Heatmap: cluster_0031 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
0.08 1.08 -2.13 0.13 -1.74 0.27
-1.12 -0.87 -0.3 0.59 0.67 0.12
-0.05 0.19 0.06 -0.12 -0.11 0.01
0.09 -0.23 0.52 0.03 -0.51 -0.1
-0.62 -0.62 -0.16 0.42 0.57 -0.03
-1.65 -3.73 -4.13 2.02 0.56 -6.33
-0.23 -0.26 -0.12 0.13 0.35 0.04
-0.24 -0.1 -0.1 0.26 0.15 -0.02
-0.74 -1.16 -0.41 0.7 0.58 0.11
-1.15 0.15 0.13 0.53 0.4 -0.77
-2.73 0.06 0.25 -0.17 0.22 0.65
-0.95 -1.06 -1.68 0.76 1.03 -0.05
-0.36 -0.25 0.09 0.2 -0.14 0.33
-1.31 0.79 -0.3 0.32 0.03 -0.35
0.36 0.72 0.03 -0.08 -1.0 -0.71
-0.51 0.38 0.26 -0.11 -0.02 -0.17
-0.18 -0.16 -0.22 0.29 0.28 -0.11
-0.09 -0.27 -0.15 0.19 0.28 -0.03
-2.67 1.29 -0.27 0.01 -0.76 -0.05
-0.05 -0.25 -0.26 0.28 0.28 -0.1
-0.25 -0.34 -0.16 0.22 0.51 -0.17
-0.49 -0.66 -0.15 0.49 0.52 -0.12
-0.19 -0.22 -0.26 0.24 0.4 -0.11
-0.32 -0.13 -0.37 0.79 0.2 -0.67
-3.4 0.2 -2.22 1.25 0.31 -0.13
-1.31 -1.01 -0.77 1.24 0.5 -0.42
-0.44 -0.45 -0.5 0.36 0.6 0.03
-0.6 0.62 -0.52 0.28 -0.28 0.09
-0.55 -1.41 0.34 -0.24 0.59 0.41
0.11 0.17 -0.06 -0.0 -0.16 -0.07
-1.01 -0.05 0.14 0.41 -0.27 0.36
-0.5 -0.29 -0.06 0.26 0.38 0.02
-0.68 -0.66 -0.52 0.72 0.71 -0.4
-2.74 -0.15 -1.88 1.36 0.71 -1.06
-1.17 -1.38 -0.51 0.85 0.62 0.19
-1.34 -0.42 -0.6 1.04 0.13 0.06
-0.84 -0.94 -0.26 0.59 0.75 -0.15
-4.33 0.45 -0.14 0.75 -0.96 0.57
-0.39 0.38 0.05 0.03 -0.31 0.1
0.11 0.36 -0.06 0.13 -0.7 -0.06
-0.45 -0.21 -0.16 0.39 0.27 -0.01
-0.36 -0.65 1.21 0.24 -0.99 -0.78
-2.11 0.06 0.32 -0.98 0.3 0.79
0.05 0.4 0.32 -1.54 -0.14 0.19
-0.21 -0.26 -0.28 0.38 0.31 -0.1
-1.84 -0.68 -0.69 1.08 0.78 -0.62
-0.9 -0.63 -0.4 0.77 0.46 -0.03
-0.87 -0.81 -0.12 0.36 0.7 0.08
-0.14 -0.1 -0.53 0.61 0.05 -0.15
-0.09 -0.18 -0.41 0.39 0.25 -0.11
-0.52 -0.32 -0.09 0.34 0.39 -0.02
-0.16 -0.56 -0.29 0.46 0.44 -0.19
-0.77 -0.37 -0.96 0.47 0.85 -0.1
-0.64 -0.41 -0.16 0.36 0.51 -0.0
-0.15 -0.21 -0.13 0.11 0.26 0.06
