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Heatmap: cluster_0052 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
-0.1 0.24 -0.52 0.2 0.43 -0.52
-0.15 -0.03 -0.13 -0.18 0.07 0.34
0.28 -0.2 -0.48 -0.23 0.04 0.4
0.27 -0.22 0.18 -0.08 0.23 -0.54
-1.68 0.32 -0.51 -1.49 -0.83 1.5
-0.54 0.06 -0.26 0.06 0.13 0.38
-0.29 -0.95 -2.4 -2.15 -1.12 1.92
-2.13 -1.51 1.05 -1.2 1.32 -1.25
-0.46 0.19 0.29 0.35 0.23 -1.13
-0.46 -0.01 0.89 -0.64 0.66 -2.31
0.51 0.22 -0.32 0.01 -0.0 -0.72
0.43 -0.91 -1.2 -0.51 -0.69 1.24
0.08 -0.08 -0.41 -0.27 0.02 0.48
0.1 -1.32 0.12 -0.44 -0.22 0.89
0.32 -0.58 0.2 -0.13 0.13 -0.11
-0.37 0.11 -0.42 -0.08 0.28 0.31
-0.23 0.01 -0.28 -0.7 -0.49 0.99
0.4 -0.8 0.55 -0.19 0.73 -3.41
0.38 0.08 0.59 -1.75 0.65 -1.9
0.04 -0.21 -0.32 -0.15 0.17 0.35
0.07 -0.05 -0.32 -0.31 0.09 0.39
0.12 -0.02 -0.01 0.05 0.12 -0.29
-0.01 -0.07 -0.82 -0.52 0.15 0.75
-0.07 -0.26 0.4 -0.31 0.65 -0.94
0.09 -0.02 -0.37 -0.15 0.06 0.31
-0.22 -0.26 0.23 0.04 0.47 -0.47
-0.03 0.0 0.26 -0.01 0.27 -0.67
-0.49 -0.5 -0.78 -0.64 0.41 1.02
0.18 -0.86 -0.35 -0.25 -0.11 0.82
0.49 0.28 0.02 -0.59 0.41 -1.45
0.89 -1.08 -0.01 -0.44 0.68 -1.58
0.04 0.03 -0.42 -0.4 0.12 0.44
0.13 0.02 -0.04 0.03 -0.02 -0.13
0.76 -0.62 -0.47 0.12 0.71 -2.2
-0.04 0.5 -0.59 0.28 -0.09 -0.34
0.53 -0.63 -0.06 0.19 0.63 -1.94
-0.1 -0.01 -0.14 0.08 0.08 0.09
-0.01 -0.26 -0.3 -0.02 0.13 0.35
-0.01 -0.0 -0.23 -0.07 0.01 0.26
-0.5 -0.72 0.36 0.52 0.5 -0.83
0.27 -0.14 -0.49 -0.32 0.06 0.42
1.1 -1.72 -0.79 -0.45 0.59 -0.46
0.34 -0.12 -1.08 -1.07 -0.71 1.17
0.13 0.15 -0.25 -0.42 -0.42 0.55
-0.12 -0.02 -0.25 -0.1 0.13 0.3
-0.03 -0.1 -0.42 -0.31 0.17 0.5
-1.04 0.26 0.1 -0.42 -0.13 0.66
0.05 -0.02 -0.04 -0.22 0.06 0.14
-0.31 -0.84 -0.45 -0.44 -0.35 1.25
0.5 -1.09 0.63 -0.98 0.84 -1.92
-0.09 -0.09 -0.22 -0.18 0.22 0.27
0.05 -0.05 0.19 -0.08 0.25 -0.46
0.92 -1.5 -0.14 -1.37 -2.42 1.18
-0.0 0.07 -0.21 -0.08 -0.03 0.22
0.22 0.3 -0.6 0.12 0.08 -0.31
0.07 -0.16 0.09 0.12 0.1 -0.27
0.3 -2.93 -0.77 -0.1 0.14 1.02
0.03 0.06 -0.13 -0.11 -0.05 0.18
-1.93 0.06 -0.37 -0.36 -0.74 1.35
-2.32 -0.31 -1.43 -1.62 0.33 1.61
-0.16 -0.46 -1.02 -0.67 0.67 0.74
-0.21 0.01 -0.61 -0.37 0.1 0.71
0.52 -0.6 -0.67 -1.38 -0.72 1.19
0.16 0.01 -0.02 -0.03 0.02 -0.15
-0.04 0.05 -0.01 0.08 -0.02 -0.08
0.23 -0.09 -0.05 -0.04 0.19 -0.3
0.34 -0.19 -0.1 -0.07 0.41 -0.65
0.22 -0.13 0.07 -0.13 0.18 -0.29
-0.61 -1.85 0.78 0.42 0.72 -1.45
-1.4 -0.36 -0.21 -0.4 -0.33 1.28
0.68 -1.1 -0.07 -1.1 -1.26 1.06
0.07 -0.3 0.41 -0.23 0.44 -0.73
0.17 0.0 -0.01 -0.23 0.31 -0.34
0.16 -0.62 0.07 0.33 0.39 -0.7
-0.07 -0.26 -0.57 -0.37 0.3 0.62
0.05 -0.11 0.01 -0.22 -0.16 0.35
-1.31 -0.55 -0.14 -0.75 0.22 1.16
