69
-1.13 -0.62 -1.55 1.38 -0.77 0.45
-1.47 0.57 -1.54 0.46 -0.3 0.7
-0.53 0.67 -0.92 0.48 -0.43 0.07
-0.53 -0.83 -0.91 0.91 -0.27 0.58
-1.65 -1.62 -1.68 2.07 -2.18 -0.65
-0.43 -0.01 -0.07 0.65 -0.52 0.07
-3.85 -0.05 -0.54 1.73 -2.05 -0.46
-1.58 0.83 -2.25 0.39 -1.47 1.01
-1.12 -0.73 -0.82 1.46 -0.37 -0.25
-0.86 0.08 -0.82 1.7 -1.62 -1.95
-0.41 0.62 -1.07 1.1 -1.09 -0.69
-1.95 0.33 -1.88 0.37 -0.09 0.99
-0.6 0.57 -0.51 0.8 -1.1 -0.07
-0.2 -1.73 -1.29 1.7 -0.58 -0.98
-0.59 -0.38 -0.57 0.68 0.27 0.11
-0.23 -1.16 -1.09 1.3 -1.71 0.55
-0.23 -0.22 -0.71 0.35 0.35 0.18
-0.46 0.37 -0.17 0.41 -0.46 0.07
-1.39 -0.35 -1.53 1.09 -0.03 0.48
-0.27 -0.04 -0.05 0.12 0.13 0.07
-0.98 0.28 0.02 0.8 -0.24 -0.55
-0.83 0.72 -1.0 0.81 -0.53 -0.25
-0.54 0.82 -1.44 0.72 0.08 -1.09
-1.34 0.59 -0.65 0.98 0.05 -1.14
-1.24 -0.65 -0.6 1.3 -0.34 0.05
-1.24 1.11 -0.63 1.14 -2.0 -1.66
-0.5 0.37 -0.66 0.27 -0.11 0.3
0.3 -1.79 -1.59 1.68 -0.69 -1.65
-2.37 -2.2 -1.46 2.15 -1.2 -1.56
1.24 0.29 -0.14 -0.58 -3.09 -0.48
-0.77 -0.44 -0.66 1.37 -1.08 -0.02
-0.02 -0.19 -0.43 1.26 -1.13 -0.87
0.1 -1.73 -1.1 1.27 -0.72 0.19
-1.12 -0.82 -0.43 1.5 -0.27 -0.8
-1.29 -1.07 -1.12 1.92 -0.91 -1.57
-0.0 -1.39 -0.84 1.52 -0.51 -1.02
-0.7 0.44 -1.67 0.74 0.21 -0.17
-0.57 0.21 -0.21 0.74 -0.26 -0.34
-0.37 -0.33 -0.37 1.0 -0.05 -0.53
-0.34 -0.32 -0.12 0.71 -0.58 0.24
0.51 -0.3 -0.0 0.03 0.04 -0.48
0.03 -0.42 -1.05 1.06 -0.64 0.03
-1.08 0.75 -0.17 0.65 -0.83 -0.28
-1.66 0.49 0.05 1.15 -0.64 -1.37
0.16 0.24 0.5 0.19 -1.79 -0.22
-0.76 -1.59 -1.26 1.41 -2.01 0.82
-0.02 -0.01 -0.47 -0.14 0.29 0.22
-0.23 -0.13 -0.02 0.31 -0.05 0.06
0.18 -0.02 0.01 -0.06 0.03 -0.16
-0.23 -0.5 -0.26 0.81 -1.01 0.44
-0.98 -0.18 -0.05 0.59 -0.01 0.2
-0.99 -1.04 -0.52 1.58 -0.52 -0.7
-0.93 -1.18 -1.43 1.83 -0.99 -0.72
-2.45 -0.12 -0.47 0.73 -0.01 0.6
0.39 0.16 -2.23 0.48 -0.57 0.36
-0.35 0.19 -0.06 0.66 -0.2 -0.6
-0.75 0.14 -0.42 0.5 -0.18 0.34
-0.28 -1.3 -1.0 1.63 -0.4 -1.28
-0.68 -1.08 -0.16 1.6 -1.11 -0.99
-0.15 0.39 -0.67 0.69 -0.71 -0.09
0.0 0.02 -0.53 1.19 -1.48 -0.6
-0.89 0.3 -0.16 1.29 -0.85 -1.62
-0.55 -0.67 -0.98 0.92 -0.13 0.45
