Heatmap: cluster_0006 (HCCA clusters)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
-0.29 0.01 -0.22 0.06 0.15 0.22
0.04 -0.27 -0.19 -0.1 -0.12 0.49
0.07 -0.2 -0.8 -0.44 0.16 0.72
-0.02 -0.21 -0.47 -0.33 0.14 0.61
-0.13 -0.78 -2.46 -1.5 0.51 1.35
0.35 0.07 -0.65 -1.65 -0.18 0.88
-0.16 0.34 -0.44 -0.57 -1.27 1.02
0.38 0.03 -0.54 -0.71 0.04 0.43
0.33 0.2 -0.71 -0.73 -0.06 0.5
0.19 0.04 -0.27 -0.34 -0.1 0.34
-0.12 -0.06 -0.42 -0.26 0.1 0.55
-0.16 -0.52 -0.86 -0.81 0.16 1.12
0.06 -0.26 -0.77 -0.41 0.08 0.79
-0.0 -0.05 -0.11 -0.15 0.06 0.22
0.1 -0.13 -0.36 -0.75 -0.24 0.85
0.19 -0.02 -0.27 -0.38 -0.05 0.39
0.12 -0.13 -0.6 -0.95 -0.1 0.92
0.24 -0.01 -0.19 -0.32 -0.21 0.36
0.42 0.05 -0.55 -1.21 -0.63 0.9
0.27 -0.29 -0.53 -0.46 -0.22 0.76
-0.43 0.24 -0.98 0.43 -0.08 0.35
-0.73 0.09 0.04 -0.34 0.04 0.58
0.38 0.08 -0.59 -0.6 0.05 0.36
0.57 -0.11 -2.13 -2.3 -0.71 1.35
0.08 -0.32 -0.65 -0.18 -0.24 0.82
0.29 -0.41 -1.28 -0.63 0.18 0.88
-1.55 -0.06 -0.01 -0.13 0.01 0.84
0.2 -0.05 -0.57 -0.53 -0.05 0.64
-0.34 -0.34 -0.79 -0.57 0.36 0.92
0.02 -0.03 -0.36 -0.14 -0.02 0.42
-0.14 -0.08 -0.5 -0.37 0.06 0.69
-0.06 -0.07 -0.18 -0.18 0.07 0.35
-0.6 0.13 -0.35 -0.07 0.11 0.51
0.13 -0.02 -0.2 -0.4 -0.1 0.44
0.06 -0.13 -0.29 -0.51 -0.05 0.65
0.25 0.02 -0.87 -0.68 -0.13 0.77
-0.08 0.16 -0.19 -0.73 -0.2 0.67
0.18 -0.24 -0.4 -0.52 -0.14 0.73
0.02 -0.22 -0.5 -0.42 0.2 0.61
-0.01 0.07 -0.62 -1.02 -0.62 1.11
-0.02 0.32 -0.44 0.35 0.38 -1.13
-0.63 -0.66 -0.67 -0.01 -0.02 1.08
-2.03 0.58 0.43 0.47 -1.7 0.29
0.2 0.24 -0.37 -1.02 -0.41 0.73
0.32 0.12 -1.32 -0.3 -0.56 0.83
-0.39 -1.03 -1.5 -1.06 0.0 1.54
0.16 -0.09 -0.28 -0.27 -0.09 0.44
-0.31 -0.85 -0.78 -0.47 0.05 1.2
0.02 -0.07 -0.26 -0.2 0.03 0.39
-0.45 -0.09 0.1 0.17 -0.15 0.3
0.23 0.13 -0.38 -0.37 -0.05 0.29
0.57 0.02 -0.77 -0.96 -0.24 0.63
0.16 -0.09 -0.36 -0.45 -0.02 0.53
0.09 0.06 -0.07 -0.16 0.02 0.04
0.32 -0.04 -1.56 -0.57 -1.25 1.23
0.7 0.05 -0.92 -1.24 -0.61 0.79
-0.45 0.12 -0.61 -0.85 0.24 0.84
0.39 -0.27 -0.9 -0.7 0.07 0.73
-3.29 -3.59 -4.54 -4.09 0.29 2.17
0.16 0.13 -0.42 -0.83 -0.22 0.7
0.62 0.15 -1.21 -1.78 -0.51 0.94
0.17 -0.26 -2.04 -1.18 -0.18 1.31
0.24 -0.03 -0.93 -1.12 -0.48 1.09
0.08 -0.11 -0.16 -0.1 -0.01 0.26
0.15 0.01 -1.28 -1.2 0.01 1.02
0.35 -0.41 -1.31 -1.89 -0.95 1.47
0.39 0.03 -0.5 -0.85 -0.29 0.67
0.32 -0.31 -1.75 -2.19 -0.34 1.4
