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Heatmap: cluster_0009 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
-0.28 -0.75 -0.64 -0.08 1.15 -0.36
-2.5 -0.15 -1.18 0.27 1.12 0.14
0.8 -0.66 -0.88 -0.48 0.98 -1.38
0.03 -0.22 -0.2 0.07 0.13 0.14
1.01 -0.97 -0.22 -0.14 0.34 -1.2
-0.82 -0.06 -0.06 -0.27 1.12 -0.99
0.9 -0.72 -2.12 -1.35 1.06 -0.31
-0.08 0.01 0.11 0.01 -0.07 0.02
-2.49 -1.41 0.43 -0.3 1.12 0.17
-0.94 -0.71 -0.02 -0.57 1.16 -0.04
-0.55 -0.33 -0.23 -1.06 0.95 0.33
1.11 -0.78 -1.81 -0.14 0.43 -0.49
-0.1 -0.26 0.08 0.12 -0.05 0.16
-0.89 -0.94 0.21 -0.83 1.49 -1.3
0.17 -1.48 -0.02 -0.44 1.23 -1.12
-0.09 -0.15 -0.21 0.05 0.57 -0.39
-1.23 -0.35 -0.17 -1.23 1.42 -0.33
-1.14 -0.53 -0.09 0.03 1.21 -0.78
-0.24 -1.42 -0.23 0.27 1.08 -0.72
-0.5 -1.8 0.09 -1.02 1.6 -1.27
-0.64 -0.42 -0.03 -0.3 0.94 -0.14
0.14 -1.01 -1.08 -1.01 1.43 -0.45
1.31 -2.42 -1.24 -1.71 1.28 -2.47
0.01 0.11 0.06 -0.06 -0.1 -0.03
-1.19 -1.45 -0.76 0.96 1.19 -1.41
-0.33 0.36 0.08 -0.04 -0.4 0.18
0.72 -1.48 0.39 -0.09 0.54 -1.78
-0.07 -0.26 0.08 0.07 0.46 -0.46
-1.52 0.06 0.12 -0.71 1.0 -0.16
-0.58 -0.58 -0.68 -0.31 1.19 -0.08
-1.26 -0.54 -1.18 -1.05 1.77 -0.84
-1.17 -0.58 -0.47 0.42 0.76 0.19
0.14 -0.1 -0.12 -0.7 0.83 -0.61
-0.55 -0.56 -1.08 -0.09 1.39 -0.71
-1.11 0.36 0.68 -1.7 1.0 -1.5
-1.26 -0.28 -0.7 -0.42 1.24 0.05
0.14 -0.64 -0.06 -0.52 0.87 -0.38
-1.17 0.67 -0.01 0.02 0.62 -1.24
-0.32 0.23 0.08 0.24 0.03 -0.39
-0.65 0.58 -0.22 -0.69 0.55 -0.1
0.11 -0.86 0.04 -1.01 0.84 0.08
0.81 -0.61 -1.87 -1.12 1.11 -0.51
-0.54 -0.36 -0.35 0.1 0.83 -0.15
-0.53 -0.98 -0.27 0.12 1.13 -0.51
-1.38 -0.32 -0.53 -0.99 1.5 -0.33
-0.8 -0.48 0.39 0.31 -0.02 0.23
0.05 -1.05 -1.69 -0.86 1.69 -1.32
-2.49 -0.93 -1.75 -0.25 1.82 -0.66
-1.35 -0.49 0.48 0.14 0.53 -0.08
0.86 -0.04 -0.78 -1.77 0.79 -0.71
-0.96 -0.04 -1.21 -1.08 1.44 -0.15
0.25 -0.48 0.04 -0.57 0.54 -0.09
-0.06 -0.35 -0.87 -0.02 1.0 -0.47