-0.71 -0.87 -1.09 1.61 -0.44 -0.79
-0.69 -0.89 0.24 1.08 0.0 -0.89
0.33 -0.06 0.16 -0.49 0.51 -0.9
-0.19 0.34 -0.35 0.59 -0.75 -0.04
-0.11 -0.01 -0.14 0.12 -0.03 0.14
-2.05 0.81 -0.91 1.13 -0.82 -0.47
-0.87 -1.11 -0.77 1.12 -1.11 0.82
-1.03 -0.9 -0.33 1.46 -0.33 -0.65
0.08 -1.56 -0.54 1.52 -2.04 -0.33
-1.26 -1.37 0.07 1.43 -1.26 0.04
-0.92 -0.68 -1.06 1.7 -0.54 -1.19
-1.77 0.91 -1.66 0.75 0.46 -1.17
-0.96 -0.15 -0.9 1.19 -1.49 0.49
-1.0 -0.11 0.17 0.73 -0.87 0.31
-0.9 -0.6 -0.3 1.54 -1.18 -0.62
-1.08 -1.67 -1.23 2.01 -1.53 -1.29
-1.16 -0.71 -0.36 0.96 -0.87 0.74
-1.09 0.47 -0.7 0.58 0.46 -0.6
-0.51 -0.97 -0.1 1.39 -1.37 -0.24
-0.15 -0.22 -0.06 0.22 -0.08 0.23
-0.38 0.24 -1.56 1.06 -1.3 0.28
0.65 0.34 0.04 -0.32 -0.35 -0.85
0.01 -1.56 0.51 1.07 -0.45 -1.31
-0.96 -2.05 -1.41 1.82 -0.32 -0.88
-1.98 -1.53 -1.95 1.79 -0.22 -0.3
-0.27 0.01 -0.16 0.08 0.09 0.2
-1.3 -0.74 -0.58 1.44 -0.32 -0.29
-1.1 -0.84 0.42 1.23 -0.64 -0.64
-0.88 -0.82 -0.91 1.57 -1.44 0.02
-1.08 -0.65 -0.43 1.33 0.21 -1.08
-2.69 -1.73 0.13 1.57 0.07 -1.2
0.46 -0.03 -0.05 -0.21 -0.08 -0.2
-1.22 0.62 -1.13 0.68 0.29 -0.39
-1.34 0.69 -1.76 0.43 0.07 0.38
-0.64 0.3 -0.94 1.19 -0.34 -0.91
-2.07 -1.14 -0.44 1.55 0.03 -0.67
0.13 -0.12 0.02 -0.08 -0.15 0.18
-1.3 -1.06 -1.06 1.64 0.01 -0.96
-1.01 -0.36 -0.86 1.37 -0.04 -0.72
-1.04 0.12 0.07 0.83 -0.32 -0.33
-0.78 0.43 -1.45 0.78 0.4 -0.59
-0.54 -0.49 -0.59 1.28 -0.49 -0.35
-0.39 -0.11 -1.3 1.5 -0.53 -1.37
-0.39 -0.24 -0.69 1.2 -1.0 -0.03
0.04 -0.0 0.13 0.05 -0.05 -0.18
-0.23 0.78 -0.33 0.89 -1.33 -1.43
-1.67 0.87 -0.28 1.02 -1.53 -0.6
-1.72 -0.4 -0.99 1.24 -1.27 0.73
-1.13 0.16 -1.14 0.28 -0.07 0.85
-1.68 -0.58 -0.37 0.92 -1.08 0.91
-0.36 -1.04 -1.36 1.82 -0.81 -2.12
-0.49 0.85 -1.49 1.21 -1.31 -1.27
-0.9 -0.18 -1.91 0.23 0.3 0.94
-0.71 -1.0 -0.58 1.34 -0.23 -0.25
-0.73 -0.22 -0.25 0.91 -0.93 0.37
-1.49 -2.58 -0.82 1.42 -0.51 0.62
-1.95 1.16 -0.29 1.06 -1.89 -1.53
0.28 0.01 0.03 -0.08 0.31 -0.79
-0.05 -0.05 -0.21 0.06 0.06 0.15
-1.67 -0.77 -0.28 1.25 0.12 -0.32
-3.1 -2.16 -0.03 1.2 -0.78 0.85
-1.74 -0.34 -0.2 1.16 -0.04 -0.24
-1.38 -2.22 -0.72 1.53 -1.03 0.51