-0.04 -0.07 -0.13 0.0 0.06 0.16
-0.07 0.02 0.01 0.04 0.16 -0.19
-1.76 0.16 0.74 -0.04 0.37 -0.62
0.07 -0.17 -0.46 -0.22 0.09 0.49
-0.16 -0.01 -0.31 -0.25 0.22 0.37
-0.12 -0.06 -0.43 -0.18 0.21 0.42
0.09 -0.08 -0.25 -0.08 0.07 0.2
-0.93 -0.25 -0.71 0.08 -0.45 1.16
-0.87 0.21 0.98 -0.26 0.33 -2.14
-0.08 -0.02 0.21 0.0 0.09 -0.25
0.24 0.17 -1.03 0.52 0.13 -0.57
-0.01 -0.08 -0.16 -0.05 0.08 0.19
0.11 0.02 -0.0 -0.01 0.06 -0.2
0.25 -1.61 -0.91 0.18 -0.79 1.16
0.16 0.19 0.0 -0.55 0.32 -0.31
0.21 -0.16 0.32 -1.46 -1.1 0.91
-0.34 0.07 -0.18 0.03 0.1 0.25
0.04 -0.36 -0.43 0.08 -0.0 0.48
-1.22 0.08 -1.18 -0.95 -0.1 1.39
-0.13 0.02 0.35 -0.11 0.14 -0.38
-0.02 0.14 -0.15 -0.24 -0.01 0.22
0.2 -0.16 0.01 -0.08 0.12 -0.13
-0.46 -1.37 0.44 0.55 0.67 -1.08
0.19 -0.32 -1.01 -0.52 0.31 0.71
-0.02 -0.17 -1.03 -0.94 0.52 0.74
0.1 -0.16 -0.36 -0.11 0.04 0.38
0.22 0.1 0.46 -0.18 -0.07 -0.87
-0.07 0.11 0.2 -0.79 0.73 -0.79
0.02 -0.09 -0.18 -0.06 0.11 0.17
-1.78 -0.19 -0.44 -0.82 -0.3 1.44
0.06 -0.12 -0.34 -0.21 0.18 0.32
-0.03 -0.07 -0.4 -0.32 0.21 0.44
-0.04 -0.04 -0.37 -0.18 0.16 0.35
0.23 -0.0 0.24 -0.34 0.11 -0.36
-0.0 0.01 -0.33 -0.27 0.18 0.31
-0.51 -0.99 1.03 -1.85 1.17 -2.11
0.75 -1.43 -0.49 0.03 -0.9 0.74
0.01 -0.1 -0.19 -0.07 0.13 0.18
0.1 0.0 -0.5 -0.61 0.2 0.5
0.62 -0.69 0.04 -0.12 0.82 -2.9
0.12 -0.35 -1.01 -0.02 -1.24 1.15
-2.0 -0.38 -0.21 -0.3 -0.82 1.46
-1.52 0.22 0.52 0.36 0.42 -1.22
-0.08 0.82 -1.24 0.44 -0.08 -0.83
0.65 -0.24 0.09 -1.43 0.83 -1.44
0.44 0.16 -0.25 0.07 -0.03 -0.61
-0.12 -0.04 0.32 -0.34 0.2 -0.13
0.53 -0.08 0.02 -0.42 -1.54 0.59
-0.26 0.31 -0.36 0.08 0.46 -0.5
-1.86 -0.36 -0.91 -0.34 -0.6 1.57
0.87 -0.89 0.72 -1.29 0.49 -2.54
-0.06 -0.01 -0.3 -0.03 0.15 0.19
0.1 -0.13 -0.35 -0.14 0.16 0.27
-0.07 0.02 -0.46 -0.23 0.16 0.41
0.03 0.01 0.02 -0.06 0.14 -0.15
0.87 -1.01 0.09 -0.81 0.87 -2.23
-0.07 -0.01 -0.19 -0.1 0.01 0.3
-0.02 -0.19 -0.05 -0.44 0.09 0.45
-0.22 0.33 0.0 0.16 -0.18 -0.18
0.34 -0.39 0.27 -0.78 0.52 -0.41
0.2 0.02 0.23 -0.49 0.32 -0.52
-0.33 -0.56 -0.41 0.08 -0.39 0.97
0.14 -0.06 0.29 -0.5 0.42 -0.57
0.1 0.04 -0.02 -0.04 0.04 -0.14
-0.38 0.4 -0.1 0.06 0.21 -0.36
0.11 0.23 0.3 -0.34 0.19 -0.75
0.08 -1.67 0.65 0.46 0.61 -2.69
-3.34 0.66 -0.21 -1.38 -0.81 1.32
0.71 -0.48 0.15 0.05 0.23 -1.64
0.12 -0.19 -0.04 -0.01 0.22 -0.14
0.53 -0.28 0.14 -1.4 0.72 -0.73
0.11 0.01 -0.52 -0.36 0.16 0.41
-0.16 -0.1 -0.4 -0.22 0.1 0.57
0.06 -0.56 0.2 0.09 0.31 -0.27
0.26 -0.03 -0.73 -0.63 0.15 0.55
0.24 0.36 -0.27 -0.79 -0.09 0.26
-2.06 0.04 -0.79 0.61 0.41 0.38
-0.31 0.03 -0.47 -0.19 0.3 0.42
-0.18 0.11 -0.03 0.24 0.19 -0.45
0.04 0.14 -0.0 -0.46 -0.27 0.4

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.