0.27 0.0 -0.28 -0.41 -0.15 0.39
0.25 -0.72 -1.85 -1.36 0.21 1.25
0.23 0.13 -0.52 -0.85 -0.14 0.66
-0.18 -0.19 -0.14 -0.13 0.12 0.42
-0.16 -0.47 -0.97 -0.73 0.37 0.98
-0.05 -0.14 -0.14 -0.32 0.15 0.38
0.16 0.03 -0.36 -0.41 0.01 0.41
-0.03 -0.05 -0.17 -0.13 0.06 0.26
-0.04 -0.02 -0.11 -0.1 0.05 0.19
-0.08 0.07 0.06 -0.03 -0.14 0.11
0.49 0.04 -0.86 -1.5 -0.19 0.84
0.18 0.1 -0.56 -0.8 0.04 0.59
0.38 0.25 -0.25 -0.72 -0.07 0.15
0.07 -0.49 -0.63 -0.78 0.15 0.93
0.55 0.07 -0.67 -1.02 -0.4 0.69
0.26 0.03 -0.55 -0.71 -0.17 0.68
0.1 0.01 -0.3 -0.37 -0.02 0.43
0.52 0.3 -1.27 -2.05 -0.57 1.0
0.76 -0.05 -1.53 -2.01 -0.37 0.97
-0.15 -0.34 -0.88 -0.55 0.27 0.91
0.35 0.04 -0.59 -0.87 -0.06 0.61
-1.28 0.14 -0.02 -0.2 0.07 0.66
0.16 -0.45 -1.09 -0.91 0.1 1.05
0.03 -0.19 -0.31 -0.27 -0.03 0.57
-2.03 0.47 -1.59 -0.24 0.18 1.04
-0.17 -0.41 -0.34 -0.22 0.24 0.62
0.03 -0.03 -0.36 -0.18 -0.01 0.43
0.2 -0.2 -0.37 -0.4 -0.06 0.58
0.18 0.11 -0.58 -0.81 -0.16 0.73
0.12 -0.0 -0.21 -0.36 -0.11 0.43
0.65 0.28 -1.22 -2.16 -0.6 0.93
-0.02 -0.22 -0.21 -0.37 0.2 0.45
0.1 -0.12 -1.26 -1.58 -0.12 1.22
-0.82 -1.31 -2.78 -2.03 0.11 1.83
0.24 -0.21 -0.55 -0.6 -0.02 0.7
0.38 0.13 -0.49 -0.65 -0.11 0.41
0.17 0.07 -0.19 -0.4 -0.19 0.39
0.5 -0.14 -1.06 -0.71 -0.1 0.72
0.22 -0.3 -0.49 -0.64 -0.12 0.81
-0.06 0.18 -1.06 -1.73 0.22 0.97
0.25 -0.14 -0.71 -0.83 0.12 0.72
-0.18 -0.25 -0.38 -0.16 -0.11 0.75
0.52 0.16 -0.74 -1.5 -0.65 0.89
0.19 0.76 -0.78 -0.37 -0.99 0.39
0.16 -0.06 -0.48 -0.48 0.08 0.51
0.05 -0.25 -0.77 -0.64 0.22 0.8
0.18 -0.04 -0.25 -0.27 -0.06 0.34
0.78 0.04 -1.4 -2.48 -1.09 1.15
0.39 -0.01 -0.24 -0.45 -0.31 0.4
0.22 -0.04 -0.32 -0.52 -0.09 0.51
0.33 -0.16 -0.39 -0.52 -0.13 0.56
-0.13 0.38 0.02 -0.31 -0.05 0.0
0.12 -0.09 -0.4 -0.31 -0.2 0.62
0.03 -0.2 -0.47 -0.21 0.07 0.55
0.18 -0.14 -0.44 -0.34 -0.09 0.58
-0.0 0.05 -0.11 -0.21 -0.07 0.29
-0.11 -0.25 -0.51 -0.38 0.14 0.74
0.09 -0.29 -0.42 -0.54 0.24 0.59
-0.15 -0.26 -0.75 -0.71 0.17 0.95
-2.64 0.62 -1.22 0.14 -0.57 1.06
0.37 0.15 -1.34 -1.09 -0.06 0.83
-0.19 -0.11 -0.21 -0.31 0.19 0.47
0.25 -0.03 -0.89 -0.9 -0.27 0.95
0.3 0.07 -0.42 -0.99 -0.46 0.8
-0.88 -0.01 -0.37 -0.03 0.16 0.67
0.19 -0.33 -0.75 -0.95 0.16 0.88
-0.25 0.05 -0.65 -0.18 -0.0 0.68
0.22 -0.09 -0.53 -0.41 -0.02 0.55
0.48 0.16 -0.29 -0.53 -0.03 -0.01
0.88 0.31 -1.47 -3.46 -0.89 0.95
0.44 0.07 -0.56 -0.62 -0.22 0.49
