Heatmap: cluster_0018 (HCCA clusters)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
0.36 0.18 -0.13 -0.5 -0.24 0.15
0.44 0.06 -0.04 -0.33 -0.29 0.02
0.3 0.12 -0.17 -0.3 -0.23 0.16
0.66 0.18 -0.07 -0.75 -0.54 0.07
-1.46 -0.83 -0.31 -0.11 0.58 0.89
0.62 -0.73 0.62 -0.05 -1.11 -0.15
0.28 0.11 0.29 -0.34 -0.4 -0.1
0.15 0.14 -0.03 -0.1 -0.22 0.03
0.32 0.21 0.09 -0.16 -0.46 -0.14
-0.47 -0.13 -1.39 0.22 0.3 0.67
0.43 0.31 0.01 -0.43 -0.37 -0.17
0.36 0.1 -0.2 -0.28 -0.1 0.02
0.26 0.21 -0.03 -0.25 -0.33 0.05
0.12 -0.4 -0.04 -0.08 0.13 0.19
0.38 0.18 -0.08 -0.31 -0.41 0.09
0.33 0.22 0.06 -0.29 -0.46 -0.02
0.08 0.3 0.13 -0.28 -0.37 0.04
0.37 0.24 0.1 -0.5 -0.56 0.1
0.25 0.21 -0.1 -0.4 -0.2 0.13
0.03 0.08 -0.0 -0.1 -0.1 0.09
0.47 -0.15 0.04 -0.4 -0.29 0.16
0.44 0.2 -0.08 -0.24 -0.37 -0.1
0.2 0.09 -0.08 -0.1 -0.21 0.07
0.32 0.11 -0.03 -0.23 -0.35 0.07
0.45 0.54 0.06 -1.29 -0.15 -0.28
0.47 0.21 0.43 -0.72 -0.57 -0.29
-0.29 -0.42 -0.14 -0.05 0.3 0.4
0.18 0.24 0.06 -0.2 -0.27 -0.08
0.72 0.02 -0.02 -0.47 -0.57 -0.08
0.24 0.18 -0.02 -0.22 -0.31 0.07
0.21 0.07 0.1 -0.09 -0.22 -0.12
0.07 0.27 0.27 -0.26 -0.47 -0.02
0.26 0.25 0.06 -0.3 -0.36 -0.02
0.17 0.15 0.12 -0.14 -0.24 -0.11
0.15 0.1 -0.11 -0.14 -0.18 0.14
0.51 0.09 -0.06 -0.53 -0.19 -0.03
0.22 0.13 -0.09 -0.37 -0.09 0.12
0.29 0.17 0.02 -0.25 -0.22 -0.09
0.71 0.28 -0.0 -1.36 -0.82 0.26
-0.66 0.01 0.08 0.16 0.27 -0.04
0.33 0.14 -0.09 -0.38 -0.2 0.08
0.56 0.35 0.07 -0.29 -0.94 -0.22
0.26 0.16 -0.04 -0.17 -0.27 -0.0
0.26 0.29 0.08 -0.36 -0.46 0.03
0.37 0.29 -0.19 -0.59 -0.29 0.17
0.48 0.13 0.02 -0.46 -0.41 0.02
0.21 0.3 0.2 -0.38 -0.39 -0.09
0.35 0.06 0.16 -0.3 -0.35 -0.05
0.49 0.56 0.36 -0.56 -1.56 -0.26
0.28 0.22 0.04 -0.27 -0.25 -0.11
0.31 0.13 0.04 -0.55 -0.28 0.18
0.2 0.04 -0.05 -0.1 -0.08 -0.03
0.45 0.29 -0.33 -0.76 -0.28 0.26
-2.51 0.05 0.44 0.08 0.6 -0.21
0.15 -0.01 0.07 -0.17 -0.09 0.03
0.31 0.25 0.16 -0.21 -0.59 -0.12
0.1 0.19 0.2 -0.19 -0.37 -0.02
