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Heatmap: cluster_0005 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
-0.12 -0.02 0.2 0.12 -0.08 -0.14
0.11 -0.16 0.35 0.34 -0.31 -0.56
-1.36 -0.81 0.9 0.8 -0.29 -0.72
-0.89 -0.43 0.65 0.64 -0.12 -0.58
-0.23 -0.32 0.38 0.4 -0.11 -0.32
0.25 0.36 0.1 -0.71 0.08 -0.34
-1.41 -0.11 0.88 0.62 -0.44 -0.77
0.21 0.04 0.34 -0.04 -0.64 -0.08
-0.1 -0.11 0.46 0.32 -0.29 -0.51
-0.66 -0.62 0.62 0.72 -0.35 -0.42
-0.34 0.43 0.97 0.48 -1.48 -2.8
-0.19 -0.19 0.37 0.42 -0.21 -0.42
-0.05 -0.18 0.58 0.3 -0.43 -0.56
-2.37 0.05 1.42 0.95 -3.22 -4.11
-0.78 0.23 0.29 -0.61 0.21 0.28
-0.13 -0.11 0.33 0.21 0.01 -0.45
-0.61 0.07 0.73 0.44 -0.44 -0.89
-0.62 -0.51 0.9 0.62 -0.81 -0.56
-0.32 -0.12 0.38 0.32 -0.01 -0.46
-1.24 -0.25 0.98 1.13 -1.57 -2.09
-0.21 -0.02 0.34 0.37 -0.23 -0.43
-0.12 0.27 -0.3 0.45 0.19 -0.86
-0.37 -0.09 0.5 0.45 -0.25 -0.59
-1.29 -1.28 0.91 1.02 -0.39 -0.97
-2.26 0.19 1.37 0.73 -2.2 -2.36
-2.18 1.27 0.96 0.15 -2.88 -2.45
-0.36 -0.07 0.32 0.33 -0.12 -0.25
-0.43 -0.2 0.6 0.46 -0.15 -0.75
-1.22 -0.42 0.98 0.71 -0.25 -1.43
-0.45 -0.13 0.52 0.48 -0.23 -0.58
-0.12 -0.18 0.26 0.24 -0.06 -0.23
-2.24 -0.48 1.39 0.73 -1.27 -1.45
-0.39 -0.4 0.74 0.6 -0.52 -0.77
-0.27 -0.25 -0.25 0.21 0.16 0.29
-0.89 -0.3 0.59 0.63 0.09 -0.92
0.02 -0.04 0.19 0.21 -0.06 -0.39
-0.0 0.19 0.85 0.37 -1.12 -1.73
-0.97 -1.16 0.83 0.96 -0.44 -0.8
-1.17 0.83 0.48 -2.47 -0.28 0.46
0.19 0.11 -0.19 0.21 0.12 -0.61
-0.33 -0.13 0.48 0.37 -0.23 -0.42
-1.03 -0.31 0.74 0.63 -0.32 -0.54
-1.54 0.07 1.3 0.79 -1.77 -3.08
-0.19 0.07 0.41 0.32 -0.2 -0.67
-0.44 -0.34 0.62 0.6 -0.35 -0.66
-1.01 -0.38 0.54 0.55 -0.32 0.02
-0.16 -0.12 0.37 0.36 -0.19 -0.46
-0.84 -0.03 0.89 0.55 -0.41 -1.33
-2.94 -0.73 1.14 1.18 -0.71 -2.44
0.02 0.02 0.17 0.19 -0.13 -0.32
-0.59 0.28 0.21 -0.27 0.1 0.09
0.19 0.56 0.33 -2.29 -0.19 0.07
-0.78 0.02 0.88 0.49 -0.75 -0.82
-0.18 -0.05 0.47 0.43 -0.27 -0.75
-0.79 -0.82 0.92 0.62 -0.34 -0.66
-4.84 -1.69 1.22 1.27 -0.58 -2.06
-0.44 -0.26 0.57 0.51 -0.45 -0.35
-0.67 -0.34 0.53 0.58 -0.32 -0.26
-0.12 -0.09 0.28 0.2 -0.03 -0.33
