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Heatmap: cluster_0004 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
0.64 0.53 -0.28 -1.08 -0.73 0.14
0.54 0.48 -0.28 -0.82 -0.46 0.05
0.33 0.3 -0.43 -0.61 -0.38 0.42
-0.07 -0.48 -0.24 0.21 0.42 -0.01
0.65 0.43 -0.34 -1.24 -0.64 0.3
0.43 0.34 -0.15 -0.75 -0.5 0.24
0.62 0.21 -0.19 -0.6 -0.51 0.1
1.08 0.33 -0.96 -2.27 -1.49 0.64
0.26 0.11 -0.15 -0.31 -0.21 0.2
0.66 0.62 -1.34 -1.21 -0.48 0.41
-0.22 -0.13 0.36 1.08 -2.45 -0.65
0.3 -0.05 -0.31 0.01 -0.17 0.14
-1.28 -0.27 0.19 1.17 -1.53 0.02
0.6 0.09 -0.41 -0.66 -0.58 0.44
0.62 0.37 -0.22 -0.71 -0.42 -0.07
0.27 0.08 -0.06 -0.29 -0.35 0.23
0.77 0.55 -0.88 -2.64 -0.99 0.7
0.76 0.51 -0.45 -1.41 -1.22 0.43
0.39 0.25 -0.15 -0.48 -0.28 0.09
0.59 0.04 -0.41 -0.4 -0.23 0.14
0.18 0.13 -0.03 -0.28 -0.07 0.03
0.35 0.11 -0.19 -0.18 -0.15 -0.02
0.9 0.58 -0.67 -1.8 -0.85 0.23
0.75 0.31 -0.35 -1.04 -0.76 0.28
0.85 0.46 -0.76 -1.76 -1.05 0.54
0.22 0.1 -0.09 -0.27 -0.26 0.22
1.53 0.35 -2.15 -2.27 -2.18 0.26
0.56 0.27 -0.46 -0.6 -0.61 0.36
0.3 0.18 -0.13 -0.67 -0.48 0.46
0.78 0.34 -0.16 -0.7 -0.62 -0.22
0.66 0.52 -0.28 -0.83 -0.56 -0.11
0.6 0.49 -0.48 -1.9 -0.88 0.64
0.13 0.12 -0.14 -0.13 -0.12 0.12
0.58 0.45 -0.44 -0.79 -0.52 0.17
0.32 0.19 -0.33 -0.7 -0.4 0.53
0.65 0.59 -0.14 -1.63 -0.88 0.2
0.75 0.36 -0.64 -1.16 -0.75 0.44
0.2 0.18 -0.2 -0.23 -0.26 0.21
0.13 0.14 -0.06 -0.27 -0.23 0.22
0.15 0.12 -0.07 -0.21 -0.14 0.11
-0.97 0.7 -1.83 -0.75 0.62 0.54
0.58 0.3 -0.28 -0.51 -0.51 0.06
0.03 0.26 -0.18 -0.4 -0.2 0.34
0.59 0.34 -0.49 -1.04 -0.41 0.35
0.88 0.55 -0.69 -1.83 -0.78 0.28
0.86 0.38 -0.7 -2.93 -1.11 0.74
0.64 0.36 -0.2 -1.03 -0.51 0.13
0.6 0.59 -0.83 -1.09 -0.35 0.21
0.29 0.15 -0.19 -0.73 -0.35 0.49
0.38 0.07 -0.34 -0.49 -0.23 0.37
0.63 0.3 -0.26 -0.97 -0.54 0.24
-0.36 0.05 -0.12 -0.5 -0.04 0.67
0.21 0.06 -0.1 -0.29 -0.23 0.25
0.7 0.08 -0.43 -1.16 -0.55 0.53
0.78 0.16 -0.29 -1.02 -0.97 0.44
0.49 0.34 -0.34 -1.19 -0.66 0.55
0.48 0.58 -0.98 -1.08 -0.6 0.55
0.54 -0.91 -0.89 -0.32 -0.16 0.83
0.47 0.34 -0.16 -0.46 -0.47 0.02
0.53 0.26 -0.56 -0.88 -0.45 0.49
0.4 0.26 -0.25 -0.48 -0.32 0.16
0.36 0.24 -0.13 -0.2 -0.36 -0.04
1.08 0.39 -1.21 -1.72 -2.1 0.68
0.21 0.14 -0.16 -0.41 -0.33 0.38
0.79 0.01 -0.48 -0.86 -0.63 0.43
0.85 0.65 -0.23 -1.54 -1.34 0.05