-0.02 -0.31 -0.72 -0.38 0.2 0.75
0.41 0.08 -1.19 -2.41 -0.75 1.26
0.41 0.22 -0.31 -0.49 -0.02 -0.0
0.43 -0.03 -0.96 -2.13 -0.25 1.06
-0.47 -0.2 -0.5 -0.16 0.21 0.72
0.02 -0.18 -0.71 -0.57 0.04 0.84
-0.17 -0.82 -0.96 -0.35 0.08 1.13
0.49 -0.09 -1.44 -1.76 -0.03 1.01
0.09 -0.79 -2.74 -1.33 -0.22 1.56
-0.39 -0.5 -1.5 -1.91 -0.05 1.56
0.92 0.27 -1.45 -3.35 -1.53 1.07
0.68 0.23 -1.3 -5.33 -1.05 1.21
0.08 -0.33 -0.76 -0.77 0.05 0.96
-0.27 -0.35 -0.67 -0.44 0.05 0.99
-0.07 -0.27 -0.24 -0.13 0.03 0.52
0.08 -0.07 -0.24 -0.29 -0.05 0.44
-0.08 -0.06 -0.34 -0.19 0.11 0.43
-1.21 0.09 0.53 0.55 -2.14 0.46
-0.03 -0.33 -0.21 -0.1 0.07 0.46
-0.31 0.25 -0.21 -0.28 0.09 0.32
0.13 -0.06 -0.67 -0.66 -0.06 0.79
-0.09 -0.14 -0.32 -0.39 0.23 0.5
-0.09 -0.58 -0.61 -0.5 -0.02 1.02
0.02 -0.12 -0.21 -0.32 0.06 0.45
-0.57 -1.07 -2.09 -2.18 0.24 1.69
0.22 0.08 -0.46 0.05 0.85 -2.16
0.12 -0.05 -0.27 -0.29 -0.05 0.42
0.36 -0.27 -0.79 -0.48 -0.09 0.73
-0.02 -0.06 -0.1 -0.17 -0.09 0.37
0.03 -0.09 -0.53 -0.44 -0.06 0.73
0.22 0.03 -0.54 -0.74 -0.14 0.7
0.16 0.11 -0.24 -1.04 -0.18 0.66
0.05 0.01 -0.22 -0.4 -0.05 0.46
0.4 0.09 -0.91 -1.77 -0.14 0.91
-0.06 -0.27 -0.75 -0.41 0.17 0.8
0.44 0.16 0.11 -0.33 -0.44 -0.13
-0.25 -0.14 -0.07 -0.3 0.07 0.53
-0.31 -0.46 -0.76 -0.64 0.23 1.04
0.2 0.51 -0.32 -0.41 -1.2 0.52
0.02 -0.46 -0.78 -0.56 0.24 0.86
-0.42 -0.33 -1.24 -2.57 0.55 1.26
0.09 -0.01 -0.14 -0.28 -0.08 0.35
-0.35 -0.73 -0.75 -0.29 0.19 1.04
-0.13 -0.23 -0.28 -0.25 0.18 0.52
0.12 -0.1 -0.34 -0.7 -0.34 0.84
0.33 0.05 -0.47 -0.67 -0.21 0.58
0.73 0.26 -0.87 -2.36 -0.76 0.86
0.31 0.09 0.1 -0.12 -0.09 -0.39
0.15 -0.05 -0.15 -0.16 -0.08 0.24
0.06 -0.06 -0.17 -0.25 0.08 0.28
-1.14 0.55 0.02 0.35 -0.99 0.37
0.34 0.09 -0.68 -0.8 -0.06 0.6
0.09 0.22 -0.14 -0.09 -0.19 0.07
0.37 0.15 -0.48 -0.85 -0.27 0.58
0.3 0.13 -0.59 -0.85 -0.29 0.71
0.06 -0.17 -0.75 -0.18 0.0 0.67
0.05 0.04 -0.42 -0.44 -0.09 0.6
-0.52 -0.82 -1.25 -1.15 0.13 1.47
-0.13 -0.29 -0.56 -0.49 -0.16 0.99
0.69 -0.03 -0.99 -1.52 -0.2 0.75
-0.16 0.32 -0.22 0.23 0.43 -1.07
-0.63 -0.6 -0.77 -0.3 0.04 1.18
0.02 0.52 -0.09 -0.69 -0.17 0.15
0.12 -0.08 -1.51 -2.14 -0.23 1.34
0.49 0.18 -0.83 -1.95 -0.52 0.96
-0.1 -0.14 -0.55 -0.56 -0.35 1.01
0.06 -0.11 -0.16 -0.02 -0.0 0.2
0.4 0.24 -0.5 -1.18 -0.52 0.73
0.44 -0.19 -1.45 -1.31 -0.77 1.28

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.