-2.29 -0.53 -0.48 -0.39 1.63 -0.89
-0.32 -0.2 -1.04 -0.12 1.17 -0.59
-0.57 -0.14 0.53 -1.73 0.56 0.27
-1.22 -1.31 -1.76 -1.22 1.89 -0.44
1.04 -0.75 -0.7 -0.71 0.87 -1.74
-0.96 0.19 -1.12 -1.05 1.45 -0.59
-0.17 -0.78 0.53 0.04 0.52 -0.69
-0.62 -0.24 -0.33 0.06 0.87 -0.24
-1.5 -1.57 -1.38 -0.59 1.51 0.49
-1.24 -0.16 -0.37 -0.16 1.3 -0.9
-1.23 -0.93 -0.64 -0.81 1.46 0.11
-0.68 -0.93 -0.89 -0.26 1.52 -0.72
-0.33 -0.61 0.08 -0.39 1.27 -1.64
-2.34 -0.7 0.07 0.71 0.61 -0.05
0.07 0.4 0.06 -0.18 -0.18 -0.28
-1.35 -1.13 -0.45 -0.24 1.38 -0.06
-0.2 -0.81 0.48 -1.0 0.86 -0.23
-0.19 -0.05 0.04 0.05 0.18 -0.05
0.12 0.06 -0.25 -0.2 -0.05 0.26
-0.26 -0.29 -0.34 0.04 0.49 0.18
0.3 -0.81 -0.36 0.17 0.68 -0.52
-1.47 -0.28 -1.15 -0.07 1.54 -1.0
-0.95 0.01 -0.81 -0.72 1.47 -0.92
-0.55 -0.75 -0.64 0.86 0.78 -0.88
-0.9 -1.21 -0.23 0.71 0.82 -0.38
-0.65 -1.35 -1.11 0.62 0.87 0.2
-2.05 -1.11 -1.85 1.08 1.04 -0.23
-0.05 -0.54 0.06 0.11 0.66 -0.66
0.98 -0.38 -0.08 -0.5 0.25 -1.26
-0.63 -0.28 -1.86 0.02 1.09 0.17
-0.65 -0.81 -1.55 -1.53 1.31 0.7
-0.09 -0.46 -1.61 -0.33 1.45 -1.09
-1.66 -0.28 0.01 -1.13 1.39 -0.36
-1.31 -2.2 0.65 -0.69 1.51 -1.57
0.87 -0.07 -0.78 -0.26 0.7 -2.44
-0.81 -0.94 -0.02 -0.29 1.11 -0.09
-0.5 -0.37 -0.34 -0.01 1.09 -0.73
-0.87 -0.07 -0.23 0.08 1.0 -0.79
1.29 -0.6 -0.85 -1.58 0.7 -1.42
-0.97 -0.63 -0.44 -0.61 1.3 -0.02
-1.26 -0.48 0.14 0.4 0.61 -0.12
-0.1 -0.38 -0.01 -0.41 0.8 -0.31
0.39 -1.11 -0.03 -0.16 0.84 -0.83
-0.02 -0.01 0.14 -0.01 -0.14 0.03
-0.68 -0.67 0.82 -1.46 0.82 -0.23
-0.34 -0.66 -0.8 0.55 1.16 -1.7
0.8 -0.63 -0.16 -0.05 0.6 -2.04
-2.45 -0.51 -0.66 -1.51 1.96 -2.1
-1.6 -0.86 0.69 -0.73 1.33 -1.37
-1.6 -1.25 0.56 0.03 1.27 -1.57
-0.39 -0.95 0.22 -0.04 1.24 -2.16
-2.0 -0.29 0.6 -1.16 1.21 -0.6
-1.62 0.37 -1.44 -0.57 1.39 -0.46
1.33 -2.41 -0.56 -0.75 0.54 -0.82
1.1 0.03 -0.93 -0.94 0.52 -1.53
-1.93 -0.76 0.81 -0.58 1.17 -1.07
-0.11 -0.17 -0.26 -0.07 0.31 0.21
0.11 -0.06 -0.02 -0.06 0.13 -0.12