-0.14 0.25 0.04 -0.11 -0.2 0.09
0.23 -0.41 0.31 0.11 -0.45 0.03
-0.27 -0.43 -0.11 0.23 0.51 -0.15
-2.34 -1.47 -0.62 1.02 0.87 -0.11
-0.41 -0.23 -0.89 0.99 0.38 -0.84
-1.61 1.33 -0.73 0.32 -1.13 -0.24
-0.28 -0.19 -0.19 0.33 0.15 0.08
-0.34 -0.47 -0.52 0.92 0.5 -1.05
-0.59 -1.18 -1.03 0.86 0.78 -0.2
-1.8 -1.03 -1.37 1.24 0.27 0.34
-0.16 -0.22 -0.22 0.24 0.34 -0.09
-0.16 -0.44 -0.81 0.54 0.47 -0.05
-0.09 -0.14 0.25 -0.15 -0.45 0.41
-1.14 0.36 0.4 -0.15 -0.58 0.46
-0.79 -2.32 -1.53 1.12 0.83 -0.1
-1.5 -1.98 -0.95 1.46 0.11 0.06
-1.65 -0.56 -0.27 1.15 0.55 -1.04
0.1 0.56 -0.11 -0.07 -0.61 -0.11
-0.35 0.41 0.1 -0.63 0.05 0.18
0.04 0.15 0.03 -0.08 -0.09 -0.06
-0.74 -0.49 -0.29 0.38 0.66 -0.01
-0.07 -0.07 -0.14 0.09 0.24 -0.09
-2.07 0.93 0.53 -0.86 -0.35 0.11
-0.54 -0.58 -0.16 0.61 0.49 -0.29
-0.04 -0.95 -0.38 0.68 0.48 -0.41
-0.21 0.57 0.35 -0.47 -0.38 -0.19
-0.54 0.48 0.33 -0.51 -0.15 0.08
0.23 -0.88 -0.03 0.35 0.47 -0.64
-0.43 -0.1 0.79 -0.28 -1.64 0.53
-1.15 -0.93 -1.53 0.98 1.15 -1.06
-1.16 0.59 -0.15 0.31 -0.99 0.49
-2.3 -0.63 -1.43 1.38 0.68 -0.82
-0.75 -0.5 -0.34 0.45 0.57 0.08
-0.91 -1.08 -0.55 1.24 0.19 -0.31
-2.97 -3.21 -0.58 1.18 0.95 -0.17
0.09 0.44 -0.28 0.27 -1.12 0.12
-0.29 -0.69 -1.12 0.85 0.7 -0.57
-0.22 0.33 0.22 -0.26 -0.1 -0.09
-0.11 0.19 0.01 0.16 -0.41 0.07
-1.76 -1.7 -1.13 0.98 1.19 -0.53
-0.58 -0.42 -0.3 0.45 0.32 0.2
-1.7 -1.13 0.52 -0.18 0.38 0.7
-0.22 0.1 0.11 0.17 -0.61 0.27
-0.35 -0.46 -0.24 0.45 0.47 -0.17
0.56 -0.93 0.07 0.04 -0.12 0.0
-0.22 -0.08 -0.16 0.2 0.28 -0.09
-1.61 -0.36 -0.86 1.13 0.57 -0.57
-0.17 0.21 0.28 -0.73 -0.56 0.54
-0.41 0.01 0.14 0.17 0.07 -0.06
-1.59 1.06 0.33 -0.07 -0.59 -0.49
0.24 -1.75 -1.89 1.05 0.94 -1.95
-0.14 -0.32 -0.17 0.4 0.39 -0.38
-0.29 -0.35 -0.22 0.36 0.36 -0.04
-0.32 0.2 0.3 -0.57 -0.24 0.37
0.18 0.21 -0.01 -0.11 -0.31 -0.02
-0.15 -0.16 -0.23 0.15 0.37 -0.08
-1.34 -0.86 -0.89 1.54 0.45 -2.12