-1.82 0.55 -1.03 0.2 0.13 0.6
-1.54 -1.37 -2.02 1.47 -1.95 1.0
0.58 0.06 -0.04 -0.05 -0.39 -0.39
-0.08 -0.07 -0.38 0.97 -1.22 -0.08
0.03 -0.03 0.34 0.13 -0.02 -0.62
-0.81 0.6 -1.64 0.34 -1.72 1.02
-1.16 -0.58 -0.49 1.28 0.02 -0.45
-1.93 -0.88 -0.33 1.39 -0.1 -0.25
-0.18 0.03 -0.17 0.06 -0.61 0.59
-1.0 -1.5 -1.37 2.03 -1.65 -1.47
-0.24 -0.35 -0.37 1.28 -0.7 -0.85
-2.38 -0.42 -0.71 1.71 -0.96 -0.57
0.33 -0.42 -1.53 1.23 -1.04 -0.29
-0.87 0.5 -1.15 1.35 -0.9 -0.99
-2.61 0.05 -2.1 1.79 -1.3 -0.5
0.43 0.09 -1.24 0.79 -1.15 -0.02
-0.67 -0.64 -1.06 1.56 -0.44 -0.81
-0.03 -2.43 -1.87 1.6 0.15 -1.28
-1.35 0.26 -1.18 0.36 -0.11 0.82
-2.18 0.62 -0.79 1.09 -1.41 0.22
-1.43 -1.07 0.26 1.59 -0.78 -1.5
0.77 -0.14 -0.01 -0.17 0.06 -1.14
-0.16 0.04 -0.16 0.23 0.04 -0.03
-0.45 -0.29 -0.12 0.74 0.06 -0.28
-1.43 -0.5 -0.73 1.13 -1.57 0.84
-0.63 0.55 -0.79 1.09 -0.99 -0.58
0.02 -0.37 -0.61 0.57 -0.04 0.13
-0.36 0.58 -0.98 0.77 -1.2 0.11
-1.13 0.64 -1.29 0.33 0.67 -0.46
0.09 0.2 -0.05 -0.14 0.52 -1.07
-0.45 -0.71 -0.33 1.41 -0.84 -0.64
-2.19 -0.34 -0.14 1.65 -1.08 -1.1
-2.62 0.29 -0.69 0.6 0.27 0.35
-0.99 -0.18 -0.6 1.35 -0.14 -0.99
-0.53 -2.44 -2.11 1.48 -1.19 0.73
0.19 0.06 0.53 0.18 -1.39 -0.22
-0.33 -0.14 -0.03 0.21 0.14 0.07
-0.74 -0.8 -0.79 1.46 -0.59 -0.27
-3.63 0.04 -2.39 1.08 0.11 0.59
0.19 -0.21 -1.87 1.67 -2.26 -1.63
-1.54 -0.38 0.14 1.36 -1.21 -0.35
-2.09 0.99 -2.47 1.45 -1.54 -0.91
-1.54 0.83 -0.35 0.74 -1.19 -0.02
-2.15 -1.01 -1.94 1.93 -1.61 -0.2
-2.64 -0.77 -1.45 1.88 -0.15 -1.66
-1.56 -1.04 -0.71 1.68 -0.85 -0.34
-0.93 -0.69 -0.74 1.49 0.04 -1.22
-0.52 -1.04 0.25 1.21 -0.28 -1.04
-1.3 -0.3 -0.53 1.42 -1.01 -0.11
-0.91 -0.38 -0.57 1.5 -0.83 -0.67
-0.62 -0.59 -0.64 1.3 -0.5 -0.2
-1.94 1.1 -1.35 1.31 -0.9 -2.43
0.42 -0.18 0.08 -0.13 0.11 -0.46
-1.5 -0.93 0.09 1.83 -2.31 -1.74
-0.11 -0.33 -1.04 1.36 -1.33 -0.25
-0.53 -0.13 -0.25 1.14 -0.19 -1.08
-1.84 -0.43 -0.84 1.27 -0.33 0.29
-1.97 -0.09 -0.64 1.48 -0.31 -0.82
-0.51 -0.25 -0.11 1.11 -0.2 -1.0
-1.07 0.76 -1.81 0.59 0.03 0.03
-0.12 -1.74 -1.29 1.65 -0.14 -1.62
-2.67 -0.15 -0.34 0.61 0.28 0.49