-0.61 -1.06 -0.41 -0.15 1.32 -0.49
-1.27 -0.77 0.79 -1.31 0.92 -0.03
0.09 -0.15 -0.17 -0.06 0.23 0.03
0.1 -0.72 -1.46 -0.85 1.39 -0.36
0.58 -1.84 0.39 0.02 0.43 -0.85
-0.16 -1.53 -0.45 -0.26 1.09 0.09
-0.04 -0.51 -1.08 -0.51 1.41 -1.04
0.69 -1.41 -1.34 -0.78 1.27 -0.68
0.1 -0.36 -0.37 0.1 0.26 0.14
-0.38 -0.28 0.05 0.07 0.6 -0.3
-0.05 -0.32 -0.35 -0.25 0.84 -0.31
-0.03 -0.01 -0.26 -1.13 1.05 -0.6
-0.44 0.19 -0.23 0.77 0.25 -1.42
-1.42 -0.27 -1.12 0.64 0.86 -0.06
-3.28 -0.68 0.61 0.08 1.05 -0.69
0.75 -0.13 -0.11 -0.68 0.16 -0.46
-0.36 -0.44 -1.25 0.12 0.89 0.17
-0.71 -1.57 -0.12 -0.07 1.06 0.12
-0.69 -1.37 0.4 0.27 0.64 -0.13
-1.21 -0.75 0.27 0.49 0.11 0.37
-0.75 -0.59 0.57 -1.94 1.13 -0.29
-0.96 -0.78 -0.25 -0.12 1.12 -0.03
-1.36 -0.07 -0.01 0.48 0.39 -0.07
0.49 -0.33 -0.31 -0.37 0.86 -1.32
0.4 -0.58 -0.34 -0.37 0.7 -0.29
0.5 -1.19 -0.59 -1.3 0.85 0.35
0.2 -0.59 -0.36 -0.63 1.15 -0.9
-1.33 -1.39 -0.82 -0.27 1.46 0.11
0.42 -0.32 -0.12 -0.05 0.18 -0.26
-1.43 -1.3 -0.26 -0.61 1.66 -0.78
0.45 -1.08 0.24 -1.02 0.88 -0.62
-1.83 -0.1 0.08 0.74 0.17 -0.1
-1.07 -0.77 -0.02 0.0 1.01 -0.1
1.29 -1.56 -2.48 -2.12 1.04 -0.4
-1.62 0.31 0.14 0.5 0.39 -0.71
-0.96 0.16 0.0 0.62 0.76 -2.94
-0.94 0.11 -0.13 -0.85 1.2 -0.66
1.2 -1.9 -1.0 -0.54 0.89 -1.31
-0.75 -0.43 0.09 -0.17 0.64 0.21
-1.56 -0.93 0.52 0.17 0.83 -0.32
-2.35 -1.4 0.73 -0.99 1.23 -0.13
0.55 -0.16 -0.23 -0.25 0.59 -1.17
-0.9 -1.71 0.13 -0.25 1.49 -1.31
-1.07 0.05 0.13 -0.32 1.07 -1.01
-2.01 0.24 -0.47 0.51 0.58 -0.11
-0.68 -0.04 0.13 0.17 0.54 -0.46
1.27 -0.93 -0.13 -1.47 0.43 -1.18
-0.88 -0.24 -1.33 -0.8 1.56 -0.53
-0.08 -1.29 -0.5 -2.26 1.6 -0.5
-1.77 -0.77 -1.82 -1.54 1.72 0.26
-1.44 -0.71 -0.06 -0.2 1.37 -0.71
-3.91 0.05 0.87 0.29 0.11 -0.38
-0.39 -0.46 -0.68 -1.35 1.57 -0.94
0.7 -0.88 -1.3 -0.95 1.15 -0.55
0.32 -2.29 -0.16 0.52 0.6 -0.5
-1.13 -1.4 -2.06 0.85 0.8 0.46
0.82 -0.98 -0.23 -0.13 0.37 -0.59