-0.21 -0.19 -0.07 0.39 0.03 -0.04
-4.22 -1.82 -0.6 1.26 0.95 -0.58
-0.38 -0.13 -0.51 0.4 0.46 -0.11
-0.2 0.57 0.35 -0.64 -0.36 -0.07
-0.52 0.02 0.22 0.24 0.03 -0.12
-0.16 -0.15 -0.13 0.15 0.27 -0.04
-0.79 -0.49 -0.34 0.64 0.37 0.09
-0.45 0.42 0.19 -0.16 -0.09 -0.08
-0.79 -0.8 -0.85 0.66 0.8 -0.06
-0.41 -0.65 -0.33 0.5 0.59 -0.17
0.33 0.92 -0.34 0.26 -2.34 -0.58
-0.1 -0.21 -0.41 0.47 0.21 -0.14
-0.45 0.3 0.33 -0.36 -0.21 0.19
-0.87 -0.9 -0.29 0.64 0.71 -0.14
-0.99 -1.13 -1.25 0.87 1.02 -0.39
-0.71 -0.91 -1.51 0.76 0.93 -0.15
-0.86 0.37 0.78 0.03 -2.41 0.3
-0.46 -0.38 -1.13 0.6 0.62 -0.01
0.19 0.44 0.02 -0.57 -0.48 0.13
-0.09 -0.06 -0.23 0.4 0.02 -0.14
-0.01 0.45 0.23 0.14 -1.29 -0.07
-0.25 -0.35 -0.29 0.25 0.51 -0.07
-0.64 -0.51 -0.18 0.52 0.33 0.12
-0.05 0.17 0.23 -0.2 -0.87 0.4
-0.45 -0.22 -0.36 0.38 0.57 -0.24
-0.28 -0.43 -0.65 0.38 0.84 -0.49
-0.16 -0.12 0.34 -0.55 -2.6 1.05
-2.41 0.12 -0.02 0.34 -0.23 0.69
-0.34 -0.05 0.45 -0.42 -0.65 0.58
-0.21 -0.55 -0.2 0.62 0.26 -0.23
0.12 0.14 0.09 -0.5 -0.04 0.1
0.06 0.06 -0.06 0.09 -0.1 -0.06
-1.08 0.07 0.66 -0.43 -0.1 0.28
-1.2 -0.17 1.01 -1.58 -0.54 0.72
-0.1 0.5 -0.02 0.33 -0.83 -0.24
0.04 -0.01 0.21 -0.26 -0.19 0.15
-0.56 -1.07 -0.17 0.52 0.47 0.19
-0.59 -0.69 -0.77 0.49 0.84 -0.08
-0.57 -0.25 -0.82 0.53 0.69 -0.21
-0.28 -0.28 -0.48 0.37 0.52 -0.14
-3.6 -2.16 -0.47 1.1 0.78 0.15
-0.68 -0.14 0.41 -0.1 -0.2 0.42
-0.58 -0.48 -0.39 0.55 0.59 -0.18
-0.06 -0.2 -0.38 0.38 0.35 -0.26
-0.18 -0.16 -0.17 0.23 0.32 -0.13
0.24 -0.01 0.28 -0.49 -0.29 0.11
-0.18 -0.01 -0.18 0.38 0.26 -0.41
-3.8 1.06 0.84 -0.03 -0.71 -1.08
0.05 0.62 -0.08 -0.33 -0.59 0.04
-0.21 -0.39 -0.36 0.36 0.44 -0.06
-0.55 -0.24 -0.41 0.55 0.46 -0.19
-1.34 0.36 0.61 -0.65 -2.04 0.94
-0.26 -0.19 -0.12 0.18 0.23 0.08
-3.23 -1.42 -2.39 0.85 1.42 -0.22
-0.14 -0.35 -0.67 0.59 0.43 -0.27
-0.18 -0.1 -0.11 0.08 0.25 0.02
-0.15 0.21 0.2 -0.12 -0.16 -0.04