0.22 0.06 -0.14 -0.1 -0.12 0.05
0.76 0.39 -0.3 -1.25 -0.75 0.23
0.5 0.43 -0.15 -1.02 -0.61 0.25
0.52 0.23 -0.23 -0.97 -0.5 0.4
0.64 0.28 -0.44 -1.31 -0.64 0.53
0.56 0.49 -0.07 -1.23 -0.96 0.3
0.18 0.18 -0.06 -0.45 -0.17 0.2
0.29 0.21 -0.13 -0.39 -0.31 0.18
0.56 0.05 -0.18 -0.35 -0.36 0.07
-0.04 0.53 -0.2 -1.85 -0.13 0.61
0.34 0.24 -0.09 -0.37 -0.35 0.08
0.63 0.48 -0.22 -1.03 -0.63 0.08
-0.69 0.37 0.38 0.22 -0.27 -0.31
0.91 -0.03 -1.69 -0.66 0.12 0.16
0.64 0.23 -0.46 -1.0 -0.5 0.41
0.79 0.23 -0.87 -1.32 -0.76 0.65
0.5 0.34 -0.07 -0.57 -0.78 0.16
1.3 0.82 -1.07 -4.26 -4.55 0.25
0.56 0.2 -0.19 -0.57 -0.7 0.28
0.49 0.06 -0.18 -0.41 -0.36 0.18
0.89 0.49 -0.41 -1.88 -1.07 0.31
0.88 0.49 -0.58 -1.99 -1.08 0.44
0.25 0.35 -0.01 -0.44 -0.51 0.14
0.49 0.22 -0.09 -0.28 -0.45 -0.09
0.68 0.41 -0.31 -1.02 -0.75 0.23
0.57 0.25 -0.36 -0.95 -0.9 0.58
1.12 0.6 -0.62 -2.36 -1.52 0.15
0.34 0.16 -0.16 -0.68 -0.28 0.34
0.43 0.43 -0.04 -0.76 -0.63 0.14
0.65 0.38 -0.32 -0.82 -0.48 0.06
-0.29 0.54 -1.89 0.13 -0.23 0.6
1.39 0.44 -0.84 -1.46 -1.32 -0.51
0.75 0.24 -0.92 -1.9 -0.46 0.7
0.91 0.51 -0.68 -1.24 -1.71 0.42
0.66 0.52 -0.24 -1.33 -0.92 0.27
0.38 0.22 -0.01 -0.48 -0.34 0.05
0.73 0.41 -0.51 -2.19 -0.99 0.67
0.49 0.43 -0.19 -0.64 -0.46 0.02
0.52 0.41 -0.07 -0.68 -0.7 0.06
-1.21 0.05 -0.48 0.32 -1.72 1.18
0.27 0.13 -0.13 -0.23 -0.18 0.07
0.75 0.43 -0.35 -1.26 -0.68 0.2
0.21 0.11 0.02 -0.17 -0.23 0.01
0.44 0.23 -0.18 -0.52 -0.27 0.09
-0.3 -0.01 -0.0 -0.1 0.08 0.27
-1.35 0.32 0.13 0.19 -1.06 0.71
-0.01 0.85 -1.98 -0.77 -0.27 0.62
0.18 0.22 -0.05 -0.47 -0.34 0.3
0.67 0.34 -0.28 -0.8 -0.64 0.14
0.47 0.17 -0.33 -0.87 -0.48 0.51
1.08 0.06 -0.75 -1.61 -0.92 0.48
1.19 0.63 -0.85 -3.2 -1.9 0.32
0.61 0.15 -0.53 -0.82 -0.45 0.45
0.27 0.14 -0.07 -0.7 -0.31 0.4
0.23 0.19 0.05 -0.15 -0.27 -0.12
0.32 0.33 -1.38 -0.08 0.01 0.22
0.59 0.29 -0.67 -1.01 -0.55 0.55
0.24 -0.08 -0.5 -0.24 0.16 0.26
0.11 0.2 -0.7 -0.12 -0.06 0.35
0.5 0.32 -0.2 -0.56 -0.37 0.02
0.66 0.27 -0.24 -1.2 -0.65 0.38
0.78 0.6 -0.25 -1.9 -1.06 0.24
0.41 0.21 -0.1 -0.35 -0.26 -0.05
0.2 -0.04 -0.17 -0.03 -0.08 0.09
0.79 0.23 -0.65 -1.42 -0.57 0.5
1.28 0.89 -0.8 -3.38 -2.26 -0.25
0.19 0.14 -0.14 -0.31 -0.08 0.14
0.76 0.69 -0.29 -1.88 -1.33 0.26
0.52 0.29 -0.18 -0.72 -0.52 0.22
0.87 0.59 -0.36 -1.89 -0.96 0.15
0.26 0.15 -0.04 -0.35 -0.21 0.09