-0.23 -0.61 -0.16 -0.79 1.31 -0.89
-0.74 -0.03 -1.1 0.26 1.0 -0.4
-0.78 -0.87 -1.32 -0.27 1.22 0.38
-2.13 -1.1 0.59 -0.1 1.04 -0.31
0.18 -0.38 -0.23 -0.7 0.85 -0.26
-1.09 -1.44 -0.88 -0.1 1.71 -1.22
0.15 -0.63 -0.65 -0.05 0.42 0.39
-1.3 -0.84 -1.02 -0.39 1.17 0.62
-0.77 -0.64 -0.61 0.09 0.96 0.14
0.34 -0.15 -0.99 -0.78 0.94 -0.28
-0.76 -0.46 0.12 -1.05 1.35 -0.85
0.07 -0.64 -1.74 -1.07 1.47 -0.39
-1.52 0.4 -0.76 -0.76 1.39 -0.94
0.29 -1.04 -2.23 -1.23 1.74 -1.69
-0.84 -0.36 -0.94 0.16 0.8 0.36
0.08 -1.6 -0.18 -0.89 1.54 -1.87
-2.24 -0.42 -1.13 -0.29 1.51 -0.13
1.38 -1.39 0.14 -0.92 0.18 -1.98
-2.43 -0.66 0.16 0.52 0.78 -0.13
-0.71 -0.69 -0.08 0.25 0.77 -0.1
-1.45 -1.58 -1.37 -1.26 2.01 -1.13
-0.22 0.48 -0.24 0.42 0.23 -1.37
0.6 -1.07 -0.76 -0.09 0.94 -0.84
-1.24 -0.34 -0.02 -0.32 1.02 -0.05
-1.68 -0.8 1.18 -1.41 1.03 -1.23
-1.12 -1.76 1.15 -1.17 1.06 -0.99
0.55 0.06 -1.31 -0.54 0.84 -0.69
-3.19 -1.43 -0.73 0.27 1.75 -1.54
-0.39 -0.31 0.08 -0.33 0.83 -0.31
-0.37 -0.45 -0.48 -0.52 0.99 0.13
-2.45 -0.41 -0.23 0.12 1.52 -1.91
-2.4 -0.51 -1.12 -0.89 1.5 0.36
0.47 -1.44 -0.6 -0.68 1.08 -0.24
-0.96 -0.02 0.27 -0.89 1.11 -0.73
0.12 -0.47 -1.06 -0.03 1.12 -0.85
-1.42 -1.26 0.51 -0.76 1.35 -0.62
-2.18 -0.78 -0.57 -0.21 1.6 -0.68
-0.44 0.13 -0.07 -0.74 0.76 -0.11
-0.26 -0.71 -1.09 -0.26 1.42 -0.79
-0.4 -1.0 0.72 -0.76 0.76 -0.29
0.98 -1.44 -0.19 0.07 0.23 -0.85
-0.77 -0.69 -0.82 -0.35 1.64 -1.62
-0.82 -1.73 -0.83 -0.36 1.31 0.39
-1.81 -0.99 -0.92 0.46 1.5 -1.06
0.83 -0.32 0.03 -0.69 0.58 -1.81
0.45 -0.93 -2.04 -0.95 1.23 -0.0
-1.1 -0.38 0.06 0.21 0.75 -0.17
-1.55 -0.61 -1.49 -0.57 1.64 -0.24
-1.8 -2.25 -1.52 1.18 0.95 -0.07
-1.08 -1.86 0.43 -0.06 0.78 0.29
-1.22 -0.25 -1.16 -0.11 0.95 0.51
-1.24 -0.54 -0.7 -0.78 1.7 -1.2
-3.09 -1.5 -0.7 -0.43 1.47 0.49
-0.52 -0.32 0.09 0.31 0.17 0.09
-1.49 -0.15 0.67 -0.83 1.11 -1.22
1.06 -2.48 -0.17 -1.04 0.98 -1.36

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.