0.13 0.27 0.25 -0.19 -0.6 -0.04
0.3 0.25 0.05 -0.39 -0.41 0.05
0.14 0.21 0.06 -0.23 -0.19 -0.04
0.31 0.17 -0.39 -0.06 -0.27 0.11
0.35 0.07 -0.12 -0.22 -0.23 0.07
0.06 0.05 0.04 -0.05 -0.09 -0.02
0.08 0.2 -0.11 -0.27 -0.2 0.22
0.4 0.21 0.07 -0.28 -0.5 -0.08
0.21 0.26 0.2 -0.28 -0.56 0.0
-0.57 0.54 0.23 -0.45 0.03 -0.08
0.77 -2.09 0.74 -0.41 -0.08 -0.54
0.11 0.2 0.11 -0.16 -0.27 -0.05
0.24 0.59 0.2 -1.02 0.37 -1.39
0.86 0.32 0.63 -2.76 -0.21 -1.4
0.13 0.11 0.01 -0.23 -0.11 0.06
0.42 -0.07 -0.05 -0.37 -0.23 0.16
0.45 0.34 -0.02 -0.67 -0.64 0.15
0.01 0.11 0.01 -0.05 -0.1 0.01
0.3 0.31 -0.0 -0.24 -0.47 -0.06
0.25 0.18 0.03 -0.26 -0.18 -0.08
0.12 0.16 0.03 -0.11 -0.21 -0.03
0.49 0.32 -0.09 -0.39 -0.67 0.02
0.38 -0.01 -0.13 -0.26 -0.24 0.15
0.12 0.01 0.09 -0.23 -0.09 0.07
0.1 -1.63 -0.26 -0.11 0.11 0.82
-0.28 -2.84 0.03 -0.05 0.25 0.9
0.36 0.16 -0.01 -0.4 -0.32 0.06
0.57 -0.15 -0.04 -1.36 -0.11 0.41
0.02 0.22 0.16 -0.17 -0.32 0.02
0.43 0.31 -0.0 -0.46 -0.52 -0.01
0.33 0.15 0.05 -0.31 -0.26 -0.07
-1.72 -0.26 -0.55 -0.2 0.58 0.86
0.29 0.14 0.01 -0.15 -0.4 0.02
-0.25 0.3 0.2 0.01 -0.16 -0.18
0.28 0.18 0.04 -0.19 -0.42 -0.0
0.37 0.47 0.18 -0.46 -0.81 -0.18
0.19 0.2 0.29 -0.8 -0.06 -0.06
0.22 0.35 0.05 -0.53 0.09 -0.38
0.31 0.32 0.09 -0.39 -0.45 -0.07
0.14 0.05 0.12 -0.39 0.03 -0.03
0.18 -0.34 -0.1 0.05 -0.12 0.25
0.26 -0.0 -0.11 -0.1 -0.16 0.06
0.36 0.22 -0.02 -0.58 -0.3 0.12
0.27 0.2 -0.11 -0.31 -0.2 0.06
0.28 0.22 0.35 -1.11 -0.08 -0.08
0.08 0.29 0.18 -0.14 -0.42 -0.1
0.0 -1.48 -0.12 -0.63 0.68 0.55
0.35 0.23 0.1 -0.34 -0.4 -0.11
0.28 0.51 0.01 -0.68 -0.93 0.26
0.17 0.18 0.08 -0.23 -0.29 0.02
0.05 0.2 0.19 -0.14 -0.3 -0.06
0.66 0.11 -0.29 -0.74 -0.39 0.21
0.22 0.52 0.29 -0.81 -0.25 -0.4
0.05 -0.47 -0.23 0.1 -0.03 0.42
0.45 0.09 -0.03 -0.45 -0.28 0.06
0.49 0.2 -0.16 -0.4 -0.26 -0.07
0.22 0.38 -0.95 0.05 -0.42 0.31
0.58 0.18 -0.17 -0.78 -0.24 0.08
0.17 0.18 0.12 -0.21 -0.23 -0.09