-0.17 0.02 0.23 0.17 -0.04 -0.26
-0.39 -0.01 0.75 0.3 -0.56 -0.62
-0.13 -0.13 0.31 0.2 -0.08 -0.26
-0.16 -0.03 0.53 0.41 -0.26 -0.98
-0.02 -0.0 0.33 0.3 -0.25 -0.55
-0.05 -0.01 0.26 0.44 -0.39 -0.46
-0.5 -0.25 0.42 0.46 -0.1 -0.32
-1.75 -0.09 1.44 0.78 -2.57 -2.7
-0.09 0.02 0.53 0.29 -0.28 -0.84
-0.2 -0.33 0.41 0.42 -0.27 -0.25
-0.05 -0.09 0.27 0.16 -0.13 -0.22
-2.94 -0.35 1.14 1.03 -0.6 -2.51
-2.66 -0.33 1.24 1.0 -0.9 -2.73
-1.5 -2.35 1.23 1.34 -1.19 -2.93
-0.82 -0.08 0.84 0.57 -0.58 -0.88
-0.05 -0.1 0.29 0.31 -0.21 -0.38
-0.44 -0.22 0.54 0.55 -0.33 -0.52
-0.5 -0.42 0.6 0.5 -0.34 -0.27
-0.14 0.07 0.4 0.14 -0.22 -0.39
-0.06 -0.08 0.34 0.2 -0.12 -0.4
-1.75 -1.23 1.17 1.12 -1.48 -1.03
-1.17 -0.83 0.8 0.95 -1.22 -0.17
-3.12 -1.43 1.38 1.36 -1.85 -4.02
0.08 0.05 -0.03 -0.23 0.05 0.07
-0.56 0.1 1.03 0.55 -1.04 -2.01
-0.35 0.25 0.46 -0.98 -0.08 0.27
-0.97 -0.6 0.79 0.67 -0.46 -0.36
-0.22 -0.03 0.57 0.45 -0.24 -1.09
-0.03 -0.08 0.27 0.32 -0.09 -0.54
-0.06 -0.14 0.4 0.31 -0.39 -0.31
-0.5 -0.11 0.5 0.38 -0.23 -0.33
-0.25 0.11 0.21 -0.18 -0.02 0.07
-3.28 0.36 0.65 -0.25 -0.08 0.32
-0.84 -0.39 0.62 0.73 -0.38 -0.48
-0.42 -0.1 0.59 0.36 -0.18 -0.62
-0.5 0.12 0.5 -0.99 0.25 0.15
-0.39 -0.19 0.41 0.34 -0.21 -0.15
-0.17 0.25 0.67 0.44 -0.81 -1.31
-3.99 -1.88 1.38 1.33 -1.12 -3.5
-0.03 -0.06 0.27 0.23 -0.21 -0.29
-1.6 0.69 0.88 -1.5 0.19 -0.46
-1.09 -0.32 0.69 0.87 -0.4 -0.92
-0.33 -0.02 0.32 0.33 -0.11 -0.35
-0.96 -0.89 1.01 0.82 -0.94 -0.65
-0.28 -0.06 0.39 0.41 -0.16 -0.56
-0.17 -0.19 0.41 0.34 -0.23 -0.35
-1.05 -0.64 0.7 0.71 -0.23 -0.39
-0.33 -0.32 0.71 0.6 -0.41 -1.0
-0.2 0.04 0.4 0.37 -0.21 -0.68
-0.39 0.57 -0.12 -1.51 0.18 0.43
-0.35 -0.05 0.63 0.45 -0.42 -0.78
-0.27 0.12 0.64 0.23 -0.42 -0.72
-1.59 0.26 1.27 0.6 -1.34 -2.77
-0.24 -0.01 0.55 0.32 -0.34 -0.6
-0.33 0.06 0.91 0.55 -0.82 -2.02
-0.24 0.17 -0.1 -0.65 0.15 0.44
-0.0 -0.07 0.18 0.26 -0.15 -0.29
-0.1 -0.19 0.36 0.23 -0.14 -0.27
-0.7 -0.18 0.5 0.64 -0.23 -0.55
-0.14 -0.13 0.57 0.42 -0.32 -0.87
-0.63 -0.33 0.51 0.81 -0.43 -0.65
-0.12 -0.09 0.23 0.28 -0.13 -0.25
-1.62 1.09 0.33 -2.17 0.16 -0.07