0.34 0.13 -0.22 -0.31 -0.26 0.18
0.68 0.2 -0.55 -0.66 -0.42 0.26
0.84 0.63 -0.29 -1.77 -1.46 0.25
-0.08 -0.47 0.44 0.61 -0.78 -0.22
0.49 0.2 -0.48 -1.02 -0.27 0.49
0.56 0.32 -0.16 -0.81 -0.45 0.12
0.36 0.02 -0.5 -0.47 0.07 0.29
0.35 0.14 -0.13 -0.6 -0.51 0.43
0.67 0.22 -0.57 -0.99 -0.47 0.43
0.37 0.1 -0.24 -0.4 -0.16 0.19
1.24 0.3 -1.05 -1.84 -1.74 0.43
-0.03 -0.06 -0.1 0.32 0.12 -0.34
0.75 0.31 -0.38 -1.15 -0.84 0.38
0.59 0.31 -0.25 -1.23 -0.81 0.51
0.7 0.15 -0.52 -1.14 -0.85 0.64
0.76 0.36 -0.6 -1.48 -0.65 0.45
1.25 0.65 -0.69 -2.28 -1.31 -0.28
0.26 0.13 -0.1 -0.28 -0.28 0.18
0.18 0.09 -0.11 -0.25 -0.16 0.18
0.75 0.33 -0.29 -0.88 -0.51 -0.0
0.28 -0.41 -0.09 0.29 0.28 -0.61
1.07 0.38 -1.16 -2.93 -1.31 0.69
0.29 0.19 -0.1 -0.48 -0.22 0.17
0.48 0.68 -0.53 -1.56 -0.41 0.29
0.58 0.41 0.01 -1.0 -0.69 0.08
0.58 0.47 -0.06 -1.16 -0.83 0.2
-0.04 -0.1 0.2 0.41 -0.18 -0.44
0.86 0.69 -0.34 -1.66 -1.25 0.07
0.53 0.27 -0.21 -0.81 -0.55 0.3
0.39 0.25 -0.06 -0.48 -0.43 0.11
0.05 0.33 -0.59 -0.13 -0.15 0.31
0.74 0.41 -0.31 -1.1 -0.64 0.12
0.29 0.24 -0.02 -0.48 -0.42 0.2
-2.96 0.16 -0.0 0.77 0.49 -0.63
-0.21 0.22 -0.89 0.01 -0.03 0.53
0.64 0.24 -0.38 -0.57 -0.29 -0.0
0.63 0.07 -0.6 -1.15 -0.22 0.52
-2.11 -0.42 -0.01 0.55 0.66 -0.02
0.14 0.06 -0.06 -0.11 -0.31 0.21
0.22 -0.69 0.1 1.19 -3.48 -0.38
0.49 0.43 -0.44 -0.29 -0.52 0.0
0.85 0.06 -0.39 -0.91 -0.65 0.28
1.07 0.3 -0.42 -1.19 -0.87 -0.09
0.51 0.17 -0.11 -0.63 -0.51 0.23
0.46 0.34 -0.21 -0.61 -0.53 0.2
-1.64 0.77 -2.26 -0.55 0.22 0.94
0.42 -0.07 0.17 0.28 -0.03 -1.35
0.64 0.11 -0.2 -0.66 -0.5 0.21
0.71 0.6 -0.19 -1.35 -0.91 0.07
0.87 0.56 -0.55 -1.0 -0.78 -0.1
-0.18 -0.17 0.04 1.03 -0.97 -0.63
0.95 0.79 -0.46 -2.56 -1.36 0.07
0.76 0.43 -0.45 -1.33 -0.64 0.25
0.51 0.32 -0.47 -1.53 -0.79 0.75
0.74 0.36 -0.31 -1.14 -0.68 0.23
0.7 0.36 -0.2 -0.73 -0.64 -0.04
0.52 0.3 -0.16 -0.81 -0.37 0.13
0.41 0.27 -0.14 -0.43 -0.3 0.01
0.85 0.34 -0.48 -1.36 -0.93 0.38
0.2 0.07 -0.08 -0.29 -0.17 0.21
0.58 0.33 -0.16 -0.55 -0.8 0.14
0.76 0.48 -0.74 -1.46 -0.6 0.37
0.23 0.21 -0.25 -0.45 -0.31 0.37
0.49 0.31 -0.33 -1.03 -0.61 0.5
0.17 0.09 0.12 -0.12 -0.18 -0.12
0.52 0.18 -0.46 -0.67 -0.37 0.38
1.05 0.64 -1.22 -2.68 -1.47 0.51
0.46 0.18 -0.25 -0.43 -0.27 0.11
0.46 0.21 -0.28 -0.96 -0.36 0.44
0.48 0.21 -0.1 -0.31 -0.61 0.07