0.11 -1.15 -0.48 -0.31 0.2 0.85
0.28 0.16 0.24 -0.38 -0.46 -0.01
0.64 0.09 0.42 -0.58 -0.89 -0.26
0.82 0.45 0.28 -1.22 -1.49 -0.21
0.25 0.2 0.02 -0.29 -0.32 0.04
0.27 0.13 0.04 -0.21 -0.19 -0.1
0.06 0.24 0.34 -0.1 -0.52 -0.18
1.09 0.45 -0.41 -1.48 -0.88 -0.24
0.56 0.28 -0.08 -0.63 -0.49 0.02
0.39 0.28 -0.04 -0.6 -0.53 0.2
0.91 0.23 -0.02 -0.7 -1.23 -0.11
0.22 0.18 0.08 -0.29 -0.26 -0.01
0.41 0.1 0.03 -0.37 -0.45 0.1
0.22 0.1 0.13 -0.13 -0.33 -0.07
0.62 0.34 0.12 -0.29 -1.07 -0.29
-0.04 0.17 0.06 -0.21 -0.12 0.1
-0.05 0.22 0.12 -0.13 -0.2 0.01
0.52 0.35 0.05 -0.55 -0.54 -0.18
0.23 0.28 0.13 -0.3 -0.61 0.07
0.27 0.18 -0.01 -0.22 -0.23 -0.06
-0.4 -0.3 -0.23 0.01 0.3 0.42
0.21 0.26 0.17 -0.31 -0.38 -0.09
0.31 0.08 0.02 -0.26 -0.22 -0.01
0.24 0.1 -0.07 -0.16 -0.22 0.07
0.28 0.11 -0.03 -0.19 -0.28 0.04
0.25 0.41 0.13 -0.44 -0.67 0.03
0.36 0.13 -0.07 -0.51 -0.02 -0.02
0.14 0.17 0.31 -0.09 -0.47 -0.2
0.46 0.33 -0.17 -0.7 -0.38 0.13
-0.86 -1.77 -0.14 -0.41 0.61 0.97
0.63 0.23 0.06 -0.78 -0.85 0.14
0.31 -0.21 0.08 0.07 -0.55 0.15
0.3 0.18 0.09 -0.34 -0.36 -0.0
0.37 0.15 0.2 -0.28 -0.86 0.11
0.29 0.07 -0.06 -0.19 -0.19 0.01
0.24 0.07 0.08 -0.17 -0.22 -0.06
0.37 0.08 -0.19 -0.36 -0.13 0.11
0.21 0.07 0.07 -0.42 0.05 -0.05
-2.49 -0.12 0.39 0.21 0.73 -0.36
0.29 0.21 0.12 -0.35 -0.46 0.02
0.14 0.18 0.19 -0.3 -0.4 0.07
0.43 0.26 0.1 -0.41 -0.52 -0.09
0.6 0.28 0.29 -0.15 -1.25 -0.48
0.26 0.1 0.03 -0.32 -0.27 0.11
0.3 0.27 0.16 -0.33 -0.53 -0.07
0.63 0.37 0.17 -0.75 -1.13 -0.02
0.15 0.1 0.06 -0.1 -0.22 -0.02
0.22 0.14 -0.16 -0.15 -0.14 0.04
0.64 -0.04 -0.19 -0.33 -0.54 0.15
0.41 0.2 0.09 -0.28 -0.74 0.06
0.09 0.02 0.05 -0.14 -0.06 0.02
0.15 0.14 0.2 -0.37 -0.51 0.22
0.02 0.13 0.15 -0.05 -0.17 -0.11
-0.47 0.27 0.1 0.19 -0.15 -0.07
0.53 0.26 0.14 -0.49 -0.64 -0.15
0.62 0.04 -0.02 -0.43 -0.63 0.08
-0.15 0.14 0.04 0.0 -0.23 0.16
0.56 0.02 -0.05 -0.5 -0.09 -0.15

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.