-0.11 -0.15 0.3 0.28 -0.09 -0.33
-1.59 0.71 1.0 -1.16 -0.3 -0.37
0.2 0.11 -0.58 -1.14 0.59 0.19
-0.66 -0.39 0.68 0.67 -0.34 -0.68
-0.82 -0.53 0.84 0.67 -0.36 -0.78
-0.08 -0.02 0.18 0.14 -0.09 -0.16
-0.87 0.11 1.12 0.66 -1.15 -2.57
-1.39 -1.09 0.81 0.95 -0.26 -0.66
-0.06 0.05 0.14 -0.45 0.25 -0.03
-0.61 -0.57 0.58 0.61 -0.28 -0.27
-0.08 -0.11 0.42 0.26 -0.12 -0.57
-0.22 -0.28 0.45 0.31 -0.09 -0.36
-1.0 -0.08 1.25 0.85 -2.2 -2.67
-1.77 0.23 1.4 0.68 -2.42 -3.44
-0.29 -0.11 0.55 0.44 -0.26 -0.74
0.39 0.54 -0.01 -2.08 0.23 -0.26
-0.32 -0.16 0.42 0.27 -0.2 -0.17
-0.37 -0.09 0.32 0.33 -0.09 -0.25
-0.11 0.11 0.16 0.07 -0.28 -0.0
-0.95 -0.45 0.63 0.68 -0.04 -0.68
-0.52 -0.47 0.92 0.73 -0.88 -1.07
0.29 0.46 0.44 -1.41 -0.8 0.13
-1.5 -0.6 0.78 0.63 -0.38 -0.08
-1.38 -0.87 1.05 0.65 -0.48 -0.5
-0.46 -0.28 0.12 0.23 0.17 0.1
-0.62 -0.23 0.4 0.36 0.07 -0.25
-4.62 -1.9 1.45 1.35 -1.64 -3.5
-0.43 -0.14 0.56 0.36 -0.12 -0.58
0.07 0.2 0.12 -0.6 -0.01 0.09
-2.68 0.8 0.71 -1.51 0.02 0.14
0.14 -0.14 0.43 0.31 -0.39 -0.65
-0.89 -0.24 0.69 0.79 -0.25 -1.21
-4.28 -2.58 1.49 1.32 -1.78 -2.36
-0.63 -0.75 0.97 0.96 -1.05 -1.4
-0.18 -0.12 0.33 0.26 -0.03 -0.38
-0.37 -0.34 0.37 0.41 -0.1 -0.19
-1.43 -0.84 0.86 1.01 -1.02 -0.42
-0.45 -0.1 0.7 0.57 -0.39 -1.1
-0.19 0.1 0.56 0.31 -0.43 -0.76
-2.67 -0.88 0.76 1.07 -0.23 -0.61
-0.14 -0.18 0.57 0.35 -0.26 -0.69
-0.69 -0.32 0.47 0.5 -0.16 -0.2
0.17 -0.04 -1.05 -0.9 0.31 0.72
-0.03 0.17 -0.22 -0.34 0.04 0.3
-1.25 -0.3 1.03 0.73 -0.58 -1.34
-0.95 -0.61 0.58 0.76 -0.04 -0.59
-0.11 -0.21 0.36 0.33 -0.11 -0.42
-2.12 -0.0 1.33 1.0 -2.29 -4.05
-0.32 0.12 0.23 -0.17 -0.08 0.14
-1.28 -0.54 1.04 0.73 -0.93 -0.59
-0.51 -0.23 0.44 0.58 -0.17 -0.51
-0.49 -0.22 0.62 0.45 -0.28 -0.52
-0.48 -0.15 0.66 0.42 -0.38 -0.52
0.04 -0.11 0.25 0.15 -0.06 -0.35
-0.4 -0.15 0.28 0.34 -0.09 -0.12
-0.42 -0.06 0.58 0.42 -0.28 -0.66
-2.98 0.12 1.39 0.8 -1.96 -2.49
-0.32 -0.05 0.54 0.31 -0.36 -0.4
-5.59 -2.45 1.4 1.6 -3.43 -5.05
-2.83 0.79 0.46 -2.14 0.29 0.38
-0.69 0.03 0.87 0.69 -0.66 -1.84
-0.34 -0.09 0.51 0.36 -0.28 -0.43

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.