-0.99 -0.43 -2.58 1.3 -0.14 0.29
-0.86 0.0 -1.5 1.43 -0.86 -0.23
-1.63 -1.21 -1.33 1.15 0.22 0.55
-1.57 -1.57 -1.33 1.42 -0.93 0.79
-0.39 -0.47 -1.33 1.76 -1.59 -1.33
-0.69 0.47 -0.85 1.58 -2.61 -1.82
-1.26 -1.34 -2.16 1.75 -0.41 -0.26
-1.63 -0.81 -0.42 1.76 -0.77 -1.36
-0.88 -0.55 -0.32 1.38 -0.5 -0.57
-2.12 0.6 -2.17 1.43 0.21 -2.38
-1.0 0.01 -1.12 0.95 -0.01 0.15
-0.28 -0.59 -1.18 1.55 -0.89 -0.74
-0.01 0.22 -1.38 0.71 -0.34 0.05
-1.63 -0.88 -1.02 1.6 0.14 -1.01
-0.12 -0.06 -0.29 0.06 0.14 0.21
0.12 0.29 0.02 -0.45 0.46 -0.82
-2.11 0.99 -1.06 0.96 0.08 -1.78
0.09 -0.0 0.01 -0.01 0.02 -0.12
-0.91 -0.91 0.06 1.26 -0.3 -0.55
-0.8 -1.29 0.26 1.16 0.05 -0.86
-1.14 0.27 -0.52 1.04 -0.13 -0.6
-0.29 -0.34 -0.05 0.63 0.08 -0.27
0.21 -0.09 0.02 -0.22 0.12 -0.09
-0.74 0.32 -0.35 1.13 -0.63 -0.91
-0.12 -1.34 -1.01 1.45 -0.81 -0.18
-3.9 0.93 -1.77 1.53 -1.22 -1.22
-1.83 -0.76 -2.26 1.79 -0.44 -0.47
-2.01 -0.48 -0.43 0.96 -1.18 0.93
-0.09 -0.37 -0.88 1.07 -1.01 0.19
-0.39 -0.33 -0.37 1.11 -0.66 -0.18
-1.54 -0.66 -0.82 1.59 -0.46 -0.46
-0.89 -1.96 0.44 1.22 -0.32 -0.49
-1.94 -0.56 -1.02 1.84 -1.12 -0.95
-1.37 -1.33 -1.03 1.8 -0.68 -0.68
-1.71 -1.82 -1.47 1.87 -0.2 -0.96
-1.99 -0.24 0.06 1.11 -0.02 -0.49
-0.95 0.74 -0.59 0.81 -0.4 -0.65
-2.05 0.47 -0.57 1.6 -1.29 -1.92
-1.08 -0.97 -0.53 1.16 -0.6 0.52
-0.16 -0.05 -0.11 0.12 0.07 0.1
-0.37 -1.32 -0.3 1.32 -0.2 -0.63
-1.22 -1.29 -0.78 1.42 -0.02 -0.11
-0.11 -0.07 -0.44 0.08 -0.01 0.41
-1.39 0.2 -2.01 1.55 -0.82 -0.47
-2.36 -0.68 -0.79 1.66 -0.66 -0.3
-1.51 0.61 0.16 0.78 -0.47 -0.83
-0.56 0.0 -0.21 1.1 0.03 -1.81
-1.39 -0.39 -1.67 1.9 -0.96 -1.79
-1.61 -1.18 -0.59 1.57 -0.81 0.03
-3.31 -1.6 -0.78 1.73 -1.5 0.4
-1.25 0.07 -1.05 1.22 -0.81 0.19
0.02 -1.58 0.35 1.55 -2.77 -1.77
0.0 -0.6 -0.52 0.93 -0.16 -0.25
-1.13 -0.43 -1.98 1.65 -0.31 -0.73
0.06 0.61 -1.24 0.49 -1.67 0.36
0.06 0.33 -0.51 0.65 -0.51 -0.45
-0.3 -2.19 -0.92 1.43 -0.72 0.2
-1.43 -1.66 -0.54 1.98 -1.66 -1.47
-0.65 0.19 -0.28 0.2 0.19 0.15
-0.43 -0.4 -0.2 1.26 -0.17 -1.5
-1.42 0.34 -0.75 0.42 0.27 0.29

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.