-1.01 0.41 0.55 -0.78 -0.07 0.24
-0.61 -0.06 0.04 0.06 0.25 0.18
-1.25 -1.01 -0.51 1.34 0.37 -0.85
-1.5 0.02 0.04 0.2 0.19 0.4
-0.36 -0.29 -0.83 0.96 0.45 -0.91
-2.03 -1.24 -0.51 0.76 0.83 0.22
-0.79 0.73 0.26 -1.46 -0.89 0.73
-2.3 1.35 0.37 -0.09 -2.22 -0.33
0.44 0.04 0.2 -0.97 0.18 -0.27
0.57 -0.71 0.5 0.01 -0.63 -0.26
-0.72 -0.51 -0.02 0.39 0.62 -0.23
-1.31 0.08 0.62 -1.62 -1.7 1.24
0.05 0.76 -0.73 0.5 -1.45 -0.17
-0.58 0.36 0.32 -0.28 -0.82 0.5
-0.26 0.27 0.36 -0.15 -1.1 0.4
-2.79 -0.04 0.34 0.28 0.41 0.1
-0.16 -0.24 -0.23 0.31 0.31 -0.12
-1.31 0.32 0.45 -0.88 -0.66 0.86
-0.63 -0.54 -0.18 0.43 0.65 -0.22
-2.68 -0.8 -0.68 0.67 1.08 -0.1
-1.45 -1.42 -0.6 0.83 0.68 0.29
-0.94 -0.57 -0.26 0.67 0.67 -0.35
-0.28 0.85 0.22 -0.26 -1.26 -0.05
-0.39 -0.32 -0.28 0.36 0.47 -0.09
-0.04 0.23 0.16 0.02 -0.43 -0.04
-3.29 -0.3 0.32 0.07 0.25 0.68
-0.29 -0.29 -0.38 0.18 0.54 0.0
-0.39 0.4 0.33 -0.09 -0.15 -0.28
-2.15 -1.4 -0.98 1.14 0.56 0.28
-3.55 0.65 0.64 -0.3 0.09 -0.14
-1.27 0.21 0.05 -0.15 -0.13 0.65
-1.96 0.01 0.39 0.36 0.01 0.18
-1.23 -0.55 -0.16 0.32 0.79 0.03
-0.03 -0.12 0.19 0.03 -0.43 0.26
0.39 -0.32 0.78 -0.49 -0.71 -0.24
-0.15 -0.2 -0.09 0.18 0.22 -0.02
-0.01 0.37 -0.1 0.44 -1.7 0.15
-1.43 -1.08 -0.46 0.71 0.77 0.11
-0.53 0.05 0.15 0.06 0.07 0.1
0.56 0.58 -0.32 0.18 -1.68 -0.35
-0.53 -0.27 -0.33 0.51 0.32 0.02
-0.01 0.01 0.08 0.24 -0.69 0.2
-0.01 -0.55 -0.29 0.29 0.46 -0.15
-0.44 0.54 0.54 -0.65 -0.34 -0.11
-2.0 0.9 0.58 -0.52 -0.79 0.16
-2.11 -0.83 -1.23 1.59 0.56 -1.77
-0.19 -0.05 0.18 -0.02 -0.02 0.08
-1.33 0.53 0.46 -1.31 -0.89 0.88
0.34 -0.97 -0.54 0.28 0.62 -0.35
-0.05 0.41 0.22 -0.22 -1.86 0.49
-0.29 -0.3 0.3 -0.3 0.11 0.31
-1.24 -1.89 -0.54 0.83 1.1 -0.5
-0.28 -0.16 -0.26 0.43 0.4 -0.36
-0.1 -0.11 -0.18 0.24 0.18 -0.09
-0.82 0.35 0.68 -0.54 -0.15 -0.04
-2.26 -0.44 -0.65 1.11 0.19 0.15

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.