1.27 0.73 -0.77 -2.95 -2.49 0.05
0.54 0.5 -0.52 -1.67 -0.59 0.53
0.6 0.3 -0.25 -0.81 -0.64 0.26
0.2 0.4 -1.05 -2.36 0.28 0.72
0.47 0.3 -0.37 -0.5 -0.46 0.23
0.03 -0.01 -0.23 0.02 -0.08 0.23
-0.75 0.17 -0.09 -0.21 0.19 0.41
0.23 0.05 -0.16 -0.14 -0.22 0.17
0.67 0.68 -0.41 -1.67 -0.97 0.29
0.2 0.24 -0.01 -0.19 -0.27 -0.04
-0.02 0.15 -0.44 -0.02 -0.16 0.36
0.7 0.43 -0.45 -1.42 -0.77 0.41
0.93 0.44 -0.91 -1.88 -1.26 0.6
0.49 0.21 -0.17 -0.62 -0.67 0.35
0.44 0.3 -0.27 -0.9 -0.54 0.44
-0.23 -0.07 0.18 -0.05 -0.34 0.39
0.56 0.31 -0.32 -1.07 -0.67 0.47
0.5 0.38 -0.13 -0.62 -0.54 0.06
0.33 0.46 -1.3 -0.66 -0.31 0.61
0.56 0.58 -0.16 -0.99 -0.85 0.11
0.72 0.44 -0.26 -1.14 -0.75 0.17
0.67 0.42 -0.36 -1.31 -0.69 0.34
-1.15 -0.12 0.34 0.83 -0.5 -0.18
0.39 0.13 -0.33 -0.92 -0.42 0.6
0.65 0.18 -0.44 -0.75 -0.35 0.23
0.35 0.36 -0.5 -0.44 -0.11 0.09
0.37 0.26 -0.47 -0.73 -0.27 0.44
0.33 0.04 -0.23 -0.36 -0.34 0.37
0.52 0.01 -0.35 -0.52 -0.19 0.27
0.64 0.39 -0.29 -0.99 -0.76 0.29
-1.85 -0.28 0.57 1.13 -0.84 -0.59
0.27 0.21 -0.11 -0.42 -0.22 0.15
1.47 0.94 -1.45 -3.97 -4.0 -0.29
0.26 0.28 -0.2 -0.57 -0.31 0.3
-0.16 0.03 0.03 0.24 0.03 -0.21
0.39 0.73 0.1 -1.43 -1.25 0.23
0.84 0.62 -0.1 -1.75 -1.58 0.16
0.44 0.15 -0.35 -0.92 -0.42 0.56
0.61 0.25 -0.46 -1.03 -0.59 0.48
0.74 0.26 -0.25 -1.12 -0.61 0.24
1.08 0.58 -0.68 -1.68 -1.02 -0.06
0.21 0.17 0.02 -0.3 -0.19 0.02
0.34 0.22 -0.16 -0.57 -0.27 0.23
-1.38 -1.2 0.83 1.4 -1.83 -1.04
0.63 0.13 -0.48 -1.11 -0.32 0.46
0.16 0.29 -0.07 -0.52 -0.27 0.24
-0.11 0.07 -0.21 -0.03 -0.23 0.4
0.72 0.33 -0.47 -1.62 -0.65 0.5
0.48 0.32 -0.37 -1.24 -0.51 0.55
-2.43 0.59 -0.02 -0.46 -0.16 0.76
-0.77 -0.05 -0.09 0.56 0.38 -0.44
0.55 0.36 -0.37 -0.96 -0.37 0.25
0.87 0.42 -0.48 -1.97 -0.82 0.36
0.75 0.46 -0.45 -1.72 -0.83 0.42
1.09 0.45 -0.25 -1.58 -2.01 0.11
0.35 0.37 -0.39 -0.33 -0.3 0.08
0.44 0.2 -0.4 -0.63 -0.36 0.39
0.92 0.5 -0.24 -1.25 -1.16 -0.02
0.8 0.51 -0.48 -1.68 -0.78 0.29
0.53 0.37 -0.16 -0.86 -0.46 0.13
1.18 0.67 -0.66 -3.3 -2.1 0.24
0.82 0.66 -0.19 -1.87 -1.39 0.16
0.17 0.18 -0.13 -0.52 -0.24 0.36
-0.91 -0.42 0.47 1.1 -0.66 -0.83
0.86 0.65 -1.82 -1.82 -1.54 0.76
-0.09 0.38 -0.24 -0.58 -0.11 0.4
0.4 0.17 -0.03 -0.55 -0.45 0.22
-0.22 0.16 -0.32 -0.31 0.17 0.37
0.52 0.17 -0.18 -0.51 -0.42 0.15

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.